Numerous rodent cell lines exist that have defects in nucleotide excision repair of DNA caused by alterations in genes that fall into 10 different complementation groups. The precise roles in the repair of these genes are unknown. We report here that extracts from Chinese hamster ovary cells of excision repair-defective complementation groups 1 and 3 are defective in DNA excision repair in a cell-free system. In vitro complementation can be achieved by mixing extracts from the two groups with one another. In addition, extracts from a human cell line representing xeroderma pigmentosum complemen…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatoblastoma (HB) is the most common primary liver malignancy in children. Oxidative DNA damage is primarily repaired through the base excision repair (BER) pathway, and genetic polymorphisms in BER-related genes may influence individual susceptibility to HB. However, the contribution of BER gene variants to HB risk remains unclear.
METHODS: A multicenter case-control study including 193 HB patients and 773 cancer-free controls were conducted. Twenty potentially functional single nucleotide polymorphisms (SNPs) in key BER pathway genes were genotyped using TaqMan assays. Adjuste…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the protective properties of diphlorethohydroxycarmalol (DPHC), a phlorotannin, against ultraviolet B (UVB) radiation-induced cyclobutane pyrimidine dimers (CPDs) in HaCaT human keratinocytes. The nucleotide excision repair (NER) system is the pathway by which cells identify and repair bulky, helix-distorting DNA lesions such as ultraviolet (UV) radiation-induced CPDs and 6-4 photoproducts. CPDs levels were elevated in UVB-exposed cells; however, this increase was reduced by DPHC. Expression levels of xeroderma pigmentosum complementation group C (XPC) and excision repair cross…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Induction of the p21(WAF1) protein (hereafter called p21) following genotoxic stress is known to inhibit proliferating cell nuclear antigen … senescence. We have evaluated the responses of normal human fibroblast (NHF) strains and nucleotide excision repair (NER)-deficient fibroblast strains representing xeroderma pigmentosum (XP) complementation groups A and G and Cockayne syndrome (CS) complementation groups A and B. We report that exposure of NHFs to < or =15 J/m(2) of UVC, and NER-deficient fibrobl …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Only about one third of non-small-cell lung cancer (NSCLC) patients respond to cisplatin-based chemotherapy. Cisplatin DNA adducts are commonly repaired through the nucleotide excision repair pathway. The study of rare inherited disorders such as xeroderma pigmentosum and Cockayne syndrome has disclosed that XP genes, including XPD, play an essential role in DNA repair, both in the global genomic repair and in the transcription-coupled repair pathways. XPD polymorphism and decreased expression of XP genes have both been linked to lower DNA repair capacity. ERCC1 overexpression has been associa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide excision repair (NER) is carried out by xeroderma pigmentosum (XP) factors. Before the excision reaction, DNA damage is recognized by a complex originally thought to contain the XP group C responsible gene product (XPC) and the human homologue of Rad23 B (HR23B). Here, we show that centrin 2/caltractin 1 (CEN2) is also a component of the XPC repair complex. We demonstrate that nearly all XPC complexes contain CEN2, that CEN2 interacts directly with XPC, and that CEN2, in cooperation with HR23B, stabilizes XPC, which stimulates XPC NER activity in vitro. CEN2 has been shown to play a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic information is frequently disturbed by introduction of modified or mismatch bases into duplex DNA, and hence all organisms contain DNA repair systems to restore normal genetic information by removing such damaged bases or nucleotides and replacing them by correct ones. The understanding of this repair mechanism is a central subject in cell biology. This review focuses on the three-dimensional structural views of damaged DNA recognition by three proteins. The first protein is T4 endonuclease V (T4 endo V), which catalyzes the first reaction step of the excision repair pathway to remove …
Сравнительное исследованиеСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human XPA is an essential component in the multienzyme nucleotide excision repair (NER) pathway. The solution structure of the minimal DNA binding domain of XPA (XPA-MBD: M98-F219) was recently determined [Buchko et al. (1998) Nucleic Acids Res. 26, 2779-2788, Ikegami et al. (1998) Nat. Struct. Biol. 5, 701-706] and shown to consist of a compact zinc-binding core and a loop-rich C-terminal subdomain connected by a linker sequence. Here, the solution structure of XPA-MBD was further refined using an entirely new class of restraints based on pseudocontact shifts measured in cobalt-substituted XP…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A hamster DNA repair gene has been isolated by cosmid rescue after two rounds of transfection of an immortalized xeroderma pigmentosum (XP) … cular characterization of the hamster repair gene has revealed no obvious similarities to two human excision repair genes (ERCC1 and ERCC2) that correct repair-defective hamster cells but have no effect on XP cells. Hybridization analyses of normal human and XP cell genomic DNAs and mRNAs, using a cosmid-clone probe from which repeated sequences have been removed …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repair-proficient human cells can be sensitized to exposure to UV radiation at 254 nm by postirradiation incubation in the presence of the eukaryotic alpha polymerase inhibitor, aphidicolin. The degree of sensitization has been examined in cells cultured from humans suffering from various types of sun-sensitive syndromes. Xeroderma pigmentosum (XP) variant and Bloom's cell lines (both excision proficient) were strongly sensitized by aphidicolin. An excision repair proficient Cockayne's cell line and a deficient XPD line were both sensitized to a level similar to the sensitivity of excision def…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial endospores are 1 to 2 orders of magnitude more resistant to 254-nm UV (UV-C) radiation than are exponentially growing cells of the same strain. This high UV resistance is due to two related phenomena: (i) DNA of dormant spores irradiated with 254-nm UV accumulates mainly a unique thymine dimer called the spore photoproduct (SP), and (ii) SP is corrected during spore germination by two major DNA repair pathways, nucleotide excision repair (NER) and an SP-specific enzyme called SP lyase. To date, it has been assumed that these two factors also account for resistance of bacterial spores…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pierisin-1 is a potent apoptosis-inducing protein found in the pupal extract of the cabbage white butterfly. Pierisin-1 catalyzes the mono(ADP-ribosyl)ation of the 2'-deoxyguanosine residue and produces a bulky adduct, N2-(ADP-ribos-1-yl)-2'-deoxyguanosine (N2-ADPR-dG) in DNA. Here, we examined the involvement of the nucleotide excision repair (NER) system in the removal of N2-ADPR-dG in Escherichia coli (E. coli) and human cells. The results of mobility shift gel electrophoresis assays using a 50-mer oligodeoxynucleotide containing a single N2-ADPR-dG showed that E. coli UvrAB proteins bound …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Wilms tumor (WT) is the most common embryonal kidney cancer in children, and the base excision repair (BER) mechanism is crucial for repairing DNA damage from reactive oxygen species. Genetic polymorphisms in BER genes may impact cancer risk by affecting DNA repair capacity.
METHODS: The research included 416 individuals with WT and 936 without the condition, examining 20 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in BER genes to determine their correlation with the risk of developing WT, utilizing odds ratios (O. Rs) and 95% confidence intervals (CIs). 20 candidate SNPs in BER pathwa…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Calcified right atrial thrombus is rare and commonly occurs secondary to atrial fibrillation and long-term central venous catheterization which present risk for embolization. Treatment typically involves anticoagulation and antiplatelet therapy but rarely surgical excision can be performed, especially in patients with venous obstruction or concomitant valvular dysfunction.
CASE PRESENTATION: We present the case of a 69 year old symptomatic female with a history of atrial fibrillation and long-term venous catheterization found to have a large calcified right atrial thrombus causing
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ultraviolet (UV) radiation is one of the most genotoxic, universal agents present in the environment. UVB (280-315 nm) radiation directly da … ay also induce mutations and thereby cause skin cancer. Photolesions are repaired by the Nucleotide Excision Repair (NER) pathway, responsible for repairing bulky DNA lesions. Both types of photolesions can also be repaired by distinct (CPD- or 6-4PP-) photolyases, enzymes that specifically repair their respective photolesion by directly splitting each dimer thro …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum (XP) complementation group A (XPA) is an essential scaffolding protein in the multiprotein nucleotide excision repair (NER) machinery. The interaction of XPA with DNA is a core function of this protein; a number of mutations in the DNA-binding domain (DBD) are associated with XP disease. Although structures of the central globular domain of human XPA and data on binding of DNA substrates have been reported, the structural basis for XPA's DNA-binding activity remains unknown. X-ray crystal structures of the central globular domain of yeast XPA (Rad14) with lesion-containin…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure to ultraviolet radiation (UVR) promotes the formation of UVR-induced, DNA helix distorting photolesions such as (6-4) pyrimidine-pyrimidone photoproducts and cyclobutane pyrimidine dimers. Effective repair of such lesions by the nucleotide excision repair (NER) pathway is required to prevent DNA mutations and chromosome aberrations. Poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) is a zinc finger protein with well documented involvement in base excision repair. PARP-1 is activated in response to DNA damage and catalyzes the formation of poly(ADP-ribose) subunits that assist in the assembly of …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Subtle functional deficiencies in highly conserved DNA repair or growth regulatory processes resulting from polymorphic variation may increase genetic susceptibility to breast cancer. Polymorphisms in DNA repair genes can impact protein function leading to genomic instability facilitated by growth stimulation and increased cancer risk. Thus, 19 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in eight genes involved in base excision repair (XRCC1, APEX, POLD1), BRCA1 protein interaction (BRIP1, ZNF350, BRCA2), and growth regulation (TGFss1, IGFBP3) were evaluated.
METHODS: Genomic DNA sampl…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We examined the O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) protein as well as MGMT activity levels and the excision repair cross-complementing rodent repair deficiency gene, ERCC2 (XPD), protein levels in 14 human tumor cell lines not selected for chloroethylnitrosourea (CENU) resistance. These results were compared with 1,3-bis-(2-chloroethyl)-1-nitrosourea (BCNU) cytotoxicity and UV light sensitivity. MGMT protein correlated significantly with MGMT activity (r = 0.9497, p = 0.0001). There was no significant linear correlation between BCNU cytotoxicity and MGMT content as determined by bot…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.