The purpose of this study was to screen for reduced susceptibility against imipenem and the presence of the New Delhi metallo-β-lactamase-1 (NDM-1) gene in a collection of Enterobacteriaceae (Escherichia coli, Shigella spp. and Klebsiella pneumoniae) from different surveillance studies between 2003 and 2010 at the International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh. None of the E. coli (n = 1789) and Shigella spp. (n = 90) isolated between 2009 and 2010 from stool samples was resistant or had intermediate susceptibility to imipenem. Among 127 extended-spectrum β-lactamase-producin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A total of 720 Vibrio cholerae O1 strains were recovered for investigation from an outbreak of cholera in South Africa between November 2008 and April 2009.
METHODS: Strains were characterized by serotype testing. Antimicrobial susceptibility testing. Genetic diversity of 248 strains was investigated using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) analysis. Extended characterization was performed on 90 strains. Molecular analysis included: polymerase chain reaction (PCR) identification of ctxA and tcpA genes, sequencing the ctxAB gene, and investigation of molecular mechanisms confe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intracellular pathogens are differentially sensed by the compartmentalized host immune system. Nevertheless, gene expression studies of infected cells commonly average the immune responses, neglecting the precise pathogen localization. To overcome this limitation, we dissected the transcriptional immune response to Shigella flexneri across different infection stages in bulk and single cells. This identified six distinct transcriptional profiles characterizing the dynamic, multilayered host response in both bystander and infected cells. These profiles were regulated by external and internal dan
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic and arsenic (As) contaminations are worldwide public health problems. Previously, the bacterial ABC-type efflux protein MacAB reportedly conferred resistance to macrolide-type antibiotics but not to other metal(loid)s. In this study, the roles of MacAB for the co-resistance of different antibiotics and several metal(loid)s were analyzed in Agrobacterium tumefaciens 5A, a strain resistant to arsenite [As(III)] and several types of antibiotics. The macA and macB genes were cotranscribed, and macB was deleted in A. tumefaciens 5A and heterologously expressed in Escherichia coli AW3110
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori, a leading human pathogen associated with duodenal ulcer and gastric cancer, presents a significant threat to human health due to increasing antibiotic resistance rates. This study investigates G-quadruplexes (G4s), which are non-canonical secondary structures form in G-rich regions within the H. pylori genome. Extensive research on G4s in eukaryotes has revealed their role in epigenetically regulating cellular processes like gene transcription, DNA replication, and oncogene expression. However, understanding of G4-mediated gene regulation in other organisms, especially bac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinosyns are a group of macrolide insecticides produced by Saccharopolyspora spinosa. Although S. spinosa can be used for industrial-scale production of spinosyns, this might suffer from several limitations, mainly related to its long growth cycle, low fermentation biomass, and inefficient utilization of starch. It is crucial to generate a robust strain for further spinosyn production and the development of spinosyn derivatives. A BAC vector, containing the whole biosynthetic gene cluster for spinosyn (74 kb) and the elements required for conjugal transfer and site-specific integration, was i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Latent tuberculosis infection is attributed in part to the existence of Mycobacterium tuberculosis in a persistent non-replicating dormant state that is associated with tolerance to host defence mechanisms and antibiotics. We have recently reported that vitamin C treatment of M. tuberculosis triggers the rapid development of bacterial dormancy. Temporal genome-wide transcriptome analysis has revealed that vitamin C-induced dormancy is associated with a large-scale modulation of gene expression in M. tuberculosis.
RESULTS: An updated transcriptional regulatory network of M.tubercul
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The hypervirulent ST-17 clone of Group B Streptococcus (GBS) is a leading cause of neonatal invasive meningitis. The link between GBS biofilm formation and the ST-17 lineage is established, and the inhibition of GBS biofilm formation by CsrR involves the regulation of adhesins. However, the specific adhesins involved in biofilm formation in ST-17 GBS strains are unknown.
HYPOTHESIS/GAP STATEMENT: CsrR inhibits biofilm formation of ST-17 GBS through the regulation of specific adhesins.
AIMS: To identify the adhesins contributing to biofilm formation in the ST-17 lineage.
METHOD
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metronidazole-resistant Bacteroides fragilis (B. fragilis) have been reported worldwide. Several mechanisms contribute to B. fragilis resistance to metronidazole. In some cases, the mechanisms of metronidazole resistance are unknown. Understanding the mechanisms of resistance is important for therapy, the design of new alternative drugs, and control of resistant strains. In this study, a comprehensive review of the B. fragilis resistance mechanisms to metronidazole was prepared. The rate of metronidazole-resistant B. fragilis has been reported as ranging from 0.5% to 7.8% in many surveys. Acco
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Low-energy shock waves (LESWs) are known to alter cell-membrane permeability. This study aimed to investigate the effect of LESWs on Escherichia coli and E. coli-induced cystitis in rats.
