DNA adducts represent internal dosimeters to measure exposure to environmental and endogenous genotoxicants. Unfortunately, in molecular epidemiologic studies, measurements of DNA adducts often are precluded by the unavailability of fresh tissue. In contrast, formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) tissues frequently are accessible for biomarker discovery. We report here that DNA adducts of aristolochic acids (AAs) can be measured in FFPE tissues at a level of sensitivity comparable to freshly frozen tissue. AAs are nephrotoxic and carcinogenic compounds found in Aristolochia herbaceous plants…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urothelial carcinomas arising from the upper urinary tract (renal pelvis and ureter) are rare and few molecular genetic studies of these tumors have been conducted to date. We investigated hyperploidy at chromosomes 3, 7, and 17 using a multitarget fluorescence in situ hybridization system to identify genetic alterations in patients with urothelial carcinomas of the upper urinary tract. Chromosomal aberrations are seen most frequently in the high-grade tumors. A highly significant relationship was found between an increase in the percentage of hyperdiploidy and high grade for each chromosome (
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A real-time PCR assay to detect Histoplasma capsulatum in formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue is described. The assay had an analytical sensitivity of 6 pg/μl of fungal DNA, analytical specificity of 100%, and clinical sensitivity of 88.9%. This proof-of-concept study may aid in the diagnosis of histoplasmosis from FFPE tissue.
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urovysion fluorescence in situ hybridization (UVFISH) identifies malignant cells in urine by detecting specific urothelial carcinoma-related chromosomal abnormalities. Some renal carcinomas (RCCs) share overlapping chromosomal aberrations with urothelial carcinoma. Malignant renal cells that are shed in urine can potentially cause a positive UVFISH result. We evaluated UVFISH in RCCs to determine its potential applicability to the diagnosis and grading of RCCs. Paraffin blocks from 39 RCCs (25 clear cell, 9 papillary, 2 chromophobe, and 3 sarcomatoid) and 15 controls (5 renal oncocytomas and 1…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The role of human papilloma virus (HPV) in the pathogenesis of anogenital dysplasia is now conclusive. However, HPV detection in formalin-fixed and paraffin-embedded tissues remains controversial. Therefore, the aim of this study was to evaluate morphological changes directly in tissue specimens using a HPV-DNA detection system involving HPV in situ hybridisation.
MATERIALS AND METHODS: Samples from patients with cervical carcinoma were analysed using the GenPoint HPV DNA Probe Cocktail (Dako, Glostrup, Denmark) and the ZytoFast HPV Screening CISH-Kit (Zytomed, Berlin, Germany).…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To optimize the morphology of pl6-positive atypical and (pre)neoplastic cells in paraffin cytoblock sections with the aim to minimize equivocal diagnoses on cytology samples.
STUDY DESIGN: Patients with negative cytology results or results within normal limits (WNL) (n=38), atypical squamous cells of undetermined significance (ASCUS) (n=25) and high grade squamous intraepithelial lesion (HSIL) (n=16) were selected. The residual material of the cervical brush samples was processed to cytoblock paraffin sections and stained for pl1. The cytohistodiagnosis of the pl1-stained paraffin …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter DNA has been detected in the liver specimens of patients with various hepato-biliary diseases. The aim of this study was to investigate the presence of H. pylori DNA in the liver tissue of Iranian patients with chronic liver diseases (CLD). Genomic DNA was extracted from the paraffin sections of 46 liver biopsies of patients with CLD and 13 from patients with metastatic adenocarcinoma as a control group. Polymerase chain reaction (PCR) analysis was carried out using primers for H. pylori 16S rRNA and cagA genes. On analysis, 17 of the 46 patient samples were positive in H. pylori …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study the genetic aberrations and their pathologic significance in follicular lymphoma (FL).
METHODS: Paraffin-embedded tissue samples of 55 cases of FL, 28 cases of other small B-cell lymphomas and 10 cases of reactive follicular hyperplasia were retrieved. Nested polymerase chain reaction (PCR) was used to detect clonal rearrangement of immunoglobulin heavy chain gene (IgH) in FL and other small B-cell lymphomas. The translocation t (14; 18) was studied by PCR and dual-color fluorescence in-situ hybridization (FISH) in FL. Cases of reactive follicular hyperplasia were used as …
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Certain recurrent cytogenetic abnormalities are diagnostic of a specific neoplasm and may portend prognosis. As conventional cytogenetics may not reveal a neoplastic clone, and unfixed material for fluorescence in situ hybridization may be unavailable, performing fluorescence in situ hybridization on fixed tissues is diagnostically and prognostically valuable. Manual interpretation of fluorescence in situ hybridization signals may be difficult on paraffin-embedded tissue sections due to truncated nuclei. Therefore, we investigated the use of an automated image acquisition and analysis system (…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric infection with Helicobacter pylori is the major cause of chronic active gastritis and is associated with the pathogenesi … routinely obtained for diagnostic histopathology.
METHODS: DNA was extracted from formalin fixed, paraffin wax embedded gastric tissue sections of 93 patients with chronic active gastritis (n = 39), adenocarcinoma (n = 28), or mucosa associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma (n = 24). The extracted DNA was used to perform a polymerase chain reaction bas …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: T- and B-lymphocytes are involved in recognition of foreign antigen by the specificity of their surface T-cell receptor and immunoglobulin, generated by gene rearrangement. Each T- and B-lymphocyte carries unique rearranged TCR or immunoglobulin gene, which has been applied to detect clonal from non-clonal T- and B-cell proliferation.
METHODS: Paraffin-embedded biopsy tissues of 85 T-, 24 B-cell non-Hodgkin's lymphomas (NHL) of various subtypes, and seven reactive lymphoid hyperplasia were retrieved from the archives for determining the feasibility of TCRgamma gene rearrangement…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular detection of a clonal population of B or T cells through analysis of rearranged antigen receptor genes is an essential adjunct to … ttle as 1% of the population in a polyclonal B-cell background. It may be used on fresh, frozen, or paraffin-embedded tissue and detects a clonal population in a majority of lymphoma subtypes. Compared with conventional PCR analysis, this method requires only a short additional cycle of denaturation and slow renaturation before PAGE. Interpretation is simp …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Splenic marginal zone lymphoma (SMZL) most commonly presents with splenomegaly and stage IV disease. To our knowledge, there have been only two reported cases of SMZL without associated splenomegaly; one was detected incidentally after a bicycle accident. This previously reported case represented an early-stage SMZL with monoclonality confirmed by immunohistochemistry. We report a case of early-stage SMZL detected incidentally following a motor vehicle accident; monoclonality was confirmed by polymerase chain reaction analysis of paraffin-embedded tissue owing to the inability of confirmation …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study provides an investigation of the availability of octyl salicylate (OS), a common sunscreen agent, from liquid paraffin and the effect of OS on skin permeability. A model membrane system to isolate the vehicle effect from membrane permeability has been developed. Partitioning of OS between liquid paraffin and aqueous receptor phases was conducted. Partition coefficients increased with increase in OS concentration. A range of OS concentrations in liquid paraffin was diffused across human epidermis and synthetic membranes into 4% bovine serum albumin in phosphate-buffered saline and 50…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One hundred and six squamous cell carcinomas (SCCs) of cattle, horses, cats and dogs were analysed immunohistochemically for overexpression … a positive reaction. Thus p53 antigen could be detected immunohistochemically in formalin-fixed and paraffin wax-embedded tissues of SCCs of domestic animals. The results support the view that, as in man, p53 overexpression plays an important role in the development of most SCCs of the animal species studied. This was in particular true for feline SCCs of …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Point mutations of the K-ras gene were analyzed in 25 periampullary cancers (21 ampulla vater cancers, two common bile duct cancers and two duodenal cancers), two gallbladder cancers and six cholangiocarcinomas. DNA extracted from the paraffin-embedded tissues was amplified with the polymerase chain reaction and subsequently analyzed by direct cycle sequencing at codons 12, 13 and 18 of the K-ras gene. Codon 61 was first screened with single strand conformation polymorphism and then sequenced by direct cycle sequencing. No point mutation was found in any of the 25 periampullary cancers or the …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel monoclonal antibody (MAb), OPD4, reactive with a helper/inducer (H/I) subset of T cells in formalin-fixed, paraffin-embedded tissue sections, has been identified through immunization with an activated H/I T cell line, namely DL40. The antibody is an IgG1 antibody and it recognizes an antigen with a molecular weight of 200 kd, corresponding to that of leukocyte common antigen. OPD4+/CD4+ T cells provided better help for pokeweed mitogen-stimulated polyclonal IgG production than OPD4-/CD4+ T cells. OPD4 recognized the H/I T cell subset even in paraffin-embedded tissue sections, but did n…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are small, non-coding RNAs that play critical roles in post-transcriptional gene regulation and are involved in various biological processes, including cancer progression. Efficient extraction of miRNAs from cultured cells and tissue samples is crucial for downstream applications, including quantitative real-time PCR (qRT-PCR), next-generation sequencing (NGS), and microarray analysis. This chapter provides reliable protocols for extracting high-quality RNA and microRNAs from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues and cultured cells. It compares manual and automated…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer (PC) represents one of the leading causes of cancer-related morbidity and mortality in men, requiring further understanding … ication will be presented, highlighting the critical issue for the detection both in formalin fixed paraffin embedded (FFPE) and blood samples.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования