The collection and processing of frozen muscle tissue is essential for accurate downstream analysis of human and animal samples collected in Duchenne muscular dystrophy (DMD) research. Specific techniques are essential for preserving the tissue morphology and molecular markers that are vital for diagnostics, evaluation of disease progression, and preclinical in vivo research. Freezing muscle tissue in liquid nitrogen-cooled isopentane maintains tissue structure and preserves enzyme activity, which is crucial for enzyme histochemistry and other downstream protein analysis. In this chapter, we w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The accumulation of cell wall components as plants grow limits forage nutrition for ruminants. In particular, lignin deposition in plant tissues impedes the breakdown of the cell wall carbohydrates cellulose and hemicellulose, thereby reducing the amount of energy available from forage. The highly digestible pectin component of the cell wall, however, is readily available for degradation. Information about lignin and pectin deposition in different stem cell types may provide mechanistic insights into the factors underlying variation in stem digestibility among alfalfa lines. In vitro incubatio
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intricate cellular architecture and dynamic molecular interplay in the nervous system have long challenged mechanistic studies of neurological diseases. Conventional approaches often miss the transient, low-affinity, or spatially confined interactions that underlie neural homeostasis and pathogenesis. Proximity labeling (PL) technologies overcome this limitation by enabling in situ capture of these elusive molecular events within living systems. Through spatially restricted biotinylation, PL methods, including engineered biotin ligases (e.g., TurboID), peroxidases (e.g., APEX2), and emergi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuronal labeling in the developing brain is essential for studying the formation and maturation of neural circuits. Among labeling techniques, adeno-associated virus (AAV)-based gene delivery offers high efficiency and versatility. However, whether AAV can effectively label neurons in the developing brain has not been fully determined. Here, we demonstrate that administration of AAV-PHP.eB in neonatal mice results in neuronal transduction as early as 3 days after injection. By titrating the AAVs, we achieve sparse neuronal labeling and facilitate high-resolution reconstruction of dendritic mo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundAccurate and timely Gram stain interpretation of positively flagged blood culture bottles is crucial for early detection of bloodstream infections and initiation of empirical therapy. However, resin and charcoal particles in culture media may interfere with smear clarity.MethodsA prospective study was conducted on 100 positive blood culture samples. Four smear preparation techniques - conventional, water wash, blood film, and drop and rest - were applied. These were assessed for diagnostic agreement with final culture results and graded for resin/charcoal interference. Kappa (κ) stat
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Super-resolution fluorescence imaging enables visualization of subcellular structures and molecular interactions at the nanoscale, but its broader application has been hindered by long-standing limitations in current protein tagging systems, including rapid photobleaching, tag-induced artifacts, poor post-fixation labeling efficiency, and restricted multiplexing capability. Here, we present FLEXTAG (Fluorescent Labeling for Exchangeable, X-resilient Tagging in Advanced Generic Nanoscopy), a comprehensive protein labeling system comprising three orthogonal, ultrasmall (12-18 kDa), and self-rene
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The goal of this study is to review the existing evidence to quantify the impact of corneal punctate epithelial erosions (PEE) on postoperative refractive error-related patient dissatisfaction after cataract surgery.
METHODS: PubMed and the Cochrane library were systematically searched for studies using the terms "dry eye" or "dry eye disease" or "punctate epithelial erosions" or "corneal staining" combined with "biometry" or "keratometry" or "cataract surgery." ChatGPT was also queried using the same search terms to identify any potentially relevant publications that might have been
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medical image matching is crucial for assisting pathological diagnosis, as it aligns gold standard hematoxylin and eosin (H&E) and immunohistochemistry (IHC) stained pathology images, enabling a comprehensive assessment for identifying cancerous regions. However, manual annotation of multi-stain pathology images incurs high labor costs. To address this challenge, we propose the deep dual-channel coupling (DDC) method for multi-stain pathology image matching. DDC utilizes virtual staining to establish two matching channels, bridging H&E-stained and IHC-stained pathology images while effectively
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Negative- and positive-staining transmission electron microscopy (ns/psTEM) is a cornerstone of research and diagnostics, enabling nanometer-resolution analysis of organic specimens from nanoparticles to cells without requiring costly cryo-equipment. For nearly 70 years, uranyl salts like uranyl acetate (UA) have been the gold-standard ns/psTEM-stains. However, mounting safety concerns due to their high toxicity and radioactivity have led to stricter regulations and expensive licensing requirements. Consequently, there is an urgent global demand for safer, more sustainable stains that deliver
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytometry by time-of-flight (CyTOF) enables comprehensive immune profiling for translational research. However, challenges such as signal variability, nonspecific binding, and antibody incompatibility can compromise data quality. This study presents an optimized CyTOF staining protocol for human peripheral blood mononuclear cells and bone marrow aspiration concentrate samples, addressing these challenges by refining antibody conjugation with polymer X8, saponin use, and fixation protocols. Preliminary data indicate improved staining for key markers (CD14, CD16, and CD19), enhancing signal cons
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biochemical applications are increasingly utilized in paleontological studies, especially for detecting ancient proteins in fossil samples. Histopathological staining techniques have been applied, but they have yet to specifically target type I collagen, the primary bone matrix protein and the most significant protein of interest in paleoproteomic research. Moreover, these staining methods are often applied to demineralized fossils, which remove the original microstructure of the bone matrix and increase the risk of contamination. To address these limitations, this study aimed to test the effe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microscopy and microanalysis : the official journal of Microscopy Society of America, Microbeam Analysis Society, Microscopical Society of Canada2025eng
Histological staining is essential for understanding bone structure and pathology; however, variations in decalcification agents can compromise reproducibility. We have previously developed a novel osteochondral staining method, Join of the Five dyes Revealing coLlagenous tissue (JFRL) staining, that is independent of the decalcification method. To promote its widespread adoption, this study confirms the robustness of JFRL staining through intra- and inter-laboratory validation. JFRL staining demonstrated consistent patterns across different manufacturers and facilities, with proper dehydratio
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In contrast to other tissues, the placenta consists of numerous functionally different cell types, distributed in a markedly dissimilar manner within one placenta and between different cases. To evaluate pathology-specific changes in cell phenotype and expression of molecular markers it is important to establish a multi staining method combining immunohistological identification of the cell type with staining of proteins of interest. We successfully established a protocol for a 6-plex antibody panel for multiplex immunofluorescence. Here, we report the staining protocol and the establishment o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vascular repair, a pivotal element of the spinal cord (SC) injury response, has been notably neglected in zebrafish research. Here, we detail the extraction and dissection of whole-mount zebrafish SCs and the optimized whole-mount immunofluorescence staining and clearing protocols for the visualization of SC structures, such as the vascular network. Additional downstream applications of these samples, from gelatin embedding to cryosectioning and tissue staining, can be done after clearing reversion and are also described in this work. For complete details on the use and execution of this p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe a microwave-assisted, methanol and acetic acid-free, inexpensive method for rapid staining of SDS-PAGE proteins. Only citric acid, benzoic acid, and Coomassie brilliant blue G-250 (CBG) were used. Microwave irradiation reduced the detection duration, and proteins in a clear background were visualized within 30 min of destaining, after 2 min of fixing and 12 min of staining. By using this protocol, comparable band intensities were obtained to the conventional methanol/acetic acid method.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intraoperative histology is essential for surgical guidance and decision-making. However, frozen-sectioned hematoxylin and eosin (H&E) staining suffers from degraded accuracy, whereas the gold-standard formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) H&E is too lengthy for intraoperative use. Stimulated Raman scattering (SRS) microscopy has shown rapid histology of brain tissue with lipid/protein contrast but is challenging to yield images identical to nucleic acid-/protein-based FFPE stains interpretable to pathologists. Here, we report the development of a semi-supervised stimulated Raman CycleGA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The detection of disialoganglioside GD2 on tumor biopsies, especially in paraffin-embedded tissues, has been challenging due to the glycolipid structure of GD2 and its membrane anchorage. Here, we present an immunofluorescence protocol for the reliable assessment of GD2 on formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues. We describe steps for antigen retrieval with Tris-EDTA buffer and staining with unconjugated anti-GD2 antibody (clone 14.G2a) and horse radish peroxidase (HRP)-conjugated secondary antibody. We then detail procedures for signal amplification using the tyramide signal amplifica
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many attempts have been made to simplify tissue fixation and processing prior to hematoxylin and eosin (H&E) staining, immunohistochemistry (IHC) and genomic DNA extraction. The acetone-methyl benzoate-xylene (AMeX) method, is gaining popularity as an alternative to aqueous formaldehyde fixation followed by alcohol dehydration. We have assessed the efficacy of AMeX for the quality of extracted genomic DNA in addition to H&E and IHC in biopsy specimens of human oral mucosal lesions of size not more than 1 cm. H&E staining showed similar results when AMeX method was compared with conventional fi
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pulmonary fat embolism (PFE) as a cause of death often occurs in trauma cases such as fractures and soft tissue contusions. Traditional PFE diagnosis relies on subjective methods and special stains like oil red O. This study utilizes computational pathology, combining digital pathology and deep learning algorithms, to precisely quantify fat emboli in whole slide images using conventional hematoxylin-eosin (H&E) staining. The results demonstrate deep learning's ability to identify fat droplet morphology in lung microvessels, achieving an area under the receiver operating characteristic (ROC) cu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid consists of insoluble beta-fibrillar proteins with stable structures. The Congo red staining method for histologically detecting amyloid is unsuitable for quantitatively assessing amyloid fibers. Scanning acoustic microscopy (SAM) detects the attenuation of sound (AOS) through sections. This study aimed to clarify whether AOS values reflected the amount of amyloid fibril degradation in tissues. Formalin-fixed paraffin-embedded unstained sections of various types of amyloidosis were digested with different endopeptidases. The AOS images after digestion were observed over time via SAM. T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.