MAIN METHODS: Standardized suspensions of E. coli ATCC25922 were treated with or without LESWs (100 or 300 pulses; 0.12 mJ/mm2; 2 pulses/s) followed by bacterial counting, an antibiotic sensitivity test, and gene ontology analysis and gene-set enrichment analysis. Intravesical administration of saline or E. coli (0.5 mL with 108 CFU/mL) for 30 min was performed in female Sprague-Dawley rats. The rats w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: MicroRNAs (miRNAs) are short, non-coding RNAs that regulate gene expression at the post-transcriptional level and play a key role in the control of innate and adaptive immune responses. For a subclinical infection such as bovine streptococcal mastitis, early detection is a great challenge, and miRNA profiling could potentially assist in the diagnosis and contribute to the understanding of the pathogenicity and defense mechanisms. We have examined the miRNA repertoire and the transcript level of six key immune genes [tumor necrosis factor alpha (TNFα), interleukin-1 beta (IL-1β), in
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7 (O157) is a major foodborne pathogen that causes severe illness in humans worldwide. The genome of O157 contains 177 genomic islands known as O islands (OIs), including Shiga toxin-converting phages (OI-45 and OI-93) and the locus for enterocyte effacement (LEE) pathogenicity island (OI-148). However, most genes in OIs are uncharacterized and code for unknown functions. In this study, we demonstrated, for the first time, that OI-9 encodes a novel transcriptional activator, Z0346 (named OvrB), which is required for bacterial adherence to host ce
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The arylalkylamine N-acetyltransferase (AA-NAT) gene is strongly expressed in the rat primarily in the pineal gland; low levels of expression are also found in the retina. AA-NAT catalyzes the key regulatory step controlling rhythmic melatonin output: the acetylation of serotonin. In the rat, the AA-NAT gene is expressed at night. This is controlled partly by cyclic AMP (cAMP) acting through a composite cAMP-responsive element-CCAAT site located upstream of the transcription start point. In the present study, we have extended our previous in vitro findings and found that additional elements in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Erythritol, a sugar alcohol, has been reported to suppress the in vitro growth of Staphylococcus pseudintermedius and Staphylococcus coagulans.
OBJECTIVES: To determine whether erythritol suppresses the growth of Staphylococcus hyicus, a major pathogen causing porcine exudative epidermitis, and to investigate the molecular mechanisms involved in erythritol-induced S. hyicus growth suppression.
MATERIALS AND METHODS: An in vitro turbidity assay was performed to assess the effect of erythritol on the growth of 26 S. hyicus strains, including a reference strain JCM 2423 and the 25 w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB) is currently the number one killer among infectious diseases worldwide. Lipids are abundant molecules during the infectious cycle of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) and studies better mimicking its actual metabolic state during pathogenesis are needed. Though most studies have focused on the mycobacterial lipid metabolism under standard culture conditions, little is known about the transcriptome of Mtb in a lipid environment. Here we determined the transcriptome of Mtb H37Rv in a lipid-rich environment (cholesterol and fatty acid) under aerobic and hypoxic conditions, using
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing occurrence of multidrug resistant tuberculosis exerts a major burden on treatment of this infectious disease. Thioridazine, previously used as a neuroleptic, is active against extensively drug resistant tuberculosis when added to other second- and third-line antibiotics. By quantitatively studying the proteome of thioridazine-treated Mycobacterium tuberculosis, we discovered the differential abundance of several proteins that are involved in the maintenance of the cell-envelope permeability barrier. By assessing the accumulation of fluorescent dyes in mycobacterial cells over ti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Avermectin and milbemycin are important 16-membered macrolides that have been widely used as pesticides in agriculture. However, the wide use of these pesticides inevitably causes serious drug resistance, it is therefore imperative to develop new avermectin and milbemycin analogs. The biosynthetic gene clusters of avermectin and milbemycin have been identified and the biosynthetic pathways have been elucidated. Combinatorial biosynthesis by domain swap provides an efficient strategy to generate chemical diversity according to the module polyketide synthase (PKS) assembly line.
RES
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemicals production by engineered microorganisms often requires induction of target gene expression at an appropriate cell density to reduce conflict with cell growth. The lux system in Vibrio fischeri is a well-characterized model for cell density-dependent regulation of gene expression termed quorum sensing (QS). However, there are currently no reports for application of the lux system to microbial chemical production. Here, we constructed a synthetic lux system as a tunable cell density sensor-regulator using a synthetic lux promoter and a positive feedback loop in Escherichia coli. In thi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regulation of gene expression ensures an organism responds to stimuli and undergoes proper development. Although the regulatory networks in bacteria have been investigated in model microorganisms, nearly nothing is known about the evolution and plasticity of these networks in obligate, intracellular bacteria. The phylum Chlamydiae contains a vast array of host-associated microbes, including several human pathogens. The Chlamydiae are unique among obligate, intracellular bacteria as they undergo a complex biphasic developmental cycle in which large swaths of genes are temporally regulated. Coup
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.