With the rapid advancements in large language model technology and the emergence of bioinformatics-specific language models (BioLMs), there is a growing need for a comprehensive analysis of the current landscape, computational characteristics, and diverse applications. This survey aims to address this need by providing a thorough review of BioLMs, focusing on their evolution, classification, and distinguishing features, alongside a detailed examination of training methodologies, datasets, and evaluation frameworks. We explore the wide-ranging applications of BioLMs in critical areas such as di
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Adeno-associated virus (AAV) is becoming an attractive vector due to its low toxicity and minimal immunogenicity. However, liver-targeted AAV gene therapy still faces challenges, such as low delivery efficiency and safety risks associated with high vector doses. Isolated hepatic perfusion (IHP) has been explored as a localized drug delivery method, yet its full potential in gene therapy remains under investigation. Here, we investigated the efficiency of AAV8 delivery via the IHP route and its preference for hepatic transduction.
METHODS: The IHP route was established thr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The critical shortage of liver transplant donors necessitates innovative solutions, with xenotransplantation emerging as a promising alternative. Despite significant ethical, scientific, and practical challenges, recent advancements in liver xenotransplantation, particularly using pigs as donors for non-human primates (NHPs), have extended graft survival duration. However, life-threatening issues such as thrombocytopenia and coagulation disorders persist, limiting survival to under a month. Advances in genetic engineering have enabled the modification of pig genomes to match the human immune s
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Estimating the transmission fitness of SARS-CoV-2 variants and understanding their evolutionary fitness trends are important for epidemiological forecasting. Existing methods are often constrained by their parametric natures and do not satisfactorily align with the observations during COVID-19. Here, we introduce a sliding-window data-driven pairwise comparison method, the differential population growth rate (DPGR) that uses viral strains as internal controls to mitigate sampling biases. DPGR is applicable in time windows in which the logarithmic ratio of two variant subpopulations is approxim
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Primary sclerosing cholangitis (PSC) is an autoimmune liver disease characterized by complex pathogenesis and limited available therapeutic options. The mechanisms underlying the development and progression of PSCs remain unclear. Liver X receptor beta (LXR-β) is recognized to modulate lipid metabolism and immune response, but its specific involvement in the PSC has not been elucidated. Here, we explored the role and mechanism of LXR-β in PSC induced by 3, 5-diethoxycarbonyl-1, 4-dihydro-2, 4, 6-collidine (DDC).
METHODS: CRISPR-Cas9 technology was applied to generate Abcb
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The liver is pivotal in protein synthesis, glucose and lipid metabolism, and detoxification. However, the liver is susceptible to both acute and chronic disorders, with chronic conditions being fatal. Chronic liver diseases (CLDs), such as liver fibrosis, which usually represents the early manifestation of cirrhosis, primarily result from hepatitis B and C viruses infections, metabolic disorders, alcohol abuse, immune-mediated attacks, and cholestatic injury. The progression of liver fibrosis contributes to the development of cirrhosis, which can further lead to hepatocellular carcinoma, porta
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Studies indicate that the gut microbiota and its metabolites are involved in the progression of cardiovascular diseases, and enterohepatic circulation plays an important role in this progression. This study aims to identify potential probiotics for the treatment of unstable angina (UA) and elucidate their mechanisms of action.
METHODS: Initially, the gut microbiota from patients with UA and control was analyzed. To directly assess the effects of Bifidobacterium supplementation, 10 patients with UA were enrolled and administered Bifidobacterium (630 mg per intake twice a d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Hepatocellular carcinoma (HCC) treatment options are limited due to the lack of effective curative therapies, and conventional chemotherapy has often demonstrated limited effectiveness and may be associated with significant toxicity. Therefore, innovative therapeutics for HCC are urgently needed. Here, we aimed to evaluate the effectiveness of microRNA (miRNA)-26a-encapsulated nanoparticles in HCC treatment.
METHODS: Span-Oleylamine-chondroitin sulfate were prepared and eighty male BALB/c mice were divided into four groups: (i) negative control group (saline injection), (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Few studies have reported hepatitis B surface antigen (HBsAg) kinetics after nucleos(t)ide analog (NA) discontinuation in patients with noncirrhotic chronic hepatitis B (CHB). The study specifically investigated long-term HBsAg kinetics after NA discontinuation.
METHODS: Between January 2014 to January 2024, this study prospectively enrolled 106 outpatients with noncirrhotic CHB who met the discontinuation criteria after NA consolidation treatment. Demographic, clinical, and laboratory data were collected and analyzed after NA discontinuation.
RESULTS: Ninety-six patients
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The onset of metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH) or non-alcoholic steatohepatitis (NASH) represents a tipping point leading to liver injury and subsequent hepatic complications in the natural progression of what is now termed metabolic dysfunction-associated steatotic liver diseases (MASLD), formerly known as non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD). With no pharmacological treatment currently available for MASH/NASH, the race is on to develop drugs targeting multiple facets of hepatic metabolism, inflammation, and pro-fibrotic events, which are major drivers of MASH. Nucl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Compared with the widely used rodents, pigs are anatomically, physiologically, and genetically more similar to humans, making them high-quality models for the study of liver diseases. Here, we review the latest research progress on pigs as a model of human liver disease, including methods for establishing them and their advantages in studying cystic fibrosis liver disease, acute liver failure, liver regeneration, non-alcoholic fatty liver disease, liver tumors, and xenotransplantation. We also emphasize the importance of genetic engineering techniques, mainly the CRISPR/Cas9 system, which has
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC), commonly known as primary liver cancer, is a major cause of malignant tumors and cancer-related deaths in China, accounting for approximately 85% of all cancer cases in the country. Several guidelines have been used to diagnose and treat liver cancer. However, these guidelines provide a broad definition for classifying advanced liver cancer, with an emphasis on a singular approach, without considering treatment options for individual patients. Therefore, it is necessary to establish a comprehensive and practical expert consensus, specifically for China, to enhan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Liver cirrhosis is a complex disease that may result in increased morbidity and mortality following bariatric surgery (BS). This study aimed to explore the outcome of BS in patients with unexpected cirrhosis, focusing on postoperative complications and the progression of liver disease.
METHODS: A retrospective study of bariatric patients with cirrhosis from four centers in China between 2016 and 2023 was conducted, with follow-up for one year after BS. The primary outcome was the safety of BS in patients with unexpected cirrhosis, while the secondary outcome was the metab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sperm development is critical for male reproductive capability; any disruption during the process of spermatogenesis will result in male infertility. In this research, we used the C-Nap1 encoded by the gene of Cep250 knockout mouse line as the model to evaluate the impact of absent C-Nap1 on spermatogenesis. To investigate the interaction between C-Nap1 and spermatogenesis, we utilized single-cell RNA sequencing to analyze 10,332 C-Nap1 +/+ and 13,308 C-Nap1 -/- testicular cells. We identified five main cell types within seminiferous tubules, including spermatogonia, Sertoli cells, spermatogon
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Kehuang (KH) capsule is an herbal medical product approved for the treatment of liver diseases, including liver injury, in China. However, the mechanism is still unclear. This study aimed to elucidate the protective effects of KH capsule against carbon tetrachloride (CCl4)-induced acute liver injury (ALI) in a murine model.
METHODS: Mice were randomly divided into control, model (CCl4), CCl4+KH_Low and CCl4+KH_High group. Liver enzyme levels and histological changes were assessed to evaluate liver injury. Oxidative stress markers and inflammatory cell infiltration in live
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Glucocorticoids are the only first-line drugs for severe alcoholic hepatitis (AH), with limited efficacy and various side effects on extrahepatic tissues. Liver-targeting glucocorticoid therapy may have multiple advantages over systemic glucocorticoid for AH. The aim of this study was to determine the role of hepatocellular glucocorticoid receptor (GR) in alcohol-associated steatosis (AS) and AH.
MATERIALS AND METHODS: AS was induced by a high-fat diet plus binge alcohol in adult male and female mice with liver-specific knockout (LKO) and heterozygote of GR. AH was induced
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Clinical data regarding patients with chronic hepatitis B (CHB) after Omicron BA.5 infection are currently limited. This study aimed to assess the clinical characteristics of patients with CHB and Omicron BA.5 infection in South China.
METHODS: This retrospective study was conducted from January to March 2023 in a cohort of 485 healthy individuals and 553 patients with CHB. Clinical features, encompassing COVID-19-related symptoms, levels of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) antibodies, vaccination status, liver functions, and virological marker
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autophagy is a highly conserved process in which cytosolic contents are degraded by the lysosome, which plays an important role in energy and nutrient balance, and protein or organelle quality control. The liver is the most important organ for metabolism. Studies to date have revealed a significant role of autophagy in the maintenance of liver homeostasis under basal and stressed conditions, and the impairment of autophagy has been closely linked to various liver diseases. Therefore, a comprehensive understanding of the roles of autophagy in liver diseases may help in the development of therap
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circadian rhythms play a central role in maintaining metabolic homeostasis and orchestrating inter-organ crosstalk. Research evidence indicates that disruption to rhythms, which occurs through shift work, chronic sleep disruption, molecular clock polymorphisms, or the consumption of alcohol or high-fat diets, can influence inflammatory status and disrupt timing between the brain and periphery or between the body and the external environment. Within the liver and gut, circadian rhythms direct the timing of glucose and lipid homeostasis, bile acid and xenobiotic metabolism, and nutrient absorpti
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcoholic liver disease (ALD) encompasses a range of conditions resulting from prolonged and excessive alcohol consumption, causing liver damage such as alcoholic fatty liver, inflammation, fibrosis, and cirrhosis. Alcohol consumption contributes to millions of deaths each year. So far, the effective treatments for ALD are limited. To date, the most effective treatment for ALD is still prevention by avoiding excessive alcohol consumption, and only few specialized medicines are in the market for the treatment of patients suffering from ALD. Small molecules targeting various pathways implicated
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.