Elizabethkingia meningoseptica is Gram-negative, rod-shaped opportunistic bacterial pathogen increasingly reported in hospital-acquired outb … enzyme of the carbapenem synthesis pathway, was also discovered in E. meningoseptica. Further, the proteomics data were harnessed for refining the genome annotation. We discovered 39 novel protein-coding genes and corrected four existing translations using proteogenomic workflow. Novel translations reported in this study enhance the molecular data on this o …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Activity-based anorexia (ABA) in rodents is a behavioral model of anorexia nervosa, characterized by negative energy balance, hyperactivity, and dysbiosis of gut microbiota. Gut bacteria are known to produce energy substrates including adenosine triphosphate (ATP) and acetate. The aim of this study was to determine whether ABA alters the proteome of gut microbiota relevant to ATP and acetate production.
METHODS: The ABA was developed in male mice and compared with food-restricted and ad libitum-fed conditions. Proteomic analysis of feces was performed using the two-dimentional gel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Parkinson's disease (PD) is one of the most common nervous system degenerative diseases. However, the etiology of this disease remains elusive. Here, a proteasome inhibitor (PSI)-induced undifferentiated SH-SY5Y PD model was established to analyze protein alterations through proteomic study.
METHODS: Cultured undifferentiated SH-SY5Y cells were divided into a control group and a group treated with 2.5 µM PSI (PSI-treated group). An methyl thiazolyl tetrazolium (MTT) assay was applied to detect cell viability. Acridine orange/ethidium bromide (AO/EB), α-synuclein immunofluorescence
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pandemic influenza A virus (IAV) outbreaks occur when strains from animal reservoirs acquire the ability to infect and spread among humans. The molecular basis of this species barrier is incompletely understood. Here we combine metabolic pulse labeling and quantitative proteomics to monitor protein synthesis upon infection of human cells with a human- and a bird-adapted IAV strain and observe striking differences in viral protein synthesis. Most importantly, the matrix protein M1 is inefficiently produced by the bird-adapted strain. We show that impaired production of M1 from bird-adapted stra…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leishmaniasis is a parasitic disease caused by more than 20 species of the Leishmania genus. The disease is globally distributed and is endemic in 97 countries and three territories in the tropical and subtropical regions. The efficacy of the current treatments is becoming increasingly low either due to incomplete treatment or resistant parasites. Failure of treatment is frequent, and therefore, the search for early biomarkers of therapeutic response in cutaneous leishmaniasis (CL) is urgently needed.
OBJECTIVE: The aim of this study was to compare the proteomic profiles in patien
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glaucoma is an optic neurological disorder and the leading cause of irreversible blindness worldwide, with primary open angle glaucoma (POAG) as its most prevalent form. An early diagnosis of the disease is crucial to prevent loss of vision. Mechanisms behind glaucoma pathogenesis are not completely understood, but disease related alterations in the serological autoantibody profile indicate an immunologic component. These changes in immunoreactivity may serve as potential biomarkers for glaucoma diagnostics. We aimed to identify novel disease related autoantibodies targeting antigens in the tr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Elite controllers (ECs) spontaneously control plasma human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) RNA without antiretroviral ther … control during the same follow-up period (persistent controllers [PCs]). Comparative plasma shotgun proteomics was performed with tandem mass tag (TMT) isobaric tag labeling and nanoflow liquid chromatography coupled to Orbitrap mass spectrometry.
RESULTS: Eighteen proteins exhibited differences comparing PC and preloss TC timepoints. These proteins were in …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
All terrestrial organisms are subject to evolutionary pressures associated with natural sources of ionizing radiation (IR). The legacy of human-induced IR associated with energy, weapons production, medicine, and research has changed the distribution and magnitude of these evolutionary pressures. To date, no study has systematically examined the effects of environmentally relevant doses of radiation exposure across an organismal proteome. This void in knowledge has been due, in part, to technological deficiencies that have hampered quantifiable environmentally relevant IR doses and sensitive d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The modern pig industry relies on extensive use of artificial insemination with cooled semen. It is important that semen doses maintain their quality during processing, transport and storage before insemination to guarantee maximum fertility rates. However, ejaculates may respond differently to liquid preservation at 17 °C, despite the optimal quality assessed before cooling. Thus, the aim of this study was to identify differences in seminal plasma proteome of ejaculates with a higher or lower seminal resistance to storage at 17 °C. A total of 148 ejaculates from 65 sexually mature healthy boa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Olive pollen is a major allergenic source worldwide due to its extensive cultivation. We have combined available genomics data with a comprehensive proteomics approach to get the annotated olive tree (Olea europaea L.) pollen proteome and define its complex allergenome. A total of 1907 proteins were identified by LC-MS/MS using predicted protein sequences from its genome. Most proteins (60%) were predicted to possess catalytic activity and be involved in metabolic processes. In total, 203 proteins belonging to 47 allergen families were found in olive pollen. A peptidyl-prolyl cis-trans isomera…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Seminal plasma is a promising diagnostic fluid for male infertility. In assisted reproduction, the seminal plasma-based characteristics of normozoospermic men achieving successful clinical pregnancy through rescue intracytoplasmic sperm injection after in vitro fertilization failure remain unclear.
OBJECTIVE: To identify potential seminal plasma proteins to contribute to a new understanding of unexplained male factor infertility.
MATERIALS AND METHODS: An approach with isobaric tags for relative and absolute quantification labeling coupled with liquid chromatography matrix-assist
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Porthidium includes nine pitviper species inhabiting Mexico, Central America, and northern South America. Porthidium porrasi is a species endemic to the Southwest of Costa Rica, for which no information on its venom was available. In this study, the proteomic composition and functional activities of P. porrasi venom are described. The most abundant venom proteins were identified as metalloproteinases (36.5%). In descending order of abundance, proteins belonging to the disintegrin, phospholipase A2, serine proteinase, C-type lectin/lectin-like, vascular endothelial growth factor, Cyst
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ultrasound (US) therapy may improve osteoarthritis symptoms. We investigated the effects of US on the synovial fluid (SF) proteome in a rabbit knee osteoarthritis (KOA) model to explore its therapeutic mechanisms.
METHODS: Sixteen healthy 6-month-old New Zealand white rabbits (eight male, eight female), weighing 2.5-3.0 kg, were randomly divided into groups A and B with eight rabbits per group. Both groups were subjected to right anterior cruciate ligament transaction. Six weeks after surgery, we treated the operated knee joint of group A rabbits with US and of group B rabbits wit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neutrophil Extracellular Traps (NETs) are implicated in the development of auto-immunity in diseases such as rheumatoid arthritis (RA) and systemic lupus erythematosus (SLE) through the externalization of intracellular neoepitopes e.g., dsDNA and nuclear proteins in SLE and citrullinated peptides in RA. The aim of this work was to use quantitative proteomics to identify and measure NET proteins produced by neutrophils from healthy controls, and from patients with RA and SLE to determine if NETs can be differentially-generated to expose different sets of neoepitopes. Ultra-pure neutrophils (>99…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Adrenocortical adenomas (ACAs) can lead to the autonomous secretion of aldosterone responsible for primary aldosteronism (PA), which is the most common form of secondary arterial hypertension. However, the authentic fundamental mechanisms underlying ACAs remain unclear.
OBJECTIVE: Isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ)-based proteomics and bioinformatics analyses from etiological studies of ACAs were performed to screen the differentially expressed proteins (DEPs) and investigate the relevant mechanisms of their occurrence and development. Results could help …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peritoneal dialysis (PD) fluids are cytotoxic to the peritoneum. Recent studies have shown that alanyl-glutamine (AlaGln) modulates the cellular stress response, improves mesothelial cell survival, reduces submesothelial thickening in experimental models of PD, and in clinical studies improves PD effluent cell stress and immune responses. However, the mechanisms of AlaGln-mediated membrane protection are not yet fully understood. Here, we explore those mechanisms through application of a novel proteomics approach in a clinically relevant in vivo model in rats. Experimental PD was performed for…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The eccrine sweat gland is an exocrine gland that is involved in the secretion of sweat for control of temperature. Malfunction of the sweat glands can result in disorders such as miliaria, hyperhidrosis and bromhidrosis. Understanding the transcriptome and proteome of sweat glands is important for understanding their physiology and role in diseases. However, no systematic transcriptome or proteome analysis of sweat glands has yet been reported. Here, we isolated eccrine sweat glands from human skin by microdissection and performed RNA-seq and proteome analysis. In total, ∼138,000 transcripts
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human leptospirosis, or commonly known as "rat urine disease" is a zoonotic disease that is caused by the bacteria called Leptospira sp. The incidence rate of leptospirosis has been under-reported due to its unspecific clinical symptoms and the limitations of current laboratory diagnostic methods. Leptospirosis can be effectively treated with antibiotics in the early stage, and it is a curable disease but the accuracy to diagnose the infection is rarely achieved.
METHODS: The present pilot study investigated plasma protein profiles of leptospirosis patients and compared them again
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Campylobacter jejuni (C. jejuni) is a foodborne intestinal pathogen and major cause of gastroenteritis worldwide. C. jejuni proteins that are immunogenic have been sought for their potential use in the development of biomarkers, diagnostic assays, or subunit vaccines for humans or livestock. To identify new immunogenic C. jejuni proteins, we used a native protein microarray approach. A protein chip, with over 1400 individually purified GST-tagged C. jejuni proteins, representing over 86% of the proteome, was constructed to screen for antibody titers present in test sera raised against whole C.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatic stellate cells (HSCs) are the main target of radiation damage and primarily contribute to the development of radiation-induced liver fibrosis. However, the molecular events underlying the radiation-induced activation of HSCs are not fully elucidated. In the present study, human HSC line LX2 was treated with X-ray irradiation and/or TGF-β1, and profibrogenic molecules were evaluated. The iTRAQ LC-MS/MS technology was performed to identify global protein expression profiles in LX2 following exposure to different stimuli. Irradiation or TGF-β1 alone increased expression of α-SMA, collagen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования