The deletion of the methylthioadenosine phosphorylase (MTAP) gene is a frequent genomic event across various malignancies, often associated … s. In this study, we analyzed MTAP copy number status in a cohort of 2,409 tumors profiled by whole-exome sequencing within the EXOMA2 study (NCT06550687) using the FACETS and TITAN algorithms. Tumors were categorized as wild-type, homozygous deletion, or probable heterozygous deleted. A subset of these cases with available tissue underwent orthogonal v …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital heart disease (CHD) is a leading cause of pediatric morbidity and mortality worldwide. The genetics of CHD in African populations is not well understood, although it has been shown in other settings that a genetic diagnosis can have implications for patient management and risk stratification. In this study, we aimed to identify pathogenic and likely pathogenic (P/LP) variants in a cohort of patients with CHD from Southern Africa.
METHODS: Exome sequencing was used to screen 356 patients with diverse cardiac phenotypes from South Africa and Namibia.
RESULTS: A P/LP vari…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prenatal exome sequencing for the diagnosis of fetal anomalies was implemented nationally in England in October 2020 by the National Health Service Genomic Medicine Service.
OBJECTIVE: To evaluate the new prenatal exome sequencing service to provide evidence that will inform improvements to quality of care and equity of access for parents having prenatal tests.
DESIGN AND METHODS: Our theoretically driven, multi-site, convergent parallel mixed-methods study design combined qualitative analyses of the service, stakeholder perspectives and ethical considerations with quantitative a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Posterior polar cataract (PPC), a rare congenital cataract, is characterized by subcapsular opacities in the lens affecting vision and posing surgical challenges. Genetic heterogeneity exists, though several genes are implicated in its pathogenesis. This study reports on the genetic profile of late-onset PPC cases and identifies variations specific to posterior capsular rupture (PCR) during surgery.
METHODS: Detailed clinical and genetic history was documented from 100 clinically diagnosed PPC patients and 100 controls. Whole-exome sequencing (WES) was performed in 30 patients and 15…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Idiopathic dilated cardiomyopathy (DCM) is a major cause of advanced heart failure and heart transplantation (HTx), yet the genetic correlates of progression to HTx and transplant-relevant arrhythmic phenotypes remain incompletely defined. We examined the genetics of idiopathic DCM in a Korean population, focusing on HTx/death and arrhythmic outcomes, to identify adverse outcome-linked genotype-phenotype associations.
METHODS: Whole-exome sequencing was performed in 202 Korean patients with idiopathic DCM, including 56 HTx recipients and 146 ambulatory patients, and compared the f…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: ReNU syndrome is a neurodevelopmental disorder (NDD) caused by pathogenic variants in RNU4-2, a non-coding gene encoding the U4 small nuclear RNA (snRNA). As a critical component of the major spliceosome, U4 snRNA is essential for pre-mRNA splicing; however, RNU4-2 is not captured by conventional exome sequencing (ES), often leaving affected individuals undiagnosed.
METHODS: To evaluate the prevalence and clinical impact of RNU4-2 variants, we performed genome sequencing in 95 patients with NDDs in whom prior ES had failed to identify a causative variant.
RESULTS: We identified…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To detect and analyze the correlation between commonly mutated genes and known genes associated with tooth agenesis in patients with non-syndromic tooth agenesis. The aim is to explore new genes that may be associated with tooth agenesis, to provide a genetic reference for its prevention as well as for the clinical diagnosis and treatment of tooth agenesis.
METHODS: Genomic DNA was extracted from the peripheral blood of 18 congenitally edentulous subjects, and related gene mutations were identified by whole-exome sequencing. The genes related to maxillofacial development and the kn…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neurotrophic receptor tyrosine kinase (NTRK) 1/2/3 fusions, though rare, are highly sought in cancer diagnostics due to tyrosine … dded) tumor samples collected between January 2016 and March 2023. Eligible samples underwent whole-exome RNA sequencing (WERS) for mesenchymal tumor diagnosis or theranostic assessment. Results were reviewed by a multidisciplinary molecular board to assess technical, biological, and clinical relevance.
RESULTS: Among 3015 samples, primarily malignant, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Diabetic kidney disease (DKD) is a major complication of diabetes, with genetic factors contributing to its progression. Although genome-wide association studies (GWAS) have identified common variants, the role of low-frequency and rare coding variants remains underexplored.
METHODS: We performed exome-wide meta-analysis of up to 10,312 individuals with type 1 diabetes (T1D) genotyped using genome arrays with focused exome content. We included 10 DKD definitions based on albuminuria, estimated glomerular filtration rate (eGFR), or both. We analyzed nonsynonymous variants individ…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Adamantinomatous craniopharyngioma (ACP) is a benign but surgically challenging intracranial tumor, and its high postoperative recurrence rate poses a threat to patient prognosis. In this study, whole exome sequencing (WES) was performed to comprehensively understand the genomic alterations in ACP.
METHODS: First, the gene mutation profile of ACP was acquired through an overview of the WES data. The somatic single nucleotide variants (SNV) mutational spectrum and signature of ACP were analyzed. Subsequently, somatic mutation data were used to identify the characteristic SNV of recurr…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital hypothyroidism (CH) is among the most common endocrine disorders in neonates. Genetic testing is essential for elucidating the underlying etiology, especially in cases of permanent CH. We enrolled 32 patients diagnosed with permanent CH from the Pediatric Endocrinology Clinics at Jeju National University Hospital and Soonchunhyang University Cheonan Hospital. Whole-exome sequencing (WES) was performed on genomic DNA extracted from buccal swabs. Variants were classified according to guidelines established by the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) and the Associa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microtia is one of the most common congenital craniofacial malformations, characterized by the maldevelopment of the external and middle ear. While numerous genes have been implicated in syndromic forms of microtia, the genetic underpinnings of isolated microtia remain poorly understood. In this study, we conducted whole exome sequencing (WES) on 201 pedigrees with isolated microtia to investigate its genetic basis. Bioinformatics analysis identified 1362 deleterious variants corresponding to 332 candidate genes, including 40 previously associated with microtia-related phenotypes. Among these,…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To identify novel candidates for cataract and evaluate the contribution of protein-coding variants to cataract susceptibility.
METHODS: We first leveraged a publicly-available browser, Genebass, to extract significant gene-based and single-variant association results for cataract in UK Biobank exomes (30,550 cataract cases and 364,291 controls). We then validated findings using genome-wide association study (GWAS) summary statistics from the Genetic Epidemiology Research in Adult Health and Aging (GERA) cohort (28,092 cataract cases and 50,487 controls). Finally, we examined the expr…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Optic nerve hypoplasia (ONH), the leading congenital cause of permanent blindness, is characterized by a retinal ganglion cell (RGC) deficit at birth and frequently associated neurologic and endocrine abnormalities. Multifactorial developmental events are hypothesized to underlie ONH; however, environmental influences are unclear, and genetic causes are under-investigated.
METHODS: To identify monogenic, disease-causing variants among ONH patients, exomes from 34 ONH subjects and their parents were sequenced and rare variants identified. Inheritance-modelled variants were evaluate…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Congenital scoliosis (CS) is a developmental disorder characterized by abnormal vertebral development during embryogenesis. Despite the identification of genes involved in vertebral development, the underlying genetic causes of CS remain largely unknown. Monozygotic (MZ) twins discordant for CS offer a unique opportunity to explore de novo or postzygotic causes. This exploratory case study aimed to investigate potential causative variants underlying CS using whole-exome sequencing (WES). Methods: We performed WES on a Kazakhstani family with MZ twins discordant for conge…
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to improve genetic diagnosis in childhood onset epilepsy with neurodevelopmental problems by utilizing RNA sequencing of fibroblasts to identify pathogenic variants that may be missed by exome sequencing and copy number variation analysis.
METHODS: We enrolled 41 individuals with childhood onset epilepsy and neurodevelopmental problems who previously had inconclusive genetic testing. Fibroblast samples were cultured and analyzed using RNA sequencing to detect aberrant expression, aberrant splicing, and monoallelic expression using the Detection of RNA Outlier Pipeli…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One out of every hundred live births present with congenital heart abnormalities caused by the aberrant development of the embryonic cardiov … on, we employed whole-genome single-nucleotide polymorphism (SNP) microarray and family-based whole-exome sequencing (WES) studies. Proband A is a full-term infant who was admitted to the neonatal intensive care unit (NICU) at five days of life for pulmonary valve stenosis (PVS). Genomic studies revealed a normal SNP microarray; however, quad WES analys …
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Retinitis Pigmentosa is the leading cause of hereditary blindness. This clinically and genetically heterogeneous group of disorders typically begins with night blindness and progresses to complete vision loss. In atypical cases, the classic triad of retinal bone-spicule pigmentation, blood vessel attenuation, and waxy disc pallor is absent, complicating definitive clinical diagnosis.
METHODS: To identify the underlying genetic causes in diagnostically challenging cases, exome sequencing was conducted on eight unrelated patients with atypical, non-syndromic Retinitis Pigmentosa. Pu…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study examines Opisthorchis viverrini (OV)-related cholangiocarcinoma (CCA), a serious malignancy common in Southeast Asia. Through multi-regional whole-exome sequencing of 52 tumor samples and 13 adjacent tissues from 13 patients, significant intratumoral heterogeneity (ITH) and inter-patient heterogeneity are shown. Chronic liver fluke infection induces a distinct mutational landscape, with 48-90% of mutations concentrated in each region of the tumor. The average mutation burden is 95 non-synonymous mutations per area, exceeding previous CCA investigations. Critical driver mutations in T…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования