We report the discovery of a new enveloped, spherical virus belonging to the Phenuiviridae family of negative ssRNA viruses associated with a massive outbreak in a French population of the endangered white-clawed crayfish Austropotamobius pallipes. We call this virus Bunya-like Brown Spot Virus (BBSV) and characterize it using transmission electronic microscopy, genome sequencing and clinical signs. Infected specimens show discolored brown spots on the cuticle. Using RNA-seq data we assembled a partial sequence for the L, M and S genome segments of BBSV. Phylogenetic analyses using all three s…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In our previous studies, diploid and triploid hybrids have been detected from the hybridization of Epinephelus coioides♀ × E. lanceolatus♂. … levels of serum estradiol-17β and testosterone were significantly higher in triploid groupers. The RNA-seq data revealed that 1518 and 14,963 differentially expressed genes were identified in the BP and G transcriptome, respectively. Further analysis revealed that the expression levels of genes involved in the sexual differentiation pathway and sex stero …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) belongs to a group of mosquito-borne alphaviruses associated with acute and chronic arthropathy, with peripheral and limb joints most commonly affected. Using a mouse model of CHIKV infection and arthritic disease, we show that CHIKV replication and the ensuing foot arthropathy were dramatically reduced when mice were housed at 30°C, rather than the conventional 22°C. The effect was not associated with a detectable fever, but was dependent on type I interferon responses. Bioinformatics analyses of RNA-Seq data after injection of poly(I:C)/jetPEI suggested the unfolded…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The adverse effects of sleep disorders on male fertility are of increased concern. In this study, a rat model of chronic sleep restriction ( … The transcriptional differences between CSR rats and control rats were detected by RNA sequencing (RNA-Seq), and DNA methylation was then detected by bisulfite sequencing. After the differentialy expressed genes of CSR rats were sequenced and screened, representative up- and down-regulated genes were randomly sampled to verify the sequencing results by r …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we describe the rational design, synthesis, and biological evaluation of a novel series of salicylaldehyde-derived sulfonamid … nmalignant cells as compared to cancer cell lines indicating selectivity. Transcriptomic profiling (RNA-seq) in SUIT-2 pancreatic cancer cells treated with C5 identified a gene expression signature that was associated with the activation of integrated stress response (ISR) through upregulation of key stress-associated genes, alongside suppression of oncog …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pulmonary fibrosis (PF), particularly idiopathic pulmonary fibrosis (IPF), is a progressive and often fatal interstitial lung disease charac … echnologies, including whole-exome sequencing (WES), whole-genome sequencing (WGS), RNA sequencing (RNA-seq), and targeted gene panels, have uncovered key genetic determinants. These include mutations in telomere-related genes (TERT, TERC, RTEL1) and surfactant-related genes (SFTPC, SFTPA2), as well as common variants like the MUC5B promoter polymorphism. …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biliary tract carcinoma (BTC) is a malignancy with poor prognosis. Current molecular targeted therapies benefit only a limited subset of pat … anoids. DNA repair and gene expression regulation was integrally examined by immunofluorescence and RNA-Seq analysis following 10 Gy of X-rays. X-ray irradiation caused significant morphological changes. In addition, X-ray irradiation upregulated extracellular matrix-related gene expression as revealed by RNA sequencing. DNA damage response analysis indic …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Amelogenesis imperfecta (AI) is a group of inherited diseases characterized by enamel defects. Mutation in multiple genes may cause … ze the expression levels of integrin and collagen proteins upon downregulation of Fam83h.
RESULTS: RNA-seq analysis revealed differential expression of 572 genes in HAT-7 cells with knockdown of Fam83h gene, including 285 up-regulated genes and 287 down-regulated genes. GO and KEGG enrichment analysis indicated that Fam83h could modulate collagen synthes …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular morphological transitions are observed across many diseases, yet their functional role remains unclear because few technologies profile form and function in the same cell. Linking single-cell morphology to transcriptomics is difficult: The two modalities share no feature correspondence and are typically measured in different cells. We present GeoAdvAE, a geometry-aware adversarial autoencoder for diagonal (unpaired) integration of single-cell morphology and single-cell RNA sequencing. GeoAdvAE couples modality-specific variational autoencoders with a Gromov-Wasserstein regularizer and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA sequencing (RNA-seq) analysis revealed transcriptional features indicative of sustained immunosuppression within regulatory T cells (Tregs) isolated from atherosclerotic tissues, highlighting the critical contribution of immune checkpoint (ICP) receptor-ligand interactions to atherosclerosis progression. To comprehensively characterize the roles of ICP signaling in this context, we integrated transcriptomic profiling, quantitative RT-PCR, and flow cytometry analysis, yielding several key findings: (1) Multiomics integration revealed global transcriptomic alterations in ICP receptors and li…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artificial intelligence (AI) strategies are revolutionizing genomics by extracting complex patterns that traditional statistical pipelines are likely to miss. This mini-review aims to provide a concise overview of how AI is transforming major genomic technologies including variant calling, gene expression analysis, single-cell transcriptomics, CRISPR-Cas9 optimization, and multi-omics integration. In genome sequencing, machine learning variant callers greatly improve the accuracy and the rate at which single nucleotide and structural variants are called. In bulk RNA-Seq, AI augmented quantific…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The early morphogenesis of the embryo and endosperm sets the upper limit of rice grain yield; yet, the cellular dynamics and regulatory mechanisms underlying this critical stage remain largely elusive. Here, we present a single-cell atlas of developing rice seeds based on single-nucleus RNA sequencing of 67,922 high-quality nuclei from rice caryopses. Integration with bulk RNA-seq, in situ hybridization, and promoter-GUS staining enabled systematic cell-type annotation and revealed a distinct population of embryo-endosperm interface (EEI) cells occupying the boundary between the developing emb…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Advanced lung adenocarcinoma (LUAD) is the leading cause of cancer-related deaths, with existing treatments hampered by drug res … functional assays including CCK-8, flow cytometry, and scratch assay, PRESTO-Tango, RNA sequencing (RNA-seq), and qPCR were employed to validate the antitumor effects of EFL2 and the functional role of NPY5R. Results: High expression of NPY5R correlated with poor prognosis and immune cell infiltration in LUAD. EFL2 targeted NPY5R, inhibiting A549 cell pro …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Caveolin-2 (CAV2) is a lipid droplet (LD)-associated protein. Its role in oral leukoplakia (OLK), an oral potentially malignant … lesion diameter/number and attenuated pathological severity. HFD failed to rescue OLK progression. RNA-seq confirmed dysregulation of lipid transport, lipolysis, and fatty acid metabolism/biosynthesis. Targeted metabolomics revealed markedly attenuated carcinogen-induced fatty acid accumulation in cKO mice, with C18:2n6c (linoleic acid, LA) identified as …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The environmental pollutant polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are abundant in the environment due to large-scale industrial production … l relevant concentrations for 28 days. By deploying molecular dynamics simulations, RNA sequencing (RNA-seq), western blotting (WB), immunofluorescence (IF) staining, immunohistochemistry (IHC), and other methods, we showed that Phe exposure induce neuron DNA damage and directly bind and disrupt ribosomal structure to induce ribotoxic stress, leading to t …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antiphospholipid syndrome (APS) lacks disease-modifying targeted therapies, and its molecular heterogeneity remains poorly characterized. We employed an integrative systems pharmacology approach combining weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), single-cell RNA sequencing, Connectivity Map (CMap) screening, and molecular docking to prioritize candidate therapeutic targets in APS. WGCNA of purified-neutrophil bulk RNA-seq (n = 18), with module preservation confirmed in whole blood (n = 88), identified two disease-associated modules: ME10 (176 genes, r = 0.77, interferon-I signaling…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lactate metabolism-related reprogramming is closely associated with colon adenocarcinoma (COAD) progression, but related key molecules remain unclear. This study integrated the colorectal cancer single-cell RNA sequencing dataset GSE231559, which served as a single-cell reference and integrated it with bulk RNA-seq data from TCGA-COAD to screen lactate metabolism-related candidate genes. Epithelial cells showed higher lactate metabolism-related transcriptional scores. An overlap-based screening strategy was applied, encompassing three gene sets: epithelial markers associated with lactate metab…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate novel combination strategies for TP53-mutated acute myeloid leukemia (AML), focusing on the potential synergy betwee … score > 10). This combination extended survival in xenograft models (33.0 vs. 18.0 days, p < 0.01). RNA-seq identified serglycin (SRGN) as a candidate mediator potentially linking AZA-induced transcriptional reprogramming to ROS-mediated cell death. SRGN knockdown elevated ROS levels and sensitized cells to AZA. The combinatorial treatment significantly i …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early-onset preeclampsia (EOPE) is a severe hypertensive disorder of pregnancy associated with preterm delivery and maternal multi-organ dysfunction. Although placental senescence and immune dysregulation have been implicated in EOPE, the expression profile of senescence-related genes(SRGs) and their mechanistic roles in disease progression remain unclear.
METHODS: Multiple placental bulk RNA-seq datasets were integrated to identify senescence-related differentially expressed genes in EOPE. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and multiple machine learning algorith…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Preeclampsia (PE) is a serious complication of pregnancy for which reliable early predictive biomarkers are currently lacking. Cell-free RNA (cfRNA) has emerged as a promising non-invasive approach that may enhance clinical management and facilitate earlier diagnosis.
METHODS: To investigate PE, we applied single‑cell RNA sequencing (scRNA‑seq) to placental tissues, enabling the identification of differentially expressed genes. Integration of weighted gene co‑expression network analysis (WGCNA) with cfRNA profiles from PE patients revealed two gene modules that showed significan
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования