The lethal-7 (let-7) family is an important microRNA (miRNA) group that usually exerts functions as a tumor suppressor. We aimed to evaluate the expression profile of let-7a, let-7b, let-7c, let-7d, let-7e, let-7f, let-7g, and let-7i and to assess their value as prognostic markers in uterine leiomyosarcoma (LMS) patients. The miRNAs expression profile was assessed in 34 LMS and 13 normal myometrium (MM) paraffin-embedded samples. All let-7 family members showed downregulation in LMS. Our findings showed that patients with let-7e downregulation had worse overall survival (OS) and is an independ…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Celiac disease is provoked by gluten exposure, but the complete pathogenic process in the duodenum and the loss of tolerance to gluten is not well understood. We aimed to define the core celiac transcriptomic signature and pathologic pathways in pre-treatment formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) duodenum biopsies used for clinical diagnosis. We use mRNAseq to define pre-treatment diagnostic duodenum gene expression in 54 pediatric celiac patients and non-celiac controls, and we validate our key findings in two independent cohorts of 67 adults and pediatric participants that used fresh froze…
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diverse studies have evidenced that chemokines can play a critical role in pathogenesis of oral squamous cell carcinoma (SCC). The main chemokines involved in oral carcinogenesis, tumor invasion and metastasis are CCR4, CCR5, CCR7 and CXCR4, and our aim was to evaluate the prognostic value of the immunoexpression of these chemokines in SCC of tongue and floor of the mouth.
MATERIAL AND METHODS: A retrospective descriptive study of the immunohistochemical expression of CCR4, CCR5, CCR7 and CXCR4 in paraffin-embedded samples of 124 patients with SCC of the tongue and floor of the mo…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine rotavirus (BRoV) and bovine coronavirus (BCoV) are major enteric viral pathogens responsible for calve diarrhoea. They are widespread … in reaction (RT-PCR). Further RT-PCR positive cases were confirmed by immunohistochemistry (IHC) in paraffin-embedded intestinal tissue sections. Three cases of enteritis caused by BRoV showed the hallmark lesions of the shortening and fusion of villi, denudation and infiltration of mononuclear cells in the lamina propria. The BRoV antigen distribution was …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To systematically describe the clinical and histopathological features of a case series of conjunctival carcinomatous lesions underlying as-and also masquerading-pyogenic granuloma.
METHODS: Nine cases of conjunctival carcinomatous lesions underlying a pyogenic granuloma (which were clinically predominant) were retrospectively identified. Patients' records were analysed for demographic data, clinical appearance and the postoperative course. Formalin-fixed paraffin-embedded specimens were routinely processed and stained with H&E and periodic acid-Schiff. Immunohistochemical stains for cy…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplex immunophenotyping technologies are indispensable for a deeper understanding of biological systems. Until recently, high-dimensional cellular analyses implied the loss of tissue context as they were mostly performed in single-cell suspensions. The advent of imaging mass cytometry introduced the possibility to simultaneously detect a multitude of cellular markers in tissue sections. This technique can be applied to various tissue sources including snap-frozen and formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues. However, a number of methodological challenges must be overcome when devel…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: During palatal development, medial edge epithelium (MEE) disappearance is one of the crucial steps in the process of fusion. The … TGF-β3(±), and TGF-β3 null) were collected at embryonic day E14.5, genotyped, fixed and embedded in paraffin. Serial sections were studied for detection of apoptosis and epithelial mesenchymal transition using immunofluorescence.
RESULTS: TGF-β3 null mice developed a cleft in the secondary palate while both mice with K14-SMAD2 overexpression had fusion of …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malignant peripheral nerve sheath tumors (MPNSTs) are rare and aggressive soft tissue sarcomas with a significant susceptibility to metastas … taining to clinical data and survival in patients with and without NF1. In total, 34 formalin-fixed paraffin-embedded MPNST tissues from 29 patients were eligible. MCD, MVD, and Ki-67 labeling index (LI) were analyzed in all stained tissues by a computer-based quantitative algorithm (Aperio ImageScope). In addition, chart review was performed for clinical …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hollow organs such as the lungs pose a considerable challenge for post-mortem imaging in preclinical research owing to their extremely low c … (silver nitrate and iodine) by immersion. To create the histology ground-truth, the CT scan of the paraffin block guided the sectioning towards specific planes of interest. The digitalized histological slides reveal the presence, extent, and appearance of the contrast agents in lung structures and organized aggregates of immune cells. These findings corre …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AL amyloidosis (light chain; previously also called primary amyloidosis) is a systemic disease characterized by an amyloid deposition proces … emotactic factor 2) deposition. Immunofluorescence (IF) plays a key role here. IF on formalin-fixed paraffin-embedded tissue after protease digestion, immunohistochemistry or laser microdissection with mass spectrometry should complete the diagnosis in unclear cases. Standard treatment with melphalan and prednisolone or with cyclophosphamide and dexamethas …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrahepatic cholangiocarcinoma is a rare malignant biliary neoplasm that causes a poor prognosis even after curative hepatectomy. Liver met … es, and 36 pairs (primary and metastatic lesions) of intrahepatic cholangiocarcinoma formalin-fixed paraffin-embedded samples, from patients who underwent surgical resection at hospitals related to the Kyushu Study Group of Liver Surgery between 2002 and 2016. We carried out cDNA microarray analyses and immunohistochemistry to identify candidate genes, and …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cytomegalovirus (CMV) endotheliitis is a significant cause for acute corneal allograft rejection in East Asian populations, wher … hat had failed without a history of endothelial rejection. For these groups archived formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue samples were retrieved. We also prospectively examined 80 non-fixed cornea rims following transplantation surgery. In all samples nested quantitative PCR was used to identify CMV, herpes simplex virus (HSV) and varicella zoste …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Histoid leprosy is a subtype of leprosy with distinct clinical presentation and histologic features. It accounts for <4% of leprosy cases. The exact location of histoid leprosy along the immune spectrum and its relation to other subtypes is unclear.
AIM: To evaluate the local immune phenomenon which define histoid leprosy.
DESIGN: Parallel skin biopsies from histoid lesions and from unremarkable skin in patients with histoid leprosy were evaluated and the histologic findings compared.
METHODS: Formalin fixed, paraffin embedded tissue sections from lesional and non-lesional biops…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uveal melanoma is a highly aggressive cancer of the eye, in which nearly 50% of the patients die from metastasis. It is the most common type … dependent probe amplification, and Illumina SNP array. By validating our assay in 27 formalin-fixed paraffin-embedded and 43 fresh uveal melanomas, we show that mutations and chromosome status can reliably be obtained using targeted next-generation sequencing. Implementing this technique as a diagnostic pathology application for uveal melanoma will allow p …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Mediastinal gray zone lymphoma (MGZL) is a rare entity with morphologic, immunophenotypic, and genetic features intermediate between c … MBLs.
CONCLUSIONS: Our study is the first to show CD123 is positive in a subset of formalin-fixed, paraffin-embedded MGZLs and CHLs, in contrast to PMBL which is largely negative. Staining for fascin was not significantly different between the lymphomas, but was less likely to be positive in PMBL. These findings suggest a role for CD123 and fascin in supp …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Next-generation sequencing (NGS) allows for the identification of a growing number of therapeutic and prognostic molecular tar … %), identifying an average of 12.7 mutations at a mean coverage depth of 806X. NGS was performed on paraffin-embedded cell blocks in 93 cases (93.9%) and on cell-free DNA in needle rinse fluid in 6 cases. The success rate of the assay improved significantly from the first third of cases (76.3%), to 92.3% for the final one-third of cases (p < 0.05).
CONCLU …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor protein 63 (p63) is a nuclear antigen found in basal epithelial cells. To date, 10 isoforms of p63 have been identified, falling into … riate substitution as a MYEC and epithelial basal cell marker. An array of archived formalin-fixed, paraffin-embedded bovine tissues were subjected to immunohistochemical staining for either p40 or p63, with a subset being dual stained for direct comparison. Positive staining for p40 and p63 was observed in serial sections of mammary, skin, rumen, salivary …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Glycoprotein non-metastatic protein B (GPNMB) is a transmembrane glycoprotein that is expressed at higher levels in several malignant human tissues than those in matched normal tissues. Thus, GPNMB may serve as an attractive therapeutic target of cancer treatment. In this study, the prognostic value of GPNMB expression was examined in tumors derived from a cohort of patients with epithelial ovarian cancer (EOC).
METHODS: GPNMB expression in matched formalin-fixed and paraffin-embedded tissue samples was evaluated by immunohistochemistry (IHC), whereas GPNMB mRNA expression in fresh…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVE: KRAS mutations are reported in many types of cancers including pancreas, lung, colon, breast,and gastric (GC). High frequency of KRAS mutation is observed in the pancreas,colon, and lung cancers; they commonly arise in codon 12 and 13 of exon 2. Due to the lack of information about the frequency of KRAS mutations in the Northeast of Iran, the currentstudy aimed at evaluating KRAS frequency in cases with GC in this region.
METHODS: A total of120 formalin-fixed, paraffin-embedded blocks of patients with GC were assessed. The assays to detect KRAS in codon 12 and13 were o…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Matrix metalloproteinases (MMPs) family play a determinative role in the development of liver fibrosis, metastasis, unregulated angiogenesis, and tumor growth. In this study the possible association between the MMP-2 gene expression level and risk of chronic hepatitis B virus (HBV) or hepatitis C virus (HCV) infections were evaluated in liver transplanted patients. Formalin fixed paraffin embedded (FFPE) liver tissue samples were collected from 225 transplant patients between years 2012 and 2016. The presence of HBV and HCV infections were analyzed in patients studied using molecular and immun…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования