BACKGROUND: Fasciola hepatica is an important pathogen that causes liver fluke disease in definitive hosts such as livestock animals and humans. Various excretory/secretory products have been used in serological diagnosis and vaccination studies targeting fasciolosis. There are no commercial vaccines against fasciolosis yet. Bioinformatic analysis based on computational methods have lower cost and provide faster output compared to conventional vaccine antigen discovery techniques. The aim of this study was to predict B- and T-cell specific epitopes of four excretory/secretory antigens (Kunitz-
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: One of the concerns of allergen-specific immunotherapy is the possible boost of inflammatory allergen-specific T lymphocytes. To address this problem, treatment with B cell epitopes devoid of allergen-specific T cell epitopes would be a promising alternative.
OBJECTIVE: In this study, we examined the therapeutic potency of a single mimotope, mimicking a structural IgE epitope of grass pollen allergen Phl p 5 in an established memory mouse model of acute allergic asthma.
METHODS: In the experimental set-up, BALB/c mice were primed with intraperitoneal injections of recombinant Phl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have constructed a stochastic stage-structured model of the cytotoxic T lymphocyte (CTL) response to antigen and the maintenance of immunological memory. The model follows the dynamics of a viral infection and the stimulation, proliferation, and differentiation of naïve CD8(+) T cells into effector CTL, which can eliminate virally infected cells. The model is capable of following the dynamics of multiple T cell clones, each with a T cell receptor represented by a digit string. MHC-viral peptide complexes are also represented by strings and a string match rule is used to compute the affinity
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis is a major health problem in Latina America, as well as the Mediterranean region of Europe and Asia. We aimed to develop a vaccine against visceral leishmaniasis targeting the intracellular amastigotes, which is the parasite stage that persists throughout infections with Leishmania parasites. With this in mind, we identified an amastigote specific antigen (A2) that contains an immunogenic epitope for CD4+ T helper (Th) cells and multiple repetitive units encoding CD8+ cytotoxic T lymphocyte (CTL) epitopes. Vaccine formulations containing the recombinant A2 associated wit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parvovirus B19 elicits both humoral and cellular immune responses. Recently some advances have been made in determining the frequencies, peptide targets and function of virus-specific CD8+ T lymphocyte responses. A single HLA B35-restricted epitope derived from the NS1 protein has been studied so far, but others clearly exist. Surprisingly large, persistent responses have been detected in healthy seropositive individuals, using interferon-gamma ELISpot assays and HLA class I peptide tetramers. Similar techniques are available for exploration of the CD4+ T cell epitopes, although less detail is
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Virus-specific cytotoxic T lymphocytes (CTL) at frequencies of >1/1, 000 are sufficient to cause insulin-dependent diabetes mellitus (IDDM) in transgenic mice whose pancreatic beta cells express as "self" antigen a protein from a virus later used to initiate infection. The inability to generate sufficient effector CTL for other cross-reacting viruses that fail to cause IDDM could be mapped to point mutations in the CTL epitope or its COO(-) flanking region. These data indicate that IDDM and likely other autoimmune diseases are caused by a quantifiable number of T cells, that neither standard e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatitis E virus (HEV) is one of the leading causes of acute and chronic hepatitis among humans across the globe and is linked to severe diseases in immunocompromised individuals and pregnant women. Despite its substantial global burden, only one vaccine is licensed (in China and Pakistan), limiting its global accessibility. Furthermore, no globally approved mRNA vaccine against HEV is currently available, highlighting the need to develop strategies for alternative vaccines.
METHODS: In this study, the amino acid sequences of ORF2 capsid proteins representative of HEV genotypes 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three different, purified, Escherichia coli-derived, recombinant preparations of the Mycobacterium leprae 18K protein were compared for their immunological recognition in leprosy. The preparations tested were 18K fusion proteins containing 70% (amino acids 38-148) of the full 18K protein fused to either a short leader sequence containing six asparagine residues or to beta-galactosidase, and the full length 18K protein. All three recombinant antigens were recognized by IgG antibodies which were restricted mostly to lepromatous leprosy patients. The 18K antigen with the asparagine leader sequenc
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV) infection resolves spontaneously in ∼25% of acutely infected humans where viral clearance is mediated primarily by virus-specific CD8+ T cells. Previous cross-sectional analysis of the CD8+ TCR repertoire targeting two immunodominant HCV epitopes reported widespread use of public TCRs shared by different subjects, irrespective of infection outcome. However, little is known about the evolution of the public TCR repertoire during acute HCV and whether cross-reactivity to other Ags can influence infectious outcome. In this article, we analyzed the CD8+ TCR repertoire speci
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dendritic cell vaccines are a promising strategy for the treatment of cancer and infectious diseases but have met with mixed success. We report on a lentiviral vector-based dendritic cell vaccine strategy that generates a cluster of differentiation 8 (CD8) T cell response that is much stronger than that achieved by standard peptide-pulsing approaches. The strategy was tested in the mouse lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) model. Bone marrow-derived dendritic cells from SAMHD1 knockout mice were transduced with a lentiviral vector expressing the GP33 major-histocompatibility-complex (MHC
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Coronavirus disease 2019 (COVID-19) linked with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) cause severe illness and life-threatening pneumonia in humans. The current COVID-19 pandemic demands an effective vaccine to acquire protection against the infection. Therefore, the present study was aimed to design a multiepitope-based subunit vaccine (MESV) against COVID-19.
METHODS: Structural proteins (Surface glycoprotein, Envelope protein, and Membrane glycoprotein) of SARS-CoV-2 are responsible for its prime functions. Sequences of proteins were downloaded from GenBa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viruses employ various means to evade immune detection. One common evasion strategy is the removal of CD8 cytotoxic T-lymphocyte (CTL) epitopes.
METHOD: Here, we use bioinformatic tools to compute the HIV CTL epitope repertoire presented by over 8000 HIV sequences in multiple Human Leukocyte Antigen alleles. We define the 'Size of Immune Repertoire' (SIR) score, which represents the ratio between the number of the predicted epitopes within a protein and their expected number within a scrambled version of the same protein.
RESULTS: We show that HIV proteins present less epitopes t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klebsiella michiganensis, an emerging multidrug-resistant member of the Klebsiella oxytoca complex, has become an important opportunistic pathogen responsible for nosocomial infections, including bacteremia and ventilator-associated pneumonia. Owing to its rapidly evolving resistance to carbapenems, new preventive strategies are urgently needed. This study presents a computational systems immunology framework integrating subtractive proteomics, reverse vaccinology, and immunoinformatics to design a multi-epitope vaccine (MEV) against K. michiganensis strain ATCC 8724. From the complete proteom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foot-and-mouth disease virus (FMDV) remains a major constraint to livestock health due to its high mutation rate and serotype diversity. Currently, FMDV vaccines, primarily inactivated whole-virus formulations, have significant limitations, including limited cross-protection, high production costs, and potential biosafety risks. To address the need for broad-spectrum protection, this study aimed to design a universal vaccine candidate by rationally constructing artificial chimeric proteins (ACPs) integrating conserved structural (VP1-VP3) and non-structural (3 A, 3 C) proteins from the predomi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunogenic epitopes that stimulate CD8+ T cells can be organized into an immunodominance hierarchy, based on their ability to induce T-cell priming and subsequent expansion. Cytotoxic CD8+ T cells can be primed through the cross-priming pathway, where exogenous viral proteins are acquired by professional antigen-presenting cells (pAPCs). We have previously reported that lymphocytic choriomeningitis nucleoprotein (LCMV-NP) expressed in HEK cells (HEK-NP) induces cross-priming of CD8+ T cells in vivo. In this study, we have used this HEK-NP model to study the effects of LCMV-NP cross-priming on
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tinea cruris, a dermatophyte fungal infection predominantly caused by Trichophyton rubrum and Epidermophyton floccosum, primarily affects the groin, pubic region, and adjacent thigh. Its recurrence is frequent, attributable to repeated fungal infections in susceptible individuals, especially those with onychomycosis or tinea pedis, which act as reservoirs for dermatophytes. Given the persistent nature of tinea cruris, vaccination emerges as a promising strategy for fungal infection management, offering targeted, durable protection against various fungal species. Vaccines stimulate both humoral
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The replacement of the catalytically active proteasome subunits β1, β2, and β5 by the immunoproteasome subunits low molecular mass polypeptide (LMP) 2 (β1i), multicatalytic endopeptidase complex-like-1 (MECL-1) (β2i), and LMP7 (β5i) is required for the production of numerous class I ligands. Hitherto, investigation of the immunoproteasome was confined to the analysis of mice deficient for one or two immunosubunits. In this study, we characterized LMP2(-/-)/MECL-1(-/-) double-deficient mice and used the well-defined LMP7-selective inhibitor ONX 0914 in these mice to generate mice lacking the ac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza A viruses pose a significant pandemic threat, with H2N3 in particular representing a subtype of particular concern due to limited population immunity and potential for zoonotic transmission. Traditional antibody-centric vaccine strategies face fundamental limitations stemming from antigenic drift and shift in hemagglutinin and neuraminidase surface proteins, necessitating annual reformulation and demonstrating reduced efficacy against mismatched strains. T-cell-mediated immunity offers a complementary approach by targeting highly conserved internal viral proteins such as nucleoprotei
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ruminococcus torques is an anaerobic, Gram-positive gut bacterium that has been associated with gastrointestinal diseases including irritable bowel syndrome (IBS) and inflammatory bowel disease (IBD). Its mucolytic effect disrupts the integrity of the intestinal barriers, which are involved in dysbiosis and pathogenicity. Recent clinical evidence has also reported its involvement in extraintestinal infections like pneumonia, keratitis, bacteremia and ocular infection in immunocompromised individuals. Although, R. torques has emerged as a clinically more significant pathogen, no vaccine is yet
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella typhimurium, a Gram-negative bacterium, is a significant cause of gastroenteritis worldwide, with outbreaks occurring in diverse regions. Despite its global impact, there is currently no vaccine for human use against this pathogen. Complicating treatment efforts, S. typhimurium has exhibited resistance to multiple antibiotics, posing challenges to effectively managing infections. Given its prevalence and unresolved antibiotic resistance-associated global health burden, urgent attention is required to develop a genuinely effective vaccine. Using the S. typhimurium complete proteome d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.