The objective of this study was to improve understandings of the rumen microbial ecosystem during ruminal acidosis and responses to feed additives to improve prudent use strategies for ruminal acidosis control. Rumen bacterial and archaeal community composition (BCC) and its associations with rumen fermentation measures were examined in Holstein heifers fed feed additives and challenged with starch and fructose. Heifers (n = 40) were randomly allocated to 5 treatment groups: (1) control (no additives); (2) virginiamycin (VM; 200 mg/d); (3) monensin (MT; 200 mg/d) + tylosin (110 mg/d); (4) mone…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Irritable bowel syndrome (IBS) is a chronic, episodic gastrointestinal disorder that is prevalent in a significant fraction of western human populations; and changes in the microbiota of the large bowel have been implicated in the pathology of the disease.
METHODS: Using a novel comprehensive, high-density DNA microarray (PhyloChip) we performed a phylogenetic analysis of the microbial community of the large bowel in a rat model in which intracolonic acetic acid in neonates was used to induce long lasting colonic hypersensitivity and decreased stool water content and frequency, re
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fischer-Tropsch type (FTT) synthesis has long been proposed to account for the existence of hydrocarbons in hydrothermal fluids. We show that iron- and chromium-bearing minerals catalyze the abiotic formation of hydrocarbons. In addition to production of methane (CH4aq), we report abiotic generation of ethane (C2H6aq) and propane (C3H8aq) by mineral-catalyzed hydrothermal reactions at 390 degrees C and 400 bars. Results suggest that the chromium component in ultramafic rocks could be an important factor for FTT synthesis during water-rock interaction in mid-ocean ridge hydrothermal systems. Th
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study provides the first metagenomic assessment of microbial diversity from the tea rhizosphere of the Kangra valley. Tea rhizosphere soil samples were collected from 4 locations (Dharamshala, Baijnath, Palampur, and Joginder Nagar) of the Kangra valley. DNA extracts of rhizosphere samples were analysed for bacterial and Archaeal diversity using amplicon sequencing (V3-V4) region of the 16S rRNA gene and Fungal diversity using ITS1 and ITS2 regions. Baijnath and Palampur samples showed the highest bacterial richness, while Dharamshala and Palampur had the highest fungal richness. Proteoba…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA 2'-phosphotransferase Tpt1 is a widely distributed enzyme that removes an internal RNA 2'-phosphate by transfer to NAD+. Tpt1 is essential in fungi, where it erases the 2'-PO4 mark installed by tRNA ligase during tRNA splicing. Tpt1 enzymes from bacteria, archaea, fungi, and metazoa are monofunctional units composed of RNA-binding and NAD+-binding lobes. The lone exception to date is fission yeast Tpt1, which consists of an N-terminal RNA 2'-phosphotransferase catalytic domain fused to a C-terminal domain homologous to budding yeast iron-sulfur cluster assembly factor Yae1. Here we report …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasites harbor diverse microbial ecosystems that include not only bacteria but also archaea, fungi, viruses and microbial eukaryotes. These parasite-associated microbiomes, long overlooked, are now recognized as important determinants of parasite development, fitness, virulence and interactions with hosts across medical, veterinary, agricultural and ecological systems. However, current understanding of parasite-associated microbiomes remains fragmented, with most studies focusing on a narrow set of human parasites, relying heavily on bacterial surveys and rarely capturing the full multi-king…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
(S)-(+)-linalool, a valuable acyclic monoterpenol secondary metabolite of plants, finds extensive applications in the food, flavor and fragrance, pharmaceutical, and daily chemical industries. Microbial synthesis offers two pathways for its production, among which the mevalonate (MVA) pathway derived from halophilic archaea is more widely employed. However, the traditional Haloarchaea-type MVA pathway relies on bifunctional enzyme catalysis, consuming 3 molecules of ATP. Moreover, the catalytic activity of natural linalool synthase (LIS) is generally low, failing to meet industrial requirement…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mismatch repair (MMR) system alterations can trigger transient hypermutation, promoting adaptive mutations under stress, such as antibiotic exposure. While most organisms use MutS and MutL protein families for MMR, many archaea and actinobacteria, including the major human pathogen Mycobacterium tuberculosis, lack these components and instead rely on NucS, a structurally distinct enzyme driving a non-canonical MMR pathway. Given the role of MMR in mutation control, understanding how nucS expression is regulated could be essential for uncovering the molecular basis of antibiotic resistance deve…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methanobrevibacter oralis (M. oralis) has predominated human oral microbiota methanogenic archaea as far back as the Palaeolithic era in Neanderthal populations and gained dominance from the 18th century onwards. M. oralis was initially isolated from dental plaque samples collected from two apparently healthy individuals allowing its first characterization. The culture of M. oralis is fastidious and has been the subject of several studies to improve its laboratory growth. Various PCR methods are used to identify M. oralis, targeting either the 16S rRNA gene or the mcrA gene. However, only one …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lava caves differ from karstic caves in their genesis and mineral composition. Subsurface microbiology of lava tube caves in Canary Islands, … and morphological characterization. The data showed an almost exclusive dominance of Bacteria over Archaea. The distribution in phyla revealed a majority abundance of Proteobacteria (37-89%), followed by Actinobacteria, Acidobacteria and Candidatus Rokubacteria. These four phyla comprised a total relative abundance of 72-96%. The main ecological function …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Manure is an impending source of carbon (C), sulfur (S) and water (H2O). Consequently, microbial populations utilize these constituents to p … ons were likely due to decreases in the activity and numbers of specific gas producing methanogenic archaea and sulfate reducing bacterial (SRB) species.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Obesity is associated with changes in the intestinal microbiome and methane-producing archaea may be involved in energy homeostasis.
OBJECTIVE: The objective of this article is to investigate the associations between intestinal methane production, waist circumference and body mass index (BMI) as biomarkers for obesity.
METHODS: Breath methane and hydrogen concentrations were measured over five hours following fructose or lactose ingestion in 1647 patients with functional gastrointestinal disorders. The relationships between gas concentrations and measures of obesity were investig…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antarctica, though remote and sparsely inhabited, faces significant ecological risks due to human activities and settlements that generate, … ch as at research stations, remain poorly understood. In this study, we characterized the bacterial/archaeal and eukaryotic communities across 106 soils sampled near research stations in three regions of the Antarctic Peninsula and the South Shetland Islands over two consecutive years, encompassing a wide range of HC pollution levels. Using 16S and 18S rR …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Modic changes are caused by various factors, such as degenerative processes, inflammation, biomechanical, genetic, and metabolic factors, infection, and smoking. Bacteria have been identified in human intervertebral discs by 16S rRNA sequencing; however, the low microbial biomass in intervertebral disc tissue limits species-level analyses using this approach. In this study, we employed 2bRAD-M (2b Restriction Site Associated DNA sequencing for Microbiome), a new sequencing technology capable of accurately characterizing bacteria, fungi, and archaea in samples with low microbial bio…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anaerobic digestion is one of the most promising options for the disposal of biodegradable food waste. However, the relatively high content … turn them into small organic molecules that also have nutrient value for other bacteria. Among the archaeal communities, the hydrogenotrophic methanogen Methanobacterium nearly supplanted the acetotrophic methanogen Methanosaeta. The time profiles of volatile fatty acids (VFAs) and pH during this period provided additional evidence for the success of the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The nitrogen isotopic composition of sedimentary rocks (δ15N) can trace redox-dependent biological pathways and early Earth oxygenation1,2. However, there is no substantial change in the sedimentary δ15N record across the Great Oxidation Event about 2.45 billion years ago (Ga)3, a prominent redox change. This argues for a temporal decoupling between the emergence of the first oxygen-based oxidative pathways of the nitrogen cycle and the accumulation of atmospheric oxygen after 2.45 Ga (ref. 3). The transition between both states shows strongly positive δ15N values (10-50‰) in rocks deposited b
СтатьяИсторическая статьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the variability in ammonia oxidation (AO) rates and the presence of ammonia-oxidizing archaea and bacteria (AOB and AOA) over an annual cycle in the water column of a small, seasonnally ice covered, temperate shield lake. AO, the first step of nitrification, was measured in situ using 15N-labelled ammonium (NH4+) at 1% and 10% of photosynthetic active radiation during day and at the same depths during night. AO was active across seasons and light levels, ranging from undetectable to 333 nmol L-1 d-1 with peak activity in winter under ice cover. NH4+ concentration was the single…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The International Space Station (ISS) represents a unique biotope for the human crew but also for introduced microorganisms. Mic … ccation, heat-shock, and clinically relevant antibiotics. In addition, we studied the bacterial and archaeal communities from the stored Russian dust samples via molecular methods (next-generation sequencing, NGS) and compared our new data with previously derived information from the US American ISS dust microbiome.
RESULTS: We cultivated and identified …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methanolobus taylorii GS-16, a moderately halophilic and alkaliphilic methanogen, grows over a wide pH range, from 6.8 to 9.0. Cells suspended in medium with a pH above 8.2 reversed their transmembrane pH gradient (delta pH), making their cytosol more acidic than the medium. The decreased energy in the proton motive force due to the reversed delta pH was partly compensated by an increased electric membrane potential (delta psi). The cytosolic acidification by M. taylorii at alkaline pH values was accompanied by K+ extrusion. The cytosolic K+ concentration was 110 mM in cells suspended at pH 8.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial signatures show remarkable potentials in predicting colorectal cancer (CRC). This study aimed to evaluate the diagnostic powers of multimodal microbial signatures, multi-kingdom species, genes, and single-nucleotide variants (SNVs) for detecting precancerous adenomas. We performed cross-cohort analyses on whole metagenome sequencing data of 750 samples via xMarkerFinder to identify adenoma-associated microbial multimodal signatures. Our data revealed that fungal species outperformed species from other kingdoms with an area under the ROC curve (AUC) of 0.71 in distinguishing adenomas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования