We describe a diagnostic workflow integrating deep intronic and RNA sequencing to resolve genetically unsolved Pompe cases. A five-year-old girl with hypertrophic cardiomyopathy, muscle weakness, recurrent respiratory tract infections, elevated CK levels, and low alpha-glucosidase enzyme activity was referred to the metabolism department. Genetic tests for Pompe disease, conducted by two different genetic laboratories, failed to detect any mutation. Two years later, the patient was referred for further genetic testing. As the third-step genetic test in our diagnostic algorithm, following exoni
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Members of the TRIM E3 ligase family are effectors of the host innate or intrinsic defense against various viruses; however, how specific TRIM proteins antagonize coronavirus infection is still largely elusive. Through an RNAi screen targeting 71 human TRIM genes, we identified multiple TRIM proteins with antiviral or proviral activity against SARS-CoV-2. TRIM32 potently restricted SARS-CoV-2 replication in a RING E3 ligase-dependent but interferon-independent manner. Mechanistically, TRIM32 binds to and SUMOylates the 3'-to-5' exoribonuclease (ExoN) of NSP14, which is essential for SARS-CoV-2
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biallelic rare pathogenic loss-of-function (LOF) variants in lipoprotein lipase (LPL) cause familial chylomicronemia syndrome (FCS). Heterozygosity for these same variants is associated with a highly variable plasma triglyceride (TG) phenotype ranging from normal to severe hypertriglyceridemia (HTG), with longitudinal variation in phenotype severity seen often in a given carrier. Here, we provide an updated overview of genetic variation in LPL in the context of HTG, with a focus on disease-causing and/or disease-associated variants. We provide a curated list of 300 disease-causing variants dis
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Traditional serological methods often struggle with the accurate identification of rare or complex blood groups. This study addresses the challenges in diagnosing clinically difficult blood groups by employing genotyping and sequencing techniques to enhance blood supply accuracy. Two patients with challenging blood groups underwent serological testing and molecular diagnostics using fluorescent PCR typing and Sanger sequencing. Patient 1 showed a discrepancy in serological typing, indicating a B subgroup confirmed by a B/O\*1 genotype and a 721C>T mutation in the ABO gene Exon 7, establishing
СтатьяКлинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Haploinsufficiency of the PAX6 gene causes aniridia, a congenital eye disorder characterised by the absence or malformation of the iris and … r the functional analysis of splicing variants in the PAX6 gene. This system covers all PAX6 coding exons and allows the analysis of any exon and most intronic variants of PAX6. Our comprehensive approach, employing fragment analysis and deep targeted sequencing, enabled us to accurately characterise 38 previously described PAX6 variants, including chal …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MYH2-associated myopathy is a group of congenital heterogeneous diseases. Case reports with MYH2-associated myopathy due to compound heterozygous mutations are rare. We report a 63-year-old Asian female who presented with bilateral ptosis and limb weakness for over 10 years. The orbits magnetic resonance imaging showed no abnormalities. Muscle biopsy revealed characteristics consistent with congenital neuromuscular disease with uniform type 1 fibers. Genetic testing identified compound heterozygous mutations in the MYH2 gene: a heterozygous mutation in exon 30, c.4066G>T (chr17:10430037, p.E13
СтатьяКлинический случайОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurotrophic tyrosine receptor kinase (NTRK) fusions are infrequent genetic events that can occur in various tumor types. Specifically, NTRK-rearranged sarcoma has been observed in pediatric mesenchymal tumors and, to a lesser extent, in adult mesenchymal tumors like fibrosarcoma. Recently, NTRK-rearranged uterine sarcoma (US) has been identified as a rare entity characterized by constitutive activation or overexpression of the TRK receptor, which plays a role in cell proliferation and differentiation. Since its initial description in 2018, only 46 cases of NTRK-rearranged US have been reporte
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory myofibroblastic tumor (IMT) is a rare soft tissue tumor primarily occurring in the abdominopelvic region of young patients, and it is characterized by spindle-shaped myofibroblasts, or fibroblasts surrounded by inflammatory infiltrate. Herein, we report a case of a 24-year-old male with a firm submucosal mass in the anterior right vocal fold diagnosed as an IMT that recurred 14 months later. The tumor demonstrated a novel THBS1::ALK fusion containing Exons 1-7 of the thrombospondin 1 (THBS1) gene fused to Exon 19 of the anaplastic lymphoma kinase (ALK) gene via next-generation seq…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in TRIO, encoding the guanine nucleotide exchange factor, are associated with two distinct neurodevelopmental delay phenotypes: gain-of-function missense mutations within the spectrin repeats are causative for a severe developmental delay with macrocephaly (MIM: 618825), whereas loss-of-function missense variants in the GEF1 domain and truncating variants throughout the gene lead to a milder developmental delay and microcephaly (MIM: 617061). In three affected family members with mild intellectual disability/NDD and microcephaly, we detected a novel heterozygous TRIO varian
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drugs that target pre-mRNA splicing hold great therapeutic potential, but the quantitative understanding of how these drugs work is limited. Here we introduce mechanistically interpretable quantitative models for the sequence-specific and concentration-dependent behavior of splice-modifying drugs. Using massively parallel splicing assays, RNA-seq experiments, and precision dose-response curves, we obtain quantitative models for two small-molecule drugs, risdiplam and branaplam, developed for treating spinal muscular atrophy. The results quantitatively characterize the specificities of risdipla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary cutaneous gamma delta T-cell lymphoma (PCGDTCL) is a rare type of non-Hodgkin lymphoma accounting for <1% of primary cutaneous T-cell lymphomas. The exact cause of PCGDTCL is not known, however, it is thought that chronic antigen exposure in the skin may lead to immune dysregulation at the site, resulting in abnormal proliferation of mature, post-thymic cytotoxic gamma delta T cells. Mutations are the most common genetic alteration seen in PCGDTCL, while structural abnormalities such as gene fusions are not common. We report a case of PCGDTCL with atypical immunophenotypic features, in
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
hnRNPDL is a ribonucleoprotein (RNP) involved in transcription and RNA-processing that hosts missense mutations causing limb-girdle muscular dystrophy D3 (LGMD D3). Mammalian-specific alternative splicing (AS) renders three natural isoforms, hnRNPDL-2 being predominant in humans. We present the cryo-electron microscopy structure of full-length hnRNPDL-2 amyloid fibrils, which are stable, non-toxic, and bind nucleic acids. The high-resolution amyloid core consists of a single Gly/Tyr-rich and highly hydrophilic filament containing internal water channels. The RNA binding domains are located as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Certain classes of genetic variation still escape detection in clinical sequencing analysis. One such class is retroelement insertion, which has been reported as a cause of Mendelian diseases and may offer unique therapeutic implications. Here, we conducted retroelement profiling on whole-genome sequencing data from a cohort of 237 individuals with ataxia telangiectasia (A-T). We found 15 individuals carrying retroelement insertions in ATM, all but one of which integrated in noncoding regions. Systematic functional characterization via RNA sequencing, RT-PCR, and/or minigene splicing assays sh
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Joubert syndrome (JBTS) is characterized by a magnetic resonance imaging appearance called 'molar tooth sign', neonatal breathing dysregulation and hypotonia, and developmental delay. Whole-exome analysis based on short-read sequencing has often contributed to the identification of causative single-nucleotide variants in patients clinically diagnosed with JBTS. However, ~10% of them are still undiagnosed even though a single possible pathogenic variant has been identified. We report a successful identification of biallelic variants using long-read whole-genome sequencing and haplotype phasing
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Warburg micro syndrome (WARBM) is a rare, autosomal recessive, neurodevelopmental disorder characterized by microcephaly, cortical dysplasia, corpus callosum hypoplasia, congenital hypotonia leading to subsequent spastic quadriplegia, severe developmental delay and hypogenitalism. Ophthalmologic findings that may affect any ocular segment including characteristic, small, atonic pupils. WARBM is known to be caused by biallelic, pathogenic variants in at least five genes although additional genetic loci may exist. The RAB3GAP1 c.748 + 1G>A, p.Asp250CysfsTer24 founder variant has been described i
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: We present the first cases of two male brothers with Leydig cell hypoplasia secondary to a novel mutation in the LHCGR gene that has never been described before.
CASE PRESENTATION: We report the case of two brothers with Leydig cell hypoplasia (LCH) type II caused by novel homozygous inactivating mutation of the LHCGR gene, located in exon 10 in c 947 position. The two patients presented at 11 years 7 months and 1 year 6 months, respectively, with abnormal sexual development, micropenis and cryptorchidism. Genetic analysis revealed a homozygous deletion of approximately 4 bp encom
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uniparental disomy (UPD) is a rare genetic event caused by errors during gametogenesis and fertilization leading to two copies of a chromosome or chromosomal region inherited from one parent. MixUPD is one type of UPD that contains isodisomic and heterodisomic parts because of meiotic recombination. Using whole-exome sequencing (WES), we identified the first case of ichthyosis due to a maternal mixUPD on chromosome 17, which results in a homozygous deletion of partial intron 8 to exon 10 in ALOX12B, being predicted to lead to an internal protein deletion of 97 amino acids. We also performed a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cranioectodermal dysplasia (CED) is rare heterogeneous condition. It belongs to a group of disorders defined as ciliopathies and is associated with defective cilia function and structure. To date six genes have been associated with CED. Here we describe a 4-year-old male CED patient whose features include dolichocephaly, multi-suture craniosynostosis, epicanthus, frontal bossing, narrow thorax, limb shortening, and brachydactyly. The patient presented early-onset chronic kidney disease and was transplanted at the age of 2 years and 5 months. At the age of 3.5 years a retinal degeneration was d
Клинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudohypoparathyroidism type 1a (PHP1a) is a genetic disorder caused by heterozygous loss-of-function mutations on the maternal allele of the GNAS gene. Patients with PHP1a predominantly exhibit parathyroid hormone (PTH) resistance and physical features of Albright's hereditary osteodystrophy. We report two unrelated cases with PHP1a who developed tertiary hyperparathyroidism (HPT). Molecular analyses of the GNAS gene identified a previously known heterozygous 4-bp deletion (c. 565_568delGACT) in exon 7 in case 1 and a novel heterozygous missense mutation (p.Lys233Glu) in exon 9 in case 2. Bo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Philadelphia-negative myeloproliferative neoplasms (MPNs) are a group of hematopoietic stem cell disorders that include polycythemia vera (PV), essential thrombocythemia (ET), and primary myelofibrosis (PMF). This study examines the driver mutations among patients with MPNs in Kuwait.
PATIENTS AND METHODS: This study was a retrospective review of 942 MPN cases with a driver mutation from July 2007 to June 2019 to examine their demographic, clinical, and laboratory attributes.
RESULTS: The annual incidence of MPNs is 1.6 per 100,000 persons, and ET is the most common subtype. The
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования