We report an atypical tuberous sclerosis complex (TSC) phenotype presenting as familial multiple renal cell carcinomas (RCCs) with (angio)leiomyomatous stroma (RCCLS) (5/7 familial RCCs) on a background of multiple angiomyolipomas, hypopigmented skin macules, and absence of neurological anomalies. In the index case and three relatives, germline genetic testing identified a heterozygous TSC2 missense pathogenic variant [c.2714 G > A, (p.Arg905Gln)], a rare TSC-associated alteration which has previously been associated with a milder TSC phenotype. Whole-exome sequencing of five RCCs from the ind
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human prion diseases are associated with a range of clinical presentations, and they are classified by both clinicopathological syndrome and etiology, with subclassification according to molecular criteria. Here, we describe updated procedures that are currently used within the MRC Prion Unit at UCL to determine a molecular diagnosis of human prion disease. Sequencing of the PRNP open reading frame to establish the presence of pathogenic mutations is described, together with detailed methods for immunoblot or immunohistochemical determination of the presence of abnormal prion protein in the br
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The application of precision medicine in oncology requires in-depth characterisation of a patient's tumours and the dynamics of their responses to treatment.
PATIENTS AND METHODS: We used next-generation sequencing of circulating cell-free DNA (cfDNA) to monitor the response of a KIT p.L576P-mutant metastatic vaginal mucosal melanoma to sequential targeted, immuno- and chemotherapy.
RESULTS: Despite a KIT mutation, the response to imatinib was mixed. Unfortunately, tumours were not accessible for molecular analysis. To study the mechanism underlying the mixed clinical response, w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The chromosome 22q11.2 region has long been implicated in genomic diseases. Some genomic regions exhibit numerous low copy repeats with high identity in which they provide increased genomic instability and mediate deletions and duplications in many disorders. DiGeorge Syndrome is the most common deletion syndrome and reciprocal duplications could be occurring in half of the frequency of microdeletions. We described five patients with phenotypic variability that carries deletions or reciprocal duplications at 22q11.2 detected by Chromosomal Microarray Analysis. The CytoScan HD technology was us
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The emergence of multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae is a major public health concern. Many K. pneumoniae infections can only be treated when resorting to last-line drugs such as polymyxin B (PB). However, resistance to this antibiotic is also observed, although insufficient information is described on its mode of action as well as the mechanisms used by resistant bacteria to evade its effects. We aimed to study PB resistance and the influence of abiotic stresses in a clinical K. pneumoniae strain using whole transcriptome profiling.
RESULTS: We sequenced 12 cDNA libraries o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Cell-free DNA (cfDNA) prenatal screening tests have been rapidly adopted into clinical practice, due in part to positive insurance coverage. We evaluated the framework payers used in making coverage decisions to describe a process that should be informative for other sequencing tests.
METHODS: We analyzed coverage policies from the 19 largest US private payers with publicly available policies through February 2016, building from the University of California San Francisco TRANSPERS Payer Coverage Policy Registry.
RESULTS: All payers studied cover cfDNA screening for detection of tris
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To document recessive FZD4-related familial exudative vitreoretinopathy.
METHODS: Retrospective case series.
RESULTS: Two brothers, the only two males among five siblings, had bilateral infantile retinal detachments and were referred for genetic counseling. Next-generation sequencing uncovered a homozygous FZD4 frameshift deletion in both affected brothers (c.40_49delCCCGGGGGCG; p.Pro14Serfs*44). None of the other immediate family members had clinical evidence for retinal disease, including the three family members who underwent confirmatory genetic testing and were found to be hete
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legius syndrome is a rare genetic disorder caused by heterozygous germ line loss-of-function SPRED1 mutation. In Japan, a family with Legius syndrome was first described in 2015 by Sakai et al. We described a first solitary case of Legius syndrome identified by next-generation sequencing in Japan. A 37-year-old woman presented with multiple café-au-lait macules and freckles but has no other features of neurofibromatosis type 1 (NF-1). Sequencing results showed the presence of a mutation in exon 2 of SPRED1 c.70C>T, resulting in the protein at position 24 (p.Arg24X). When a dermatological clini
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Retention of a subset of introns in spliced polyadenylated mRNA is emerging as a frequent, unexplained finding from RNA deep sequencing in mammalian cells.
RESULTS: Here we analyze intron retention in T lymphocytes by deep sequencing polyadenylated RNA. We show a developmentally regulated RNA-binding protein, hnRNPLL, induces retention of specific introns by sequencing RNA from T cells with an inactivating Hnrpll mutation and from B lymphocytes that physiologically downregulate Hnrpll during their differentiation. In Ptprc mRNA encoding the tyrosine phosphatase CD45, hnRNPLL induc
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triploidy is a relatively common cause of miscarriage; however, recurrent triploidy has rarely been reported. A healthy 34-year-old woman was ascertained because of 18 consecutive miscarriages with triploidy found in all 5 karyotyped losses. Molecular results in a sixth loss were also consistent with triploidy. Genotyping of markers near the centromere on multiple chromosomes suggested that all six triploid conceptuses occurred as a result of failure to complete meiosis II (MII). The proband's mother had also experienced recurrent miscarriage, with a total of 18 miscarriages. Based on the hypo
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lyme disease is a zoonosis caused by various species belonging to the Borrelia burgdorferi bacterial species complex. These pathogens are transmitted by ticks and infect multiple, taxonomically distinct, host species. From an epidemiological perspective, it is important to determine whether genetic variants within the species complex are able to spread freely through the whole host community or, instead, if certain variants are restricted to particular hosts. To this end, we characterized the genotypes of members of the B. burgdorferi species complex; the bacteria were isolated from more than
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital myopathies are heterogeneous inherited diseases of muscle characterized by a range of distinctive histologic abnormalities. We have studied a consanguineous family with congenital myopathy. Genome-wide linkage analysis and whole-exome sequencing identified a homozygous non-sense mutation in 3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1 (HACD1) in affected individuals. The mutation results in non-sense mediated decay of the HACD1 mRNA to 31% of control levels in patient muscle and completely abrogates the enzymatic activity of dehydration of 3-hydroxyacyl-CoA, the third step in the elongation of v
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rift Valley fever virus (RVFV; genus Phlebovirus, family Phenuiviridae, order Bunyavirales) is a mosquito-borne zoonotic pathogen endemic in Africa. Its negative-stranded genomic RNA (vRNA) is divided into three segments termed L, M, and S. Both vRNAs and antigenomic cRNAs are encapsidated by viral nucleoprotein (N) to form nucleocapsids, which constitute the template for genome transcription and replication. Based on a number of electron microscopy and structural studies, the viral RNAs of negative-strand RNA viruses, including phleboviruses, are commonly considered to be entirely and uniform
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using high-resolution genomic microarray analysis, a distinct genomic profile was defined in 114 samples from patients with splenic marginal zone lymphoma (SMZL). Deletion or uniparental disomy of chromosome 7q were detected in 42 of 114 (37%) SMZLs but in only nine of 170 (5%) mature B-cell lymphomas (P < 0·00001). The presence of unmutated IGHV, genomic complexity, 17p13-TP53 deletion and 8q-MYC gain, but not 7q deletion, correlated with shorter overall survival of SMZL patients. Mapping studies narrowed down a commonly deleted region of 2·7 Mb in 7q32.1-q32.2 spanning a region between the S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation-based age prediction has become a reliable method for individual identification. While current models have achieved high accuracy when targeting a single type of biological fluid, crime scenes often contain multiple body fluids. Applying single fluid models to other fluid types may result in significant prediction errors, potentially misleading investigations. Therefore, age prediction models applicable to multiple biological fluids are of critical importance. In this study, we screened three age-related methylation sites (cg05940966, cg10501210, and cg10528482) from blood, sal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The occurrence of colistin-resistant Escherichia coli in food-producing animals presents a global public health hazard. We aimed to determine the prevalence and molecular characteristics of mobilized colistin resistance (mcr)-carrying E. coli isolated from colistin-use and non-use pig farms.
METHODS: Antimicrobial susceptibility of isolated 552 E. coli from pig feces (n = 334) and their farm environments (n = 218) was assessed using broth microdilution. Molecular characterization of colistin-resistant E. coli was determined by polymerase chain reaction, multi-locus sequence typing,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Congenital hypogonadotropic hypogonadism (CHH) arises from defects in the synthesis, secretion, or action of gonadotropin-releasing hormone (GnRH), resulting in incomplete or absent pubertal development and various nonreproductive features. CHH is genetically heterogeneous, with over 50 genes implicated in its pathogenesis. This study aimed to elucidate the genetic variants of CHH in a cohort of patients from a single-center endocrinology unit.
METHODS: We used a targeted next-generation sequencing panel to analyze 52 CHH-related genes in 35 patients. Functional studies validate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate the short- and long-term dynamics of intact and defective proviral HIV DNA during ART.
DESIGN: We evaluated viral reservoir dynamics in a cohort of nine individuals with chronic HIV-1 subtype B who initiated first-line ART and were followed for 20 years while continuing ART.
METHODS: PBMCs were obtained before ART ( n = 5), during the first year, and after 8.5 and 20 years of treatment. T cell subsets (naive, central-memory, transitional-memory and effector-memory) were sorted at 8.5 and 20 years. DNA was isolated and analyzed using the intact proviral DNA assay (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The concurrent presence of multiple New Delhi metallo-β-lactamase (blaNDM) variants within an isolate often goes undetected without next-generation sequencing. This study detects and characterizes dual blaNDM variants in Escherichia coli through Sanger and whole-genome sequencing. Additionally, a rapid identification method utilizing restriction digestion was designed for detecting blaNDM variants carrying M154L mutation. Antibiotic susceptibility, minimal inhibitory concentration for meropenem and ertapenem, PCR, and Sanger sequencing of blaNDM along with genome sequencing using Illumina and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transmission within families and multiple spike protein mutations have been associated with the rapid transmission of SARS-CoV-2. We aimed to: (1) describe full genome characterization of SARS-CoV-2 and correlate the sequences with epidemiological data within family clusters, and (2) conduct phylogenetic analysis of all samples from Yogyakarta and Central Java, Indonesia and other countries.
METHODS: The study involved 17 patients with COVID-19, including two family clusters. We determined the full-genome sequences of SARS-CoV-2 using the Illumina MiSeq next-generation sequencer.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования