BACKGROUND: Spatial transcriptomics provides unprecedented insights into gene expression in the spatial context of tissues; however, some mainstream techniques lack quantitative analysis of uncertainty.
METHODS: In this study, we propose a computational framework-Spatial Deconvolution via Deep Gaussian Processes (SDDGP)-that integrates deep Gaussian processes with Bayesian inference for spatially aware deconvolution of spatial transcriptomics data. The framework consists of three tightly coupled components. A multi-layer deep Gaussian process (DGP) captures nonlinear spatial dependencies in c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One typical missing pattern in longitudinal data is dropout in the sense that some participants may withdraw prematurely and never return. Dropout is generally regarded as a non-ignorable mechanism when the probability of the occurrence of missing values is related to both observed and unobserved data. This paper aims at extending the t $t$ linear mixed models to cope with the problem of non-ignorable dropout for modeling continuous longitudinal data in the situation where outliers or heavy-tailed noises may be present. We consider the selection modeling strategy with a logistic link function
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting the kinetics of drug-protein interactions is crucial for understanding drug efficacy, particularly in personalized medicine, where protein mutations can significantly alter drug residence times. This study applies replica exchange transition interface sampling and its partial path variant to investigate the dissociation kinetics of imatinib from Abelson nonreceptor tyrosine kinase (ABL) and mutants relevant to chronic myeloid leukemia therapy. These path sampling methods offer a bias-free alternative to conventional approaches requiring qualitative predefined reaction coordinates. N
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rationale: Pancreatic cancer has a dismal prognosis and requires better treatments. One promising approach aims at improving radiotherapy using nanoscintillators, which down-convert ionizing radiation into visible light, triggering various radiotherapeutic effects upon X-ray irradiation. One such effect is radiation dose-enhancement, driven by high-Z elements present in the nanoscintillator core. These elements efficiently absorb X-rays, releasing secondary electrons that amplify the radiation dose in the surrounding tissue. Methods: In this paper, we study the ability of Lu3Al5O12:Pr@SiO2, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mechanistic Monte Carlo simulations have proven invaluable in tackling complex challenges in radiobiology, for example for protecting astronauts from solar particle events (SPEs) during deep space missions which remains an underexplored area. In this study, the Geant4-DNA Monte Carlo code was used to assess the DNA damage caused by SPEs and evaluate the protective effectiveness of a multilayer shelter. By examining the February 1956 and October 1989 SPEs-two extreme cases-the results showed that the proposed shelter reduced DNA damage by up to 57.9% for the October 1989 SPE and 36.7% for the F
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Physica medica : PM : an international journal devoted to the applications of physics to medicine and biology : official journal of the Italian Association of Biomedical Physics (AIFB)2025eng
PURPOSE: Experimental patient-specific quality assurance (PSQA) in proton therapy is a labor-intensive process requiring physical access to treatment rooms, beam time, and significant human resources. With the increasing complexity of treatment plans and the implementation of adaptive therapy, the need for efficient alternatives is pressing. Simulation-based techniques are proposed as a replacement or enhancement for experimental ones. This study presents a data-driven approach to simulation-based PSQA criteria selection and validation.
METHODS: The FRED Monte Carlo code was used to simulate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Outbreaks of Salmonella in low moisture foods have been caused by cross-contamination from the processing environment into product. We used Monte Carlo simulations to model the impact of hypothetical cross-contamination scenarios of Salmonella from production equipment into milk powder. Model outputs included the quantity and extent of the contaminated product from a production line. Outputs were used to compare the efficacy of cleaning interventions. Cross-contamination of potential dry cleaning surrogates was also modeled. Input parameters for the model included log reductions fr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As the number of new breast cancer cases grows around the world, there is an unmet need for fast, accurate, and low-cost methods of early cancer detection. It was previously shown that X-ray scattering on lipid molecules can provide the necessary structural biomarker. However, these measurements were performed on small ex vivo samples, and to ensure the progress to in vivo diagnostics, the approach should be extended to larger tissues. We use the phantom fat samples to establish such a procedure. In the obtained X-ray scattering patterns, we observe the characteristic features for the inter-fa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Physiologically based pharmacokinetic (PBPK) models describe the absorption, distribution, metabolism, and excretion of chemicals. Probabilistic PBPK models can be used to produce distributional estimates of human equivalent doses (HEDs), which are external measures of human exposure predicted to result in a target internal dose, generated with Monte Carlo sampling and reverse dosimetry calculations. Very low HED percentiles represent individuals that are more sensitive to possible adverse effects of chemical exposures and are therefore frequently used in risk evaluation. Details of the parame
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Fetal alcohol spectrum disorder (FASD) is caused by prenatal alcohol exposure (PAE) and characterised by severe neurodevelopmental impairment. Australian studies have reported PAE prevalence of between 14% and 78% of births. Estimating national FASD prevalence in the general population using gold-standard active case ascertainment is costly and time-consuming, and alternative approaches are required.
METHODS: Using a published equation for the risk of FASD following PAE (estimated from an international meta-analysis) and a pooled estimate of PAE prevalence in Australia (from a m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The occurrence of heavy metal contamination in groundwater poses significant health risks through ingestion and dermal exposure, with potential links to cancer and other diseases. This study evaluated groundwater samples for 10 heavy metals (Al, As, Cr, Cu, Cd, Fe, Mn, Ni, Pb, and Zn) using ICP-OES. While cadmium and chromium levels were within acceptable limits prescribed by the Bureau of Indian Standards, aluminum and iron exceeded these limits in 56 and 58% of samples, respectively. Other metals surpassed limits in 2-20% of cases. Health risk analysis revealed non-carcinogenic risks for 28%
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Generally, studies in perinatal epidemiology restrict cohort entry to 20 weeks of gestation, but exposures and outcomes may occur earlier. This restriction may introduce left truncation bias.
OBJECTIVES: To examine the impact of left truncation bias when estimating the causal effect of abruption on perinatal mortality in the context of abnormal placentation, with spontaneous abortion (SAB) as a censoring event.
METHODS: Through 80 Monte Carlo simulation scenarios based on realistic clinical assumptions, we estimated risk differences (RD), risk ratios (RR) and bias parameters for
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Univariate zero-inflated models are increasingly being used to account for excess zeros in spatio-temporal infectious disease counts. Howeve … ransmission intensity of the diseases. Inference is performed using efficient Bayesian Markov chain Monte Carlo methods based on jointly sampling all unknown presence indicators. We apply the model to spatio-temporal counts of dengue, Zika, and chikungunya cases in Rio de Janeiro, during the first triple epidemic there.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucellosis, a zoonotic disease primarily transmitted through livestock, poses significant health and economic challenges globally. Its increasing incidence in China highlights critical gaps in current control measures, particularly in regions with high livestock movement, where domestic ruminants trade networks elevate the risk of disease transmission. Traditional value chain analyses often provide descriptive mappings of these networks but lack quantitative methods to assess specific risk levels. This study integrates value chain with quantitative risk assessment using Monte Carlo simulation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective. The International Commission on Radiological Protection (ICRP) decided to develop pregnant-female reference computational phantoms, including the maternal and fetal phantoms, through its 2007 general recommendations. Acknowledging the advantages of the mesh geometry, the ICRP decided to develop the pregnant-female mesh-type reference computational phantoms (MRCPs) for 8, 10, 15, 20, 25, 30, 35, and 38 week fetal ages directly in the mesh format. As part of this process, the present study developed the mesh-type fetal phantoms.Approach. The reference blood-inclusive organ masses, ele
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper examines the dosimetric uncertainty arising from the use of thermoplastic masks in the treatment of head and neck cancer through radiotherapy. This study was conducted through Monte Carlo simulations using the Monte Carlo N-Particle eXtended (MCNPX code), and the theoretical results are compared with radiochromic films. Using material characterization techniques, the compounds of the thermoplastic mask were identified, confirming that most of the material corresponds to the polymer C10H16O4. The theoretical results show increases ranging from 42% to 57.4% in the surface absorbed dos
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Because of significant variations and existence of high fluoride (F-) in some waters, Iran has been considered for various fluoride studies in recent decades. Nevertheless, there is a no updated review on fluoride levels especially including F- risk assessment. Thus, this systematic review is mainly aimed to evaluate the spatial distribution of F- content in water sources of Iran using geographic information system (GIS) and conduct the health risk assessment. Besides, the Monte-Carlo Simulation technique with 10,000 iterations was applied for determination of the non-carcinogenic effects of F
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective.Compton camera imaging shows promise as a range verification technique in proton therapy. This work aims to assess the performance of a machine learning model in Compton camera imaging for proton beam range verification improvement.Approach.The presented approach was used to recognize Compton events and estimate more accurately the prompt gamma (PG) energy in the Compton camera to reconstruct the PGs emission profile during proton therapy. This work reports the results obtained from the Geant4 simulation for a proton beam impinging on a polymethyl methacrylate (PMMA) target. To valid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Details of excitation and ionization acts hide a description of the biological effects of charged particle traversal through living tissue. Nanodosimetry enables the introduction of novel quantities that characterize and quantify the particle track structure while also serving as a foundation for assessing biological effects based on this quantification. This presents an opportunity to enhance the planning of charged particle radiotherapy by taking into account the ionization detail. This work uses Monte Carlo simulations with Geant4-DNA code for a wide variety of charged particles and their r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Characterise the relationship between hydroxychloroquine (HCQ) blood levels and the number of missed doses, accounting for dosage, dose timing and the large variability in pharmacokinetics (PK) between patients.
METHODS: We externally validated a published PK model and then conducted dosing simulations. We developed a virtual population of 1000 patients for each dosage across a range of body weights and PK variability. Using the model, 10 Monte Carlo simulations for each patient were conducted to derive predicted whole blood concentrations every hour over 24 hours (240 000 HCQ leve
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования