Since the isolation of morphine from the opium poppy over 200 years ago, the molecular basis of opioid action has remained the subject of intense inquiry. The identification of specific receptors responsible for opioid function and the discovery of many chemically diverse molecules with unique opioid-like efficacies have provided glimpses into the molecular logic of opioid action. Recent revolutions in the structural biology of transmembrane proteins have, for the first time, yielded high-resolution views into the 3-dimensional shapes of all 4 opioid receptors. These studies have begun to deco
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work presents the theoretical background for the computation of nuclear magnetic shielding, nuclear hyperfine, and magnetizability tensors of paramagnetic molecules using a magnetically induced current density framework to account for both orbital and spin contributions. The resulting magnetizability tensor is fully consistent with the general Van Vleck formulation, recovering the temperature-dependent Curie contribution through the explicit integration of the magnetically induced spin current density. The methodology proposed herein provides a straightforward computational route that byp
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives: Herpetrione (HPE) is a bioactive lignan recognized for its hepatoprotective properties; however, it exhibits limited oral bioavailability. This study aimed to classify HPE within the framework of the biopharmaceutics classification system (BCS) and to develop a nanoparticle formulation. Methods: To this end, a comprehensive investigation was conducted, encompassing computer prediction analysis, equilibrium solubility measurements across the gastrointestinal pH range, Caco-2 bidirectional transportation, in situ single-pass intestinal perfusion (SPIP), and molecular docking with P-g
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ring strain energy (RSE) is crucial for understanding molecular reactivity, with broad implications in polymerization, click chemistry, drug discovery and beyond. However, quantitatively determining RSE through experiments or quantum mechanics (QM) is resource-intensive, limiting its application on a large scale. We present a machine learning (ML)-based workflow that enables the reliable and efficient prediction of RSE, entirely bypassing traditional QM calculations. Our workflow employs AIMNet2 machine learning interatomic potentials and Auto3D for the identification of low-energy conformers
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The purification of expressed proteins is the most critical part of subunit-- vaccine production. Protein-purification methods such as affinity chromatography and ion exchange still have the shortcomings of being time consuming and complicated. With the rapid development of computational molecular-simulation technology, structure-based peptide-ligand design has become feasible. Objection: We aimed to apply molecular docking for a peptide ligand designed for classical swine fever virus (CSFV) E2 purification.
METHODS: Computational-derived peptides were synthesized, and the in vitr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, no approved vaccine is available against the Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), which causes severe respiratory disease. The spike glycoprotein is typically considered a suitable target for MERS-CoV vaccine candidates. A computational strategy can be used to design an antigenic vaccine against a pathogen. Therefore, we used immunoinformatics and computational approaches to design a multi-epitope vaccine that targets the spike glycoprotein of MERS-CoV. After using numerous immunoinformatics tools and applying several immune filters, a poly-epitope vaccine was co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variations and similarities in our individual genomes are part of our history, our heritage, and our identity. Some human genomic variants are associated with common traits such as hair and eye color, while others are associated with susceptibility to disease or response to drug treatment. Identifying the human variations producing clinically relevant phenotypic changes is critical for providing accurate and personalized diagnosis, prognosis, and treatment for diseases. Furthermore, a better understanding of the molecular underpinning of disease can lead to development of new drug targets for
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this issue of Molecular Cell, Ollikainen et al. combine computational simulations with empirical data to reveal how the dynamics of chromatin loop extrusion at the immunoglobulin heavy chain locus enable comparable frequencies of VDJ recombination across megabases of chromatin.
СтатьяКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the advancing technology, the way to drug discovery has evolved. The use of AI and computational methods have revolutionized the methods to develop novel therapeutics. In previous years, the methods to discover new drugs included high-throughput screening and bioassays which were labor-dependent, extremely expensive and had high probability to inaccurate results. The introduction of Computational studies has changed the process by introducing various methods to determine hit compounds and their methods of analysis. Methods such as molecular docking, virtual screening, and dynamics have ch
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Full three-dimensional diffuse scattering data have been recorded for both polymorphic forms [(I) and (II)] of aspirin and these data have been analysed using Monte Carlo computer modelling. The observed scattering in form (I) is well reproduced by a simple harmonic model of thermally induced displacements. The data for form (II) show, in addition to thermal diffuse scattering (TDS) similar to that in form (I), diffuse streaks originating from stacking fault-like defects as well as other effects that can be attributed to strain induced by these defects. The present study has provided strong ev
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The design and performance optimization of future nanocatalysts will depend on our understanding of adsorbate-metal interactions. Using first principle calculations, we identify suitable descriptors, namely, the coordination number and curvature angle of the surface Au atoms, capable of predicting the CO binding strength on every site of Au nanoparticles. Our results unravel how the size, shape, and symmetry of nanoparticles affect their electronic properties and, consequently, their interaction with CO. Importantly, these descriptors can be successfully applied to other metals using structura
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1-Arylmethyl-2-(cyanomethyl)aziridines were transformed into 4-(N,N-bis(arylmethyl)amino)-3-(pyrrolidin-1-yl)butanenitriles and 4-(N,N-bis(arylmethyl)amino)-2-butenenitriles via 4-(N,N-bis(arylmethyl)amino)-3-bromobutanenitriles in high yields and purity. The key steps involve the unprecedented regiospecific ring opening of intermediate 2-(cyanomethyl)aziridinium salts by bromide and pyrrolidine in acetonitrile, exclusively at the substituted aziridine carbon atom. The results were rationalized on the basis of ab initio calculations.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibodies to a soluble liver antigen/liver pancreas (SLA/LP) appear to be highly specific for the diagnosis of autoimmune hepatitis. The SLA/LP target antigen was recently identified as a hitherto unknown gene encoding 474 amino acid residues. The function of this antigen remains unclear, because it does not share sequence homology with proteins of known function stored in any of the publicly accessible databases. Therefore we used a new theoretical method called fold recognition and could show that the SLA/LP sequence is compatible with the architecture of the superfamily of pyridoxal phosph
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent computational advances in mass spectrometry imaging (MSI) now enable unprecedented insight into organ-wide molecular composition and functional architecture. Here, we present the first high-resolution molecular-computational atlas of specific mouse brain lipids and metabolites, acquired using a NEDC matrix and negative-mode MSI, covering 123 anatomically defined regions and 191 polygonal annotations derived solely from MSI data, without auxiliary imaging. To overcome annotation ambiguity and MSI complexity, we introduced the Computational Brain Lipid Atlas (CBLA), a graph-based visual-e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structure of 3,5-dichlorophenylcyanamide c-C6H3Cl2-NHCN was investigated by DFT-B3LYP and ab initio MP2 calculations with the 6-311+G** basis set. The planar to perpendicular rotational barrier was calculated to be of about 5 kcal mol(-1) at both levels of calculation. The stability of the planar structure of the molecule was explained on the basis of conjugation effects between the cyanamide-NHCN moiety and the phenyl c-C6H5 ring in agreement with earlier NMR results. The CNC and the HNC bond angles were calculated to be about 120 degrees especially by MP2 calculation, which is consistent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular imaging seeks to unravel critical molecular and cellular events in living subjects by providing complementary biological information to current structural clinical imaging modalities. In recent years, molecular imaging efforts have marched forward into the clinical cardiovascular arena, and are now actively illuminating new biology in a broad range of conditions, including atherosclerosis, myocardial infarction, thrombosis, vasculitis, aneurysm, cardiomyopathy, and valvular disease. Development of novel molecular imaging reporters is occurring for many clinical cardiovascular imaging
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a general computational protocol for the evaluation of extensive molecular response properties in complex environments within a polarizable quantum embedding framework. The approach extends multilevel density functional theory (MLDFT) to response theory by formulating the coupled-perturbed Kohn-Sham (CPKS) equations for the MLDFT Hamiltonian. The method is further coupled to an additional polarizable molecular mechanics layer based on the fluctuating-charge (FQ) force field, which allows an accurate yet computationally efficient description of long-range interactions. We apply this
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic resistance represents a critical global health challenge, necessitating the development of innovative antimicrobial agents. This research focuses on the design and evaluation of antimicrobial compounds through chemical synthesis and computational methodologies. Biaryl analogues were synthesized via Suzuki coupling reactions and assessed for in vitro antimicrobial activity against Staphylococcus aureus, Escherichia coli, and Candida albicans. Computational approaches, including molecular docking, crystal structure optimization, and toxicity profiling, were employed to explore potenti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Designing single molecules that compute general functions of input molecular partners is a major unsolved challenge in molecular design. Here we demonstrate that high-throughput, iterative experimental testing of diverse RNA designs crowdsourced from the online game Eterna yields sensors of increasingly complex functions of input oligonucleotide concentrations. After designing single-input RNA sensors with activation ratios beyond our detection limits, we created logic gates, including challenging XOR and XNOR gates, and sensors that respond to the ratio of two inputs. Finally, we describe the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Differentiated thyroid cancer (DTC), arising from thyroid follicular epithelial cells, is the most common type of thyroid cancer. Despite the well-known utilization of radioiodine treatment in DTC, i.e., iodine-131, radioiodine imaging in DTC is typically performed with iodine-123 and iodine-131, with the current hybrid scanner performing single photon emission tomography/computed tomography (SPECT/CT). Positron emission tomography/computed tomography (PET/CT) provides superior visualization and quantification of functions at the molecular level; thus, lesion assessment can be improved compare
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования