Maize lethal necrosis (MLN) is a severe disease caused by the combined infection of maize chlorotic mottle virus (MCMV) and a potyvirus, most often sugarcane mosaic virus (SCMV). This disease seriously threatens food security across sub-Saharan Africa (SSA). We investigated a major-effect quantitative trait locus for resistance on chromosome 6, named the maize lethal necrosis susceptibility locus 1 (qMLNS1), derived from the Thai line KS23-6. Fine mapping and CRISPR-Cas9 editing of the candidate genes within the narrowed 105 kb interval revealed a peroxisomal peptidase as the underlying cause
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyploidy is prominent in plant evolution and in many of the world's most important crops, yet how domestication reshapes the regulation of duplicated genes (homoeologs) to generate superior agronomic traits remains incompletely understood. Here, we integrate population genomics, stage-resolved transcriptomics, expression quantitative trait locus (eQTL) mapping, and coexpression network analysis across 161 semiwild and 376 cultivated accessions of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum) to dissect the regulatory consequences of domestication. We show that domestication increases both the f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chilling stress severely threatens rice productivity. While multiple signaling pathways in chilling tolerance have been elucidated, the role of the Mediator complex in this process remains poorly understood. Here, we identify COG5, a major quantitative trait locus (QTL) gene encoding the Mediator complex subunit Med21, as a positive regulator of chilling tolerance in rice. A promoter variation in COG5 leads to differential expression between japonica and indica. OsDREB6 preferentially binds to and activates COG5jap rather than COG5ind, resulting in higher expression in japonica. COG5 interacts
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWAS) aim to identify loci associated with different traits, which could be evaluated in subsequent studies and later be prioritized in individual and seed stand selection. In trees, traits are measured at maturity or are only available after a long time, and juvenile-mature correlations are often unknown. Therefore, it is a promising approach to study natural populations directly. Data were collected from approximately 100 adult beech trees per stand in five locations in the Postăvarul Massif, South-Eastern Romanian Carpathians (Carpații de Curbură) along an a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-Amylase activity is the primary underlying factor for starch degradation and therefore yield and quality losses induced by preharvest … = 0.05. The six markers explained 7.41% to 16.95% of the phenotypic variation and represented five quantitative trait loci (QTLs) on chromosomes 1H (QAmy.umb-1H.1), 4H (QAmy.umb-4H.1), 5H (QAmy.umb-5H.1 and QAmy.umb-5H.2) and 7H (QAmy.umb-7H.1). Expression analysis of genes that harbour the significant single-nucleotide polymorphism (SNP) markers revealed their potentia …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Erinacine A, a cyathane-type diterpenoid mainly from Hericium erinaceus mycelia, exhibits prominent neurotrophic and neuroprotective activities, making it a promising candidate for managing neurodegenerative diseases. However, its low abundance and unclear genetic regulatory mechanisms hinder its application as a nutraceutical. This study aimed to decipher its regulatory mechanisms and enhance production. Four exogenous inducers were screened, with salicylic acid (SA) and ergosterol (ERG) significantly increasing erinacine A content by 62.21% and 146.70% at 20 days, respectively. Transcriptome
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study identified and validated novel PTN QTL and predicted corresponding candidate genes, providing a genetic basis for the improvement of tiller number and grain yield in wheat. Productive tiller number (PTN) is a central component of wheat yield, yet its genetic regulation remains complex and highly responsive to environmental variation. This study employed a Chinese endemic wheat association population of 182 accessions to systematically dissect the genetic architecture of PTN across three environments. Phenotypic analysis revealed moderate-to-high genetic control (H2 = 69.59%) coupled
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel non-race-specific adult-plant resistance locus, QYr.cbl-5D, from spelt wheat confers near-immune resistance to stripe rust. The resistance conferred by QYr.cbl-5D is suppressed in bread wheat from an unknown suppressor. Adult-plant resistance (APR) genes provide durable, non-race-specific resistance against wheat rust diseases. We identified a novel APR locus in the spelt wheat cultivar CDC Silex that confers non-race-specific near-immune resistance to stripe rust. The trait segregates as a single dominant gene in the CDC Origin/CDC Silex spelt populations, and bulked segregant analysi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Phosphorus (P) utilization is a complex trait influenced by numerous genetic variants. The jejunum is the primary site of P abso … al phytase to stimulate adaptive mechanisms.
RESULTS: In total, 114 miR-eQTLs (microRNA expression quantitative trait loci) were detected at a false discovery rate (FDR) of less than 5%, including 56 miR-eQTLs in the LB strain and 58 miR-eQTLs in the LSL strain. Lohmann Brown contained 23 cis and 35 trans loci, with the most significant cis-eQTL targeting miR-146b. In t …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis (OA) is a chronic inflammatory and degenerative joint disease that commonly affects the aging population. This study was desi … se candidates and OA susceptibility, we performed Mendelian randomization (MR) using cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTL) as genetic instruments and identified significant associations between TNFRSF10B and OA. In parallel, single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) was used to map the cell-type-specific expression profile of TNFRSF10B, and its expression was …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gout is a prevalent inflammatory arthropathy driven by monosodium urate crystal deposition, yet the causal relationships between … HyPrColoc) were applied to map causal biomarkers to tissue-specific effector genes using expression quantitative trait loci data from kidney, liver, and whole blood. Candidate genes were experimentally validated in monosodium urate-stimulated THP-1 macrophages.
RESULTS: We identified 32 metabolites, one lipid species (TAG 54:3), and two protective plasma proteins (ISLR2 …
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neuromyelitis optica spectrum disorder (NMOSD) is a rare central nervous system autoimmune disease characterized by aquaporin-4 antibody-mediated astrocyte injury. Although genetic risk variants in the major histocompatibility complex (MHC) region have been consistently implicated in NMOSD susceptibility, the cellular context in which these genetic risk factors operate in the brain remains uncharacterized. We aimed to identify cell-type-specific genetic associations between brain gene expression and NMOSD risk through a systematic Mendelian randomization screen.
METHODS: Cis-eQTL
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Milk urea concentration (MUC) is an indicator of dietary protein utilization and nitrogen use efficiency in dairy cows. We performed GWAS on MUC in early, mid, and late lactation in the Holstein (HOL) and Brown Swiss (BSW) dairy cattle breeds using imputed sequence variants. We identified 11 and 17 independent QTL for MUC across the 3 lactation stages in BSW and HOL, respectively. Although many of these QTL have previously been reported for MUC and other dairy traits, our study provides evidence that some QTL exert lactation stage-specific effects. Our findings suggest that variants at the DGA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
When breeding apple cultivars for northern latitudes, early harvest and late flowering are desirable to manage the short growing season and … the 20 K apple Infinium® SNP array we performed haplotype-based validation of previously described quantitative trait loci (QTL) intervals and genomic regions on Linkage Group (LG) 3 (harvest date), LG 9 and 12 (flowering), and LG16 (PRB2). We assessed the correlation between the traits and historical climate adaptation and identified haplotypes associated with increasi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The teat number trait in pigs has significant economic value, with Meishan and Erhualian pigs having the highest counts globally. To uncover the genetic basis of teat number variation, this study employed genome re-sequencing for a total of 1 119 individuals. Genome-wide association study (GWAS), meta-analysis, and Bayesian fine mapping were conducted. The GWAS from two breeds revealed multiple significant quantitative trait locus (QTL) for total teat number (TNT) mainly on SSC1, SSC5, SSC10, and others. Bayesian fine mapping targeted the most significant QTL in both Meishan pig GWAS and meta-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Helicobacter pylori (H. pylori) is a major risk factor for gastric cancer (GC) and multiple other chronic illnesses. Host genetic factors influence the susceptibility to H. pylori infection, as evidenced by elevated concordance in monozygotic twins and racial disparities independent of socioeconomic status. Leveraging meta-analyses and in silico functional annotation, we investigated host genetic susceptibility to H. pylori infection, and to examine how these variants may influence gastric cancer (GC) risk.
METHODS: Meta-analyses were performed on 25 candidate genetic var
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complex diseases often have distinct mechanisms spanning multiple tissues. We propose tissue-gene fine-mapping (TGFM), which infers the posterior inclusion probability (PIP) for each gene-tissue pair to mediate a disease locus by analyzing summary statistics and expression quantitative trait loci (eQTL) data; TGFM also assigns PIPs to non-mediated variants. TGFM accounts for co-regulation across genes and tissues and models uncertainty in cis-predicted expression models, enabling correct calibration. We applied TGFM to 45 UK Biobank diseases or traits using eQTL data from 38 Genotype-Tissue Ex…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD) is a hereditary and chronic inflammatory condition affecting the gastrointestinal tract, with two main subphenotypes: Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC). Most IBD-related genetic associations are limited to independent subphenotypes and ancestral populations, and the heritability remains largely unexplained, prompting us to conduct the large-scale multi-trait genome-wide association study (GWAS) meta-analysis that incorporates both subphenotypes and diverse ancestral populations to reveal novel susceptibility loci through the substantially enhance
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: We investigated genetic regulators of circulating plasma metabolites to identify pathways underlying biochemical changes in clinical and biomarker-supported Alzheimer's disease (AD).
METHODS: We computed metabolite quantitative trait loci (QTL) with whole-genome sequencing (WGS) and small molecule plasma metabolites from 229 older adults with clinical AD and 322 age-matched healthy controls. Unbiased associations between 6881 metabolites and 332,772 common genetic variants were tested, adjusted for age, sex, and both metabolomic and genomic principal components.
RESULTS: We ide…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Numerous studies have revealed a correlation between immune system dysfunction and Parkinson's disease (PD), yet the causal link between the … from a genome-wide association study (GWAS) involving 3,757 individuals, while the genomic protein quantitative trait loci (pQTL) data for circulating inflammatory proteins were sourced from a GWAS dataset comprising 14,824 individuals of European descent. Additionally, we utilized PD risk data from a large meta-analysis of GWAS, which included 33,674 PD cases and 449,0 …
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования