Salmonella serovars Heidelberg and Minnesota encoding antimicrobial resistance to third-generation cephalosporins and fluoroquinolones are often detected in poultry/poultry meat. We analysed the genomes of 10 Salmonella Heidelberg (SH) and 4 Salmonella Minnesota (SM) from faecal isolates of Brazilian poultry. These featured virulent and multidrug-resistant characteristics, with AmpC beta-lactamase (blaCMY-2 ) predominance (9/14), for all SM (4/4) and some SH (3/10) located on IncC plasmid replicons. IncC carrying blaCTX-M-2 was only detected among SH (3/10). Mutation in the gyrA/parC genes was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although infection is common in patients with cancer, the distribution of causative agents and the proportion of resistant bacteria in patients with urinary tract infection remain unknown. The aim of this study was to describe the incidence, the causative agents, and the proportion of antimicrobial resistance in bacteria cultured from urine of hospitalized children with cancer. A single-center retrospective chart review of patients with cancer admitted between 2012 and 2020 was performed to identify patients with positive urine culture. Overall, 61 (0.9%) of 7107 patients were identified to ha
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Antimicrobial resistance (AMR) is a global threat that requires serious attention, particularly when it is developed against colistin, which is considered one of the 'last-resort' antibiotics for curing an infection. This study aimed to investigate the AMR profile of the Klebsiella (K.) pneumoniae clinical isolates and to obtain the comprehensive characteristics of the carbapenemases among the carbapenem-resistant K. pneumoniae (CR-KP) when isolated. In addition, to detect the colistin resistance and investigate the MCR genes in the clinical K. pneumoniae isolates for the first tim
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study was carried out to determine the prevalence and the genetic background of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli invasive isolates obtained from a tertiary-care hospital in Budapest, Hungary.
METHODS: Between October-November 2018, all invasive ESBL-producing E. coli isolates were collected from Central Hospital of Southern Pest. The antimicrobial susceptibility testing was performed according to the EUCAST guidelines. The possible clonal relationships were investigated by core genome (cg)MLST (SeqSphere +) using whole-genome sequencing (WGS) data of i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proper selection of susceptible antibiotics in drug-resistant bacteria is critical to treat bloodstream infection. Although biomarkers that guide antibiotic therapy have been extensively evaluated, little is known about host biomarkers targeting in vivo antibiotic susceptibility. Therefore, we aimed to evaluate the trends of hemodynamics and biomarkers in a porcine bacteremia model treated with insusceptible antibiotics compared to those in susceptible models. Extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli (E. coli, 5.0 * 10^9 CFU) was intravenously administered to 11 male pig
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background and Objectives. The aim of this study is to determine the prevailing microbiota in samples from pediatric patients with acute appendicitis, as well as evaluate the antibacterial sensitivity of the isolated microorganisms, comparing the data obtained with the clinic's antibacterial therapy guidelines. Materials and Methods. The study group consisted of 93 patients between the ages of 7 and 18. All patients underwent a laparoscopic or conventional appendectomy. The children were hospitalized with signs and symptoms suggestive of acute appendicitis. Microbiological cultures from the ap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extra-intestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) strains are responsible for a large number of human infections globally. The management of infections caused by ExPEC has been complicated by the emergence of antimicrobial resistance, most importantly the increasing recognition of isolates producing extended-spectrum β-lactamases (ESBL). Herein, we used whole-genome sequencing (WGS) on ExPEC isolates for a comprehensive genotypic characterization. Twenty-one ExPEC isolates, nine with and 12 without ESBL-production, from 16 patients with suspected sepsis were sequenced on an Illumina MiSeq p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aims to investigate trends in bloodstream infections and their antimicrobial susceptibility profiles over 12 years in our hospital. This retrospective study was carried out in the Bursa Uludag University Hospital, Turkey, during 2008-2019. Blood cultures from patients were performed using BACTEC System. Isolates were identified with Phoenix System until 2018 and "matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry" (MALDI-TOF MS) in 2019. Antibiotic susceptibility testing was performed with Phoenix System. Patient data came from the BD EpiCenter™ data manage
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The emergence of blaKPC-2 within nosocomial settings has become a major public health crisis worldwide. Our aim was to perform whole-genome sequencing (WGS) of three KPC-producing Gram-negative bacilli (KPC-GNB) strains isolated from a hospitalized patient to identify acquired antimicrobial resistance genes (ARGs).
METHODS: WGS was performed using Illumina MiSeq-I, and de novo assembly was achieved using SPAdes. Bioinformatics analysis was done using Resfinder, AMRFinder, ISFinder, plasmidSPAdes, PlasmidFinder, MOB-suite, PLSDB database, and IntegronFinder. Conjugation assays were
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli ST131 clade C is an important driver for fluoroquinolone resistance (FQ-R). We conducted a prospective observational study in residents from two long-term care facilities (LTCFs) in Seville, Spain, in 2018. Fecal swabs and environmental samples were obtained. E. coli isolates were screened for clade C, FQ-R ST131 by PCR, and molecular typing by PFGE; representatives from pulsotypes were studied by whole-genome-sequencing (WGS) and assigned to lineages (cgSTs). Prevalence of colonization at each time point, incidence density, and risk factors for acquisition were studied. Seven
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The resistome, virulome, mobilome and phylogenetic relationship of the Acinetobacter baumannii isolate FG121 depicting the multilocus sequence type (ST) 231 isolated from hospital effluent water in South Africa was determined using whole-genome sequence analysis.
METHOD: A. baumannii FG121 was isolated on Leed Acinetobacter Medium (LAM) agar and the bacterial isolate was identified using the VITEK®2 platform. Antibiotic susceptibility testing was performed using Kirby-Bauer Disk diffusion method. A whole genome sequencing library was constructed from DNA extracted from the isolate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Colibacillosis is a frequent enteric disease in the pig industry that causes significant economic losses. The objective of this study was to investigate the molecular characteristics of fluoroquinolone (FQ)-resistant E. coli isolates from suckling piglets with colibacillosis.
RESULTS: A total of 43 FQ-resistant E. coli isolates were tested in this study and all isolates showed multi-drug resistance (MDR) and mutations in quinolone resistance determining regions (gyrA or parC). Especially, FQ-resistant E. coli isolates with double mutations in both gyrA and parC were shown a high F
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) cause approximately 13 100 infections, with an 8% mortality rate in the United States annually. Carbapenemase-producing CRE (CP-CRE) a subset of CRE infections infections have much higher mortality rates (40%-50%). There has been little research on characteristics unique to CP-CRE. The goal of the current study was to assess differences between US veterans with non-CP-CRE and those with CP-CRE cultures.
METHODS: A retrospective cohort of veterans with CRE cultures from 2013-2018 and their demographic, medical, and facility level covari
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: CDATA[Background: Multidrug resistance among ESBL producing isolates has limited the administration of proper antibiotics. It is, therefore, important to monitor the resistance patterns of Klebsiella pneumoniae isolates and provide infection control strategies to prevent nosocomial outbreaks. This study was aimed to determine antimicrobial resistance patterns of K. pneumoniae isolates obtained from wound infections of patients in Tehran, Iran.
METHODS: A total of 102 K. pneumoniae isolates were obtained from wound infections of patients in Tehran, Iran. The production of phenotypi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Movement of patients in a health care network poses challenges for the control of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae (CPE). We aimed to identify intra- and interfacility transmission events and facility type-specific risk factors of CPE in an acute-care hospital (ACH) and its intermediate-term and long-term-care facilities (ILTCFs). Serial cross-sectional studies were conducted in June and July of 2014 to 2016 to screen for CPE. Whole-genome sequencing was done to identify strain relatedness and CPE genes (blaIMI, blaIMP-1, blaKPC-2, blaNDM-1, and blaOXA-48). Multivariable logistic reg
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A carbapenem-resistant Citrobacter sedlakii strain AA2CS carrying blaNDM-5 was detected in outdoor aerosols of a wastewater treatment plant (WWTP) in China and the whole genome was sequenced subsequently. AA2CS was captured in an aerobic tank with aerosol particles of sizes ranging from 4.7 to 7.0 μm. Besides blaNDM-5, AA2CS also harbored 21 other antibiotic resistance genes and displayed a high level of resistance to ampicillin, cefotaxime, ceftazidime, tetracycline, and meropenem. BlaNDM-5 was located on the IncX3 plasmid (pCSNDM-5) with an IS3000-IS5-blaNDM-5-bleMBL-trpF-dsbD-IS26 structure
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sea turtles are useful sentinels to monitor the dissemination of antimicrobial resistance (AMR) in the marine coastal ecosystems. Forty Gram negative bacteria were isolated from wounds of 52 injured Caretta caretta, living in the Mediterranean Sea. Bacteria were identified using 16S rRNA gene sequencing and tested for susceptibility to 15 antibiotics. In addition, NGS amplicon sequencing was performed to detect the presence of AmpC β-lactamase genes (blaAmpC) and extended-spectrum β-lactamase (ESBL) genes (blaCTX-M,blaSHV,blaTEM). Seventy-five percent of the isolates (30/40 isolates) exhibited
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Present study was aimed to determine ESBL-encoding genes distribution in Diarrhoeagenic Escherichia coli (DEC) isolated from animal-source food products and human clinical samples in Mashhad, Iran. The strains were also further studied to analyse genotypic diversity and find genetic relationships between them.
METHODS AND RESULTS: The number of 85 DEC strains including 52 and 33 strains isolated from 300 food and 520 human stool samples, respectively. Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD), and repetitive extragenic palindromic-PCR (rep-PCR) typing methods were used to track their ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this observational study, phenotypic and genotypic patterns of antimicrobial resistance (AMR) in Klebsiella pneumoniae isolated from intramammary infections, clinical mastitis, fresh feces, rectal swabs, animal hindlimbs, and bulk tank milk samples from Brazilian dairy herds were investigated. In addition, we identified specific genetic variants present among extended-spectrum β-lactamase (ESBL) producers. We obtained 169 isolates of K. pneumoniae from 2009 to 2011 on 24 Brazilian dairy farms located in 4 Brazilian states. The AMR profile of all isolates was determined using disk-diffusion
СтатьяObservational Study, VeterinaryПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug users may represent a hidden reservoir of antibiotic resistance genes among their intestinal flora due to the poor hygiene and inappropriate use of antibiotics. Therefore, this study was focused to examine the prevalence of extended-spectrum β-lactamase (ESBL) genes among intestinal Escherichia coli isolated from drug users in Ahvaz, Iran. Among clients of toxicology laboratory who were confirmed their addiction to each of Morphine, Amphetamine or Methamphetamine, 109 drug users were examined voluntarily for infection with hepatitis B or C using commercial enzyme linked immunosorbent assa
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования