HIV-1 protease (PR) enzyme is a viable antiretroviral drug target due to its crucial role in HIV maturation. Over many decades, the HIV-1 PR enzyme has exhibited mutations brought on by drug pressure and error-prone nature of HIV-1 reverse transcriptase. Non-active site mutations have played a pivotal role in drug resistance; however, their mechanism of action has not been fully elucidated. We investigated how non-active site mutations affect the conformational stability and drug binding ability of HIV-1 PR. In light of this, we studied a novel HIV-1 subtype C protease variant containing an in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive aspergillosis is one of the most serious clinical invasive fungal infections, resulting in a high case fatality rate among immunocompromised patients. The disease is caused by saprophytic molds in the genus Aspergillus, including Aspergillus fumigatus, the most significant pathogenic species. The fungal cell wall, an essential structure mainly composed of glucan, chitin, galactomannan, and galactosaminogalactan, represents an important target for the development of antifungal drugs. UDP (uridine diphosphate)-glucose pyrophosphorylase (UGP) is a central enzyme in the metabolism of carb
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serum albumin (SA) is the most prevalent protein found in blood. Human albumin was used as an albumin substitute in hypoalbuminemia pets due to high sequence similarity. SAs from furry animals were also reported to be the major indoor allergens. Sensitizing to one of SAs coupled with high sequence identity can lead to cross-reactive antibodies in allergic individuals. Thus, understanding the structural and dynamic characters of SAs is crucial for not only albumin substitution but also allergen therapy. Herein, Molecular dynamics (MD) simulations were performed to elucidate the structural and d
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The SARS-CoV-2 main protease (Mpro) has a pivotal role in mediating viral genome replication and transcription of the coronavirus, making it a promising target for drugs against the COVID-19 pandemic. Here, a crystal structure is presented in which Mpro adopts an inactive state that has never been observed before, called new-inactive. It is shown that the oxyanion loop, which is involved in substrate recognition and enzymatic activity, adopts a new catalytically incompetent conformation and that many of the key interactions of the active conformation of the enzyme around the active site are lo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work we present a computational analysis together with experimental studies, focusing on the interaction between a benzothiazole (BTS) and lysozyme. Results obtained from isothermal titration calorimetry, UV-vis, and fluorescence were contrasted and complemented with molecular docking and machine learning techniques. The free energy values obtained both experimentally and theoretically showed excellent similarity. Calorimetry, UV-vis, and 3D/2D-lig-plot analysis revealed that the most relevant interactions between BTS and lysozyme are based on a predominance of aromatic, hydrophobic Va
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gp41 type I membrane protein is part of the trimeric Env complex forming the spikes at the HIV surface. By interacting with cellular receptors, the Env protein complex initiates the infectious cycle of HIV. After the first contact has been established Env disassembles by shedding gp120 while the remaining gp41 undergoes a number of conformational changes which drive fusion of the cellular and the viral membranes. Here we investigated the membrane interactions and oligomerization of the two gp41 heptad repeat domains NHR and CHR. While these are thought to form a six-helix bundle in the pos
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mumps virus is one of the main cause of respiratory illnesses in humans, especially children. Among the viral surface glycoproteins, the hemagglutinin - neuraminidase, MuV-HN, plays key roles in virus entry into host cells and infectivity, thus representing an ideal target for the design of novel inhibitors. Here we report the detailed analysis of the molecular recognition of host cell surface sialylated glycans by the viral glycoprotein MuV-HN. By a combined use of NMR, docking, molecular modelling and CORCEMA-ST, the structural features of sialoglycans/MuV-HN complexes were revealed. Evidenc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aspergillus fumigatus is a major pathogen of invasive pulmonary aspergillosis with high mortality rate. The nucleoside diphosphate kinase of A. fumigatus, AfNDK (also called SwoH) is essential for its viability, however, its structural characteristic was unknown. In this study, we solved the crystal structure of AfNDK and found that it exists predominantly in form of tetramer in solution. Oligomeric form rather than dimeric form was essential for its kinase activity. The Arg30 and the C terminal amino acids were crucial for dimer-dimer interaction and the viability of A. fumigatus. Mutation V8
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little is known about Epstein Barr Virus (EBV) proteins that participate in viral DNA cleavage and packaging. Genes encoding potential terminase subunit and portal protein homologs include BGRF1/BDRF1, BALF3, BFRF1A and BBRF1 respectively. EBV mutants with deletions in one or more of these genes were impaired for DNA packaging (Pavlova et al., 2013). In the current study, BBRF1 oligomers were purified from recombinant baculovirus infected insect cell extracts. Transmission electron microscopy revealed that purified EBV portals retained features typically found in other portals including a cent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Etoricoxib, widely used for the treatment of osteoarthritis, rheumatoid arthritis, ankylosing spondylitis, and related conditions has ample affinity to bind with globular proteins. Here, the molecular interaction between purified human hemoglobin (HHb), a major heme protein and etoricoxib, a cyclooxygenase-2 inhibitor was studied by various spectroscopic, calorimetric, and molecular modeling techniques. The binding affected hypochromic changes in the Soret band of hemoglobin (Hb) and induced remarkable quenching of the intrinsic fluorescence property of protein molecules. Synchronous fluoresce
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gentamicins are heavily methylated, clinically valuable pseudotrisaccharide antibiotics produced by Micromonospora echinospora. GenN has been characterized as an S-adenosyl-l-methionine-dependent methyltransferase with low sequence similarity to other enzymes. It is responsible for the 3″-N-methylation of 3″-dehydro-3″-amino-gentamicin A2, an essential modification of ring III in the biosynthetic pathway to the gentamicin C complex. Purified recombinant GenN also efficiently catalyzes 3″-N-methylation of related aminoglycosides kanamycin B and tobramycin, which both contain an additional hydro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The aim of this study was to predict the T-cell and B-cell epitopes in major outer membrane protein (MOMP) of Chlamydia trachomatis (CT) by using online software and also to analyse the secondary structure of MOMP through bioinformatics tools.
MATERIALS AND METHODS: The predictions of secondary structure of MOMP protein were carried out using SOPMA software, and the prediction of B-cell epitopes in MOMP protein was carried out using IEDB and LEPS software, while the T-cell epitopes were predicted by the software of IEBD and SYFPEITHI. The predictions from the software were combined w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid formation is related to neurodegenerative diseases like Alzheimer's disease or Parkinson's disease. In the molecular onset of the diseases, soluble peptides adopt conformations that are rich in β-sheet and ultimately form aggregates. How this process is triggered or influenced by membrane binding, or how the membrane integrity is disturbed by the peptide binding and conformational transition is still under debate. In the present study, we systematically examine the effects of β-sheet prone model peptides on zwitterionic and negatively charged lipids in both mono- and bilayers and in va
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Phenoloxidase (PO)-catalyzed melanization is a universal defense mechanism of insects against pathogenic and parasitic infections. In mosquitos such as Anopheles gambiae, melanotic encapsulation is a resistance mechanism against certain parasites that cause malaria and filariasis. PO is initially synthesized by hemocytes and released into hemolymph as inactive prophenoloxidase (PPO), which is activated by a serine protease cascade upon recognition of foreign invaders. The mechanisms of PPO activation and PO catalysis have been elusive.
RESULTS: Herein, we report the crystal struct
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloidogenic peptides and proteins play a crucial role in a variety of neurodegenerative disorders such as Alzheimer's and Parkinson's disease. These proteins undergo a spontaneous transition from a soluble, often partially folded form, into insoluble amyloid fibrils that are rich in β-sheets. Increasing evidence suggests that highly dynamic, polydisperse folding intermediates, which occur during fibril formation, are the toxic species in the amyloid-related diseases. Traditional condensed-phase methods are of limited use for characterizing these states because they typically only provide ens
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gene 30S ribosomal protein S2 (30S2) is identified as a potential drug and vaccine target for Pneumonia. Its structural characterization is an important to understand the mechanism of action for identifying its receptor and/or other binding partners. The comparative genomics and proteomics studies are useful for structural characterization of 30S2 in C. Pneumoniae using different bioinformatics tools and web servers. In this study, the protein 30S2 structure was modelled and validated by Ramachandran plot. It is found that the modelled protein under most favoured "core" region was 88.7% an
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Injectable hydrogels have a variety of applications, including regenerative medicine, tissue engineering and controlled drug delivery. In this paper, we reported on a pure protein hydrogel based on tetrameric recombinant proteins for the potential drug delivery application. This protein hydrogel was formed instantly by simply mixing two recombinant proteins (ULD-TIP1 and ULD-GGGWRESAI) through the specific protein-peptide interaction. The protein hydrogel was characterized by rheology and scanning electron microscopy (SEM). In vitro cytotoxicity test indicated that the developed protein hydrog
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nowadays clinical therapy witnesses a challenging bacterial resistance limiting the available armament of antibiotics. Over the decades strains resistant to all antibiotics have been selected while medicinal chemists were not able to develop agents capable of destroying them or to prevent their extension. In particular, carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE), representing one of the most common human pathogens, have been reported with increased frequency since their first identification twenty years ago. The enterobacterial carbapenemases differ from the extended spectrum β-lactamases (
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Central Diabetes Insipidus (CDI) is caused by a deficiency of antidiuretic hormone and characterized by polyuria, polydipsia and inability to concentrate urine. Our objective was to present the results of the molecular analyses of AVP-neurophysin II (AVP-NPII) gene in a large familial neurohypophyseal (central) DI pedigree. A male patient and his family members were analyzed and the prospective clinical data were collected. The proband applied to hospital for eligibility to be a recruit in Armed Forces. The patient had severe polyuria (20 L/day), polydipsia (20.5 L/day), fatique, and deep thir
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tyrosinase is responsible for the two initial enzymatic steps in the conversion of tyrosine to melanin. Many tyrosinase mutations are the leading cause of albinism in humans, and it is a prominent biotechnology and pharmaceutical industry target. Here we present crystal structures that show that both monophenol hydroxylation and diphenol oxidation occur at the same site. It is suggested that concurrent presence of a phenylalanine above the active site and a restricting thioether bond on the histidine coordinating CuA prevent hydroxylation of monophenols by catechol oxidases. Furthermore, a con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования