Molecular research in cancer is one of the largest areas of bioinformatic investigation, but it remains a challenge to understand biomolecular mechanisms in cancer-related pathways from high-throughput genomic data. This includes the Nuclear-factor-kappa-B (NFκB) pathway, which is central to the inflammatory response and cell proliferation in prostate cancer development and progression. Despite close scrutiny and a deep understanding of many of its members' biomolecular activities, the current list of pathway members and a systems-level understanding of their interactions remains incomplete. H
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
6-C-(E-phenylethenyl)naringenin (6-CEPN) is a small molecule found in naringenin fortified fried beef. It has been shown to suppress colon cancer cell proliferation, but the underlying mechanisms are not fully understood. Here we demonstrate that 6-CEPN suppresses tumour cell proliferation through cell cycle arrest in G1 phase, induces necrotic cell death and autophagy in colon cancer cells. Blockade of autophagy by knockdown of the essential autophagy proteins, Atg7 or beclin-1, resulted in aggravated cell death in response to 6-CEPN treatment. In addition, genome-wide transcriptome expressio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Traditional Chinese medicine (TCM) has definitely clinical effect in treating hyperlipidemia, but the action mechanism still need to be explored. Based on consulting Chinese Pharmacopoeia (2010), all the lipid-lowering Chinese patent medicines were analyzed by associated rules data mining method to explore high frequency herb pairs. The top three couplet medicines with high support degree were Puerariae Lobatae Radix-Crataegi Fructus, Salviae Miltiorrhizae Radix et Rhizoma-Crataegi Fructus, and Polygoni Multiflori Radix-Crataegi Fructus. The 20 main ingredients were selected from the herb pair
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gremlin is a member of the CAN (cerberus and DAN) family of secreted BMP (bone morphogenetic protein) antagonists and also an agonist of VEGF (vascular endothelial growth factor) receptor-2. It is critical in limb skeleton and kidney development and is re-expressed during tissue fibrosis. Gremlin binds strongly to heparin and heparan sulfate and, in the present study, we sought to investigate its heparin-binding site. In order to explore a putative non-contiguous binding site predicted by computational molecular modelling, we substituted a total of 11 key arginines and lysines located in three
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug-induced liver injury (DILI) is an important cause of drug toxicity. Inhibition of multidrug resistance protein 4 (MRP4), in addition to bile salt export pump (BSEP), might be a risk factor for the development of cholestatic DILI. Recently, we demonstrated that inhibition of MRP4, in addition to BSEP, may be a risk factor for the development of cholestatic DILI. Here, we aimed to develop computational models to delineate molecular features underlying MRP4 and BSEP inhibition. Models were developed using 257 BSEP and 86 MRP4 inhibitors and noninhibitors in the training set. Models were exte
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tanshinone IIA is a pharmacologically active compound isolated from Danshen (Salvia miltiorrhiza), a traditional Chinese herbal medicine for the management of cardiac diseases and other disorders. But its underlying molecular mechanisms of action are still unclear. The present investigation utilized a data mining approach based on network pharmacology to uncover the potential protein targets of Tanshinone IIA. Network pharmacology, an integrated multidisciplinary study, incorporates systems biology, network analysis, connectivity, redundancy, and pleiotropy, providing powerful new tools and in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antifreeze proteins (AFPs) enable the polar living species to survive subzero temperature conditions through effective lowering of the freezing point of body fluids. At the molecular level, AFPs directly interact with the growing seeds of ice crystals to inhibit their formation. To understand the structural and dynamic aspects of this interaction at the atomistic level, molecular dynamics (MD) simulations were carried out on several type I AFPs at multiple temperatures, including the physiologically relevant temperature of 273 K, a lower temperature of 227 K, and the conventional 300 K. A comp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disease classification system increasingly incorporates information on pathogenic mechanisms to predict clinical outcomes and response to therapy and intervention. Technological advancements to interrogate omics (genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, metagenomics, interactomics, etc.) provide widely open opportunities in population-based research. Molecular pathological epidemiology (MPE) represents integrative science of molecular pathology and epidemiology. This unified paradigm requires multidisciplinary collaboration between pathology, epidemiology, biostatistic
Conference ProceedingsПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metachondromatosis is a benign bone disease predominantly observed in the hands and feet of children or young adults demonstrating two different manifestations: a cartilage-capped bony outgrowth on the surface of the bone called exostosis and ectopic cartilaginous nodules inside the bone called enchondroma. Recently, it has been reported that loss-of-function mutations of the SHP2 gene, which encodes the SHP2 protein tyrosine phosphatase, are associated with metachondromatosis. The purpose of this study was to investigate the role of SHP2 in postnatal cartilage development, which is largely un
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Analyze genetic and phylogenetic interrelations between S. pneumoniae strains isolated from meningitis patients and carriers.
MATERIALS AND METHODS: 23 S. pneumoniae isolates (9 from bacterial meningitis patients, 9 from nasopharynx of bacterial carriers, 5 strains from museum collection of Gabrichevsky Moscow Research Institute of Epidemiology and Microbiology) were studied. S. pneumoniae ATCC 49619, S. mitis ATCC 49456 served as control strains. S. pneumoniae serotype determination was carried out in latex-agglutination reaction and quelling reaction. Multiplex PCR according to WHO pro
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиОригинал на русском
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Ca(2+)-activated channel of intermediate-conductance (KCa3.1) is a target for antisickling and immunosuppressant agents. Many small peptides isolated from animal venoms inhibit KCa3.1 with nanomolar affinities and are promising drug scaffolds. Although the inhibitory effect of peptide toxins on KCa3.1 has been examined extensively, the structural basis of toxin-channel recognition has not been understood in detail. Here, the binding modes of two selected scorpion toxins, charybdotoxin (ChTx) and OSK1, to human KCa3.1 are examined in atomic detail using molecular dynamics (MD) simulations.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Free energy simulations compare multiple ligand:receptor complexes by "alchemically" transforming one into another, yielding binding free energy differences. Since their introduction in the 1980s, many technical and theoretical obstacles were surmounted, and the method ("MDFE," since molecular dynamics are often used) has matured into a powerful tool. We describe its current status, its effectiveness, and the challenges it faces. MDFE has provided chemical accuracy for many systems but remains expensive, with significant human overhead costs. The bottlenecks have shifted, partly due to increas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic islet cell tumors (ICTs) occur as sporadic neoplasias or as a manifestation of multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1) and von Hippel-Lindau disease (VHL). Molecular classification of ICTs is mandatory for timely diagnosis and surveillance. Systematic comparison of VHL-ICTs and sporadic ICTs has been lacking. Our registry-based approaches used the German NET-Registry with 259 patients with neuroendocrine tumors (NETs), who were primarily diagnosed with NETs, and the German VHL-Registry with 485 molecular genetically confirmed patients who had undergone magnetic resonance imaging
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylglyoxal is mainly catabolized by two major enzymatic pathways. The first is the ubiquitous detoxification pathway, the glyoxalase pathway. In addition to the glyoxalase pathway, aldose reductase pathway also plays a crucial role in lowering the levels of methylglyoxal. The gene encoding aldose reductase (ALR) has been cloned from Leishmania donovani, a protozoan parasite causing visceral leishmaniasis. DNA sequence analysis revealed an open reading frame (ORF) of approximately 855 bp encoding a putative protein of 284 amino acids with a calculated molecular mass of 31.7 kDa and a predict
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies of recombinant full-length human apolipoprotein A-V (apoA-V) provided evidence of the presence of two independently folded structural domains. Computer-assisted sequence analysis and limited proteolysis studies identified an N-terminal fragment as a candidate for one of the domains. C-Terminal truncation variants in this size range, apoA-V(1-146) and apoA-V(1-169), were expressed in Escherichia coli and isolated. Unlike full-length apoA-V or apoA-V(1-169), apoA-V(1-146) was soluble in neutral-pH buffer in the absence of lipid. Sedimentation equilibrium analysis yielded a weigh
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
'Homeopathic dilutions' and 'Memory of Water' are two expressions capable of turning a peaceful and intelligent person into a violently irrational one,' as Michel Schiff points out in the introduction of his book 'The Memory of Water'. The idea of the memory of water arose in the laboratory of Jacques Benveniste in the late 1980s and 20 years later the debate is still ongoing even though an increasing number of scientists report they have confirmed the basic results. This paper, first provides a brief historical overview of the context of the high dilution experiments then moves on to digital
Историческая статьяСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The low-copy repeat (LCR) is a new class of repetitive DNA element and has been implicated in many human disorders, including DiGeorge/velocardiofacial syndrome (DGS/VCFS). It is now recognized that nonallelic homologous recombination (NAHR) through LCRs flanking the chromosome 22q11.2 region leads to genome rearrangements and results in the DGS/VCFS. To refine the structure and content of chromosome 22q11.2 LCRs, we applied computational analysis to dissect region-specific LCRs using publicly available sequences. Nine distinct duplicons between 1.6 and 65 kb long and sharing >95% sequence ide
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Considerable progress has been achieved by functional brain imaging over the past 20 years in uncovering the biological basis of major psychiatric disorders and to more effectively target therapeutics. Radioligand techniques, especially the PET (positron emission tomography) method, are specific and sensitive tools for quantitative in vivo imaging of molecular pathways and molecular interactions within brain tissues. Since 1980s, advances in neuroimaging and neurophysiological techniques have provided tremendous merits for investigations into different psychiatric disorders. PET and SPECT (sin
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The autosomal recessive Pendred's syndrome is defined by congenital sensorineural deafness, goiter, and impaired iodide organification. It is caused by mutations in the Pendred's syndrome (PDS) gene that encodes pendrin, a chloride/iodide transporter expressed in the thyroid, the inner ear, and the kidney.
OBJECTIVE: To perform a detailed clinical and molecular analysis of patients with Pendred's syndrome from four patients from three unrelated Mexican families.
METHODS: Thyroid function tests, perchlorate test, thyroid scintigraphy, audiometry, computer tomography and magnetic r
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertensive heart disease caused by renovascular hypertension reflects the response of the heart to an increased afterload and neurohormonal stimulation. We hypothesized that in this condition the composition of the myocardial proteins of rats was altered. To identify yet unknown quantitative and qualitative differences in myocardial proteins in renovascular hypertensive heart disease, we analyzed protein patterns by computer-assisted two-dimensional polyacrylamide large gel electrophoresis. Renovascular hypertension was induced by placing a silver clip on the left renal artery in 9-week-old
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.