Molecular methods in clinical and research applications frequently encounter complex mixtures of human and microbial DNA, sometimes alongside environmental or reagent contaminants. In metagenomic studies, the presence of host contamination poses a significant challenge, reducing the assay sensitivity of microbial detection and characterization. Different host-depletion and microbial enrichment platforms have been developed to reduce or eliminate host DNA in samples predominantly composed of human DNA. To establish an effective method to assess the efficacy of host DNA depletion or microbial en
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Precise data on quantitative kinetics of blood feeding of fleas, particularly immediately after contact with the host, are essential for understanding dynamics of flea-borne disease transmission and for evaluating flea control strategies. Standard methods used are inadequate for studies that simulate early events after real-life flea access to the host.
METHODS: Here, we developed a novel quantitative polymerase chain reaction targeting mammalian DNA within fleas to quantify blood consumption with high sensitivity and specificity. We used primers and fluorescent probes that amplif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant viruses cause significant damage to crops, yet research on them remains limited, leading to an underestimation of plant viral diversity. This study constructed an up-to-date atlas of plant viruses by integrating data from public databases and further established the Plant Virus Database (PVD, freely available at http://computationalbiology.cn/PlantVirusBase/#/) for storing and organizing these viruses. The PVD contained 3,353 virus species and 9,010 virus-plant host interactions, more than double the amounts reported in previous studies. Among these, 1,986 viruses are capable of infectin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
African cichlids are model systems for evolutionary studies and host-parasite interactions, because of their adaptive radiations and because they harbour many species of monogenean parasites with high host-specificity. Five locations were sampled in southern Lake Victoria: gill-infecting monogeneans were surveyed from 18 cichlid species belonging to this radiation superflock and two others representing two older and distantly related lineages. We found one species of Gyrodactylidae, Gyrodactylus sturmbaueri Vanhove, Snoeks, Volckaert & Huyse, 2011, and seven species of Dactylogyridae. Four are
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophages that lyse Salmonella enterica are potential tools to target and control Salmonella infections. Investigating the host range of Salmonella phages is a key to understand their impact on bacterial ecology, coevolution and inform their use in intervention strategies. Virus-host infection networks have been used to characterize the "predator-prey" interactions between phages and bacteria and provide insights into host range and specificity. Here, we characterize the target-range and infection profiles of 13 Salmonella phage clones against a diverse set of 141 Salmonella strains. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prophage 919TP is widely distributed among Vibrio cholera and is induced to produce free φ919TP phage particles. However, the interactions b … ion in V. cholerae. The developed approach assists in the identification of genetic determinants of host specificity and is used to explore the molecular mechanism underlying phage-host interactions. Our findings contribute to the understanding of prophage-facilitated horizontal gene transfer and emphasize the potential for developing new strategies to optimize th …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We studied patterns of ectoparasite species turnover and pairwise ectoparasite-host interactions across space and time in fleas and mites harboured by small mammals using a novel metric, zeta diversity (similarity between multiple communities). We asked whether the zeta diversity of parasites and their interactions with hosts follow a similar spatial or temporal trend. We found substantial differences in some (zeta decline and retention rate) but not in other (zeta decay) spatial patterns of zeta diversity between species and interactions, whereas the differences between the patterns of the te
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interactions of holoplanktonic mollusks with symbionts and parasites are poorly known. We investigated the ecology of infection (prevalence, intensity, and abundance) in Firoloida desmarestia, caught during two sampling campaign sessions in 2012, off the Baja California Peninsula, Mexico (IMECOCAL, 83 stations) and a coastal research center near La Sorpresa Beach, Baja California Sur, in the Gulf of California (14 stations). Only females of F. desmarestia were parasitized. Hemiuroidea parthenita rediae infected 1% of F. desmarestia population at IMECOCAL, whereas young unencysted metacercariae
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Non-sputum tests are needed to improve tuberculosis (TB) diagnosis and close the diagnostic gap. The World Health Organization's target product profile (TPP) for point-of-care (POC) screening tests requires a minimum sensitivity of 90% and a specificity of 70%. Our objective was to identify host blood protein biomarkers meeting TPP criteria. A systematic review was conducted and reported following PRISMA guidelines. Data extraction and quality assessment with Quality Assessment of Diagnostic Accuracy Studies-2 (QUADAS-2) were completed for the included studies. Heterogeneity was as
Систематический обзорСтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cysteine proteases of the protozoan parasite Entamoeba histolytica are key virulence factors involved in overcoming host defences. These proteases are cathepsin-like enzymes with a cathepsin-L like structure, but cathepsin-B substrate specificity. In the host intestine, amoeba cysteine proteases cleave colonic mucins and degrade secretory immunoglobulin (Ig) A and IgG rendering them ineffective. They also act on epithelial tight junctions and degrade the extracellular matrix to promote Cell death. They are involved in the destruction of red blood cells and the evasion of neutrophils and macrop
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little is known regarding the diversity, distribution or host-parasite associations of Trypanosoma spp. in Australian wildlife. Here we repo … revealed considerable parasite diversity with no clear geographical distribution and no evidence of host specificity. In general, it appears that Australian Trypanosoma spp. are widespread, with several genotypes appearing in multiple host species and in varied locations including both mainland areas and offshore islands. Some host species were found to be suscept …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Blood-based gene signatures offer potential as a near point-of-care tuberculosis (TB) screening tool. We examined the accuracy of the GeneXpert MTB Host Response (Xpert-HR) cartridge to screen for TB in children.
METHODS: We enrolled children under 15 years from The Gambia and Uganda being evaluated for pulmonary TB. Each child provided a blood sample for Xpert-HR and underwent standard TB assessments, including chest X-ray (CXR) and sputum Xpert Ultra testing, followed by National Institutes of Health (NIH) case classification of Confirmed, Unconfirmed, or Unlikely TB. We measure
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integration of morphological and molecular approaches to species delineation has become an essential part of digenean trematode taxonomy, particularly when delimiting cryptic species. Here, we use an integrated approach to distinguish and describe two morphologically cryptic species of Hysterolecitha Linton, 1910 (Trematoda: Lecithasteridae) from fishes of Moreton Bay, Queensland, Australia. Morphological analyses of Hysterolecitha specimens from six fish species demonstrated a complete overlap in morphometric data with no reliable differences in their gross morphological characters that sugge
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Samples of Myxobolus lentisuturalis were found in the gallbladder of Carassius auratus in Chongqing, China, without obvious disease symptoms, which were different from samples reported in Hubei, China, and Italy which were described as highly pathogenic muscle-infecting species. In order to improve our understanding of the relationships between these different samples, we analyzed geography, DNA sequence data, and site specificity. The results indicated that (1) the genetic relationship between Chongqing and Italy samples of M. lentisuturalis was much closer than relationship between each of t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epidemiology of infectious causes of meningitis in sub-Saharan Africa is not well understood, and a common cause of meningitis in this region, Mycobacterium tuberculosis (TB), is notoriously hard to diagnose. Here we show that integrating cerebrospinal fluid (CSF) metagenomic next-generation sequencing (mNGS) with a host gene expression-based machine learning classifier (MLC) enhances diagnostic accuracy for TB meningitis (TBM) and its mimics. 368 HIV-infected Ugandan adults with subacute meningitis were prospectively enrolled. Total RNA and DNA CSF mNGS libraries were sequenced to identif
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stage-specificity of cross-resistance between Nippostrongylus brasiliensis and Strongyloides ratti was investigated. Results showed that immunization with tissue-migrating larvae was sufficient to generate cross-resistance and that host defense mechanisms operating in the cross-resistance were directed against tissue-migrating larvae but not against intestinal adult worms. In addition, no significant potentiation of the cross-resistance was observed after multiple immunization. These observations suggest that host defense mechanisms against heterologous challenge infection were qualitatively a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many eukaryotic microbes have complex life cycles that include both sexual and asexual phases with strict species specificity. Whereas the asexual cycle of the protistan parasite Toxoplasma gondii can occur in any warm-blooded mammal, the sexual cycle is restricted to the feline intestine. The molecular determinants that identify cats as the definitive host for T. gondii are unknown. Here, we defined the mechanism of species specificity for T. gondii sexual development and break the species barrier to allow the sexual cycle to occur in mice. We determined that T. gondii sexual development occu
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Techniques for sub-classifying morphologically identical Giardia duodenalis trophozoites have included comparisons of the electrophoretic mobility of enzymes and of chromosomes, and sequencing of genes encoding β-giardin, triose phosphate isomerase, the small subunit of ribosomal RNA and glutamate dehydrogenase. To date, G. duodenalis organisms have been sub-classified into eight genetic assemblages (designated A-H). Genotyping of G. duodenalis organisms isolated from various hosts has shown that assemblages A and B infect the largest range of host species, and appear to be the main (or possib
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
West Nile virus (WNV), like the dengue virus (DENV) and yellow fever virus (YFV), are major arboviruses belonging to the Flavivirus genus. WNV is emerging or endemic in many countries around the world, affecting humans and other vertebrates. Since 1999, it has been considered to be a major public and veterinary health problem, causing diverse pathologies, ranging from a mild febrile state to severe neurological damage and death. WNV is transmitted in a bird-mosquito-bird cycle, and can occasionally infect humans and horses, both highly susceptible to the virus but considered dead-end hosts. Ma
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Culex pipiens pipiens plays an important role in the transmission of several vector-borne pathogens such as West Nile virus (WNV) in North America. Laboratory and field studies suggest that this species is ornithophilic but because of genetic hybridization with sibling species during the active mosquito season, it may occasionally feed on mammals. Adult female Cx. p. pipiens undergo a facultative diapause and may serve as an overwintering mechanism for WNV. To determine the effect of diapause on the innate host preference of Cx. p. pipiens emerging from winter hibernation, we condu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования