BACKGROUND AND AIMS: Liver cancer remains a major global health burden with a complex and shifting epidemiology. While viral hepatitis continues to drive significant morbidity, metabolic risk factors are increasingly contributing to the incidence of liver cancer. Utilizing data from the Global Burden of Disease (GBD) Study 2021, this analysis examines China's incidence, prevalence, and age-standardized disability-adjusted life year (DALY) rates for liver cancer from 1990 to 2021, comparing these trajectories against global and regional patterns. This study further analyzed the correlations bet
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) generates high-dimensional transcriptomic data but is severely affected by dropout events, which obscure true gene-gene relationships. These missing values introduce bias into downstream analyses, complicate data processing, and reduce analytical efficiency. Therefore, accurate imputation of dropout events is essential for recovering genuine expression signals and improving the reliability of scRNA-seq studies. In this work, we propose a novel scRNA-seq data imputation method, imputation with a parallel gated recurrent unit neural network (IPGRU), based o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Steady-state attractor detection differs fundamentally between discrete Boolean network (BN) and continuous diffusion-based models because they operate on different state spaces and exhibit distinct dynamic behaviors. Here, we propose cell dynamics on energy landscape (CellLand) to systematically compare BN and diffusion-based approaches for quantifying cellular dynamics on the energy landscape, with a particular focus on attractor identification under in silico gene perturbations. Although the energy landscape provides a unifying conceptual framework, BN-based models face specific challenges,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although long-read sequencing enables comprehensive genomic analysis, its potential is hindered by its reliance on the incomplete GRCh38 reference genome. GRCh38's unresolved bases, structural errors, and haplotype mosaics introduce reference biases, leading to missed variants and false-positive calls. This limitation creates a circular dependency because benchmarks derived from GRCh38 exclude about 15% of complex genomic regions, thereby restricting the training and evaluation of state-of-the-art variant callers. The complete telomere-to-telomere (T2T-CHM13) assembly resolves these gaps and p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative analysis of fluorescence microscopy images remains a significant challenge in cytopathological assessments, as subjective interpretation and inter-observer variability hinder reproducibility and standardization of classifications. In this study, an artificial intelligence-assisted analytical framework utilizing a multimodal large language model (MLLM) was employed to classify cytotoxic responses in acridine orange/propidium iodide-stained MCF-7 cells subjected to doxorubicin treatment for 24 h. A total of 500 fluorescence images, collected from five experimental groups including a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repetitive DNA, a fundamental architectural element of genomes, is widespread across organisms and comprises about 54% of the human genome. With advances in long-read sequencing and bioinformatics approaches, highly repetitive sequences can now be characterized in depth. Nevertheless, engineering repetitive DNA is mainly limited by repeat instability. Despite these challenges, advances have been reported in the construction of short tandem repeats and the large-scale duplication of genes. This review provides a comprehensive overview of current strategies for constructing repetitive DNA, cover
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-phenome association (GPA) prediction can broaden the understanding of biological mechanisms underlying complex phenotypic traits (e.g., diseases and agronomic traits). Traditional deep matrix factorization (DMF)-based GPA methods can integrate multiple data types and uncover nonlinear associations but often rely on low-dimensional matrix representations, making it challenging to capture intricate node interactions under sparse data conditions. Existing approaches also inadequately integrate multi-omics data and frequently neglect local neighborhood (LN) and graph structural information,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has transformed the study of cellular heterogeneity by making it possible to classify individual cells and their functional states. However, the analysis remains difficult because high dropout rates lead to sparse and noisy expression data. Existing marker gene selection methods are often fragmented, typically relying on a single strategy that overlooks complementary biological signals. Without a unifying framework for denoising and marker identification, clustering can suffer in accuracy, stability, and interpretability. This makes it more difficult to d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bile acids (BAs) serve not only as key facilitators of lipid absorption but also as crucial signaling molecules regulating glucose and lipid metabolism, inflammation, and overall energy homeostasis. Aging profoundly alters BA metabolism, characterized by shifts in biosynthetic pathways, compositional changes, disrupted receptor-mediated signaling, and alterations in gut microbiota interactions. These age-related changes contribute to the onset and progression of metabolic conditions, including type 2 diabetes, obesity, metabolic dysfunction-associated fatty liver disease, and neurodegenerative
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver fibrosis is a key pathological process in the progression of chronic liver disease toward cirrhosis and liver failure. The development of liver fibrosis is closely related to a variety of etiologies, including alcoholic hepatitis, metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD), viral hepatitis, and drug-induced liver injury. Although advances in antiviral therapies for hepatitis B have contributed to a decline in its incidence, other etiologies such as MASLD and alcoholic hepatitis are becoming the main drivers for liver fibrosis. Currently, the management of liver fibr
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) is the most common cause of hepatocellular carcinoma (HCC), which is the predominant liver cancer type in Southeast Asia. Approximately 350 million individuals suffer from persistent hepatitis B infection worldwide. HBV promotes HCC development through direct and indirect mechanisms. HBV DNA integrates into the host genome during the initial stages of tumorigenesis, causing insertional mutagenesis of cancer-related genes and genomic instability. Extrachromosomal circular DNA (ecDNA) is formed, which is efficiently amplified in large quantities to express viral genes and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Noninvasive assessments play a crucial role in ruling out high-risk esophageal varices (HREV) in cirrhotic patients. However, the value of sound touch elastography (STE) in predicting HREV has not been comprehensively investigated. Therefore, this study aimed to establish prediction models based on liver and spleen stiffness measurements obtained by STE and provide assessment strategies and cutoff values tailored for different clinical situations.
METHODS: This prospective study included cirrhotic patients who underwent esophagogastroduodenoscopy (EGD). Liver and spleen s
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is a complex and heterogeneous disease characterized by various genetic and epigenetic alterations. Early diagnosis, accurate subtyping, and staging are essential for effective, personalized treatment and improved survival rates. Traditional diagnostic methods, such as biopsies, are invasive and carry operational risks that hinder repeated use, underscoring the need for noninvasive and personalized alternatives. In response, this study integrates transcriptomic data into human genome-scale metabolic models (GSMMs) to derive patient-specific flux distributions, which are then combined wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-coding RNAs (ncRNAs), encompassing microRNAs (miRNAs), long non-coding RNAs (lncRNAs), and circular RNAs (circRNAs), have emerged as critical regulators of gene expression and cellular function. In alcohol-associated liver disease (ALD), chronic alcohol consumption disrupts the expression and function of ncRNAs in the liver and circulation, contributing to the disease's pathogenesis and progression. Dysregulated ncRNAs influence key pathways involved in hepatocyte injury, lipid metabolism, inflammation, and hepatic stellate cell (HSC) activation, thereby exacerbating steatosis, inflammatio
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aging is characterized by a gradual deterioration of the physiological integrity of cells, tissues, and organs, resulting in a decrease in the body's physiological functions and an acceleration of the onset of age-related diseases, ultimately leading to death. The aging of the liver, which is a critical metabolic organ, is closely linked to various chronic liver diseases, such as hepatitis, liver fibrosis, and cirrhosis, and it exacerbates their prognosis and is a primary risk factor for their development at all stages. Therefore, a comprehensive understanding of the causes, mechanisms, and po
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Early and accurate diagnosis of the coexistence of Wilson's disease (WD) and chronic hepatitis B (CHB) presents a significant challenge for clinicians. The objective of this study was to retrospectively analyse the characteristics of such patients to improve clinical practice and provide a reference for clinical management.
METHODS: From January 2011 to December 2022, 35 patients with concurrent CHB and WD (CHB + WD group) were identified. A total of 127 patients with CHB (CHB group) and 168 patients with WD (WD group) were included in the control group between January 20
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Environmental pollutants, particularly organochlorine insecticides like endosulfan (ENDO), are increasingly linked to liver toxicity and related diseases. Despite its widespread historical use, the mechanisms underlying ENDO-induced liver damage remain poorly understood. This study aims to elucidate the cellular and molecular mechanisms of ENDO-induced hepatotoxicity.
METHODS: C57BL/6 mice were exposed to ENDO for two weeks. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) was subsequently performed on mouse livers to explore ENDO-induced hepatotoxicity at the single-cell level. Di
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular vesicles (EVs) are membrane-bound entities secreted by each cell, categorized as, exosomes, microvesicles or apoptotic bodies based on their size and biogenesis. They serve as promising vectors for drug delivery due to their capacity to carry diverse molecular signatures reflective of their cell of origin. EV research has significantly advanced since their serendipitous discovery, with recent studies focusing on their roles in various diseases and their potential for targeted therapy. In liver diseases, EVs are particularly promising for precision medicine, providing diagnostic a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.