Bardet-Biedl Syndrome (BBS) is a rare, autosomal-recessive ciliopathy characterized by obesity, rod-cone dystrophy, postaxial polydactyly, renal abnormalities, genital abnormalities and learning difficulties. To date, mutations in 21 different genes have been described as being responsible for BBS. Recently sequential gene sequencing has been replaced by next generation sequencing (NGS) applications. In this study, 15 patients with clinically diagnosed BBS were investigated using a next generation sequencing panel which included 17 known BBS causing genes (BBS1, BBS2, ARL6, BBS4, BBS5, MKKS, B
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Freeman-Sheldon syndrome, or distal arthrogryposis type 2A (DA2A), is an autosomal-dominant condition caused by mutations in MYH3 and characterized by multiple congenital contractures of the face and limbs and normal cognitive development. We identified a subset of five individuals who had been putatively diagnosed with "DA2A with severe neurological abnormalities" and for whom congenital contractures of the limbs and face, hypotonia, and global developmental delay had resulted in early death in three cases; this is a unique condition that we now refer to as CLIFAHDD syndrome. Exome sequencing
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human milk oligosaccharides (HMOs) shape the intestinal microbiota in term infants. In premature infants, alterations in the intestinal microbiota (dysbiosis) are associated with risk of necrotizing enterocolitis (NEC) and sepsis, and the influence of HMOs on the microbiota is unclear.
METHODS: Milk, urine, and stool specimens from 14 mother-premature infant dyads were investigated by mass spectrometry for HMO composition. The stools were analyzed by next-generation sequencing to complement a previous analysis.
RESULTS: Percentages of fucosylated and sialylated HMOs were highly v
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We screened for viral DNA in cerebrospinal fluid samples using next-generation sequencing (NGS) technology to diagnose CNS viral infections. We collected CSF samples from four cases with clinically suspected viral meningoencephalitis. DNA extracted from the samples was analyzed with NGS, and the results were further validated using PCR. Herpes simplex virus 1 (HSV-1) was detected in the CSF of two patients, HSV-2 and human herpes virus type 3 (HHV-3, VZV) in the CSF of two other patients separately. The number of unique reads of the identified viral genes ranged from 144 to 44205 (93.51 to 99.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phacomatosis pigmentokeratotica (PPK) is characterized by the co-existence of epidermal nevi and large segmental speckled lentiginous nevi of the papulosa type. PPK, previously explained as 'twin spot' mosaicism due to the postzygotic crossing-over of two homozygous recessive mutations, has recently been shown to derive from one postzygotic activating RAS mutation. Epidermal nevi, including those in PPK, are known to give rise to neoplasms such as trichoblastoma and basal cell carcinoma. Within speckled lentiginous nevi, Spitz nevi and melanoma have been well documented. We report a case of PP
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To assess the utility of integrating genomic data from next-generation sequencing and phenotypic data to enhance the diagnosis of bilateral congenital cataract (CC).
DESIGN: Evaluation of diagnostic technology.
PARTICIPANTS: Thirty-six individuals diagnosed with nonsyndromic or syndromic bilateral congenital cataract were selected for investigation through a single ophthalmic genetics clinic.
METHODS: Participants underwent a detailed ophthalmic examination, accompanied by dysmorphology assessment where appropriate. Lenticular, ocular, and systemic phenotypes were recorded. Mutatio
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inverted duplications are a common type of copy number variation (CNV) in germline and somatic genomes. Large duplications that include many genes can lead to both neurodevelopmental phenotypes in children and gene amplifications in tumors. There are several models for inverted duplication formation, most of which include a dicentric chromosome intermediate followed by breakage-fusion-bridge (BFB) cycles, but the mechanisms that give rise to the inverted dicentric chromosome in most inverted duplications remain unknown. Here we have combined high-resolution array CGH, custom sequence capture,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next generation sequencing (NGS) technology has led to a burst of disease-relevant molecular information in a variety of lymphoid tumors, including chronic lymphocytic leukemia, diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, mantle cell lymphoma, Burkitt lymphoma, Waldenström macroglobulinemia, hairy cell leukemia, and splenic marginal zone lymphoma. Beside disclosing comprehensive catalogs of somatic mutations and new insights into the genes that contribute to cellular transformation, NGS has also provided molecular clues useful for addressing a number of unmet clinical needs in the fiel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNU2 exists in two functional forms (RNU2-1 and RNU2-2) distinguishable by the presence of a unique 4-bases motif. Detailed investigation of datasets obtained from deep sequencing of five human lung primary tumors revealed that both forms express at a high rate a 19-22nt fragment (miR-U2-1 and -2) from its 3' region and contains the 4-bases motif. Deep sequencing of independent pools of serum samples from healthy donors and lung cancer patients revealed that miR-U2-1 and -2 are pervasively processed in lung tissue by means of endonucleolytic cleavages and stably exported to the blood. Then, mi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: New strains of meticillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) may be associated with changes in rates of disease or clinical presentation. Conventional typing techniques may not detect new clonal variants that underlie changes in epidemiology or clinical phenotype.
AIM: To investigate the role of clonal variants of MRSA in an outbreak of MRSA bacteraemia at a hospital in England.
METHODS: Bacteraemia isolates of the major UK lineages (EMRSA-15 and -16) from before and after the outbreak were analysed by whole-genome sequencing in the context of epidemiological and clinical dat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As bacterial pathogens develop resistance against most currently used antibiotics, novel alternatives for treatment of microbial infectious diseases are urgently needed. Targeting bacterial virulence functions in order to disarm pathogens represents a promising alternative to classical antibiotic therapy. Type IV secretion systems, which are multiprotein complexes in the cell envelope that translocate effectors into host cells, are critical bacterial virulence factors in many pathogens and excellent targets for such "antivirulence" drugs. The VirB8 protein from the mammalian pathogen Brucella
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In wheat and other crops, some genes display presence/absence variation, and it is occasionally beneficial to select for the absent allele to remove a functional gene. However, current high-throughput genotyping methods used to detect the absence of genes tend to be inconsistent and inconclusive. Kompetitive allele-specific PCR (KASP) and PCR allele competitive extension (PACE) are two well-established methods for allele-specific polymerase chain reaction (AS-PCR) assays, each using fluorescence resonance energy transfer (FRET) to generate a signal for each allele, typically targeting bialleli
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The majority of cleft lip with or without cleft palate cases appear as an isolated, nonsyndromic entity (NSCLP). With the advent of next generation sequencing, whole exome sequencing (WES) has been used to identify single nucleotide variants and insertion/deletions which cause or increase the risk of NSCLP. However, to our knowledge, there are no published studies using WES in NSCLP to investigate copy number changes (CNCs), which are a major component of human genetic variation. Our study aimed to identify CNCs associated with NSCLP in a Honduran population using WES.
METHODS: WE
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Transcription Factor (TF) p63 is a master regulator of epidermal development and differentiation as evident from the remarkable skin phenotype of p63 mouse knockouts. Furthermore, ectopic expression of p63 alone is sufficient to convert simple epithelium into stratified epithelial tissues in vivo and p63 is required for efficient transdifferentiation of fibroblasts into keratinocytes. However, little is known about the molecular mechanisms of p63 function, in particular how it selects its target sites in the genome. p63, which acts both as an activator and repressor of transcri
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida tropicalis is one of the main causes of invasive candidiasis. Rapid identification of antifungal resistance is crucial for selection of an appropriate antifungal to improve patient outcomes. Mutations at specific loci are strongly correlated with resistance to antifungal agents. In this study, we developed a multi-single-nucleotide polymorphism (SNP) panel to accurately identify 36 mutation sites across seven genes of C. tropicalis that are associated with resistance to azoles and/or echinocandins. Ten isolates were selected to test repeatability, and another 20 isolates of C. tropical
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (allo-HSCT) has improved outcomes in patients with acute myeloid leukemia (AML) harboring FLT3-internal tandem duplication (FLT3-ITD) mutations. However, relapse still occurs in 15-35% of these patients after transplantation. Therefore, early and highly sensitive detection methods are required to identify patients at risk of relapse and enable timely post-transplant intervention.
METHODS: In this NICHE cohort study, a total of 136 patients were included, then we evaluated whether high-sensitivity polymerase chain reaction (PCR)-ne
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ovarian oncobiome is subject to increasing scientific focus, but a potential link between bacterial dysbiosis and ovarian carcinogenesis remains controversial. Our primary aim was to characterize the bacterial microbiota in epithelial ovarian cancer samples. Secondarily, we aimed to compare results from the bacterial microbiota in formalin-fixed, paraffin-embedded ovarian tissue samples from 194 patients with epithelial ovarian cancer, fallopian tube tissue samples from 16 patients with serous tubal intraepithelial carcinomas and in benign fallopian tube tissue samples from 25 patients. Ba
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diversity and evolution of the genomes of human bocavirus (HBoV), which causes respiratory diseases, have been scarcely studied. Here, we aimed to obtain and characterize HBoV genomes from patients's nasopharyngeal samples collected between 2017 and 2022 period (5 years and 7 months). Next-generation sequencing (NGS) used Illumina technology after having implemented using GEMI an in-house multiplex PCR amplification strategy. Genomes were assembled and analyzed with CLC Genomics, Mafft, BioEdit, MeV, Nextclade, MEGA, and iTol. A total of 213 genomes were obtained. Phylogeny classified them
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Conjunctival melanoma (CoM) is a rare but highly lethal ocular melanoma and there is limited understanding of its genetic background. To update the genetic landscape of CoM, whole-exome sequencing (WES) and targeted next-generation sequencing (NGS) were performed.
METHODS: Among 30 patients who were diagnosed and treated at Shanghai Ninth People's Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, from January 2018 to January 2023, WES was performed on 16 patients, while targeted NGS was conducted on 14 patients. Samples were analysed to identify the mutated genes, and the pote
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Next-generation DNA sequencing (NGS) technologies have increased the sensitivity for detecting the bacterial presence and have been used in other areas of orthopaedics to better understand the native microbiome of various joints. This study uses NGS to determine whether (1) a unique microbiome exists in human ankle tissues, (2) if components of the ankle microbiome affect patient outcomes, and (3) whether microbes found on the skin are a normal part of the ankle microbiome.
METHODS: A prospective study recruited 32 patients undergoing total ankle arthroplasty (n = 23) or ankle a
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования