Soil microarthropods are known to harbor diverse microbial communities that play crucial roles in host physiology and ecological functions. Due to the minute size of oribatid mites, microbial studies have traditionally relied on whole body DNA extraction after surface sterilization, potentially confounding gut microbiota with microorganisms from other tissues. This study employed high-throughput Illumina sequencing to comprehensively compare bacterial and fungal communities between the whole body and dissected gut samples of the oribatid mite Eremobelba eharai. Our results revealed significant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bat-borne coronaviruses are of increasing interest due to their potential for zoonotic spillover, particularly within the Betacoronavirus genus. Partial genomic sequences related to MERS-like CoV was identified in multiple hosts, including humans, camelids, and bats from the families Vespertilionidae and Molossidae. In this study, we investigated the presence of coronaviruses in 65 Molossus molossus bats captured in southern Brazil using nested RT-PCR and high-throughput sequencing (HTS). One individual (1.5%) tested positive in a rectal swab, and sequence analysis revealed the presence of a M
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genetic mosaicism is a well-recognized consequence of CRISPR-Cas9 genome editing, yet its characterization remains challenging, especially when it involves low-frequency structural variants. A comprehensive analysis of mosaicism requires deep and unbiased sequencing of the target loci, with accurate single-molecule reads.
METHODS: We performed amplification-free PureTarget PacBio sequencing to investigate CRISPR-Cas9 outcomes at on-target and off-target sites in genome edited zebrafish and their offspring. CRISPR-Cas9 genome editing was performed by micro-injection in fertilized e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Von Willebrand disease (VWD) is the most common inherited bleeding disorder, caused by quantitative or qualitative defects in von Willebrand factor (VWF). Diagnosis is challenging and requires integrating bleeding history, VWF antigen and activity measurements, FVIII assays, and specialized phenotyping. Genetic testing is increasingly recognized as a key component. Here, we review current concepts in VWD diagnostics and highlight the Spanish Clinical and Molecular Profile of von Willebrand Disease (PCM-EVW-ES) project as a model for genomics-enabled precision medicine. PCM-EVW-ES is a multicen
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral metagenomic next-generation sequencing (mNGS) is a powerful approach for pathogen detection in clinical diagnostics; however, accurate virus identification depends critically on the quality of reference databases. Diagnostic specificity is frequently compromised by erroneous viral classifications, which occur when host- or reagent-derived sequences align to non-viral contaminant regions (such as ribosomal RNA, vector contamination like cytomegalovirus enhancers, and sequencing adapters) embedded within the viral reference sequences. To address this, we present VirMask, a novel computatio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In veterinary medicine, particularly in pet clinics, the accurate and rapid detection of pathogens is crucial for effective disease diagnosis and treatment. Traditional diagnostic methods are often time-consuming and fall short in identifying a broad spectrum of pathogens. The newly developed metagenomic transcriptomics next-generation sequencing (mtNGS) technology is a promising tool for the rapid detecting RNA- and DNA-based pathogens. However, its application in pet clinics has been limited due to high costs, complex operational procedures, and the absence of unified protocols. Here we esta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Next-generation sequencing (NGS) is essential for precision oncology, yet its clinical implementation is often hindered by limited sample quantity, complex workflows, and cross-contamination risks. We evaluated a modified One-Step Multiplex PCR (OS-MPCR) assay designed to streamline library construction while maintaining high analytical sensitivity and diagnostic accuracy.
METHODS: The OS-MPCR method integrates adapter ligation and library amplification into a single, closed-tube reaction, eliminating intermediate open-tube manipulations. The analytical performance was evaluated u
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vegetation restoration is an important indicator for evaluating the health of mining ecosystems. Soil microorganisms influence soil material cycling and play an important role in vegetation restoration. Clarifying the effects of mining on soil microbial communities has spleen benefits for vegetation restoration. In this study, we analyzed the effects of mine disturbance on soil bacterial communities by high-throughput sequencing and setting up sampling sites at different distances from the mine site. The results showed that the α-diversity of the bacterial community gradually increased and the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The China Space Station (CSS) modules feature many areas that are difficult to clean and thus susceptible to microbial outbreaks. A new sampling method utilizing an equivalent material sheet was applied to characterize the diversity of microbes that accumulated in inaccessible areas in orbit on the CSS. Equivalent material sheet is a membrane made of the same material as the wall of the module.
RESULTS: Fifty samples were collected from interior surfaces (work, sleeping, and sanitary areas) of the Tianhe core module and the Wentian and Mengtian experimental modules, covering three
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The widespread use of high-throughput sequencing for genetic diagnosis has led to considerable advances in patient care, but interpretation of the variants identified remains a challenge and geneticists routinely face the question of variants of uncertain significance. The clinical interpretation of genomic variants requires a high level of expertise to ensure appropriate genetic counseling. Assessing the impact of variants on splicing is a key issue in order to determine their pathogenicity as each variant can impact pre-mRNA splicing by disruption of the splicing code. It is for this reason
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phelipanche ramosa is a widespread parasitic weed of significant economic importance, particularly affecting tomatoes and tobacco. Despite its well-documented impact on agriculture, its microbial associations remain poorly understood. For the first time, we used Next-Generation Sequencing (NGS) to determine the composition of microorganisms (bacteria and fungi) on the flower stigma of P. ramosa and its host, Nicotiana tabacum, as well as to explore their potential functions. The stigma is a nutrient-rich environment that fosters a varied microbial community, encompassing both beneficial and pa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurogenetic disorders are a large group of genetic and phenotypically heterogeneous diseases, making diagnosis challenging. Sequencing hundreds of disease genes concurrently using massively parallel sequencing is, therefore, invaluable for diagnosis of these disorders. The PathWest neuromuscular disease gene panels include all known genes associated with neurologic and muscle disorders. Initially implemented in 2013, covering 336 genes, the gene panel has undergone various updates in chemistries and seen the addition of many newly described neurogenic disease genes. The results from versions
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Much evidence supports the assessment of minimal residual disease (MRD) status in the clinical management of multiple myeloma (MM). Using highly sensitive next-generation flow cytometry and next-generation sequencing tests to detect MRD enables clinicians to evaluate the depth of response and therefore the prognosis of patients with MM as achieving deep and sustained (≥ 12 months) undetectable MRD correlates with prolonged survival in patients with MM. Because of this, undetectable MRD (also referred to as MRD-negativity) has been recognized and approved by the FDA as an early endpoint in clin
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ovarian Cancer is one of the leading causes of cancer death among women worldwide and the therapeutic landscape to treat it is constantly evolving. One of the major points of decision for the treatment choice is the presence of some genomic alterations that could confer sensitivity to the new available therapies including inhibitors of poly (ADP-ribose) polymerase (PARPi) with BRCA1 and 2 genes playing the most important role.
METHODS AND RESULTS: We performed the search for any somatic and/or germline alteration in patient's samples by next generation sequencing (NGS). On two pat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Genomic and transcriptomic sequencing technologies have revolutionized our ability to characterize prostate cancer at the molecular level. The underlying premise of next-generation sequencing technologies and their current and evolving applications in prostate cancer management are provided in the review.
RECENT FINDINGS: Improved methodologies are allowing timely sequencing of the coding regions or both the coding and noncoding regions of the genome to help identify potential mutations and structural variations in the prostate cancer genome, some of which are currently als
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in understanding genomic drivers of human malignancies have evolved from morphologic evaluations to in-depth DNA and RNA analyses and gene expression profiling. In urologic malignancies, these molecular diagnostics are integral to patient management, aiding pathological diagnosis, providing prognostic and predictive relevance, and identifying therapeutic options for advanced diseases. For instance, renal cell carcinoma frequently harbors alterations in VHL, PBRM1, and BAP1, influencing therapeutic responses, while urothelial carcinoma is characterized by FGFR3 mutations and TERT promo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasitic infections are a group of infectious diseases that are mainly caused by helminths and protozoa. Recently, emerging diagnostic techniques have been developed to not only elevate the chance of parasite detection but also increase the accurate diagnosis. Next-generation sequencing (NGS) technologies are highlighted among different genomic-based methods due to their wide-spectrum application. NGS presents an opportunity for clinical use in detecting parasitic infections. Also, it allows for the characterization of parasites, as well as the identification of drug resistance. Incorporating
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exploring the variability of the intestinal flora of patients with hepatic blastocysticercosis and searching for members of the intestinal microflora that may play a role in the disease process by means of macro-genome sequencing technology. A case-control study was used to include fecal samples from patients with hepatic vesicular schistosomiasis admitted to Qinghai Provincial People's Hospital between October 2023 and January 2024 and individuals attending health checkups. The experimental group (AE group) consisted of 10 patients with liver vesicular schistosomiasis and the control group (N
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcosis, a rare deep fungal infection, primarily affects immunocompromised individuals and carries a high mortality risk when hematogenously disseminated to the central nervous system (CNS). Cutaneous cryptococcosis poses diagnostic challenges due to its diverse and nonspecific dermatological manifestations. Traditional diagnostic methods, including mycological examination, culture, and histopathology, are time-consuming and require specialized expertise, often leading to misdiagnosis. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS), an advanced molecular tool, enables rapid and unbiased
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zoonotic malaria, caused by parasites like Plasmodium simium, poses challenges to control and elimination efforts due to undetected reservoirs and altered transmission dynamics. Recent outbreaks in Brazil underscore the importance of P. simium spillovers from non-human primates. Genomic studies are crucial for identifying molecular markers of host adaptation and improving diagnostic tools; however, a high-quality reference genome is needed. To address this, we used Oxford Nanopore and Illumina sequencing platforms to generate a high-quality P. simium reference (Ps_SãoPaulo, 21.8 Mb). Comparati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования