BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is characterized by a prominent desmoplastic stroma, which plays a crucial role in tumor biology and treatment resistance. While the stromal compartment is a defining histopathological feature of PDAC, its prognostic significance remains incompletely understood. This study aimed to quantify the stromal content in PDAC using digital pathology and evaluate its association with patient outcomes.
METHODS: Tissue microarrays (TMAs) were constructed from resected PDAC specimens (n = 142). Digital analysis of tumor stroma percentage (TSP) was perfo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: High-grade serous carcinoma (HGSC) is the most common and aggressive subtype of ovarian cancer. Although tumour stage and complete cytoreduction are key prognostic factors, the tumour immune microenvironment also influences prognosis, with CD8+ T lymphocytes representing the main effector component.
OBJECTIVE: To evaluate the clinical relevance of quantifying intraepithelial (ieTILs) and stromal (sTILs) CD8+ tumour-infiltrating lymphocytes using digital image analysis.
MATERIAL AND METHODS: A retrospective study was conducted on 74 patients with stage III-IV HGSC treated with c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accumulation of visceral white adipose tissue leads to central obesity and is associated with insulin resistance and increased risk of metabolic disease. lncRNAs have been reported to regulate the growth and development of adipocytes, providing new clues for the prevention and treatment of obesity. In the present study, we identified numerous dysregulated lncRNAs by microarray analysis between human differentiated adipocytes and preadipocytes. In addition, we focused on the lncRNA ENST00000521141.1 (abbreviated as lncRNA521141) confirmed by qRT-PCR to be enriched in differentiated adipocytes. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The goal of this study is to investigate the expression pattern of GANAB in colorectal cancer and the role behind it.
METHODS: In order to study the expression level of GANAB in the tissue of colorectal cancer, we used quantitative real-time PCR and immunohistochemistry. In the aspect of biological function, we study it through the experimental models. The molecular mechanism is clarified by RNA pull-down and RNA stability assays. Student's t-tests and one-way ANOVA are used for data analysis.
RESULTS: Analysis of tissue microarrays and Colorectal cancer (CRC) cell lines revealed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Triple-negative breast cancer (TNBC) harbors an immunosuppressive tumor microenvironment dominated by tumor-associated macrophages (TAMs). P2RY6, a UDP-sensitive purinergic receptor, is implicated in immune modulation, but its functional role in TNBC TAMs remains elusive.
METHODS: The clinical relevance of P2RY6+ TAMs was assessed via bioinformatics, tissue microarrays, and survival analysis. In vitro, P2RY6 function in macrophage polarization, signaling, and paracrine regulation of TNBC cells was evaluated using genetic/pharmacological approaches, RNA sequencing, calcium imaging,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human papilloma virus (HPV)-related head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) incidence is rising. Despite the prognostic and therapeutic implication of HPV status, standardised detection methods are lacking. This study compared multiple HPV detection methods and evaluated the prognostic value of viral transcriptional activity in archival HNSCC tissues.
METHODS: HPV-DNA status and subtyping was determined by GP5+/GP6 + PCR. Multiplex immunohistochemistry (p16INK4) and chromogenic in-situ hybridization (CISH for E6/E7 mRNA) was performed on tissue microarrays (TMAs) from a retr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clinical utility of biomarker-based treatment depends on both analytical and clinical validity. CD20+ B-lymphocytes often form nodular lymphoid structures within tumors, presenting potential analytical issues if using tissue microarrays (TMA). We compared CD20 expression in TMAs and whole-slide sections (WS) using digital image analysis.
MATERIALS AND METHODS: Immunohistochemical CD20+ expression was assessed on 1 TMA core/patient and corresponding WS from 221 breast cancer patients. CD20+ area fractions were quantified within four spatial tissue compartments: (1) tumor epithelium
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Parkinson's disease (PD) is a complex, common neurodegenerative disorder with unclear etiology. The pathogenic hallmark is the death of dopaminergic neurons in the substantia nigra. PD diagnosis depends on clinical manifestation of symptoms but is lack of effective biomarker.
METHODS: Available human microarray-based transcriptomic datasets of the substantia nigra and blood were acquired for PD cases and controls. Robust rank aggregation and Weighted Gene Co-expression Network analysis were performed to identify gene signatures in substantia nigra and blood of PD. An overlapping a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is an aggressive cancer with 60% survival rate, high mortality, and morbidity. Leukaemia inhibitory factor (LIF) and its receptor (LIF-R) are involved in the activation of the signal transducer and activator of transcription-3 (STAT3) pathway which has central involvement in the signalling pathways involved in important pathological processes including carcinogenesis and inflammation. STAT3 and its activators have shown prognostic significance in OSCC. The aim is to evaluate the immunohistochemical (IHC) expression of LIF and LIF-R proteins in OSCC. Four tis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Both embryonic stem cells (ESCs) and the successful reprogramming of induced pluripotent stem cells (iPSCs) offer an unprecedented therapeutic potential for Parkinson's disease (PD), allowing for the replacement of depleted neurons in PD-affected brain regions, thereby achieving therapeutic goals. This study explored the differences in cell types between iPSCs and ESCs in the PD brain to provide a feasible theoretical basis for the improved use of iPSCs as a replacement for ESCs in treating PD. Signal cell RNA sequencing data and microarray data of ESCs and iPSCs were collected from the GEO da
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometrial cancer (EC) is associated with significant risk factors such as polycystic ovarian syndrome (PCOS) and sedentary behavior. In our study, we aim to employ machine learning algorithms to investigate the potential molecular processes that underlie their interaction and explore their respective roles in the diagnosis and immunotherapy of EC. The GEO database provides access to microarray data, which was utilized in this study to identify gene expression modules associated with PCOS and sedentary behavior, using weighted gene expression network analysis (WGCNA). Cluego software was then
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cerebral palsy (CP) is the most frequent cause of motor impairment in children. Although perinatal asphyxia was long considered to be the leading cause of CP, recent studies demonstrate its causation in only around one in 10 individuals with CP. Instead, genetic causes are increasingly demonstrated. We systematically performed clinical phenotyping and genetic investigations in a monocentric CP cohort, aiming to gain insight into the contribution of genetic variants in CP and its different subtypes.
METHODS: Chromosomal microarray and/or trio exome sequencing were systematically pe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dilated cardiomyopathy (DCM) is a progressive heart condition characterized by ventricular dilatation and impaired myocardial contractility with a high mortality rate. The molecular characterization of DCM has not been determined yet. Therefore, it is crucial to discover potential biomarkers and therapeutic options for DCM.
METHODS: The hub genes for the DCM were screened using Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) and three different algorithms in Cytoscape. These genes were then validated in a mouse model of doxorubicin (DOX)-induced DCM. Based on the validated hu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Women with polycystic ovarian syndrome (PCOS) have increased hypothalamic-pituitary-adrenal (HPA) axis activation, pro-inflammatory mediators, and psychological distress in response to stressors. In women with PCOS, the corticotropin-releasing hormone (CRH) induces an exaggerated HPA response, possibly mediated by one of the CRH receptors (CRHR1 or CRHR2). Both CRHR1 and CRHR2 are implicated in insulin secretion, and variants in CRHR1 and CRHR2 genes may predispose to the mental-metabolic risk for PCOS.
METHODS: We phenotyped 212 Italian families with type 2 diabetes (T2D) for PCO
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnostic puncture (amniocentesis, chorionic villus sampling, and fetal blood sampling) is an essential part of prenatal diagnostics and the only established and sufficiently scientifically evaluated possibility of diagnosing genetic diseases from pregnancy-specific cells. The number of diagnostic punctures in Germany, as in other countries, has fallen significantly. This is largely due to the introduction of first-trimester screening with further detailed ultrasound examination of the fetus and the analysis of cf-DNA (cell-free DNA) from maternal blood (noninvasive prenatal test - NIPT). On
ОбзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma is preceded by monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS). Serum markers are currently used to stratify MGUS patients into clinical risk groups. A molecular signature predicting MGUS progression has not been produced. We have explored the use of gene expression profiling to risk-stratify MGUS and developed an optimized signature based on large samples with long-term follow-up. Microarrays of plasma cell mRNA from 334 MGUS with stable disease and 40 MGUS that progressed to MM within 10 years, was used to define a molecular signature of MGUS risk. After a three-fo
Письмо в редакциюПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In a previous genome wide association study (GWAS) of UK Biobank (UKB) data, we identified one susceptibility locus, tubulointerstitial nephritis antigen (TINAG), with genome wide significance for dermatophytosis. We used genotype calls from file UKB22418. These data are derived directly from Affymetrix DNA microarrays but are missing many genotype calls. Using computationally efficient approaches, UKB has entered imputed genotypes into a second dataset, UKB22828, increasing the number of testable variants by over 100-fold to 96 million variants.
METHODS: In the current study, we
МетаанализСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To construct the lncRNA-miRNA-mRNA competing endogenous RNA (ceRNA) network based on our microarray chip data for providing new insights into the pathogenesis of autoimmune hepatitis.
METHODS: The ceRNA pairs were obtained by calculating the co-expression relationships among the differentially expressed lncRNAs (DELs), differentially expressed microRNAs (DEMis), and differentially expressed mRNAs (DEMs) with Pearson correlation analysis and hypergeometric distribution. The data of the differentially expressed genes were obtained from our previous studies in the concanavalin A-induced AI
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current studies have demonstrated that significant increased LPA levels to be observed in ascites in patients with ovarian cancer. Although several studies have shown that Lysophosphatidic acid (LPA) related to the progression of ovarian cancer, which LPA receptors (LPARs) and G-coupled protein subtypes mediated in LPA actions have not been clearly elucidated. This study aimed to clarify the roles of LPA and it is subtype-specific LPARs mediating mechanisms in ovarian cancer integrated using bioinformatic analysis and biological experimental approaches. The big data analysis shown that LPA3 wa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
B10.BR-Ydel male mice with large deletion in the male-specific region of the Y chromosome long arm (MSYq) are very useful experimental model … progeny, what was documented in our previous works. Epigenetic inheritance hypothesis was tested by microarray analysis of DNA methylation in B10.BR-Ydel and control B10.BR sperm. The assessment revealed moderate differences and allowed concluding that the mutated Y chromosome can influence traits of females from the next generation partially through altering sperm D …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.