UNLABELLED: The accurate and timely detection of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) and non-tuberculous mycobacteria (NTM) remains a diagnostic challenge, particularly in extrapulmonary samples and low-resource settings. This study aimed to evaluate and compare the clinical performance of three commercial real-time polymerase chain reaction (PCR) assays, VIASURE M. tuberculosis complex + non-tuberculous mycobacteria Real-Time PCR Detection Kit ("Viasure"), Mycobacterium Multiplex Nucleic Acid Diagnostic Kit ("Sansure"), and Anyplex MTB/NTMe Real-Time Detection ("Seegene"), against conve…
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tuberculosis (TB) is the leading infectious killer and about a quarter of the world's population is estimated to have latent TB … d 35 patients suffering from active TB. Quantification of microRNA expression levels was done using real-time polymerase chain reaction (PCR). The diagnostic accuracy of this microRNA signature was determined through ROC curve analysis. The applied statistical methods were ANOVA, post hoc testing, and correlation analysis.
RESULTS: The three-microRNA signature showed graded express …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid diagnosis is vital for patients with sepsis. Therefore, this study was conducted to assess the diagnostic performance of rapid Real-Time PCR (rRT-PCR), which detects 32 pathogens and common resistance genes in whole blood within four hours. This study included 160 adult patients with sepsis. Whole-blood samples and BCs were collected from all patients simultaneously, and causative microorganisms were investigated using an rRT-PCR panel and an automated BC system. The panel was also used to detect common resistance genes. The microorganisms most frequently isolated from the BCs were Staph
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study compared cPCR and qPCR for Helicobacter pylori detection in 302 gastric biopsies and correlated the findings with gastric diseases. qPCR detected more positive cases, mainly among healthy individuals. Despite significant discordance (p < 0.001), both methods showed substantial agreement (κ = 0.75), confirming the reliability of qPCR and its diagnostic equivalence to cPCR.
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV), a major cause of acute febrile illness and joint pain, remains a significant public health threat in tropical regions. Rapid and accurate detection is essential for timely clinical management and outbreak control, particularly in resource-limited settings where real-time PCR (RT-qPCR) is often impractical. We developed and validated a SHERLOCK assay coupled with recombinase polymerase amplification for CHIKV RNA detection. Analytical performance was assessed by determining the limit of detection (LOD), cross-reactivity, clinical sensitivity and specificity, and predi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Due to limited documentation on vector-borne pathogens of companion animals in Namibia, a country-wide, multi-site field study was conducted to estimate the prevalence of these pathogens in domestic dogs.
METHODS: Samples of whole blood and serum from 375 dogs in 15 towns across eight regions were analysed. Vector-borne pathogens were screened by light microscopic examination of blood smears, point-of-care serology, and quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR). Haematology and serum biochemistry analyses were also performed.
RESULTS: Collectively, the SNAP® 4Dx® Pl…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Lung cancer, predominantly lung adenocarcinoma, remains a major health challenge in Indonesia, with late-stage detection being common. This study explores the use of quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) for assessing ALK rearrangement from smear samples, a significant shift towards less invasive diagnostic methods, by assessing its concordance with immunohistochemistry (IHC) in detecting Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK) rearrangements in lung adenocarcinoma patients.
MATERIALS AND METHODS: This observational cross-sectional study analyzed 175 lung adenocarc…
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Lower respiratory tract infections (LRTIs), including bronchitis and pneumonia, are common pediatric conditions. Accurate and timely pathogen identification is essential in this population, with targeted next-generation sequencing (tNGS) significantly improving detection rates. This study aimed to systematically assess the clinical utility of tNGS in identifying pathogens in pediatric LRTIs.
METHODS: A retrospective analysis of 107 pediatric patients with lower respiratory tract infections (LRTIs) was conducted between January 2024 and December 2024. The concordance of tNGS, quant
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: This study aimed to evaluate the survival of airborne viruses in exhaled particles produced during voluntary coughing by participants infected with respiratory viruses.
METHODS: We utilized a novel technique, recruiting patients with diverse respiratory infections and performing real-time polymerase chain reaction (rt-PCR) and culture analyses. Respiratory particles were aged in an airborne state to reach equilibrium with ambient relative humidity following cough in 13 participants who presented to hospital with PCR-positive respiratory viral infections.
FINDINGS: Nasopharyngeal swab rt…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Schistosoma sp. transmission is linked to water bodies, poor sanitation, and the presence of intermediate hosts. Nevertheless, parasite detection in snails is hampered by challenges in snail sampling and low infection rates, mainly in moderate and low-endemic areas, as well as requiring specialized personnel and being time-consuming. Thus, there is a need to improve tools to assist schistosomiasis surveillance and an environmental DNA (eDNA) approach may help to overcome these limitations. Here, we standardized and used an eDNA-based approach to monitor Schistosoma mansoni occurren
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related macular degeneration (AMD) is a neurodegenerative retinal disorder that typically emerges later in life and is the primary cause of central visual loss. The microtubule-associated protein Tau (MAPT) gene produces six significant splice variants in neural cells, which are differentiated by the exclusion or inclusion of exon 10, resulting in expression of 3R and 4R isoforms. Changes in Tau expression and the ratio of 4R-3R isoforms have been observed in various neurodegenerative diseases; however, the expression of Tau mRNA in AMD remains unexplored. This study represents the first i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pneumocystis jirovecii pneumonia (PCP) is an opportunistic infection in immunocompromised patients, with a complex diagnosis due to its colonizing role. Current guidelines recommend microbiological confirmation through direct microscopy of lower respiratory tract samples, 1,3-β-D-glucan (BDG) serum testing, or RT-PCR detection in lower respiratory samples. However, non-invasive diagnostic alternatives, such as oral wash RT-PCR combined with BDG serum levels, could be an option for non-intubated and non-candidates to bronchoscopy patients in a real clinical setting. A retrospective study analys
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The extent to which commercially available nucleic acid extraction platforms impact the magnitude of Cytomegalovirus (CMV) DNA loads measured in plasma specimens by 1st WHO standard-normalized real-time PCR assays is uncertain.
METHODS: This retrospective study compares the performance of Abbott m2000sp, Qiagen QIAsymphony SP, and KingFisher Flex platforms using plasma samples from allogeneic hematopoietic stem cell transplant recipients and plasma spiked with the CMV AD169 strain. The Abbott RealTime CMV PCR assay was used for CMV DNA quantitation.
RESULTS: Maximum differences
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastrointestinal (GI) cytomegalovirus (CMV) infection is an important cause of morbidity after solid organ transplantation (SOT), and diagnosis mainly relies on histopathology of GI tissue biopsies. CMV detection by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) on tissue biopsy is not routinely performed, but potentially holds many practical advantages.
METHODS: We compared the performance of CMV qPCR on fresh GI biopsies to histopathologic identification for the detection of CMV GI disease.
RESULTS: Sixty-one SOT patients with GI symptoms underwent endoscopic assessment, with ti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: In developing countries like Vietnam, childhood diarrhea remains frequent and is often treated empirically without an etiological diagnosis.
METHODOLOGY: Patients aged under five years, hospitalized at a gastroenterology department with acute diarrhea, were recruited at one hospital. Enteric pathogens were tested by real-time PCR.
RESULTS: 451 children with diarrhea were included, 65.2% were male. 56.3% were aged under 12 months. Upon inclusion, 49.7% (224/451) had nausea and vomiting, and 17.5% had bloody diarrhea. 27.1% of children had a fever, and 37.7% and 4.2% had moderate
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Periodontitis is a multifactorial disease that affects a wide range of populations. However, its pathogenesis remains unclear. mi … val crevicular fluid samples collected after diagnosis to assess miRNA-214 and -223 by quantitative real-time polymerase chain reaction assay.
RESULTS: ROC curve analyses for the non-smoker periodontitis group showed that miR-214 as a predictor in comparison to miR-223 had higher sensitivity [92.86%-64.29%], same specificity [100%], and a significantly higher area under the curve [ …
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To evaluate the performance of simultaneous amplification and testing (SAT) assay for the detection of group B Streptococcus (GBS) in maternal vaginal and perianal swabs compared with real-time polymerase chain reaction (RT-PCR).
METHODS: We obtained vaginal and perianal swabs from 1474 pregnant women at the Obstetrics and Gynecology Hospital of Fudan University (Shanghai, China) between April 2023 and June 2023. Vaginal and perianal swabs were collected at 35-37 weeks of gestation. Swabs were tested for GBS simultaneously by using the SAT assay and RT-PCR, and a comparative analy…
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Polymorphisms of Plasmodium falciparum chloroquine resistance transporter (pfcrt), Plasmodium falciparum multi-drug resistance 1 (pfmdr1) and Plasmodium falciparum kelch 13-propeller (pfk13) genes are accepted as valid molecular markers of quinoline antimalarials and artemisinins. This study investigated the distribution patterns of these genes in P. falciparum isolates from the areas along the Thai-Myanmar border during the two different periods of antimalarial usage in Thailand.
RESULTS: Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) were used to d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma pneumoniae is a significant pathogen responsible for community-acquired pneumonia, predominantly affecting children and adolescents. Here, we devised a rapid method for M. pneumoniae that combined multiple cross displacement amplification (MCDA) with real-time fluorescence technology. A set of ten primers, which were specifically designed for M. pneumoniae detection, were employed in a real-time fluorescence MCDA reaction. Of these, one primer incorporated a restriction endonuclease recognition sequence, a fluorophore, and a quencher, facilitating real-time fluorescence detection. T
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The mechanism leading to the development of immunoglobulin A nephropathy (IgAN) remains to be completely understood. Endothelin-1 (ET-1) as well as angiotensin II (AngII) promote glomerular injury, tubulointerstitial inflammation and fibrosis leading to chronic kidney disease. Sparsentan, a dual endothelin angiotensin receptor antagonist, recently received accelerated approval in the USA for the reduction of proteinuria in adults with IgAN at high risk of disease progression. To elucidate the mechanisms by which sparsentan is efficacious in IgAN, we examined the effect of treatment
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.