Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most prevalent cancers and is rising in incidence worldwide. The molecular mechanisms leading to the development of HCC are complex and include both genetic and epigenetic events. To determine the relative contribution of these alterations in liver tumorigenesis, we evaluated epigenetic modifications at both global and gene specific levels, as well as the mutational profile of genes commonly altered in liver tumors. A mouse model of fibrosis-associated liver cancer that was designed to emulate cirrhotic liver, a prevailing disease state observed in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Contemporary high-throughput technologies permit the rapid identification of transcription factor (TF) target genes on a genome-wide scale, yet the functional significance of TFs requires knowledge of target gene expression patterns, cooperating TFs, and cis-regulatory element (CRE) structures. Here we investigated the myogenic regulatory network downstream of the Drosophila zinc finger TF Lame duck (Lmd) by combining both previously published and newly performed genomic data sets, including ChIP sequencing (ChIP-seq), genome-wide mRNA profiling, cell-specific expression patterns of putative t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: MYC is a key transcription factor involved in central cellular processes such as regulation of the cell cycle, histone acetylation and ribosomal biogenesis. It is overexpressed in the majority of human tumors including aggressive B-cell lymphoma. Especially Burkitt lymphoma (BL) is a highlight example for MYC overexpression due to a chromosomal translocation involving the c-MYC gene. However, no genome-wide analysis of MYC-binding sites by chromatin immunoprecipitation (ChIP) followed by next generation sequencing (ChIP-Seq) has been conducted in BL so far.
METHODOLOGY/PRINCIPAL F
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mice with three amino acid mutations in the calmodulin binding domain of type-2 ryanodine receptor ion channel (Ryr2(ADA/ADA) mice) have impaired intracellular Ca(2+) handling and cardiac hypertrophy with death at an early age. In this report, the role of signaling molecules implicated in cardiac hypertrophy of Ryr2(ADA/ADA) mice was investigated. Calcineurin A-β (CNA-β) and nuclear factor of activated T cell (NFAT) signaling were monitored in mice carrying either luciferase transgene driven by NFAT-dependent promoter or knockout of CNA-β. NFAT transcriptional activity in Ryr2(ADA/ADA) hearts
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial infection has become a focus of attention in the pathogenesis of primary biliary cirrhosis (PBC). We earlier reported that the bacterial lipoteichoic acid was detected at the sites of inflammation around damaged bile ducts in the livers of PBC, and PBC patients' sera showed high titers against streptococcal histone-like protein. Here, we investigated whether chronic bacterial exposure could trigger PBC-like epithelial cell damage in normal mouse. BALB/c mice were repeatedly inoculated with various bacteria for 8 weeks. At 1 week (Group 1) and 3, 4, or 20 months (long term; Group 2) a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Because insulin-like growth factor-1 (IGF-1) counteracts the anti-neoplastic effect of cisplatin that induces DNA damage and cell death through the formation of platinum-DNA adducts, we investigated the effects of IGF-1 on the DNA double-strand breaks (DSBs) repair system induced by cisplatin. NCI-H1299 and H460 non-small cell lung cancer (NSCLC) cells treated with IGF-1 recovered from cisplatin-derived inhibited proliferation and apoptosis. Decreased tail length in comet assay and suppressed phosphorylation of histone H2AX at Ser139 with IGF-1 cotreatment indicates that IGF-1 attenuates cispl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-Hodgkin's lymphomas (NHL) form a heterogeneous group of diseases, with diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) comprising the largest subg … also indicate a novel mechanism by which acetylation promotes transcription, not only by modifying histones and activating transcriptional activators, but also by inhibiting transcriptional repressors.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rett syndrome (RTT) is an X-linked dominant neurodevelopmental disorder caused by mutations in MECP2, encoding methyl-CpG-binding protein 2 … xpressed at normal transcript and protein levels, and exhibited no significant effect on acetylated histones or methyl-binding protein 3 (MBD3) levels. Since MeCP2 was predicted to silence transcription of methylated genes, we hypothesized that MeCP2 may be required for silencing imprinted or methylated gene expression. The allelic expression of three diff …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein kinase C (PKC) has been implicated as a target for general anesthetic action in the central nervous system. Previous reports have described either stimulation or inhibition of PKC activity by general anesthetics. This study examines the effects of halothane and propofol on the activity of purified rat brain PKC under various assay conditions.
METHODS: PKC was assayed in vitro using three previously characterized artificial substrates and three different lipid preparations in the absence or presence of halothane or propofol.
RESULTS: Both halothane (50% effective concentra
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclic GMP-dependent protein kinase, purified to homogeneity from bovine lung, was shown to activate hormone-sensitive lipase partially purified from chicken adipose tissue. The degree of activation was the same as that effected by cyclic AMP-dependent protein kinase although higher concentrations of the cyclic GMP-dependent enzyme were required (relative activities expressed in terms of histone H2b phosphorylation units). Activation by cyclic AMP-dependent protein kinase was completely blocked by the heat-stable protein kinase inhibitor protein from skeletal muscle but activation by the cycli
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HDAC6 is a promising therapeutic target for the treatment of cancer and neurodegenerative and inflammatory diseases. We have developed a thiazolyl alkyl hydroxamate scaffold as an HDAC6-selective inhibitor. Herein, we synthesized new thiazolyl hydroxamate derivatives to investigate the effects of aliphatic linker length and cap group rigidity on HDAC6 selectivity. N-Hydroxy-3-(2-(6-methoxynaphthalen-2-yl)thiazol-4-yl)propanamide (5h) was identified as a potent HDAC6 inhibitor (IC50 = 25.56 nM) with ∼500-fold selectivity over HDAC1. Docking and MD simulations revealed that the 6-methoxy-β-napht
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phytophthora root rot, caused by Phytophthora sojae, is a devastating soilborne disease of soybean (Glycine max). However, the epigenetic regulation of soybean responses to P. sojae remains incompletely understood. Here, using genetic, molecular and biochemical approaches, we characterized the functions of LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1 (GmLHP1) and its downstream regulatory network. We demonstrated that GmLHP1, as a reader of H3K27me3, negatively regulates soybean resistance to P. sojae. GmLHP1 binds to H3K27me3 peptides in vitro and colocalizes with H3K27me3 marks genome-wide in vivo. The in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydrophobic tags (HyTs) in targeted protein degradation (TPD) offer a novel strategy to address HDAC off-target effects and drug resistance in hematological cancers. Artemisinin derivatives，characterized by their unique and highly hydrophobic endoperoxide bridge, emerge as promising candidates for HyTs development. However, the structure-activity relationship has not been systematically investigated. Herein, we conjugateddiverse artemisinin analogs (including D-ring-contracted artemisinin, deoxyartemisinin, and monocyclic endoperoxide derivatives) with the hydroxamic acid pharmacophore of SAHA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cell-free DNA in blood originates from fragmented chromatin released by dying cells from both healthy and diseased tissues1,2. These fragments carry rich molecular modalities that can reveal pathological alterations in tissues of origin3-10. Here we develop cf-EpiTracing, a highly sensitive automated platform that profiles histone modifications in cell-free DNA from as little as 50 μl of human plasma. By integrating multimodal chromatin states with machine learning, cf-EpiTracing enables accurate deconvolution of cell types of origin. We generated 2,417 cf-EpiTracing profiles from plasma of 12
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) is among the most common malignant tumors in China and leads in incidence across all cancer types. For over three decades, the standard treatment has been traditional chemotherapy, which often involves monotherapy with 5-fluorouracil (5-FU) or its combination with other drugs. Unfortunately, nearly all cases of GC eventually develop resistance to 5-FU, typically displaying a median time to progression that ranges from 0 to 8 months. Therefore, elucidating the mechanisms of acquired resistance to 5-FU in GC continues to be a critical focus of ongoing research. Various gene a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP-3) prevents over-activity of metalloproteinases, thereby reducing the severity of several immune/ inflammatory diseases in which T-lymphocyte-stimulated macrophage invasion plays an essential role. However, the underlying mechanism of TIMP-3 expression and its modulation by anti-inflammatory agents are poorly understood.
METHODS AND RESULTS: Using RT-qPCR measurements in human macrophages, we showed that TIMP-3 steady-state and pre-spliced mRNAs are induced by the Thelper2 cytokine, interleukin-4 (IL-4) but downregulated by the pro-in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sotos syndrome is a rare and complex genetic disorder caused by haploinsufficiency of the NSD1 gene. This syndrome is characterized by rapid early childhood growth, distinct facial features, a learning disability, and multiple other developmental and behavioral challenges.
METHODS AND RESULTS: In this work, we describe four Moroccan patients with variable clinical presentations of Sotos syndrome, in whom we identified four novel NSD1 monoallelic pathogenic variants by conducting targeted Next Generation Sequencing. Genetic testing allowed us to provide a precise medical diagnosis
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Indole-3-carboxaldehyde (3-IAld), a tryptophan metabolite derived from gut microbiota, has been reported to protect the intestine against radiation injury. This study aimed to clarify the role of Bifidobacterium longum (B. longum) and its metabolite indole-3-carboxaldehyde (3-IAld) in the pathophysiology of intestinal ischemia/reperfusion (II/R) injury. Superior mesenteric artery occlusion and reperfusion were performed to establish II/R mice, and pathological injury in II/R mice was evaluated. II/R mice showed impaired gut microbiota diversity and reduced abundance of B. longum in the intesti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis is a major neglected parasitic disease that affects more than 265 million people worldwide and for which the control strategy consists of mass treatment with the only available drug, praziquantel. In this study, we chemically optimized our previously reported benzhydroxamate-based inhibitors of Schistosoma mansoni histone deacetylase 8 (smHDAC8). Crystallographic analysis provided insights into the inhibition mode of smHDAC8 activity by the highly potent inhibitor 5o. Structure-based optimization of the novel inhibitors was carried out using the available crystal structures as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence of diabetes and its related complications are increasing significantly globally. Collected evidence suggested that several genetic and environmental factors contribute to diabetes mellitus. Associated complications such as retinopathy, neuropathy, nephropathy and other cardiovascular complications are a direct result of diabetes. Epigenetic factors include deoxyribonucleic acid (DNA) methylation and histone post-translational modifications. These factors are directly related with pathological factors such as oxidative stress, generation of inflammatory mediators and hyperglycemi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования