Sex determination is exceptionally diverse and shows a high evolutionary rate in fish. European hake (Merluccius merluccius) is a species of great commercial value distributed throughout European coasts, which displays a significant sexual growth dimorphism. We present a chromosome-level genome of M. merluccius, composed of 215 contigs using long- and short-read sequencing, further scaffolded into the species' 21 chromosomes using Hi-C technique (715 Mb). RNA-seq on several tissues from pooled individuals improved annotation (26,625 protein-coding genes and 11,083 ncRNAs). Five males and 5 fem
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anorexia nervosa (AN) is a severe psychiatric disorder characterized by substantial heritability and a high mortality rate among psychiatric disorders. While cerebrospinal fluid (CSF) metabolomics has emerged as a novel approach to investigating central nervous system pathologies, its specific causal relationship with anorexia nervosa remains to be fully elucidated. Using genome-wide association study (GWAS) summary statistics for human CSF metabolites and AN information from publicly available datasets, we performed a two-sample Mendelian randomization (MR) analysis using the inverse-variance
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anorexia nervosa (AN) is a prevalent psychiatric disorder with high rates of mortality and limited treatment options. AN is a complex disorder, for which common variation contributes to disorder risk. To dissect the genetic architecture of AN, a variety of statistical methods can be applied. Many of these utilise genome-wide association study (GWAS) datasets to investigate biological mechanisms within disease progression in addition to broader associations between complex traits. GWAS for AN have revealed important biological insights, however, these have not translated into new pharmacotherap
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is a common liver condition resulting from metabolic syndrome characterized by fat accumulation in the liver. It is often associated with obesity and diabetes, contributing to hepatic steatosis in liver cells. The prevalence of NAFLD is increasing globally, with 32% of the adult population affected. Genetic modifiers, such as single nucleotide polymorphisms, can increase susceptibility to the disease. Gene expression analysis and genetic variation can help identify disease-causing pathways and reveal biomarkers involved in NAFLD. This study employed int
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human leukocyte antigen (HLA) region plays an important role in human health through its involvement in immune cell recognition and maturation. While genetic variation in the HLA region is associated with many diseases, the pleiotropic patterns of these associations have not been systematically investigated. Here, we developed a haplotype approach to investigate disease associations phenome wide for 412,181 Finnish individuals and 2,459 diseases. Across the 1,035 diseases with a genome-wide association study association, we found a 17-fold average per-SNP enrichment of hits in the HLA regi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genetic roles of protein-encoding genes in nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) susceptibility have been intensively studied, but many gaps remain including the emerging roles of long non-coding RNA. In this study, we found that NSCL/P risk-associated SNPs may have higher chances to modulate lncRNA genes than protein-coding genes. Through a multi-omics screen strategy, we identified a variant in lncPSMB1, associated with the risk of NSCL/P. We found that the rs4710839 risk C allele recruited more MYC, and increased the expression of lncPSMB1. LncPSMB1 overexpression
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-nucleotide variations (SNVs) represent vital clinical and biological information in the onset and progression of many cancers, but lacking of cost-effective, high-sensitive and reliable SNVs detection method. In this study, we propose a programmable electrochemical biosensing strategy initiated simultaneously from multi-directions by enzyme-free amplifying circuit for high-sensitivity SNVs detection. Through elaborate design, we utilized the power of conventional enzyme-free catalytic reaction to activate a multidirectional initiation self-assembly process, enabling multiple amplificati
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to explore the potential causal relationship between obesity and ankylosing spondylitis (AS) using the Mendelian randomization (MR) approach. Data were derived from a comprehensive genome-wide association study dataset. Genetic loci that demonstrated significant, independent associations with both obesity and AS in populations of European ancestry were selected as instrumental variables. Multiple MR analyses, including MR-Egger, weighted median, and inverse variance weighting, were employed to assess the causal impact of obesity on AS risk. To ensure reliability, heterogeneity,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circadian rhythms influence various physiological and behavioral processes, including sleep, metabolism, and immune response. Although key regulatory factors of biological clocks have been identified and genome-wide association studies have pinpointed some genetic variants linked to sleep traits, the genetic architecture underlying circadian rhythms remains incompletely understood.
RESULTS: Here, we introduce the circadian deviation score, a novel quantitative trait that measures circadian disruption at the molecular level. Derived from gene expression levels of thousands of circa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine leiomyomata or fibroids are highly heritable, common, and benign tumors of the uterus with poorly understood etiology. Previous GWAS have reported 72 associated genes but included limited numbers of non-European individuals. Here, we identify 11 novel genes associated with fibroids across multi-ancestry and ancestry-stratified GWAS analyses. We replicate a known fibroid GWAS gene in African ancestry individuals and estimate the SNP-based heritability of fibroids in African ancestry populations as 15.9%. Using genetically predicted gene expression and colocalization analyses, we identif
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The relationship between uterine fibroids and keloid/hypertrophic scars has been contradictory. Our research employs a bidirectional Mendelian Randomization (MR) approach to establish a clearer understanding of this potential causal link.
OBJECTIVE: This study aimed to determine the effect of uterine fibroids on keloid/hypertrophic scars and the effect of keloid/hypertrophic scars on uterine fibroids.
PURPOSE: We aimed to demonstrate the relationship between uterine fibroids and keloid/ hypertrophic scars.
METHODS: Our bidirectional MR study utilized summarized data from genome-
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Central Plains Han Chinese (CPHC) is the typical agricultural population of East Asia. Investigating the genome of the CPHC is crucial to understanding the genetic structure and adaptation of the modern humans in East Asia. Here, we perform whole genome sequencing of 492 CPHC individuals and obtained 22.65 million SNPs, 4.26 million INDELs and 41,959 SVs. We found the CPHC has a higher level of genetic diversity and the glycolipid metabolic genes show strong selection signals, e.g. LONP2, FADS2, FGF21 and SLC19A2. Ancient DNA analyses suggest that the domestication of crops, which drove th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Headaches affect up to 95% of individuals during their lifetime and are a major global cause of disability. Intracranial Aneurysm (IA) is a cerebrovascular disorder affecting approximately 3.2% of the general population. Observational studies have suggested an association between headaches and IA, but the causal relationship remains unclear. This Mendelian Randomization (MR) analysis aims to elucidate the causal relationship between headaches and IA.
METHODS: A two-sample bidirectional Mendelian Randomization (MR) analysis was performed using publicly available Genome-Wide Assoc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A plethora of studies have demonstrated that the level of uric acid (UA) and gout are the risk factors for erectile dysfunction (ED). However, the causal effect of UA level and gout on ED is still unclear. This Mendelian randomization (MR) study aims to examine the bidirectional causality between ED and UA levels as well as gout.
METHODS: We performed a bidirectional MR analysis using summary statistics from genome-wide association studies (GWAS) to investigate the causal association between ED and UA levels as well as gout. We meticulously selected single nucleotide polymorphisms
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clozapine therapy presents a risk of agranulocytosis, necessitating monitoring of white blood cell count. The detection of benign ethnic neutropenia (BEN), in which neutropenia can be present without an increased risk of infection, is particularly important in preventing unnecessary withdrawal of clozapine. BEN is strongly linked to the CC homozygote of the single nucleotide polymorphism rs2814778 in the atypical chemokine receptor-1 (ACKR1) gene.
AIMS: We introduced voluntary genetic testing for BEN in one of our clozapine clinics, with the aim of assessing the prevalence of undi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to explore the potential causal relationship between frailty and allergic diseases through bidirectional Mendelian randomization (MR) analysis. Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) were selected as instrumental variables from the genome-wide association studies summary data. The inverse variance weighted (IVW) method was used as the main analysis method, and the MR-Egger regression and weighted median method were employed to complement the IVW results. Verification of the reliability of results using multiple sensitivity analysis methods. The results of forward MR analysis r
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enteromyxosis, or emaciation disease, caused by myxosporean parasites of the Enteromyxum genus, results in significant economic losses in aquaculture, particularly affecting adult flounders. Although the pathogen has been identified, effective treatments for Enteromyxum infections remain limited. In this study, a genome-wide association study (GWAS) and genomic prediction (GP) were conducted to evaluate Enteromyxum leei resistance in a flounder population using a high-density single-nucleotide polymorphism (SNP) panel. Fish were categorized based on infection severity, and disease-related trai
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium ulcerans pseudoshottsii is a mycolactone-producing bacterium previously isolated from Striped Bass (Morone saxatilis (Walbaum)) from Chesapeake Bay and adjacent waters of the Atlantic Coast of North America. We report the first molecular detection of this pathogen in the native Gulf strain of Morone saxatilis collected from the Pearl River, Mississippi (USA). Molecular identification was conducted using a novel PCR assay targeting the parA-625 intergenic spacer of the virulence-associated pMUM plasmid. The isolate was unambiguously assigned to M. u. pseudoshottsii based on diagno
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The application of pan-genomics in understanding Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) transmission remains understudied, particularly in high-burden settings such as China. We constructed an M. tuberculosis complex pan-genome (MTB_pan) using 307 complete genomes representing all eight lineages from the National Center for Biotechnology Information (NCBI). Core and accessory genomes were analysed, lineage-associated genes were identified and functional annotations were assessed using Pfam domains. Transmission dynamics were evaluated by comparing pan-genome- and H37Rv-based approaches for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we performed an in-depth comparison of genome-sequenced Mycobacterium tuberculosis isolates from Ireland with isolates from other countries. The sequenced isolates from Ireland mostly belonged to Lineage 4 (64.15 %) with Lineages 2 (17.27 %), 1 (13.21 %), 3 (5.22 %), and 5 (0.15 %) also represented. Of these, Lineages 2 (47.57 %) and 4 (34.95 %) accounted for the majority of the isolates that were resistant to at least rifampicin. By performing hierarchical clustering of the genomes, we determined that many drug-resistant (DR) strains of Lineage 2 collected in Ireland belonged t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования