BACKGROUND: Oxaliplatin-induced peripheral neuropathy (OIPN) poses a significant challenge for patients with colorectal tumor, often resulting in treatment interruption or discontinuation and subsequent treatment failure. Herein, a longitudinal untargeted metabolomic study to reveal the metabolomic profiles and biomarkers associated with the progression of OIPN.
METHODS: A prospective cohort of 129 colorectal cancer patients receiving oxaliplatin-based chemotherapy was stratified into four OIPN severity grades (Level 0-3). Serum samples underwent untargeted LC-MS/MS metabolomic analysis, dete
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fermentation of red grapefruit by Monascus purpureus (M. purpureus) results in complex changes in flavor compounds and metabolic profiles, but the specifics of these alterations are not well understood. This study aimed to investigate the changes in flavor compounds and metabolomic traits during this fermentation process. Using Headspace solid-phase microextraction-gas chromatography-mass spectrometry (HS-SPME-GC-MS) with non-targeted metabolomics, we analyzed flavor compounds and measured physicochemical indices throughout the fermentation period. We identified 23 volatile flavor metabolites …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Commiphora species, valued for their resinous cell saps rich in terpenoids and other compounds, are known for their therapeutic benefits. This study aimed to be the first NMR-based metabolome profiling of oleo-gum resin derived from endemic rare Commiphora species. Insights into taxonomic variation and tree sex differences were targeted for future correlation with bioactivities-related assays. Oleo-gum resins and cell sap were collected and extracted by methanol from four naturally growing Commiphora species, including C. gileadensis, C. quadricincta, C. kataf female, and C. kataf male. Afterw
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DM and PM were the two major subtypes in myositis; among which, a unique metabolomic and biomarker profile remains lacking. Serum from 36 di … , and palmitoylethanolamide presented moderate or strong correlation with clinical characteristics. Metabolomics presents a different spectrum between myositis patients and healthy controls, PM and DM patients. Besides, indoxyl sulfate, oleamide, and palmitoylethanolamide may be potential biomarkers in distinguishing PM from DM.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The conservation of microbial genetic resources (MGR) is increasingly recognized as a strategic pillar for food security, biotechnology, eco … y induce subtle yet biologically relevant metabolic and physiological alterations. In this context, metabolomics emerges as a critical tool for advancing microbial conservation beyond identity-based paradigms toward a framework of functional conservation. By directly capturing the biochemical phenotype, metabolomics provides an integrated readout of microbial …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Analytical chemistry, and particularly mass spectrometry (MS), plays a central role in the molecular characterization of biological and envi … egrating, and interpreting the high-dimensional, heterogeneous datasets generated in proteomics and metabolomics research. This chapter first introduces the fundamental principles and operational mechanisms of commonly used AI/ML methods in analytical chemistry. These include regression models, decision trees, k-nearest neighbors, support vector machines, neur …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Based on gut microbiota and serum untargeted metabolomics analyses, this study investigated changes in gut microbiota structure and serum metabolic profiles in children infected with human parainfluenza virus (HPIV). By integrating multi-omics data, we aimed to explore interactions between gut dysbiosis and serum metabolic disorders, and their potential roles in HPIV pathogenesis, to provide preliminary evidence for microbiota--targeted and metabolic intervention strategies.
METHODS: Clinical data and laboratory results were collected from 230 hospitalized children (<14 years) with…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology of myeloproliferative neoplasms (MPN) is poorly understood. We investigated the possible role of early-life exposures in the pathogenesis of MPN diagnosed among children and young adults in a population-based case-control study in California. Untargeted metabolomics analysis was conducted using archived neonatal dried blood spots. Data reduction methodologies revealed subtle metabolic differences between cases and controls, particularly when stratifying by age at diagnosis. Key differences were observed in fatty acids, amino acids, and metabolites in redox pathways. This study sug…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Untargeted metabolomics and lipidomics generate high-dimensional data sets whose biological interpretation remains challenging, particularly at the pathway and network levels. Here, we present MetaboGraph, a standalone Python-based workflow for end-to-end metabolomics and lipidomics analysis, enabling pathway-level interpretation from small-molecule data. MetaboGraph integrates automated data cleaning, comprehensive multidatabase metabolite and lipid annotation, pathway mapping, and direction-aware pathway inference. A central feature of the platform is its ability to predict pathway direction…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Bronchopulmonary dysplasia (BPD), the most frequent complication of extreme preterm birth, lacks not only of a comprehensive definition but also of effective treatments and predictive tools. Metabolomics is a valuable tool to unravel the underlying pathogenetic pathways of diseases and identify possible early markers. The objective of this study was to find metabolic signatures of subsequent BPD development, defined and stratified as per Jobe and Bancalari 2001 NHICD Consensus.
METHODS: In this observational case-control study, we initially enrolled 161 very preterm unmatched infan…
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to characterize serum metabolic profiles in hypertensive patients and investigate the regulatory role of tryptophan metabolism.
METHODS: We employed an integrated metabolomics strategy that combined non-targeted screening with targeted validation. From November 2022 to November 2023, we enrolled 25 newly diagnosed, treatment-naïve hypertensive patients and 25 age- and sex-matched healthy controls (1:1 ratio) from a local Shanghai hospital, together with their clinical baseline data. Non-targeted metabolomics, combined with Principal Component Analysis (PCA) and Ort…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer remains the leading cause of cancer-related deaths worldwide, with brain metastasis being one of the most common complications in advanced-stage disease. The development of noninvasive and efficient early diagnostic methods is therefore of critical clinical importance. In this study, untargeted liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) was employed to perform metabolomic profiling of 66 serum samples from patients with lung cancer brain metastasis, early-stage lung cancer, and healthy controls. A total of 719 metabolites were identified with high data reliability. Comparative
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Direct infusion-based single-cell metabolomics analysis has the potential to isolate the causes of drug resistance and cancer progression; however, processing and analyzing the data generated remains a challenge. While many packages exist for metabolomics analysis, they are not optimized for direct infusion-based single-cell measurements, which do not rely on chromatographic separation and are typically noisier than traditional population-level methods. To address this gap, the MeDUSA (Metabolomics of direct-infusion untargeted single-cell analysis) R package was developed. MeDUSA was built es…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Machine learning (ML) integrated with metabolomics has emerged as a promising strategy to advance precision pharmacotherapy, enabling data-driven prediction of drug response. This review provides an overview of commonly applied ML methodologies in metabolomics-based pharmacological studies, including supervised models (Random Forest, Extreme Gradient Boosting, Support Vector Machine, Logistic Regression, K-Nearest Neighbors), unsupervised models (K-Means Clustering, Principal Component Analysis), and deep learning approaches. We summarize recent progress in the application of metabolomics-driv…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: The protective effects of vitamins on the dopaminergic neurons and against alpha-synuclein toxicity indicate their possible contrib … sk of PD.
DATA ANALYSIS: Of the 1208 citations obtained, 19 articles (3 dietary assessments and 16 metabolomics analysis studies) were included in the final review. Two out of 3 studies showed that high dietary consumption of pantothenic acid was associated with decreased odds of PD. Of 16 studies that performed metabolomics analysis of biofluids, brain struc …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute kidney injury (AKI) is a common syndrome among critically ill patients with high incidence and high mortality, characterized by elevated serum creatinine (SCr) and uric acid (UA) levels. Given that xanthine is a key intermediate in nucleotide metabolism and the direct precursor of UA, profiling of nucleotide metabolic dysregulation in AKI remains largely unexplored. Using ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry (UHPLC-MS/MS), we simultaneously quantified 29 nucleotide intermediates both in plasma and matched urine samples from 58 propensity score-matched pai
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular mechanisms underlying cholesterol gallstone (CG) formation remain incompletely elucidated, and effective diagnostic biomarkers are lacking. This study integrates high-resolution ultra-high-performance liquid chromatography-mass spectrometry (UHPLC-MS) with high-throughput targeted metabolomics to systematically reveal the serum metabolic profile of CG patients. The goal is to elucidate the pathological mechanisms of CG and identify potential high-value biomarkers. Serum samples were collected from 39 CG patients (who underwent laparoscopic cholecystectomy) and 32 healthy controls…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic enzymes have traditionally been regarded as highly specific catalysts; however, many can catalyze multiple reactions. To systematically investigate the prevalence of such enzyme promiscuity, we used nontargeted metabolomics to measure dynamic metabolite ion profiles in in vitro assays with 667 successfully purified Escherichia coli enzymes in a natural intracellular metabolome extract. Notably, nearly half of these enzymes elicited significant changes in ion traces. Using a machine learning-derived multivariate classifier at a false-discovery rate of 33%, we identified unexpected cha…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hairtail is prone to spoilage during refrigerated storage and it is due to microbial activity, which will directly lead to changes in the co … ng compounds such as TMAO released in large quantities in the later stage of spoilage. Non-targeted metabolomics results revealed a total of 62 differentially expressed metabolites. Metabolic pathway enrichment analysis revealed that cysteine and methionine metabolism, tyrosine metabolism and nucleotide metabolism played pivotal roles in the putrefaction proce …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Steatotic liver disease (SLD) is characterised by profound metabolic reprogramming, yet no single biomarker reliably distinguishes disease e … regulated serum metabolites as candidate biomarkers of disease progression, quantified by NMR-based metabolomics and ELISA and complemented by CSC marker staining. We combined these NMR-based metabolomic 'liquid biopsy' data with circulating tumour-associated biomarkers, MELD-based risk assessment and tissue-level CSC marker expression across MetALD, MASLD, im …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования