BACKGROUND: Undifferentiated acute febrile illness (UAFI) cause by several pathogens poses a diagnostic challenge due to the similarity on the clinical manifestations across these diseases. Precise pathogen detection is vital for appropriate medical intervention, early treatment, and timely outbreak alerts regarding emerging pathogens. In tropical regions, UAFI is predominantly linked to a wide range of viral, bacterial, and parasitic infections. Hence, confirmatory laboratory tests are essential for specific pathogen identification.
OBJECTIVES: Our primary goal was to develop two real-time m
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Canine distemper virus (CDV) is a major threat to domestic dogs and wildlife worldwide. Molecular assays are the most sensitive and specific tests to diagnose the disease, however, the high CDV genetic variability may compromise laboratory diagnosis. Herein, we designed a high-coverage primer set for end-point (RT-PCR) and real-time (RT-qPCR) for CDV detection. Initially, we collected 194 complete/near-complete CDV genomes (GenBank) and analyzed them for highly conserved regions for primer design. We then assessed the in silico coverage, analytical sensitivity, specificity and diagnostic perfo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blastocystis sp. is a common parasite in the intestinal tract of humans and animals. The clinical diagnosis of Blastocystis sp. mainly depends on the microscopic observation of parasite, which can lead to false-negative results. An accurate and convenient diagnostic approach for Blastocystis sp. infection is crucial for effectively preventing and controlling blastocystosis. Herein, we developed a recombinase polymerase amplification (RPA) method for detecting Blastocystis sp. The results showed that the DNA amplification by RPA established in this study could be performed within 5 min at 37°C,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Various variants of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) began emerging worldwide from the end of 2020 to the beginning of 2021. The variants GRY/VOC202012/01 (B1.1.7), GH/N501Y.V2 (B1.351), and GR/N501Y.V3 (P1) are characterized by N to Y amino acid substitution at position 501 in the S protein. The variant containing L to R substitution at position 452 in the S protein G/L452R.V3 (B1.617) was endemic to India. The heightened concern regarding these variants is related to their increased viral infectivity. Information about nucleotide mismatch(es) on the primer/probe s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis (Nm) is a leading cause of invasive infections associated with high mortality and morbidity, notably meningitis and septicemia. Etiological rapid diagnosis is key for the preventive management of invasive meningococcal disease (IMD). However, conventional methods for diagnosis are time-consuming and could be hampered by the difficulties in culturing the isolates from clinical specimens especially due to early antibiotic treatment. Therefore, sensitive, specific and rapid non-culture-based methods are valuable for early diagnosis, effective therapy, and prevention. Here w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative real-time PCR (qRT-PCR) is a highly sensitive and reliable method for detection and quantification of DNA. When combined with a prior stage of RNA reverse transcription to generate complementary DNA (cDNA), this is a powerful approach to determine and analyze gene transcriptional expression. Real-time quantitative reverse transcription PCR has become the gold standard method in studying genes expression and virulence regulation under various genetic backgrounds (e.g., in the absence of regulators) or environmental conditions. Here we demonstrate the utilization of this approach to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several commercial assays are now available to detect the nucleic acid of multiple respiratory pathogens from a single specimen. Head-to-head comparisons of such assays using a single set of standard specimens provide additional information about key assay parameters such as sensitivity, specificity and lower limits of detection, and help to inform the decision regarding which method to use. We evaluated two real-time PCR platforms: the Fast-track Diagnostics® (FTD) multiplex respiratory panel and a TaqMan array card (TAC) for simultaneous uniplex detection of multiple respiratory pathogens. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the Fast Testing Sstrategy (FTS) for wild poliovirus I (WP1).
METHODS: Epidemiological investigations were carried out on 671 students from WP1 epidemic areas in China. A set of real time RT-PCR assays, including panenterovirus testings (PE) assay, poliovirus serotypings (PS) assay and the assay distinguishing wild strain from vaccine strain of poliovirus I (DWV) were introduced into the screening program for WPV1 to replace the conventional RT-PCR, recommended by the China National Polio Laboratory (GNPL). Additionally, sensitivities of all the assays were assessed by p
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, and Streptococcus pneumoniae are important causes of meningitis and other infections, and rapid, sensitive, and specific laboratory assays are critical for effective public health interventions. Singleplex real-time PCR assays have been developed to detect N. meningitidis ctrA, H. influenzae hpd, and S. pneumoniae lytA and serogroup-specific genes in the cap locus for N. meningitidis serogroups A, B, C, W135, X, and Y. However, the assay sensitivity for serogroups B, W135, and Y is low. We aimed to improve assay sensitivity and develop multiplex
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVES: Bats are recognized as important reservoirs for emerging infectious disease and some unknown viral diseases. Two novel viruses, Malsoor virus (family Bunyaviridae, genus, Phlebovirus) and a novel adenovirus (AdV) (family, Adenoviridae genus, Mastadenovirus), were identified from Rousettus bats in the Maharashtra State of India. This study was done to develop and optimize real time reverse transcription - polymerase chain reaction (RT-PCR) assays for Malsoor virus and real time and nested PCR for adenovirus from Rousettus bats.
METHODS: For rapid and accurate screening
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Beet western yellows virus (BWYV - Polerovirus BWYV) is a polerovirus associated with yellowing and stunting symptoms in sugar beet and several other crops. Its close relationship with other beet-infecting poleroviruses, has long complicated accurate diagnosis due to serological cross-reactivity and limited molecular data. To overcome these issues, we developed a novel real-time RT-PCR assay enabling the specific and sensitive detection of BWYV and beet leaf yellowing virus (BLYV - Polerovirus BLYV). The assay was designed from a curated genomic dataset to ensure inclusivity and tested in para
СтатьяСравнительное исследованиеВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUNDS: The BioFire FilmArray RP2.1 plus is a syndromic multiplex PCR panel for qualitative detection of 20 respiratory pathogens. BioMérieux recently introduced FIREWORKS, a software platform providing access to amplification data, including cycle threshold (Ct) values.
OBJECTIVES: This study evaluated the diagnostic performance of the BioFire RP2.1 plus and explored the potential utility of Ct values for semi-quantitative assessment of pathogen load.
METHODS: This retrospectively study included 72 specimens. Some were serially diluted for quantitative analyses, yielding 130 PCR tests.
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increased demand for highly pathogenic avian influenza (HPAI) testing in milk highlights the critical need for well-characterized samples that enable meaningful evaluation of current detection methods. In this study, we focus on the development and rigorous characterization of artificially contaminated spiked milk samples, forming the foundation for reliable assessment of assay performance. By using reverse transcriptase digital PCR (RT-dPCR), we obtained precise genome copy (GC) measurements of our virus stock and of spiked samples, producing accurate quantification even at low viral load
СтатьяОценочное исследованиеПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative detection of Escherichia coli in water is essential for assessing fecal contamination because of its potential adverse effects on human health. Polymerase chain reaction (PCR)-based techniques enable rapid detection, facilitating timely decision-making and public health interventions. However, conventional quantitative real-time PCR (qPCR) assays generally require expensive, non-portable equipment and are often inaccessible in resource-limited settings. Therefore, this study evaluated a simple endpoint PCR combined with SYBR Green I (SGI)-based colorimetric deoxyribonucleic acid (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute respiratory tract infections (ARTIs) are a major global health burden with high morbidity and mortality, mainly affecting children under 5 years old and people over 60 years old. The majority of ARTIs are caused by respiratory viruses, such as influenza virus (IFV), respiratory syncytial virus (RSV), human rhinovirus (HRV), human parainfluenza virus (HPIV), human adenovirus (HAdV), human coronavirus (HCoV), human bocavirus (HBoV) and human metapneumovirus (HMPV). Accurate and sensitive diagnosis of respiratory viruses is crucial for clinical treatment and management of patients with ARTI
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of accurate diagnostic tools and surrogate markers of parasitological response to treatment are priorities in Chagas disease (CD) research. For years, the detection of Trypanosoma cruzi DNA by polymerase chain reaction (PCR) has proved to be useful in some clinical scenarios such as acute CD, including cases of vertical transmission and oral outbreaks, CD reactivation in immunosuppressed patients, and post-treatment follow-up. In that sense, the implementation of quantitative real-time PCR (qPCR) assays was an important step in the development of more reliable tools for T. cruz
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An automated cartridge-based Vcheck M Canine Vector 8 Panel for qualitative detection of Leishmania spp. DNA in canine lymph node aspirates, an off-label specimen type, using laboratory qPCR as the comparator, was evaluated. Fifty-seven residual lymph node aspirate suspensions from dogs investigated for suspected canine leishmaniosis (CanL) were tested. Reference qPCR detected L. infantum DNA in 29 samples. Vcheck M was positive in 22/29 qPCR-positive samples and negative in 28/28 qPCR-negative samples, corresponding to positive percent agreement/sensitivity of 75.9% (95% CI, 56.5-89.7) and ne
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative real-time PCR assays often lack harmonization, leading to variability in viral load reporting. Differences in calibration materials, assay design, extraction methods, and gene targets further complicate standardization. This study evaluated the Qiagen QIAcuityDx digital PCR (dPCR) platform for absolute quantification of adenoviruses and compared its performance with Bio-Rad droplet dPCR and the standard-of-care quantitative real-time PCR assays. Viral loads of commercially available quality control materials, calibrators, and clinical samples were assessed. Whether adenovirus geno
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Arboviruses represent a potential threat to global public health due to their ability to infect various vertebrate hosts and vec … 3 and June 2024.
METHODS: Samples negative for rabies virus were analysed by reverse transcription real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) targeting Alphavirus, Orthoflavivirus and Phlebovirus species.Positive samples were subjected to viral isolation in cell culture and whole-genome sequencing using next-generation sequencing.Phylogenetic and molecular clock analyses were pe …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Waterfowl parvoviruses (WPVs), including classical goose parvovirus (cGPV), Muscovy duck parvovirus (MDPV), Muscovy duck-origin goose parvovirus (MDGPV), and short beak and dwarfism syndrome virus (SBDSV), are significant pathogens that affect waterfowl flocks worldwide. Due to their high genetic similarity and frequent coinfections, rapid and accurate differentiation of these viruses remains challenging. In this study, we developed a multiplex TaqMan-minor groove binder (MGB) real-time PCR assay for the simultaneous detection and differentiation of cGPV, MDPV, MDGPV, and SBDSV. Specific prime
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования