Dysregulated signaling cascades alter energy metabolism and promote cell proliferation and cyst expansion in polycystic kidney disease (PKD). Here we tested whether metabolic reprogramming towards aerobic glycolysis ("Warburg effect") plays a pathogenic role in male heterozygous Han:SPRD rats (Cy/+), a chronic progressive model of PKD. Using microarray analysis and qPCR, we found an upregulation of genes involved in glycolysis (Hk1, Hk2, Ldha) and a downregulation of genes involved in gluconeogenesis (G6pc, Lbp1) in cystic kidneys of Cy/+ rats compared with wild-type (+/+) rats. We then tested…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Adenomyosis is a clinical disorder defined by the presence of endometrial glands and stroma within the myometrium, the pathogenes … from leiomyoma, endometriosis, and hormonal exposures. Isolated purified total RNA was subjected to microarray analysis using the Gene 1.0 ST Affymetrix platform. Data were analyzed with GeneSpring and Ingenuity Pathway analysis. Validation of several genes was undertaken by quantitative real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction.
RESULTS: Comparison …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Exercise is vital for maintaining cartilage integrity in healthy joints. Here we examined the exercise-driven transcriptional reg … (KEGG) pathway mapper was used to identify the metabolic pathways regulated by exercise.
RESULTS: Microarray analysis revealed that exercise-induced 644 DEGs in healthy articular cartilage. The DAVID bioinformatics tool demonstrated high prevalence of functional annotation clusters with greater enrichment scores and GO-terms associated with extracellular matrix (EC …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Despite recent advances in cancer therapy, the overall 5-year survival rate of patients with lung cancer remains low. The aim of our study was to search for novel markers for early diagnosis in patients with lung cancer.
METHODS: Complementary DNA microarray analysis was performed in primary lung adenocarcinomas and cell lines to search for differentially expressed genes, followed by in vivo and in vitro tumorigenic assays to characterize the oncogenic potential of the candidate genes. Gene body methylation was analyzed by 450K methylation array, bisulfite sequencing, and quanti…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BRCA-associated protein 1 (BAP1) has emerged as a promising biomarker for malignant pleural mesothelioma (MPM). Loss of BAP1 expression can occur by a variety of mechanisms, but reports on incidence are variable and the clinical significance is unclear. In order to investigate the diagnostic and prognostic significance of BAP1, we constructed a tissue microarray consisting of 111 MPM cases and performed BAP1 immunohistochemistry. BAP1 was lost in 77% of epithelioid cases (n=58) but was retained in all sarcomatoid cases (n=10); 49% of biphasic cases showed loss (n=43), and BAP1-negative cases d
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To analyze the expression of karyopherin alpha 2 (KPNA2) in upper tract urothelial carcinoma (UTUC) and to investigate whether the KPNA2 expression provides additional prognostic information following radical nephroureterectomy (RNU).
METHODS: A tissue microarray (TMA) containing samples from 176 patients with UTUC who underwent RNU at our institute was analyzed for KPNA2 expression using immunohistochemistry. KPNA2 expression in normal urothelial cell line and urothelial carcinoma cell lines was evaluated by western blot analysis. Using RNA interference in vitro, the effects of K
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human papillomavirus (HPV) testing is used in primary cervical screening, as an adjunct to cervical cytology for the management of low grade abnormal cytology, and in a test of cure. PapilloCheck (Greiner Bio-One) is a PCR-based DNA microarray system that can individually identify 24 HPV types, including the 13 high-risk (HR) types identified by Hybrid Capture 2 (HC2). Here, we compare PapilloCheck with HC2 for the detection of high-grade cervical intraepithelial neoplasia (CIN2+) in a total of 8,610 cervical cytology samples from the ARTISTIC population-based cervical screening study. We perf
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Test systems to identify developmental toxicants are urgently needed. A combination of human stem cell technology and transcriptome analysis was to provide a proof of concept that toxicants with a related mode of action can be identified and grouped for read-across. We chose a test system of developmental toxicity, related to the generation of neuroectoderm from pluripotent stem cells (UKN1), and exposed cells for 6 days to the histone deacetylase inhibitors (HDACi) valproic acid, trichostatin A, vorinostat, belinostat, panobinostat and entinostat. To provide insight into their toxic action, w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Osteogenesis imperfecta (OI) is a rare inherited skeletal disease, characterized by bone fragility and low bone density. The mutations in this disorder have been widely reported to be on various exonal hotspots of the candidate genes, including COL1A1, COL1A2, CRTAP, LEPRE1, and FKBP10, thus creating a great demand for precise genetic tests. However, large genome sizes make the process daunting and the analyses, inefficient and expensive. Therefore, we aimed at developing a fast, accurate, efficient, and cheaper sequencing platform for OI diagnosis; and to this end, use of an advanc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the mechanisms underlying damage to rat small intestine in heat- and shake-induced stress. Eighteen Sprague-Dawley rats were … nd gaps in the karyolemma increased; and the endoplasmic reticulum (ER) swelled significantly. Gene microarray analysis assessed 93 differentially expressed genes associated with apoptosis, ER stress, and autophagy. Relevant genes were compiled from the Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) databases. Forty-one genes were involved in t …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic sclerosis (SSc) is an autoimmune disease characterized by vascular damage and fibrosis of the skin and internal organs. Because activated and oligoclonally expanded CD8(+) T cells can be detected in peripheral blood and lungs of SSc patients, effector memory CD8(+) T cells may play a critical role for organ involvement in SSc; however, the pathogenic functions of effector memory CD8(+) T cells remain incompletely understood. In this study, we performed DNA microarray analysis of the sort-purified effector memory CD8(+) T cells from SSc patients and healthy controls, and showed that th…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To search for biomarkers to differentiate primary focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) and minimal change disease (MCD).
METHODS: We isolated glomeruli from kidney biopsies of 6 patients with adult-onset steroid sensitiveFSGS and 5 patients with MCD, and compared the profiles of glomerular transcriptomes between the two groups of patients using microarray analysis.
RESULTS: Analysis of differential expressed genes (DEGs) revealed that up-regulated DEGs in FSGS patients compared with MCD patients were primarily involved in spermatogenesis, gamete generation, regulation of musc…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vascular remodeling caused by extracellular matrix (ECM) metabolism contributes to the development of cerebral vasospasm after subarachnoid … ial hemorrhage. TIMP-1, TIMP-2, MMP-2, and MMP-9 mRNA and protein expression were investigated with microarray analysis, quantitative real-time PCR, immunoblot analysis, and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The expression and localization of TIMP-1, TIMP-2, MMP-2, MMP-9, elastin, fibronectin, laminin, and collagens I, III, and IV were investigated with immu …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer (CC) as other cancer types, presents molecular deregulations, such as the alterations of transcription factors. Krüppel-like factors (KLF) are a family of transcriptional regulators. They are involved in diverse cellular processes, such as proliferation, apoptosis, and angiogenesis among others. Here, we analyzed the expression of all 17 KLF members at messenger RNA (mRNA) level, and protein expression of the two most commonly altered KLF5 and KLF6 in cervical tissues. Fifty-nine cervical tissues ranging from normal tissue to CC were evaluated for KLF1-17 mRNA expression by end
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An effective countermeasure against radiation damage to normal tissues is urgently needed. The major goal of the present study was to determ … vs. 2-Gy alone); this cytokine is implicated in immune-related central nervous system pathologies. Microarray analysis of brains on day 32 showed that while radiation increased expression of inflammatory genes such as Il1f10, Il17, Tnfrsf11b, Tnfsf12, Il12b and Il1f8, these were no longer up-regulated in the minocycline-treated groups. Similarly, the pro-apoptotic g …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Brachyury overexpression has been reported in various human malignant neoplasms, but its expression and function in hepatocellular car … issues collected from patients with HCC (n = 112) were analyzed using immunohistochemical method; a microarray analysis of HCC tissues was performed to explore the clinicopathological variables of HCC. The migratory and invasive capacities of Brachyury-SMMC7721 and Brachyury-HepG2 transfected cells were evaluated using in vitro scratch wound healing and Matrigel inva …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methyl-mercury (MeHg) is a potent neuroendocrine disruptor that impairs reproductive processes in fish. The objectives of this study were to … ish and one river system with LMB that contained elevated concentrations of MeHg (St. Marys River). Microarray analysis was used to quantify transcriptomic responses to MeHg exposure. Although fish at the high-MeHg site did not show overt health or reproductive impairment, there were MeHg-responsive genes and pathways identified in the laboratory study that were also …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Several clinical forms of malaria such as chronic carriage, gestational malaria or hyper-reactive malarial splenomegaly may follow a cryptic evolution with afebrile chronic fatigue sometimes accompanied by anemia and/or splenomegaly. Conventional parasitological tests are often negative or not performed, and severe complications may occur. Extensive explorations of these conditions often include the search for antinuclear autoantibodies (ANA).
METHODS: We analysed fluorescence patterns in the ANA test in patients with either chronic cryptic or acute symptomatic malaria, then condu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To develop a standardized approach for molecular diagnostics, we used the gene expression ratio bioinformatic technique to design a molecular signature to diagnose malignant pleural mesothelioma (MPM) from among other potentially confounding diagnoses and differentiate the epithelioid from the sarcomatoid histologic subtype of MPM. In addition, we searched for pathways relevant in MPM in comparison with other related cancers to identify unique molecular features in MPM.
EXPERIMENTAL DESIGN: We conducted microarray analysis on 113 specimens including MPMs and a spectrum of tumors and …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Alveolar soft part sarcoma (ASPS) is a rare, highly vascular tumor, for which no effective standard systemic treatment exists for p … best response, with a disease control rate (partial response + stable disease) at 24 weeks of 84%. Microarray analysis with validation by quantitative real-time polymerase chain reaction on paired tumor biopsies from eight patients demonstrated downregulation of genes related to vasculogenesis.
CONCLUSION: In this largest prospective trial to date of systemic thera …
Клиническое исследование II фазыСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.