TSGA10 has recently been highlighted as an important factor in spermatogenesis with critical roles during sperm maturation. Although up-regulation of TSGA10 expression in early stages and its down-regulation in advanced stages of some cancers has already been demonstrated, the regulatory mechanism governing its expression has not yet been elucidated. RHOXF1 transcription factor is known to be a cancer/testis antigen with vital roles in spermatogenesis. Besides, both RHOXF1 and TSGA10 are cancer/testis antigens that are involved in the carcinogenic processes. Given that RHOXF1 is a transcriptio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colorectal cancer (CRC) progression involves complex gene regulatory interactions, yet conventional analyses often overlook genes that, while not canonical drivers, may contribute to network-level instability. In this study, we propose a dynamic computational framework that integrates time-series co-expression networks with an autoregressive neural network and local network entropy (ARNN-LNE) to quantify perturbation-induced changes in gene regulatory stability. Rather than relying on static correlation patterns, this framework evaluates how in silico perturbations influence network entropy to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are small single-stranded RNAs belonging to a class of non-coding RNAs with an average length of 18-22 nucleotides. Although not able to encode any protein, miRNAs are vastly studied and found to play role in various human physiologic as well as pathological conditions. A huge number of miRNAs have been identified in human cells whose expression is straightly regulated with crucial biological functions, while this number is constantly increasing. miRNAs are particularly studied in cancers, where they either can act with oncogenic function (oncomiRs) or tumor-suppressors role
СтатьяОбзорОтозванная публикацияПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Papillary thyroid carcinoma (PTC), which is the most common endocrine malignancy, has been steadily increasing worldwide in incidence over the years, while mechanisms underlying the pathogenesis and diagnostic for PTC are incomplete. The purpose of this study is to identify potential biomarkers for diagnosis of PTC, and provide new insights into pathogenesis of PTC.
METHODS: Based on weighted gene co-expression network analysis, Robust Rank Aggregation, functional annotation, GSEA and DNA methylation, were employed for investigating potential biomarkers for diagnosis of PTC.
RESU
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mounting evidence has shown that long noncoding RNAs (lncRNAs) can function as competing endogenous RNAs (ceRNAs) in distinct physiological and pathological states. The activation of hepatic stellate cells (HSCs) is a critical event in the development of hepatic fibrosis (HF). LncRNAs have recently been revealed to be involved in HSC activation as ceRNAs. CeRNA analysis tremendously expands the functional information of proteins, DNA and coding and noncoding RNA. In addition, many validated ceRNA networks, including the traditional ceRNA/mRNA/miRNA, participate in the initiation and progress o
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BC) encompasses heterogeneous pathologies with different subtypes exhibiting distinct molecular changes, including those related to DNA methylation. However, the role of these changes in mediating BC heterogeneity is poorly understood. Lowly methylated regions (LMRs), non-CpG island loci that usually contain transcription factor (TF) binding sites, have been suggested to act as regulatory elements that define cellular identity. In this study, we aimed to identify the key subtype-specific TFs that may lead to LMR generation and shape the BC methylome and transcription program. We
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs are a class of small, non-coding RNAs that can negatively regulate protein-coding genes, and are associated with almost all known physiological and pathological processes, especially cancer. The number of studies documenting miRNA expression patterns in malignancy continues to expand rapidly, with continuously gained critical information regarding how aberrantly expressed miRNAs may contribute to carcinogenesis. miRNAs can influence cancer pathogenesis, playing a potential role as either oncogenes or tumour suppressors. Recently, several miRNAs have been reported to exert different r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Normal tissue in a tumor-bearing organ shows morphological and molecular differences from normal tissue in a tumor-free organ. One explanation to this is that tumors actively instruct adjacent normal tissues to support growth and invasion. The aim of this study was to examine if changes in gene-expression patterns in tumor-adjacent histologically benign prostate tissue, termed tumor instructed normal tissue (TINT), were associated with tumor proximity, grade and molecular subtype and, furthermore, whether they could indicate the presence of high-grade cancer elsewhere in the prosta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tumor-associated macrophages (TAMs), a pivotal component of the tumor microenvironment (TME), play an important role in the development and progression of colorectal cancer (CRC). However, the function of macrophage-related genes (MRGs) in CRC remains poorly understood. This research examined the role of MRGs in CRC. METHODS: MRGs were identified by integrating the gene set that exhibited differential expression between tumor and non-tumor tissues in CRC with the gene set associated with TAMs identified by CIBERSORT. To establish a prognostic signature specifically related to TAMs,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transient receptor potential (TRP) channels regulate Ca2+ homeostasis and tumor malignant phenotypes, whereas their prognostic relevance and therapeutic implications in glioblastoma (GBM) remain poorly characterized.
METHODS: We curated a comprehensive compendium of 522 TRP-related genes from MSigDB, KEGG, and GeneCards. Differential expression analysis across clinical variables in The Cancer Genome Atlas Glioblastoma cohort (TCGA-GBM; n = 529) identified 193 TRP-associated genes significantly linked to patient outcomes. Using univariate Cox regression followed by LASSO-Cox regula
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic, epigenetic, and transcriptomic analyses have stratified medulloblastoma (MB) into four canonical subgroups of Wingless Type (WNT), Sonic Hedgehog (SHH), and Group 3 and Group 4, with distinct patient profiles and prognoses. Recent classification strategies have also considered combining Group 3 and Group 4 tumors into a Non-WNT/Non-SHH subgroup to account for biological overlap and heterogeneity. Using high-dimensional gene expression data from 487 pediatric and young adult patients and over twenty-one thousand transcripts, this study explores which genes can improve prognostic accura
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Differentiated thyroid cancer generally has a favorable prognosis; however, the cure rate remains low for patients with metastatic or undifferentiated thyroid cancer. Moreover, this group of patients exhibits diverse responses to different treatments. To address this, single- cell RNA sequencing (scRNA-seq) offers an unbiased approach to reveal the heterogeneity within and between tumor cells. Using, scRNA-seq, we aimed to explore the intricate ecosystem of thyroid cancer, potentially providing novel insights into clinical cancer staging and treatment strategies.
METHODS: We con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: A third of melanomas originate from benign melanocytic nevi, representing a transition between distinct stages of melanocytic neoplasia. To gain insight into the transcriptional and microenvironmental changes accompanying this transition, we used spatially resolved, transcriptome-wide analysis combined with imaging mass cytometry on nevus-associated melanomas. The transcriptional alterations were multifaceted, broadly spanning three principal processes: increased proliferation coupled with metabolic adaptation, enrichment of melanocytic lineage-associated programs, and remodeling o
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Extrahepatic cholangiocarcinoma (eCCA) is characterized by marked molecular heterogeneity and limited therapeutic options. MicroRNAs (miRNAs) are key post-transcriptional regulators of cancer-related pathways, but their contribution to tumor adaptation in physiologically relevant models remains poorly understood. Three-dimensional (3D) tumor spheroids better mimic in vivo conditions than conventional two-dimensional (2D) cultures.
METHODS: We compared miRNA expression profiles in two eCCA cell lines (Sk-ChA-1 and Mz-ChA-1) grown as monolayers (2D) or multicellular tumor spheroids
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer heterogeneity limits the precision of current prognostic and therapeutic strategies, underscoring the need for molecular frameworks that capture underlying metabolic drivers. Here, we systematically dissected the landscape of amino acid metabolism (AAM) in breast cancer through integrated bulk and single‑cell transcriptomics, machine learning, in silico knockout, and computational drug screening. From 379 AAM-related genes, we identified 48 survival‑associated AAM genes, which were genomically altered in 53% of patients. Unsupervised consensus clustering defined three stable subt
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) is the most common renal carcinoma subtype. Aging-related genes (ARGs) are implicated in ccRCC progression, though their mechanisms remain unclear. This study aimed to elucidate the molecular mechanisms of ARGs in ccRCC and identify potential prognostic biomarkers and therapeutic targets. Transcriptomic data from the cancer genome atlas (TCGA-ccRCC) cohort were analyzed. differentially expressed genes and ARGs were intersected to identify candidate genes. Prognostic ARGs were then screened using machine learning algorithms. A risk model was constructed a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer (BC) is a heterogeneous malignancy with diverse molecular subtypes and variable clinical outcomes. Despite diagnostic and therapeutic advances, recurrence and metastasis contribute to poor prognosis in subsets of patients. Regulators of G protein signaling (RGS) proteins, negative modulators of G protein-coupled receptor (GPCR) pathways, influence tumor progression, but their expression profiles, genomic alterations, immune associations, and prognostic roles in BC remain incompletely understood. This study systematically investigated the RGS family to identify potenti
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteosarcoma (OSA) is the most common malignant bone tumor in dogs and serves as a translational model for human pediatric OSA due to shared molecular features. This aggressive and metastatic cancer exhibits significant heterogeneity, which has limited therapeutic advances. Spatial transcriptomics offers a powerful method to investigate intratumoral complexity and the tumor microenvironment. In this study, we used the 10x Genomics Visium platform to profile spatial gene expression in 14 fresh-frozen canine OSA (cOSA) tumor samples from 11 dogs, including primary, metastatic, and recurrent tumo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteosarcoma is the malignant bone neoplasm affecting pediatric and adolescent with unsatisfactory five-year survival. Dysregulated phospholipid metabolism is crucial for membrane integrity, signaling, and energy homeostasis, contributinga range of cancers' progression. Nevertheless, itsrolein osteosarcoma persists uncertain. The investigation aims to identify phospholipid metabolism-related signature genes for osteosarcoma and evaluate their prognostic value and therapeutic potential.
METHODS: The data curated from the TARGET and GEO databases. Differential expression analysis, L
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MALAT1 is a long non-coding RNA (lncRNA) with altered expression in many cancers but poorly studied in B-cell neoplasms like mantle cell lymphoma (MCL), a very aggressive B-cell lymphoma. To elucidate the role of MALAT1 in MCL we have investigated its expression in 219 primary tumors using microarray data. We also analyzed the expression of its natural antisense transcript (TALAM1), which is key for the processing of MALAT1 RNA to its active isoform. High expression of MALAT1/TALAM1 lncRNAs was consistently linked to favorable clinical behavior in MCL, independently of other alterations previo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования