Biallelic pathogenic variants in LAMB1 have been associated with autosomal recessive lissencephaly 5 (OMIM 615191), which is characterized b … cerebellar cystic defects, signal intensity abnormalities, and a hypoplastic corpus callosum. Trio-exome analysis revealed a homozygous in-frame deletion of Exons 23 and 24 of LAMB1 affecting 104 amino acids including the epidermal growth factor (EGF)-like units 11 and 12 in Domain III. To our knowledge, this is the first reported in-frame deletion in …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteopetrosis is a genetic condition of the skeleton characterized by increased bone density caused by osteoclast formation and function defects. Osteopetrosis is inherited in the form of autosomal dominant and autosomal recessive manner. We report autosomal recessive osteopetrosis (ARO; OMIM 611490) in a Chinese case with a history of scarce leukocytosis, vision and hearing loss, frequent seizures, and severe intellectual and motor disability. Whole-exome sequencing (WES) followed by Sanger sequencing revealed novel compound heterozygous mutations in the chloride channel 7 (CLCN7) gene [c.982…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Familial thoracic aortic aneurysms and dissections may occur as an isolated hereditary trait or as part of connective tissue disorders with Mendelian inheritance, but severe cardiovascular disease in pediatric patients is extremely rare. There is growing knowledge on pathogenic variants causing the disease; however, much of the phenotypic variability and gene-gene interactions remain to be discovered. We present a case report of a 5.5-year-old girl with an aortic aneurysm and concomitant polycystic kidney disease. Whole exome sequencing was performed, followed by family screening by amplicon d…
Клинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital dyserythropoietic anemia type II (CDA II) refers to a group of extremely rare heterozygous disorders characterized by ineffective … ocytic anemia that required transfusions every 2 to 3 weeks since birth, as well as jaundice. Whole exome sequencing revealed a novel compound heterozygosity in the SEC23B gene, thus establishing the diagnosis of CDA II. Analysis by multiple bioinformatics tools predicted that the mutant proteins were deleterious. Here, we report a novel variation in SE …
ОбзорКлинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hallux valgus is a common form of foot deformity, and genetic factors contribute substantially to the pathogenesis of hallux valgus deformity. We conducted a genetic study on the structural variants underlying familial hallux valgus using whole exome sequencing approach. Twenty individuals from five hallux valgus families and two sporadic cases were included in this study. A total of 372 copy number variations were found and passed quality control filtering. Among them, 43 were only present in cases but not in controls or healthy individuals in the database of genomic variants. The genes cover…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Grange syndrome (OMIM 602531) is characterized by a constellation of symptoms of hypertension, stenosis, or occlusion of diffe … novel homozygous frameshift variant (c.2291del; p.Pro764Leufs*12) in the YY1AP1 gene through whole-exome sequencing.
CONCLUSION: This report extends the allelic spectrum in Grange syndrome and helps provide insight into the potential role of YY1AP1 in the regulation of cellular processes.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cerebellar ataxia, mental retardation, and disequilibrium syndrome (CAMRQ) is a genetically and clinically heterogeneous disorder with four … um, diffuse white matter reduction, widespread delayed myelination and ventriculomegaly. Trio whole-exome sequencing revealed compound heterozygosity in the ATP8A2 gene consisting of a known variant c.1756C>T (p.Arg586*) inherited from the mother and a novel variant c.691_701delCTGATGAAGTT (p.Leu231fs) inherited from the father. CAMRQ type 4 has been fo …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A male infant presented with progressive paleness of the body since 3 months of age. On examination, the child had pallor, microcephaly with dysmorphic facies (depressed nasal bridge, low set ears, retrognathia, high arched palate and tongue hamartoma). Postaxial polydactyly in bilateral hands and feet, broad great toes, with syndactyly of left fourth and fifth toes were present. The haemogram showed severe anaemia with a microcytic hypochromic picture. High-performance liquid chromatography (HPLC) was normal. However, the parents' HPLC was suggestive of beta thalassaemia trait. Whole-exome se…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homozygous mutations in the triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (TREM2) gene are known to cause Nasu-Hakola disease, which is a … callosum and caudate and frontotemporal cortical atrophy, in addition to the ischemic lesion. Whole exome sequencing revealed a homozygous mutation (c.A257T; p.D86V) in TREM2. The present case expands the clinical phenotype of Nasu-Hakola disease and further suggests that TREM2 pathway might have role in vessel wall health.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using exome sequencing for biomarker discovery and precision medicine requires connecting nucleotide-level variation with functional changes in encoded proteins. However, for functionally annotating the thousands of cancer-associated missense mutations, or variants of uncertain significance (VUS), purifying variant proteins for biochemical and functional analysis is cost-prohibitive and inefficient. We describe parallel functional annotation (PFA) of large numbers of VUS using small cultures and crude extracts in 96-well plates. Using members of a histone methyltransferase family, we demonstra…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic defect in the nuclear encoded subunits of cytochrome c oxidase are very rare. To date, most deleterious variants affect the mitochondrially encoded subunits of complex IV and the nuclear genes encoded for assembly factors. A biallelic pathogenic variant in the mitochondrial complex IV subunit COX5A was previously reported in a couple of sibs with failure to thrive, lactic acidosis and pulmonary hypertension and a lethal phenotype. Here, we describe a second family with a 11-year-old girl presenting with failure to thrive, lactic acidosis, hypoglycemia and short stature. Clinical exome …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Familial partial lipodystrophy type 2 is the most well-known subtype of lipodystrophy. We describe for the first time the phenot … owed the challenge due to unable control of insulin resistance, glucose and lipid metabolism. Whole exome sequencing revealed the heterozygous mutation c.1394G>A at exon 11 of LMNA gene (p.G465D).
CONCLUSIONS: Our case displayed an atypical phenotype of FPLD2 with metabolic anomalies, not cardiovascular diseases. The difficulties of medical management …
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A boy, aged 5 years, attended the hospital due to progressive psychomotor regression for 2.5 years. Motor function regression was the main manifestation in the early stage, and brain MRI and whole-exome sequencing (WES) of the family showed no abnormalities. After the age of 4 years and 9 months, the boy developed cognitive function regression, and brain MRI showed cerebellar atrophy. The reanalysis of WES results revealed a compound heterozygous mutation, [NM_000520, c.784C>T(p.His262Tyr]), c.1412C>T(p.Pro471Leu)], in the HEXA gene. The enzyme activity detection showed a significant reduction…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dominant optic atrophy (DOA) is the most common hereditary optic neuropathy. Although DOA is caused by mutations in several genes, there are still many cases that have not been diagnosed or misdiagnosed. Herein, we present a large family of 11 patients with DOA. To identify potential pathogenic mutations, whole exome sequencing (WES) was performed on the proband, a 35-year-old woman. WES revealed a novel pathogenic mutation (c.524T>C, p.F175S) in the AFG3L2 intermembrane space domain, rather than in the ATPase domain, which is the hot mutation region associated with most of the previously repo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meniere's disease (MD) is an inner ear disorder characterised by recurrent vertigo attacks associated with sensorineural hearing loss and tinnitus. Evidence from epidemiology and Whole Exome Sequencing (WES) suggests a genetic susceptibility involving multiple genes, including α-Dystrobrevin (DTNA). Here we investigate a Drosophila model. We show that mutation, or knockdown, of the DTNA orthologue in Drosophila, Dystrobrevin (Dyb), results in defective proprioception and impaired function of Johnston's Organ (JO), the fly's equivalent of the inner ear. Dyb and another component of the dystroph…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitral valve prolapse (MVP) is a common valvular heart defect with variable outcomes. Several studies reported MVP as an underestimated cause of life-threatening arrhythmias and sudden cardiac death (SCD), mostly in young adult women. Herein, we report a clinical and genetic investigation of a family with bileaflet MVP and a history of syncopes and resuscitated sudden cardiac death. Using family based whole exome sequencing, we identified two missense variants in the SCN5A gene. A rare variant SCN5A:p.Ala572Asp and the well-known functional SCN5A:p.His558Arg polymorphism. Both variants are sha…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although tobacco use is an independent adverse prognostic feature in HPV(+) oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC), the biologic features associated with tobacco use have not been systematically investigated. We characterized genomic and immunologic features associated with tobacco use through whole exome sequencing, mRNA hybridization, and immunohistochemical staining in 47 HPV(+) OPSCC tumors. Low expression of transcripts in a T cell-inflamed gene expression profile (TGEP) was associated with tobacco use at diagnosis and lower overall and disease-free survival. Tobacco use was associ…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early-onset ataxias are often difficult to diagnose due to the genetic and phenotypic heterogeneity of patients. Whole exome sequencing (WES) is a powerful method for determining causative mutations of early-onset ataxias. We report a case in which a novel de novo KIF1A mutation was identified in a patient with ataxia, intellectual disability and mild foot deformity.A patient presented with sporadic forms of ataxia with mild foot deformity, intellectual disability, peripheral neuropathy, pyramidal signs, and orthostatic hypotension. WES was used to identify a novel de novo mutation in KIF1A, a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The C-terminal binding protein 1 (CTBP1) functions as a transcriptional corepressor in vertebrates and has been identified to have critical roles in nervous system growth and development. Pathogenic variants in the CTBP1 gene has been shown to cause hypotonia, ataxia, developmental delay and tooth enamel defect syndrome (HADDTS). There have only been 16 cases reported to date with heterozygous, pathogenic variants in CTBP1 manifesting with a neurodevelopmental phenotype. We report a further case of a pathogenic, heterozygous, de novo variant in CTBP1 identified by whole exome sequencing in a f…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recessive mutations in glutamate pyruvate transaminase 2 (GPT2) have recently been found to be associated with intellectual and developmental disability (IDD). In this study, we discovered a homozygous missense variant, NM_133443: [c.1172C > T, p. Pro391Leu], of GPT2 on chromosome 16 in a proband diagnosed with IDD through trio whole-exome sequencing (WES). The pathogenicity of the variant was further verified by bioinformatics analysis and functional studies in vitro. This autosomal recessive disease was caused by paternal uniparental disomy (UPD) which was further proven by single nucleotide…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.