Background: Microarray testing is commonly used as a screening method for phenotypic traits and common diseases and for genome-wide association studies (GWASs). Despite the known limitations, microarray services can potentially be used as a prescreening tool for chromosomal disorders, which affect approximately 0.4-0.6% of the world population, followed by further clinical diagnostic methods when appropriate. Case Presentation: Here we present a case study of a male subject in his 40s who underwent direct-to-consumer (DTC) genetic testing that utilized microarray, which revealed the absence of
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromosomal abnormalities involving the sex chromosomes constitute critical genetic factors influencing fertility in horses. Nevertheless, a substantial proportion of individuals carrying sex chromosomal abnormalities exhibit normal reproductive phenotypes, which complicates their identification until adulthood. Here, we present four mares carrying a complex deletion/translocation rearrangement with the karyotype formula 64, X, del(X)(p∼25), t(X; Y)(p∼25; q∼15). The cases analyzed belong to three unrelated families of Pura Raza Española (PRE), all presenting the same chromosomal abnormality. T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrent pregnancy loss (RPL) is characterized by two or more consecutive pregnancy losses, often associated with genetic, immunological, endocrine, and anatomical abnormalities. Among these, chromosomal abnormalities, including aneuploidies and submicroscopic copy number variations (CNVs), play a critical role in adverse pregnancy outcomes. A total of 125 fetal specimens were collected, of which 118 were included after applying predefined exclusion criteria. DNA isolated from products of conception and fetal tissues was subjected to quantitative fluorescent PCR (QF-PCR) for rapid aneuploidy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extranodal natural killer/T-cell lymphoma (ENKTL) is rare, and treatment options for relapsed/refractory (R/R) disease are limited. This multicenter, single-arm phase 2 study evaluated the efficacy and safety of atezolizumab monotherapy in patients with R/R ENKTL. The primary end point was objective response rate (ORR), as assessed by an independent review committee (IRC). Fourteen patients were ultimately enrolled. Among the 13 with evaluable responses, the median age was 72 years (range, 27-80), 46% were female, and 77% had an Eastern Cooperative Oncology Group performance status of 1. The I
СтатьяКлиническое исследование II фазыМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial drug resistance is an escalating global health burden, often driven by multiple genetic changes within key resistance-associated genes. Achieving multiplex capability of mutation detection while maintaining simplicity and affordability is critical, particularly in point-of-care and resource-limited settings. Here, we introduce a strategy for multi-site mutation detection using single isothermal amplification of a nucleic acid fragment spanning multiple mutations in the rifampicin resistance-determining region (RRDR) of the rpoB gene, encompassing codons 516 and 526 in Mycobacteri
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Pediatric thyroid cancers are rare, with papillary thyroid carcinoma (PTC) being the most common type. The diffuse sclerosing variant (DSV) is a rarer subtype associated with frequent recurrence and extensive lymphatic involvement. Among 51 pediatric patients treated for thyroid carcinoma at our tertiary center over a 20-year period, three were diagnosed with DSV-PTC. We present this retrospective case series to highlight its clinical course and diagnostic challenges.
CASE PRESENTATION: Three patients (aged 8-17) presented with neck swelling; one also exhibited high fever and neck
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Approximately 1% of chronic lymphocytic leukemia (CLL) cases harbor a translocation juxtaposing the immunoglobulin heavy chain (IGH) and B-cell lymphoma 3 (BCL3) loci. Aiming at comprehensive molecular characterization of IGH::BCL3-positive B-cell neoplasms, we here investigated samples from 84 patients using fluorescence in situ hybridization (FISH), whole-genome and targeted sequencing, and DNA methylation analyses. Junctional sequences obtained in 27 patients showed breakpoints upstream of BCL3 in all CLL cases. IGH breaks were presumably driven by aberrant class-switch recombination in 26/
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: PMP22 duplications cause Charcot-Marie-Tooth disease (CMT), whereas PMP22 deletion results in hereditary neuropathy with liability to pressure palsies (HNPP). Although PMP22 point mutations can cause a spectrum of neuropathies, including hereditary motor and sensory neuropathy (HMSN) I, congenital hypomyelinating neuropathy, HMSN III, and HNPP, they are rare, and their features in Japanese patients have not been well characterized. Therefore, we compared the genetic, clinical, and electrophysiological characteristics of patients with PMP22 point mutations.
METHODS: This multicente
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: MECOM rearrangements (MECOM-r) are high-risk events in myeloid neoplasms often cryptic or incompletely characterized by conventional karyotype analysis. We used optical genome mapping (OGM) to define the frequency and spectrum of MECOM-r in an unselected, consecutively collected cohort of individuals with high-grade myeloid neoplasms (HGMNs) and compared these findings with standard cytogenetic approaches.
METHODS: A total of 252 HGMN specimens, including 224 with definitive diagnoses of acute myeloid leukemia, were processed over a 2-year period using OGM, G-banded karyotyping an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleoporin 98 rearrangements (NUP98r) are recurrent in myeloid neoplasms and are subtype-defining for acute myeloid leukemia (AML) in the World Health Organization Classification 5th edition (WHO5) and the International Consensus Classification (ICC). Identification of NUP98r is essential given the frequency of treatment resistance and possibility of sensitivity to targeted therapies. However, NUP98r is often cryptic on karyotype and has over 40 described partners. Therefore, it is underdiagnosed in the absence of dedicated testing that is not always routine practice, e.g., RNA-based next gen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salivary duct carcinoma (SDC) is primarily categorized as de novo (SDCDN) or ex pleomorphic adenoma (SDCXPA). The incidence of HMGA2 and PLAG1 fusion genes has been suggested to be higher in SDCXPA than in SDCDN. Surgical resection remains the main intervention due to limited guidance on new treatment strategies. However, frequent recurrence and challenging management of metastasis highlight the necessity for innovative treatments. This study aimed to investigate SDC characteristics, including perineural invasion (PNI), and elucidate its carcinogenic mechanisms and adverse prognostic factors.
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An aerobic methanotroph was isolated from a biofilm of coal mine Gruve 7 (Svalbard) and designated strain G7T. Cells of strain G7T were Gram-stain-negative, pink-pigmented and motile rods. Strain G7T could grow at pH 6.8 and at temperatures ranging from 4 to 21 °C. The genome size was 4.00 Mb with a (digital) DNA G+C content of 47.7 mol%. Strain G7T represents a member of the family Methylomonadaceae of the class Gammaproteobacteria. It displayed 94.6-99.7% 16S rRNA gene sequence similarity to the type strains of the genus Methylobacter. Whole-genome comparisons based on average nucleotide ide
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pregnancy loss (PL), particularly early pregnancy loss (EPL), is a prevalent reproductive complication, with approximately 15% of confirmed pregnancies affected. Chromosomal abnormalities are implicated in more than half of EPLs, with trisomies being the most prevalent. Partial abnormalities, including segmental deletions, duplications, and unbalanced translocations, are detected in up to 10% of EPL cases. This study focuses on the precise characterization of partial chromosomal abnormalities, previously identified by Quantitative fluorescent polymerase chain reaction (QF-PCR) and multiplex li
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The aim of this study was to investigate the detection capability of medium-coverage whole-genome sequencing for chromosomal mosaicism in prenatal diagnosis, and to evaluate the pregnancy outcome of mosaicism. METHODS: Thirty-four prenatal samples with chromosomal mosaicism diagnosed by chromosomal microarray analysis with single nucleotide polymorphism (CMA/SNP) were included and subsequently subjected to chromosome analysis by medium-coverage whole-genome sequencing (CMA-seq) for back-to-back comparison. The results of karyotyping or fluorescence in situ hybridization (FISH) were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Duplications occurring upstream of the SOX9 gene have been identified in a limited subset of patients with 46,XX testicular/ovotesticular differences/disorders of sex development (DSD). However, comprehensive understanding regarding their clinical presentation and diagnosis is limited.
OBJECTIVE: To gain further insight into the diagnosis of a large cohort of 46,XX individuals with duplications upstream of SOX9.
METHODS: We retrospectively analyzed data of 46,XX/SRY-negative individuals with SOX9 upstream duplications. Clinical data were recorded, and genetic etiologies were investi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: BCR::ABL1+ fusion is associated with chronic myelogenous leukemia and precursor B acute lymphoblastic leukemia. Though rare, there has been continued reporting of acute myeloid leukemia (AML) with BCR::ABL1+ fusion. We report two such cases.
CASE PRESENTATIONS: The first is a 38-year-old male, who has been human immunodeficiency virus positive since 2004, with leukocytosis and numerous circulating blasts that showed evidence of a BCR::ABL1+ fusion rearrangement in the 91% of the cells analyzed via fluorescence in situ hybridization. He responded well to tyrosine kinase inhibitor
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Providencia, as an opportunistic pathogen, can cause serious infections and increasingly poses a life-threatening risk to public health. Carbapenems were initially considered effective agents conquering such infectious; however, the emergence of carbapenem-resistant Providencia strains has been attributed to the rapid spread of carbapenemase genes. In this study, we first reported a uniquely blaNDM-1 genetic structure that can evolve 'circular DNA'. Among 901 carbapenem-resistant Enterobacteriaceae strains examined, only one P. huaxiensis strain was identified using VITEK MS, 16S rRNA sequenci
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anticoagulant rodenticides (ARs) are used globally to manage pest rodent populations. However, resistance to ARs in target rodent populations challenges pest control efforts and can increase risks to nontarget species. Resistance is frequently associated with nonsynonymous single nucleotide polymorphisms (nsSNPs) in the Vkorc1 gene, and this study carried out the first Vkorc1 survey of introduced rats on the Australian mainland.
RESULTS: We identified three species of introduced rat using the cytochrome b gene across Brisbane, Melbourne, Perth and Sydney: Rattus rattus (Linnaeus 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Adenoid cystic carcinoma (AdCC) of the Bartholin's gland (AdCC-BG) is a very rare gynecologic vulvar malignancy. AdCC-BGs are slow-growing but locally aggressive and are associated with high recurrence rates. Here we sought to characterize the molecular underpinning of AdCC-BGs.
METHODS: AdCC-BGs (n = 6) were subjected to a combination of RNA-sequencing, targeted DNA-sequencing, reverse-transcription PCR, fluorescence in situ hybridization (FISH) and MYB immunohistochemistry (IHC). Clinicopathologic variables, somatic mutations, copy number alterations and chimeric transcripts were
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Loss of heterozygosity in chromosome 9p21, common in urothelial carcinoma (UC), typically involves deletion of CDKN2A and MTAP genes. MTAP loss is emerging as a promising therapeutic target and predictive biomarker in UC. This single-centrre retrospective study examined the incidence of CDKN2A deletions and MTAP loss in muscle-invasive bladder cancer (MIBC) and metastatic urothelial carcinoma (mUC), investigating their correlations with clinical, pathological, and genomic features, as well as patient outcomes.
METHODS: Fluorescence in situ hybridization (FISH) and immunohistochemistry (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования