OBJECTIVE: The objective of this study was to determine whether Lactobacillus species found in African women differ substantially to those of white decent, described in previous studies. The vaginal microbiota play an important role in female health, and when the naturally dominant lactobacilli are displaced resulting in bacterial vaginosis (BV), the host is more at risk of acquiring sexually transmitted diseases, including HIV.
METHODS: Vaginal samples were collected from 241 healthy, premenopausal Nigerian women, which were then Gram-stained for Nugent scoring. Microbial DNA was extracted,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Hereditary hypophosphatemic rickets with hypercalciuria (HHRH) is a rare metabolic disorder, characterized by hypophosphatemia and rickets/osteomalacia with increased serum 1,25-dihydroxyvitamin D [1,25-(OH)(2)D] resulting in hypercalciuria.
OBJECTIVE: Our objective was to determine whether mutations in the SLC34A3 gene, which encodes sodium-phosphate cotransporter type IIc, are responsible for the occurrence of HHRH.
DESIGN AND SETTING: Mutation analysis of exons and adjacent introns in the SLC34A3 gene was conducted at an academic research laboratory and medical center.
PATIENTS
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The complete nucleotide sequence of the 6913 bp plasmid pSTE2 from Staphylococcus lentus, which mediates inducible resistance to tetracyclines, macrolides and lincosamides, was determined. The plasmid was analysed for potential reading frames and structural features to gain insight into its development from potential ancestor plasmids.
METHODS: Plasmid pSTE2 was transformed into Staphylococcus aureus RN4220. Suitable restriction fragments were cloned into E. coli plasmid vectors and sequenced. In vitro susceptibility testing was performed to confirm the resistance phenotype mediat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The JC virus (JCV) is generally considered the etiological agent of progressive multifocal leukoencephalopathy (PML), a demyelinating brain illness, often associated with immunosuppression and significantly frequent in acquired immunodeficiency syndrome (AIDS) patients. The primary infection by JCV is usually asymptomatic and the virus can remain in a latent status in the kidney. As a consequence of immunological alterations of the host, the virus can show a genetic variability in the noncoding control region (NCCR) due to deletions, duplications, and insertions as compared with the archetype.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Simian AIDS-related lymphomas (sARL) of cynomolgus monkeys infected with a simian immunodeficiency virus (SIVsm) were studied in relation to growth in severe combined immunodeficient (SCID) mice, karyotype abnormalities, and DNA sequence of the first noncoding region of the Bcl-6 gene. The tumors were diffuse large B cell lymphomas and expressed a simian homolog to Epstein-Barr virus (HVMF-1) in 12 of 13 primary tumors and corresponding cell lines. A tested cell line was tumorigenic in SCID mice. Tumors in the SCID mice showed cell growth features similar to those in the original lymphoma, sug
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the majority of patients with Pelizaeus-Merzbacher disease, duplication of the proteolipid protein gene PLP1 is responsible, whereas deletion of PLP1 is infrequent. Genomic mechanisms for these submicroscopic chromosomal rearrangements remain unknown. We identified three families with PLP1 deletions (including one family described elsewhere) that arose by three distinct processes. In one family, PLP1 deletion resulted from a maternal balanced submicroscopic insertional translocation of the entire PLP1 gene to the telomere of chromosome 19. PLP1 on the 19qtel is probably inactive by virtue o
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial (mt)DNA is strictly maternally inherited in mammals; new mutations thus segregate along maternal lineages without the benefit of homologous recombination with mtDNA of paternal origin. Despite the high mtDNA copy number (approximately 100000 or more) in mature oocytes, and despite the relatively small number of cell divisions during oogenesis, mtDNA sequence variants segregate rapidly between generations. This paradoxical behaviour has been ascribed to the presence of a mtDNA 'bottleneck' in oogenesis or early embryogenesis. The nature and size of this bottleneck have been the su
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diffuse esophageal leiomyomatosis (DL), a benign smooth-muscle-cell tumor, is characterized by abnormal cell proliferation. DL is sometimes associated with X-linked Alport syndrome (AS), an inherited nephropathy caused by COL4A5 gene mutations. COL4A5 is tightly linked, in a head-to-head fashion, to the functionally related and coordinately regulated COL4A6 gene. No X-linked AS cases are due to COL4A6 mutations, but all DL/AS cases are always associated with deletions spanning the 5' regions of the COL4A5/COL4A6 cluster. Unlike the COL4A5 breakpoints, those of COL4A6 are clustered within intro
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Stoffel fragment of Taq DNA polymerase lacks the 5' to 3' exonuclease activity that hydrolyzes potentially blocking DNA strands during primer extension. We there-fore asked whether by using this fragment in the PCR, non-extendable, base-paired oligonucleotides could inhibit amplification in a sequence-dependent manner. Model targets were chosen from the partially conserved ribosomal 16S rDNA of three bacterial species: E. coli, Bacillus subtilis and Neisseria gonorrhoea. A single pair of primers was capable of amplifying a homologous 240-bp region from all three. Two non-extendable "blocki
Поддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАTechnical ReportСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrin alpha 2 beta 1 is a cell surface adhesion receptor for collagen and echovirus 1. Here we localized the epitopes for anti-alpha 2 monoclonal antibodies using interspecies (human/bovine) alpha 2 chimeras with different lengths of human alpha 2 sequence on the amino-terminal side and site-directed mutagenesis. The antibodies that block the collagen and/or echovirus 1 binding to human alpha 2 beta 1 (6F1, RMAC11, 12F1, and AA10) recognizes a small region (residues 173-259) within the I domain. Asp-160 and Arg-242 are critical for binding of the two other function-inhibiting antibodies, P1
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to better understand the regulation of Pseudomonas aeruginosa flagellin expression we cloned the sigma factor of RNA polymerase used to transcribe the flagellin gene. It is a member of the sigma 28 class of alternative sigma factors described in several bacterial genera. Using the published sequence of the fliA gene encoding the sigma 28 from Salmonella typhimurium, we designed two oligonucleotides and, using the polymerase chain reaction, isolated the fliA gene from S. typhimurium chromosomal DNA. This heterologous probe was used in the DNA blot analysis of restriction digests of P.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent discovery of sequences at the site of the Duchenne muscular dystrophy (DMD) gene in humans has opened up the possibility of a detailed molecular analysis of the genes in humans and in related mammalian species. Until relatively recently, there was no obvious mouse model of this genetic disease for the development of therapeutic strategies. The identification of a mouse X-linked mutant showing muscular dystrophy, mdx, has provided a candidate mouse genetic homologue to the DMD locus; the relatively mild pathological features of mdx suggest it may have more in common with mutations of
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in DNA MMR genes, mainly MSH2 and MLH1, account for the majority of HNPCC, an autosomal dominant predisposition to colorectal cancer and other malignancies. The evaluation of many questions regarding HNPCC requires clinically and genetically well-characterized HNPCC patient cohorts of reasonable size. One main focus of this multicenter study is the evaluation of the mutation spectrum and mutation frequencies in a large HNPCC cohort in Germany; 1,721 unrelated patients, mainly of German descent, who met the Bethesda criteria were included in the study. In tumor samples of 1,377 patien
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate detection of pathogenic variants in genes with highly homologous pseudogenes remains challenging in next-generation sequencing (NGS). SBDS, the causative gene for Shwachman-Diamond syndrome (SDS), is challenging to analyze because of interference from its pseudogene, SBDSP1, causing frequent read misalignment and false-negative variant calls, especially for low-variant-allele-frequency (VAF) variants such as c.183_184delinsCT. We developed Pseudogene ReAligner (PseudoRA), a novel bioinformatics algorithm that resolves gene-pseudogene misalignment through read realignment and haplotype
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human immune response and factors that modulate it represent challenges and opportunities in many areas of medicine. Examples are the threat of transplant rejection and the reduction of this threat by the administration of a bacterially derived immune evasion enzyme. Streptococcus species secrete proteases of the IdeS/Mac family that efficiently degrade host immunoglobulin G (IgG) to help the bacteria evade the host's immune response. IdeS has recently received interest as a tool for transiently ablating circulating IgG in the context of diverse treatments, including transplantation and ge
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
17β-hydroxysteroid dehydrogenases (Hsd17bs) play a critical role in sex steroid biosynthesis. Although multiple types of Hsd17b have been found in fish, there is limited research on their expression and function. Recently, we succeeded in identifying eight types of Hsd17b (types 3, 4, 7, 8, 10, 12a, 12b, and 14) by RNA sequencing in the Japanese sardine Sardinops melanostictus, a commercially important clupeoid fish; however, a homologous sequence of Hsd17b1, which catalyzes the key reaction of estradiol-17β (E2) synthesis, was absent. Here, we aimed to identify the Hsd17b type that plays a ma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Charcot-Marie-Tooth disease, type 4D (CMT4D) is a progressive, autosomal recessive form of CMT, characterized by distal muscle weakness and atrophy, foot deformities, severe motor sensory neuropathy, and sensorineural hearing impairment. Mutations in NDRG1 gene cause neuropathy in humans, dogs, and rodents. Here, we describe clinical and genetic features of a 17-year-old male with wasting of hand muscle and foot and severe motor neuropathy. Whole exome sequencing was carried out on the patient and his unaffected parents. We identified a novel deletion of nine nucleotides (c.537 + 2_537 + 10del
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria utilize a wide variety of endogenous cell wall hydrolases, or autolysins, to remodel their cell walls during processes including cell division, biofilm formation, and programmed death. We here systematically investigate the composition of these enzymes in order to gain insights into their associated biological processes, potential ways to disrupt them via chemotherapeutics, and strategies by which they might be leveraged as recombinant antibacterial biotherapies. To do so, we developed LEDGOs (lytic enzyme domains grouped by organism), a pipeline to create and analyze databases of aut
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypervirulent Klebsiella pneumoniae (hvKP) has been increasingly reported over the past three decades and causes severe infections. To increase our understanding of hvKP at the genome level, genome sequencing and comparative genome analysis were performed on 6 hvKPs. The whole genome DNA from 6 hvKPs with different capsular serotypes isolated in China was extracted. The genome sequencing and assembly results showed the genome size of the six hvKPs and GC content. Comparative analyses of the genomes revealed the gene homology and genome rearrangement in the 6 hvKPs compared with Klebsiella pneu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinal muscular atrophy (SMA) is a leading genetic cause of infant death, influenced by the copy number of two highly homologous genes: SMN1 and SMN2. Although exome sequencing is widely applied for genetic testing, SMA diagnosis and carrier screening have not been incorporated in routine data analysis and lack evaluation in clinical applications. We established a workflow for the SMN gene copy number analysis through uniquely mapped reads on exon 7 of SMN genes and the control region. The workflow was applied retrospectively in the enrolled cohort and validated with multiple ligation-dependen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования