PTEN-induced kinase 1 (Pink1), a familial Parkinson's associated gene, is a key regulator of mitochondrial and cellular energy homeostasis. Mutations in Pink1 disrupt mitophagy and perturbations in gastrointestinal homeostasis. This suggests the possibility that Pink1 deficiency may influence neurodegenerative processes by altering gut-to-brain signaling mechanisms. To facilitate investigation of gut-specific consequences of Pink1 deficiency, we generated a single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) dataset from gut tissue of wild-type (WT) and Pink1 knockout (KO) mice. We identified major cell
СтатьяDatasetПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Peredibacter is a member of the obligate predatory bacteria Bdellovibrio and like organisms (BALOs). However, there is still a paucity of information because few strains have been isolated, and HCB2-198, a strain of Peredibacter, has been isolated from soil in China. It shares high genomic similarity with Peredibacter starrii A3.12. Thus, HCB2-198 shares some genomic traits with Peredibacter. The complete genome has 3988 coding sequences and a GC content of 42.77. It has a high number of ribosomal structures and biogenesis-associated genes. It contains a larger histone gene with two
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gp60 gene has been widely used to subtype Cryptosporidium for many years. Predominantly, this has involved nested polymerase chain reaction (PCR) amplification, gel electrophoresis, and Sanger sequencing of the amplicons. However, laboratories may no longer have gel electrophoresis capability, and during outbreak investigations a more timely approach may be required. Here, we describe a real-time PCR assay combined with high-resolution melt curve analysis that streamlines the PCR detection of gp60 amplicons of Cryptosporidium parvum and Cryptosporidium hominis for sequencing during public
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Tumor protein p53 (TP53) alterations are frequently reported in canine cancers but remain incompletely characterized due to differences in reference genomes and sequencing cost.
OBJECTIVE: To evaluate a cost-efficient primer-walking approach for TP53 variant screening in dogs with spontaneous tumors.
METHODS: Tumor tissue (n = 10) or blood (n = 16) was collected from 26 dogs with suspected neoplasia. Interpretable TP53 sequences spanning introns and exons 2-11, excluding long intron 1 and non-protein-coding exon 1, were obtained by primer-walking polymerase chain reaction and San
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spotted knifejaw (Oplegnathus punctatus) is an economically important marine cultured species exhibiting a unique complex sex chromosome system (X1X1X2X2 in females and X1X2Y in males), with males possessing one fewer chromosome (2n = 47) than females (2n = 48) and an abnormally large Y chromosome. Additionally, males demonstrate significant growth advantages over females. Rapid and accurate sex identification is essential for effective culture management, selective breeding, and population control. In this study, we identified a homologous region of the tmem88 gene containing large DNA insert
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
So far there has been no comprehensive review using systematic literature search strategies to show the application of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) in the human testis of the whole life cycle (from embryos to aging males). Here, we summarized the application of scRNA-seq analyses on various human testicular biological samples. A systematic search was conducted in PubMed and Gene Expression Omnibus (GEO), focusing on English researches published after 2009. Articles related to GEO data-series were also retrieved in PubMed or BioRxiv. 81 full-length studies were finally included in the
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schizophrenia (SCZ) is a highly heritable, polygenic complex mental disorder with imprecise diagnostic boundaries. Finding sensitive and specific novel biomarkers to improve the biological homogeneity of SCZ diagnosis is still one of the research hotspots. To identify the blood specific diagnostic biomarkers of SCZ, we performed RNA sequencing (RNA-seq) on 30 peripheral blood samples from 15 first-episode drug-naïve SCZ patients and 15 healthy controls (CTL). By performing multiple bioinformatics analysis algorithms based on RNA-seq data and microarray datasets, including differential expressi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The malaria parasite has a complex life cycle exhibiting phenotypic and morphogenic variations in two different hosts by existing in heterogeneous developmental states. To investigate this cellular heterogeneity of the parasite within the human host, we performed single-cell RNA sequencing of synchronized Plasmodium cells under control and temperature treatment conditions. Using the Malaria Cell Atlas (https://www.sanger.ac.uk/science/tools/mca) as a guide, we identified 9 subtypes of the parasite distributed across known intraerythrocytic stages. Interestingly, temperature treatment results i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Limb girdle muscular dystrophy recessive type 1 (LGMDR1, Previously LGMD2A) is characterized by inactivating mutations in CAPN3. Despite the significant burden of muscular dystrophy in India, and particularly of LGMDR1, its genetic characterization and possible phenotypic manifestations are yet unidentified.
MATERIAL AND METHODS: We performed bidirectional CAPN3 sequencing in 95 LGMDR1 patient samples characterized by calpain-3 protein analysis, and these findings were correlated with clinical, biochemical and histopathological features.
RESULTS: We identified 84 (88.4%) cases of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Huntington's disease (HD) is an autosomal dominant neurodegenerative disorder caused by the expansion of the HTT CAG repeat. Affected individuals inherit ≥36 repeats and longer alleles cause earlier onset, greater disease severity and faster disease progression. The HTT CAG repeat is genetically unstable in the soma in a process that preferentially generates somatic expansions, the proportion of which is associated with disease onset, severity and progression. Somatic mosaicism of the HTT CAG repeat has traditionally been assessed by semi-quantitative PCR-electrophoresis approaches
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY QUESTION: Are SARS-CoV-2 canonical cell entry machinery, consisting of ACE2, TMPRSS2, NRP1 and LY6E, or alternative potential cell entry machinery, consisting of BSG, ANPEP, CD209, CLEC4G, TMPRSS4, TMPRSS11A, FURIN, CTSB, CTSL and IFITM1, expressed in the human endometrium across the menstrual cycle?
SUMMARY ANSWER: Analysis of cell entry factors for SARS-CoV-2 by single-cell RNA-sequencing (scRNAseq) in the preconceptional human endometrium reveals low risk of infection.
WHAT IS KNOWN ALREADY: Gene expression datasets from bulk endometrial tissue show no significant expression of the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the WFS1 gene, encoding wolframin (WFS1), cause endoplasmic reticulum (ER) stress and are associated with a rare autosomal-recessive disorder known as Wolfram syndrome (WS). WS is clinically characterized by childhood-onset diabetes mellitus, optic atrophy, deafness, diabetes insipidus and neurological signs. We identified two novel WFS1 mutations in a patient with WS, namely, c.316-1G > A (in intron 3) and c.757A > T (in exon 7). Both mutations, located in the N-terminal region of the protein, were predicted to generate a truncated and inactive form of WFS1. We found that althoug
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intermittent fasting blunts inflammation in asthma1 and rheumatoid arthritis2, suggesting that fasting may be exploited as an immune-modulatory intervention. However, the mechanisms underpinning the anti-inflammatory effects of fasting are poorly characterized3-5. Here, we show that fasting in humans is sufficient to blunt CD4+ T helper cell responsiveness. RNA sequencing and flow cytometry immunophenotyping of peripheral blood mononuclear cells from volunteers subjected to overnight or 24-h fasting and 3 h of refeeding suggest that fasting blunts CD4+ T helper cell activation and differentiat
Письмо в редакциюResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular epidemiology uses genetic information from bacterial isolates to shed light on the population structure and dynamics of pathogens. Bacterial pathogens can now be studied by whole genome sequencing, but for some well-studied pathogens such as Mycobacterium tuberculosis a wealth of information is also available from other sources such as spoligotyping and multi-locus variable-number-tandem-repeats (VNTR). Isolates are also frequently tested for susceptibility to antibiotics. Methods of analysis are available for each type of data but it would be informative to combine multiple sources
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Traumatic myiasis causes substantial economic losses to farmers worldwide. In the present study, six flocks of sheep (2261 sheep) were investigated in Gansu, China, and 207 of 552 larvae were genetically characterized based on three genes, including cyt b, EF-1α, and white gene, by polymerase chain reaction and sequence analysis. A survey of sheep in China revealed that the prevalence of vulvar myiasis of six sheep flocks was 5.00% (11/220, Flock1), 4.85% (10/206, Flock2), 4.50% (9/200, Flock3), 5.00% (15/300, Flock4), 4.68% (15/320, Flock5), 0% (0/1015, Flock6), respectively. The sequence and
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the possible effects of epigenetic modification of testis protein-encoding genes on precocious puberty of Eriocheir sinensis, we used MeDIP-seq and hMeDIP-seq techniques to compare the methylation and hydroxymethylation of 263 E. sinensis protein-encoding genes known in the NCBI database in precocious testes with those in normally developing testes. The results showed that total methylation level of those genes was lower than their total hydroxymethylation level. Moreover, their total hydroxymethylation level in precocious testes was significantly lower than that in normal teste
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work reports the purification of new potent scorpion neuropeptide, named BotAF, by an activity-guided screening approach. BotAF is a 64-residue long-chain peptide that shares very high similarity with the original β-like scorpion toxin group, in which several peptides have been characterized to be anti-nociceptive in rodents. BotAF administration to rodents does not produce any toxicity or motor impairment, including at high doses. In all models investigated, BotAF turned out to be an efficient peptide in abolishing acute and inflammatory (both somatic and visceral) pain in rodents. It pe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Plasmodium knowlesi a parasite of the macaques is currently the most common cause of human malaria in Malaysia. The thrombospondin-related adhesive protein (TRAP) gene is pre-erythrocytic stage antigen. It is a well-characterized vaccine candidate in Plasmodium vivax and Plasmodium falciparum, however, no study has been done in the orthologous gene of P. knowlesi. This study investigates nucleotide diversity, haplotypes, natural selection and population differentiation of full-length pktrap genes in clinical samples from Malaysia.
METHODS: Forty full-length pktrap sequences from c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three third-instar Oestrus larvae were found in the frontal sinus of an adult female Asiatic ibex (Capra sibirica) in the Tian Shan mountain range, Kyrgyzstan. The larvae were identified as Oestrus ovis based on morphology and after sequencing and analyzing a fragment of the cytochrome oxidase I (COI) gene. In light of this identification and the fact that Asiatic ibex and livestock are sympatric in many areas in Central Asia, we discuss the risks of interspecific parasite spillover.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhinoviruses (RVs) are frequently detected respiratory viruses that cause mild common cold symptoms, but may also lead to more severe respiratory tract infections. The large number of RV types, classified into species A, B and C, hampers clear insights into the epidemiology and clinical significance of each RV type. The aim of this study was to map the circulation of RV types in the Amsterdam area. RV-positive nasopharyngeal and oropharyngeal samples, collected from 2007 to 2012 in the Academic Medical Centre (Amsterdam, the Netherlands), were typed based on the sequence of the region coding f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования