Taurine is a semiessential micronutrient critical to many biological processes. However, the genetic variation and the relationships between circulating taurine and human health are unclear. Here, we conducted the largest genome-wide meta-analysis to date, integrating summary statistics from five publicly available independent genome-wide association studies (GWAS) on circulating taurine levels in 36,490 European individuals. We employed LiftOver to harmonize genomic coordinates across the summary statistics derived from five large European cohorts with plasma taurine measurements, followed by
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schizophrenia genome-wide association studies (GWASes) have identified >250 significant loci and prioritized >100 disease-related genes. However, gene prioritization efforts have mostly been restricted to locus-based methods that ignore information from the rest of the genome. To more accurately characterize genes involved in schizophrenia etiology, we applied a combination of highly-predictive tools to a published GWAS of 67,390 schizophrenia cases and 94,015 controls. We combined both locus-based methods (fine-mapped coding variants, distance to GWAS signals) and genome-wide methods (PoPS, M
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite major advances in lipid-lowering therapies, a significant unmet need remains, particularly for patients with homozygous familial hypercholesterolemia (HoFH), severe heterozygous familial hypercholesterolemia (HeFH), and those who fail to achieve guideline-recommended LDL-C targets. Nucleic acid-based therapeutics have emerged as a transformative approach for treating hypercholesterolemia. Antisense oligonucleotides and small interfering RNAs (siRNAs) have demonstrated durable hepatic gene silencing and have led to approved therapies, while gene replacement and in vivo genome-editing st
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Giant cell arteritis (GCA) is a clinically heterogeneous disease, which complicates both diagnosis and management. This study aimed to identify genetic risk factors associated with GCA clinical manifestations and evaluate their utility for defining clinical phenotypes.
METHODS: Genome-wide genotype data from 3498 patients with GCA and 15,550 controls were analysed to investigate the genetic architecture of GCA manifestations. Logistic regression was used to compare patients with and without each manifestation, as well as each subgroup of patients vs controls. Gene annotation was c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella infections represent a significant challenge to global public health, a situation further complicated by the rising prevalence of antibiotic resistance. In this study, a broad-spectrum phage, designated vB_SaeS_BG-2P, capable of efficiently lysing S. 4,[5],12:i:-and S. Kentucky, which are among the predominant serovars associated with human salmonellosis, was identified. The phage demonstrated a lytic efficiency of >98.3% against selected serovars (n = 5) of Salmonella isolates and also infected various Enterobacteriaceae, including Shigella flexneri, Escherichia coli and Klebsiella
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVIES: Pregnancy induced hypertension (PIH) syndrome is a disease that unique to pregnant women and is associated with elevated risk of offspring cardiovascular diseases (CVDs) and neurodevelopmental disorders in their kids. Previous research on cord blood utilizing the Human Methylation BeadChip or EPIC array revealed that PIH is associated with specific DNA methylation site. Here, we investigate the whole genome DNA methylation landscape of cord blood from newborns of PIH mother.
METHODS: Whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) was used to examine the changes in whole genome DNA meth
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adult T-cell leukemia/lymphoma (ATL) is an aggressive neoplasm immunophenotypically resembling regulatory T cells, associated with human T-cell leukemia virus type-1. Here, we performed whole-genome sequencing (WGS) of 150 ATL cases to reveal the overarching landscape of genetic alterations in ATL. We discovered frequent (33%) loss-of-function alterations preferentially targeting the CIC long isoform, which were overlooked by previous exome-centric studies of various cancer types. Long but not short isoform-specific inactivation of Cic selectively increased CD4+CD25+Foxp3+ T cells in vivo. We
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The children of related parents show increased risk of early mortality. The Native American genome typically exhibits long stretches of homozygosity, and Latin Americans are highly heterogeneous regarding the individual burden of homozygosity, the proportion and the type of Native American ancestry. We analysed nationwide mortality and genome-wide genotype data from admixed Chileans to investigate the relationship between common causes of child mortality, homozygosity and Native American ancestry. Results from two-stage linear-Poisson regression revealed a strong association between the sum le
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Down syndrome (DS) is characterized by a genome-wide profile of differential DNA methylation that is skewed towards hypermethylation in most tissues, including brain, and includes pan-tissue differential methylation. The molecular mechanisms involve the overexpression of genes related to DNA methylation on chromosome 21. Here, we stably overexpressed the chromosome 21 gene DNA methyltransferase 3L (DNMT3L) in the human SH-SY5Y neuroblastoma cell line and assayed DNA methylation at over 26 million CpGs by whole genome bisulfite sequencing (WGBS) at three different developmental phas
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psychostimulant (methamphetamine, cocaine) use disorders have a genetic component that remains mostly unknown. We conducted genome-wide quantitative trait locus (QTL) analysis of methamphetamine stimulant sensitivity. To facilitate gene identification, we employed a Reduced Complexity Cross between closely related C57BL/6 mouse substrains and examined maximum speed and distance traveled over 30 min following methamphetamine (2 mg/kg, i.p.). For maximum methamphetamine-induced speed following the second and third administration, we identified a single genome-wide significant QTL on chromosome 1
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying genetic risk factors for parasitic infections such as the leishmaniases could provide important leads for improved therapies and vaccines. Until recently most genetic studies of human leishmaniasis were underpowered and/or not replicated. Here, we focus on recent genome-wide association studies of visceral leishmaniasis (VL) and cutaneous leishmaniasis (CL). For VL, analysis across 2287 cases and 2692 controls from three cohorts identified a single major peak of genome-wide significance (Pcombined = 2.76 × 10-17) at HLA-DRB1-HLA-DQA1. HLA-DRB1*1501 and DRB1*1404/DRB1*1301 were the
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella enterica serovar Enteritidis (SE) is one of the pathogenic bacteria, which affects poultry production and poses a severe threat to public health. Chicken meat and eggs are the main sources of human salmonellosis. DNA methylation is involved in regulatory processes including gene expression, chromatin structure and genomic imprinting. To understand the methylation regulation in the response to SE inoculation in chicken, the genome-wide DNA methylation profile following SE inoculation was analyzed through whole-genome bisulfite sequencing in the current study.
RESULTS: Th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presence of bacterial DNA in Dientamoeba fragilis DNA extracts from culture poses a substantial challenge to sequencing the D. fragilis genome. However, elimination of bacteria from D. fragilis cultures has proven difficult in the past, presumably due to its dependence on some unknown prokaryote/s. This study explored options for removal of bacteria from D. fragilis cultures and for the generation of genome sequence data from D. fragilis. DNA was extracted from human faecal samples and xenic D. fragilis cultures. Extracts were subjected to 16S ribosomal DNA bacterial diversity profiling. X
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zika virus (ZIKV) has drawn global attention as the etiologic agent of Zika Congenital Syndrome in babies born to infected pregnant women. To prevent future ZIKV outbreaks and protect persons at risk for severe disease, we developed two live-attenuated vaccine (LAV) candidates containing 10- or 20-nucleotide deletions in the 3'UTR of the viral genome (Δ10 and Δ20). After a single-dose immunization, both Δ10 and Δ20 LAVs protected mice and non-human primates against ZIKV infection. Here, we characterized the stability, safety, and efficacy of the LAVs after continuously culturing them on manufa
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis is one of the most frequent and disabling diseases of the elderly. Only few genetic variants have been identified for osteoarthritis, which is partly due to large phenotype heterogeneity. To reduce heterogeneity, we here examined cartilage thickness, one of the structural components of joint health. We conducted a genome-wide association study of minimal joint space width (mJSW), a proxy for cartilage thickness, in a discovery set of 13,013 participants from five different cohorts and replication in 8,227 individuals from seven independent cohorts. We identified five genome-wide
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Persistent infections with carcinogenic human papillomavirus (HPV) types are the necessary cause of cervical cancer. We recently demonstrated that the HPV16 genome is strongly methylated in cervical precancer compared with transient infections. However, the extent of methylation in other HPV types and its role in progression to cancer is poorly understood.
METHODS: We analyzed whole-genome methylation patterns of the three next most carcinogenic HPV genotypes: HPV31 (closely related to HPV16), and two other closely related types, HPV18 and HPV45. DNA was extracted from cervical cy
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leptospira are the parasitic bacterial organisms associated with a broad range of mammalian hosts and are responsible for severe cases of human Leptospirosis. The epidemiology of leptospirosis is complex and dynamic. Multiple serovars have been identified, each adapted to one or more animal hosts. Adaptation is a dynamic process that changes the spatial and temporal distribution of serovars and clinical manifestations in different hosts. Serotyping based on repertoire of surface antigens is an ambiguous and artificial system of classification of leptospiral agents. Molecular typing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial respiration, the most efficient metabolic pathway devoted to energy production, is at the crosspoint of 2 quite different genetic systems, the nuclear genome and the mitochondrial genome (mitochondrial DNA, mtDNA). The latter encodes a few essential components of the mitochondrial respiratory chain and has unique molecular and genetic properties that account for some of the peculiar features of mitochondrial disorders. However, the perpetuation, propagation, and expression of mtDNA, the majority of the subunits of the respiratory complexes, as well as a number of genes involved i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The central demyelinating disease progressive multifocal leukoencephalopathy (PML) is caused by the human polyomavirus JC virus (JCV). JCV evolved as geographically based genotypes of which Type 3 is an African variant first characterized in HIV-1 positive patients from Tanzania. This study reports the complete sequence of five JCV Type 3 strains. The entire JCV genome was PCR amplified from urine specimens of three African and two African-American individuals. The African consensus sequence was compared to the Type 1 and Type 2 prototype strains, JCV (Mad-1) and JCV(GS/B), respectively. Type
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A polymerase chain reaction (PCR) amplification assay was developed to detect Coxsackievirus B3 ribonucleic acid (RNA) in blood and myocardial tissue of explanted hearts from 40 patients who underwent cardiac transplantation and in 1 normal heart. Twenty-one patients were affected by idiopathic dilated cardiomyopathy of different duration and 19 by coronary artery disease. Coxsackievirus B3 in vitro infected Vero cells and cells infected by related human enteroviruses (Coxsackievirus B2, B4, and poliovirus 1) were used as reaction controls. PCR was performed using 4 pairs of primers homologous
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования