OBJECTIVE: To analyse the expression profiles of serum exosome tRFs/tiRNAs and to explore their diagnostic value in tuberculosis (TB) activity.
METHODS: The serum exosome tRF/tiRNA profile was analysed using high-throughput sequencing technology in 5 active tuberculosis (ATB) patients, 5 latent tuberculosis infection (LTBI) patients and 5 healthy controls (HCs). Then, serum exosome tRFs/tiRNAs were validated by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR), and their diagnostic value was evaluated by receiver operating characteristic curve (ROC) and area under the curve (AUC). Fi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Next-generation sequencing (NGS) is a promising diagnostic tool for pathogens diagnosis. The aim of this study is to evaluate the application of NGS-based antimicrobial therapy on clinical outcomes in severe community-acquired pneumonia (SCAP) patients with empiric antimicrobial therapy failure.
METHODOLOGY: We performed a multi-center, retrospective cohort of SCAP patients with initial empiric therapy failure. Propensity score (PS) matching was used to obtain balance among the baseline variables in NGS group (n = 82) and conventional group (n = 82). We compared the diagnostic per
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human papillomavirus (HPV)-associated head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC), particularly oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC), is an increasingly prevalent pathology worldwide, especially in developed countries. For diagnosing HPV in HNSCC, the combination of p16 immunohistochemistry (IHC) and polymerase chain reaction (PCR) offers high sensitivity and specificity, with p16 IHC being a reliable initial screen and PCR confirming HPV presence. Advanced techniques like next-generation sequencing (NGS) and RNA-based assays provide detailed insights but are primarily used in resea
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aimed to understand the clinical characteristics of pulmonary abscess caused by Streptococcus constellatus infection.
METHODS: The clinical manifestations, laboratory examination, drug sensitivity, chest CT manifestations, and treatment and prognosis of patients with pulmonary abscess caused by Streptococcus constellatus infection were retrospectively collected and analyzed.
RESULTS: A total of 9 cases of pulmonary abscess caused by Streptococcus constellatus infection were confirmed; one case was confirmed by traditional cultures, while metagenomic next-generation seq
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Telomerase reverse transcriptase promoter (TERTp) mutations are frequently targeted tumor markers, however, they reside in regions with high GC content, which poses challenges when examined with simple molecular techniques or even with next-generation sequencing (NGS). In bladder cancer (BC), TERTp mutations are particularly frequent, however, none of the available tools have demonstrated efficacy in detecting TERTp mutations via a simple noninvasive technique. Therefore, we developed a novel PCR-based method for the detection of the two most common TERTp mutations and demonstrated its use for
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carcinosarcoma (CS) is an uncommon and clinically aggressive malignancy. The objective of the present study was to characterize the molecular features of CS at various anatomic locations, including serous effusions. Specimens (n = 32) consisted of 25 biopsies/surgical resection specimens and 7 serous effusions (6 peritoneal, 1 pleural) from 25 patients. Fresh-frozen cell pellets and surgical specimens underwent targeted next-generation sequencing covering 50 unique genes. A total of 31 mutations were found in 25 of the 32 tumors studied, of which 1 had 3 mutations, 4 had 2 different mutations,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the mechanism of Xianglian Huazhuo formula (, XLHZ) blocking the development of chronic atrophic gastritis (CAG) to gastric cancer (GC) through bioinformatics analysis and in vitro.
METHODS: Pathological morphology of gastric mucosa of rats were observed. High-throughput sequencing was used to analyze the miRNA expression profile of gastric mucosa. The miRanda, miRDB and miRWalk databases were used to predict the differential target genes. Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) enrichment analysis were performed for differential target gene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protozoan parasite Trypanosoma brucei evades clearance by the host immune system through antigenic variation of its dense variant surface glycoprotein (VSG) coat, periodically 'switching' expression of the VSG using a large genomic repertoire of VSG-encoding genes1-6. Recent studies of antigenic variation in vivo have focused near exclusively on parasites in the bloodstream6-8, but research has shown that many, if not most, parasites reside in the interstitial spaces of tissues9-13. We sought to explore the dynamics of antigenic variation in extravascular parasite populations using VSG-seq
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the clinicopathological, immunohistochemical, and molecular features of primary leptomeningeal melanocytic neoplasms (LMNs). Twelve LMN cases were retrospectively reviewed. We performed Fluorescence in-situ hybridization (including a 4-probe FISH assay with CDKN2A and MYC assay) and Next-Generation sequencing analyses on available cases. Histologically, 2 tumours were classified as melanocytomas (MC), 2 as intermediate-grade melanocytomas (IMC), and 8 as leptomeningeal melanomas (LMM). Two rare cases of LMM were associated with large plaque-like blue nevus. One MC case
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to explore the diagnostic value of novel technique-targeted next-generation sequencing (tNGS) of bronchoalveolar lavage fluid (BALF) in pulmonary mycobacterial infections.
METHODS: This retrospective study was conducted on patients who underwent bronchoscopy and tNGS, smear microscopy, and mycobacterial culture of BALF. Patients with positive Mycobacterium tuberculosis (MTB) culture or GeneXpert results were classified into the tuberculosis case group. Those diagnosed with nontuberculous mycobacteria (NTM)-pulmonary disease (NTM-PD) composed the case group of NTM-P
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although previous studies have reported the dysregulation of respiratory tract microbiota in infectious diseases, insufficient data exist regarding respiratory microbiota imbalances in the lower respiratory tracts of children with pulmonary tuberculosis (PTB). In this study, we assessed the value of mNGS in the pathogen diagnosis and microbiome analysis of PTB patients using bronchoalveolar lavage fluid (BALF) samples.
METHODS: A total of 64 participants, comprising 43 pediatric PTB and 21 pediatric pneumonia patients were recruited in the present study. BALF samples were collecte
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Next-generation sequencing (NGS) of plasma cell-free DNA identifies driver mutations in advanced non-small cell lung cancer (NSCLC) and may complement routine molecular evaluation. The utility of liquid NGS at the start of tumour workup is undetermined.
METHODS: This is a randomised study of patients with suspected advanced NSCLC. All patients received blood liquid NGS testing at their first clinic visit and underwent standard histological diagnosis and tissue genotyping, encompassing polymerase chain reaction based methods for EGFR mutation, immunohistochemical (IHC) staining for
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: In the monotherapy arms of the phase 2 JADE study (ClinicalTrials.gov Identifier: NCT03361956) evaluating the safety and efficacy of JNJ-56136379 (capsid assembly modulator-class E) with/without nucleos(t)ide analogue (NA), viral breakthroughs (VBT) were observed, leading to JNJ-56136379 monotherapy discontinuation. We present the viral sequencing analysis of JNJ-56136379±NA-treated hepatitis B virus (HBV)-infected patients.
METHODS: The HBV full genome was sequenced using next generation sequencing. Baseline amino acid (aa) polymorphisms were defined as changes versus the
Клиническое исследование II фазыСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A drug for urinary tract infections may also treat Balamuthia mandrillaris.
Клинический случайНовостьПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The detection of ROS1 and ALK rearrangements is performed for advanced-stage non-small cell lung cancer. Several techniques can be used on cytological samples, such as immunocytochemistry (ICC), fluorescence in situ hybridization (FISH) and, more recently, next-generation sequencing (NGS), which is gradually becoming the gold standard. We performed a retrospective study to compare ALK and ROS1 rearrangement results from immunocytochemistry, FISH and NGS methods from 131 cytological samples. Compared to NGS, the sensitivity and specificity of ICC were 0.79 and 0.91, respectively, for ALK, and 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gallbladder Cancer (GBC) is one of the most common cancers of the biliary tract and the third commonest gastrointestinal (GI) malignancy worldwide. The disease is characterized by the late presentation and poor outcome despite treatment, and hence, newer therapies and targets need to be identified.
METHODS: The current study investigated various functionally enriched pathways in GBC pathogenesis involving the genes identified through Next Generation Sequencing (NGS) in a hospital-based cohort. The Pathway enrichment analysis and Gene Ontology (GO) were carried out after NGS, follo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The screening of the BCR::ABL1 kinase domain (KD) mutation has become a routine analysis in case of warning/failure for chronic myeloid leukemia (CML) and B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (ALL) Philadelphia (Ph)-positive patients. In this study, we present a novel DNA-based next-generation sequencing (NGS) methodology for KD ABL1 mutation detection and monitoring with a 1.0E-4 sensitivity. This approach was validated with a well-stablished RNA-based nested NGS method. The correlation of both techniques for the quantification of ABL1 mutations was high (Pearson r = 0.858, p < 0.001
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although the role of HER2 amplification and its evaluation methods are well known in breast carcinoma, methods for detection of HER2 amplification in non-small cell lung carcinoma are unclear. Next-generation sequencing is widely used in searching multiple therapeutic targets, and it is possible to evaluate copy number variation of genes by next-generation sequencing.
AIMS: To re-evaluate the HER2 status of non-small cell lung carcinoma cases detected as HER2 amplified and non-amplified by next-generation sequencing via the most commonly used HER2 investigation methods in routine
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnosis of salivary gland neoplasms is often challenging due to their high morphological diversity and overlaps. Several recurrent molecular alterations have been described recently, which can serve as powerful diagnostic tools and potential therapeutic targets (e.g. NTRK or RET fusions). However, current sequential molecular testing can be expensive and time consuming. In order to facilitate the diagnosis of salivary gland neoplasms, we designed an all-in-one RNA-based next generation sequencing panel suitable for the detection of mutations, fusions and gene expression levels (including NR4
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To elucidate the molecular cause in a well-characterized cohort of patients with Congenital Hypothyroidism (CH) and Dyshormonogenesis (DH) by using targeted next-generation sequencing (TNGS).
STUDY DESIGN: We studied 19 well-characterized patients diagnosed with CH and DH by targeted NGS including genes involved in thyroid hormone production. The pathogenicity of novel mutations was assessed based on in silico prediction tool results, functional studies when possible, variant location in important protein domains, and a review of the recent literature.
RESULTS: TNGS with variant p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования