BACKGROUND: Acute kidney injury (AKI) is a frequent complication after liver transplantation (LT) and is associated with morbidity, mortality, and late development of chronic kidney disease. Risk factors for AKI after LT include patient, perioperative and graft-related factors. The exact renal molecular mechanisms behind AKI in LT are unclear.
METHODS: Alterations in the proteome were investigated in kidney biopsies from 21 patients undergoing LT using quantitative proteomics. The most upregulated protein was validated using immunohistochemistry. In addition, serum levels of interleukin (IL)-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins function through complex interaction networks that govern nearly all aspects of cellular physiology. Identifying protein-protein interactions (PPIs) under native conditions remains challenging due to the transient nature of many complexes and technical limitations of conventional approaches. We present TIE-UP-SIN (Targeted Interactome Experiment for Unknown Proteins by Stable Isotope Normalization), a robust and reproducible method for in vivo identification of PPIs. This approach combines metabolic labeling with 15N isotopes, reversible in vivo formaldehyde crosslinking, affinity pur
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bactericidal/permeability-increasing protein (BPI)-inducible protein A (BipA) is a highly conserved protein in Gram-negative bacteria that is structurally similar to translational GTPases such as IF2, EF-Tu, and EF-G. Our previous research showed that deleting bipA in Escherichia coli at 20°C leads to a defect in 50S ribosomal assembly and impaired lipopolysaccharide (LPS) synthesis. This LPS defect activates the Regulator of Capsule Synthesis (Rcs) pathway, resulting in an overproduction of capsular polysaccharides, a reduction in biofilm formation, and decreased flagella-mediated motilit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human chorionic gonadotropin (hCG) is constituted of the hCGα and hCGβ subunits and is a highly glycosylated protein. Affinity supports based on immobilized Concanavalin A (Con A) lectin were used in solid phase extraction (SPE) to fractionate the hCG glycoforms according to their glycosylation state. For the first time, the lectin SPE fractions were off-line analysed by a nano liquid chromatography - high-resolution mass spectrometry (nanoLC-HRMS) method keeping the glycoforms intact. For this, home-made Con A sorbents were prepared by immobilizing lectin on Sepharose with a mean grafting yie
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Preterm infants, especially those born small for gestational age (SGA), are at risk of short-term and long-term health complications. Characterization of changes in circulating proteins postnatally in preterm infants may provide valuable fundamental insights into this population. Here, we investigated postnatal developmental patterns in preterm infants and explored protein signatures that deviate between SGA infants and appropriate for gestational age (AGA) infants using a mass spectrometry (MS)-based proteomics workflow.
METHODS: Longitudinal serum samples obtained at postnatal d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Identifying neurobiological targets predictive of the molecular neuropathophysiological signature of human opioid use disorder (OUD) could expedite new treatments. OUD is characterized by dysregulated cognition and goal-directed behavior mediated by the orbitofrontal cortex (OFC), and next-generation sequencing could provide insights regarding novel targets.
METHODS: Here, we used machine learning to evaluate human postmortem OFC RNA sequencing datasets from heroin users and control participants to identify transcripts that were predictive of heroin use. To determine a causal link
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Impairment of insulin action and metabolic dysregulation have traditionally been associated with schizophrenia, although the molecular basis of such association remains still elusive. The present meta-analysis aims to assess the impact of insulin action manipulations (i.e., hyperinsulinemia, hypoinsulinemia, systemic or brain insulin resistance) on glutamatergic, dopaminergic, γ-aminobutyric acid (GABA)ergic, and serotonergic pathways in the central nervous system. More than one hundred outcomes, including transcript or protein levels, kinetic parameters, and other components of the neurotrans
МетаанализСистематический обзорСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The maturation process that occurs in most viruses is evolutionarily driven, as it resolves several conflicting virion assembly requirements. During herpesvirus assembly in a host cell nucleus, micron-long double-stranded herpes DNA is packaged into a nanometer-sized procapsid. This leads to strong confinement of the viral genome, resulting in tens of atmospheres of intracapsid DNA pressure. Yet, the procapsid is unstable due to weak reversible interactions between its protein subunits, which ensures free energy minimization and reduces assembly errors. In this work, we show that herpesviruses…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trypanosoma brucei causes African trypanosomiasis and contains three full-length oligosaccharyltransferase (OST) genes; two of which, TbSTT3 … and TbSTT3B proteins associate with each other in large complexes that contain no other detectable protein subunits. We probed the peptide acceptor specificities of the OSTs in vivo using a transgenic glycoprotein reporter system and performed glycoproteomics on endogenous parasite glycoproteins using sequential endoglycosidase H and peptide:N-glycosidase-F diges …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the present study was to identify key genes that may be involved in the pathogenesis of Tetralogy of Fallot (TOF) using bioinformatics methods. The GSE26125 microarray dataset, which includes cardiovascular tissue samples derived from 16 children with TOF and five healthy age‑matched control infants, was downloaded from the Gene Expression Omnibus database. Differential expression analysis was performed between TOF and control samples to identify differentially expressed genes (DEGs) using Student's t‑test, and the R/limma package, with a log2 fold‑change of >2 and a false discovery
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angelman syndrome is a neurodevelopmental disorder characterized by mental retardation, severe speech disorder, facial dysmorphism, secondary microcephaly, ataxia, seizures, and abnormal behaviors such as easily provoked laughter. It is most frequently caused by a de novo maternal deletion of chromosome 15q11-q13 (about 70-90%), but can also be caused by paternal uniparental disomy of chromosome 15q11-q13 (3-7%), an imprinting defect (2-4%) or in mutations in the ubiquitin protein ligase E3A gene UBE3A mostly leading to frame shift mutation. In addition, for patients with overlapping clinical
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolutionary pathway of highly toxic proteins expressed in snake venom glands from proteins without toxic function and expressed in non-parotid tissues remains poorly understood. Here we examine gene structure of a representative of a venom protein with an ADAMs metalloproteinase evolutionary origin. The structure of the 15,652 bp Echis ocellatus pre-pro EOC00089-like PIII-SVMP gene was assembled from PCR-amplified sequences of overlapping genomic fragments. The gene comprises 12 exons interrupted by 11 introns. In a homology model of the EOC00089-like protein, the insertion of introns int
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anthrax is caused by the bacterium Bacillus anthracis and is regarded as one of the most prominent bioterrorism threats. Anthrax toxicity is induced by the tripartite toxin complex, composed of the receptor-binding anthrax protective antigen and the two enzymatic subunits, lethal factor and edema factor. Recombinant lactobacilli have previously been used to deliver antibody fragments directed against surface epitopes of a variety of pathogens, including Streptococcus mutans, Porphyromonas gingivalis, and rotavirus. Here, we addressed whether or not anthrax toxins could be targeted
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic hypoxia reduces aerobic capacity (mitochondrial content) in limb skeletal muscles, and one of the causes seems to be decreased physical activity. Diaphragm and other respiratory muscles, however, may have a different pattern of adaptation as hypoxia increases the work of breathing. Thus, we hypothesized that chronic hypoxia would not reduce mitochondrial content in mouse diaphragm. Adult male C57BL/6J mice were kept in normoxia (Fi(O(2)) = 21%, control) or normobaric hypoxia (Fi(O(2)) = 10%, hypoxia) for 1, 2, and 4 wk. Mice were then killed, and the diaphragm and gastrocnemius muscles
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: Epithelial surface hydration is critical for proper gut function. However, colonic tissues from individuals with inflammatory bowel disease or animals with colitis are hyporesponsive to Cl(-) secretagogues. The Cl(-) secretory responses to the muscarinic receptor agonist bethanechol are virtually absent in colons of mice with dextran sodium sulphate (DSS)-induced colitis. Our aim was to define the mechanism underlying this cholinergic hyporesponsiveness.
EXPERIMENTAL APPROACH: Colitis was induced by 4% DSS water, given orally. Epithelial ion transport was measured in U
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent interest in the function of the nuclear lamina has been provoked by the discovery of lamin A/C mutations in the laminopathy diseases. However, it is not understood why mutations in lamin A give such a range of tissue-specific phenotypes. Part of the problem in rationalising genotype-phenotype correlations in the laminopathies is our lack of understanding of the function of normal and mutant lamin A. To investigate this we have used photobleaching in human cells to analyse the dynamics of wild-type and mutant lamin A protein at the nuclear periphery.
RESULTS: We have found t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIF-1 is composed of HIF-1alpha and HIF-1beta protein subunits. HIF-1 is induced by hypoxia and binds to promoter/enhancer elements and stimulates the transcription of hypoxia-inducible target genes. Because HIF-1 activation might promote cell survival in hypoxic tissues, we studied the effect of stroke on the expression of HIF-1alpha, HIF-1beta and several HIF-1 target genes in adult rat brain. After focal cerebral ischemia, mRNAs encoding HIF-1alpha, glucose transporter-1 and several glycolytic enzymes including lactate dehydrogenase were up-regulated in the areas around the infarction. HIF …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have identified a new human cDNA (y+L amino acid transporter-1 (y+LAT-1)) that induces system y+L transport activity with 4F2hc (the surface antigen 4F2 heavy chain) in oocytes. Human y+LAT-1 is a new member of a family of polytopic transmembrane proteins that are homologous to the yeast high affinity methionine permease MUP1. Other members of this family, the Xenopus laevis IU12 and the human KIAA0245 cDNAs, also co-express amino acid transport activity with 4F2hc in oocytes, with characteristics that are compatible with those of systems L and y+L, respectively. y+LAT-1 protein forms a app
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mature excitatory synapses are composed of more than 1500 proteins postsynaptically and hundreds more that operate presynaptically. Among them, drebrin is an F-actin-binding protein that increases noticeably during juvenile synaptogenesis. Electron microscopic analysis reveals that drebrin is highly enriched specifically on the postsynaptic side of excitatory synapses. Since dendritic spines are structures specialized for excitatory synaptic transmission, the function of drebrin was probed by analyzing the ultrastructural characteristics of dendritic spines of animals with genetic deletion of
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kisspeptin2 is a neuropeptide widely found in the brain and multiple peripheral tissues in the zebrafish. The pituitary is the center of synthesis and secretes various endocrine hormones. However, Kiss2 innervation in the zebrafish pituitary is unknown. In this study, the organization of Kiss2 cells and structures in the zebrafish pituitary by promoter-driving mCherry-labeling Kiss2 neurons were investigated. Kiss2 neurons in the hypothalamus do not project into the pituitary. Kiss2 cells are found in the female pituitary. Unidentified Kiss2 cells and extensions are located in the proximal par
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.