This review article describes a historical perspective of elucidation of the nature of the chemical bonds of the high-valent transition metal oxo (M=O) and peroxo (M-O-O) compounds in chemistry and biology. The basic concepts and theoretical backgrounds of the broken-symmetry (BS) method are revisited to explain orbital symmetry conservation and orbital symmetry breaking for the theoretical characterization of four different mechanisms of chemical reactions. Beyond BS methods using the natural orbitals (UNO) of the BS solutions, such as UNO CI (CC), are also revisited for the elucidation of th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cavity model of the effect of a solvent on thermodynamic parameters of dimerization of polar species in non-polar liquids has been develop … f the solvent effect on Kd is a first step to generalization of standard implicit solvent models in computational chemistry (such as the polarizable continuum model) to media of significant quadrupolar strength. This is expected to be particularly important for polar species dissolved in CO2 relevant for carbon capture and storage where appropriate models do not currentl …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enols - tautomers of ketones or aldehydes - are anticipated to be ubiquitous in the interstellar medium and play a key role in the formation of complex organic molecules in deep space, but their fundamental formation mechanisms have remained largely elusive as of now. Here we present a combined experimental and computational study demonstrating the first preparation of propen-2-ol (CH3C(OH)CH2) and its isomer methyl vinyl ether (CH3OCHCH2) in low-temperature acetone (CH3COCH3) ices upon exposure to energetic electrons. Propen-2-ol is the simplest enol tautomer of a ketone. Exploiting tunable v
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An integrated computational approach to drug discovery was used to identify novel potential inhibitors of the native and mutant (T315I) Bcr-Abl tyrosine kinase, the enzyme playing a key role in the pathogenesis of chronic myeloid leukemia (CML). This approach included i) design of chimeric molecules based on the 2-arylaminopyrimidine fragment, the main pharmacophore of the Abl kinase inhibitors imatinib and nilotinib used in the clinic for the CML treatment, ii) molecular docking of these compounds with the ATP-binding site of the native and mutant Abl kinase, iii) refinement of the ligand-bin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The urgency of finding novel antibacterial drugs (not only antibiotics), exhibiting different mechanisms of therapeutic action, is significa … rophore ligands of various structures, denticities, and charge states by employing the tools of the computational chemistry at the DFT/SMD level. Our results not only fall in line with recent experimental data but also complement our knowledge about "Trojan horse" gallium-based therapy.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular interactions of importance to cell biology are subject to sol-gel transitions: large clusters of weakly interacting multivalent molecules (gel phase) are produced at a critical concentration of monomers. Examples include cell-cell and cell-matrix adhesions, nucleoprotein bodies, and cell signaling platforms. We use the term pleomorphic ensembles (PEs) to describe these clusters, because they have dynamic compositions and sizes and have rapid turnover of their molecular constituents; this plasticity can be highly responsive to cellular signals. The classical polymer physical chemistry
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Agmatine is an endogenous brain metabolite, decarboxylated arginine, which has neuroprotective properties when injected intraperitoneally (i.p.) into rat pups following hypoxic-ischemia. A previous screen for compounds based on rat brain lysates containing agmatinase with assistance from computational chemistry, led to piperazine-1-carboxamidine as a putative agmatinase inhibitor. Herein, the neuroprotective properties of piperazine-1-carboxamidine are described both in vitro and in vivo. Organotypic entorhinal-hippocampal slices were firstly prepared from 7-day-old rat pups and exposed in vit…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The properties of nitrogen centres acting either as hydrogen-bond or Brønsted acceptors in solid molecular acid-base complexes have been probed by N 1s X-ray photoelectron spectroscopy (XPS) as well as (15)N solid-state nuclear magnetic resonance (ssNMR) spectroscopy and are interpreted with reference to local crystallographic structure information provided by X-ray diffraction (XRD). We have previously shown that the strong chemical shift of the N 1s binding energy associated with the protonation of nitrogen centres unequivocally distinguishes protonated (salt) from hydrogen-bonded (co-crysta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of HIV-1 integrase (INT) inhibitors has been hampered by incomplete structural and mechanistic information. Despite the efforts made to overcome these limitations, only one compound has been approved for clinical use so far. In this work, we have used all experimental information available for INT and similar enzymes, to build a model of the holo-integrase:DNA complex that includes an entire central core domain, a ssDNA GCAGT substrate, and two magnesium ions. Subsequently, we used a large array of computational techniques, which included molecular dynamics, thermodynamic integ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Climate change necessitates the urgent development of sustainable alternatives to petroleum-derived fuels for energy-intensive applications such as aviation, rocketry, and long-haul transport, where electrification remains impractical. This study presents polycyclopropanated lipid-inspired ionic liquids (PCP-ILs) as the first class of high-energy-density fuel candidates synthesized from renewable bioderived fatty esters. Our design strategy draws inspiration from natural lipid structures, leveraging their inherent fluidity characteristics to create functional ILs. We developed a facile synthes
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bioprospecting for extremozymes from unique ecological niches is crucial for developing robust biocatalysts for green chemistry. Here, we report the de novo hybrid genome assembly of Penicillium crustosum CTM10622, isolated from the humid montane forest of El Feïdja National Park, Tunisia. Using Illumina NextSeq™ 500 and Nanopore PromethION 2 Solo, a highly contiguous 31.38 Mb assembly (N50 = 1.94 Mb; 98.3% BUSCOs) was achieved. This robust genomic foundation enabled the identification of an extensive hydrolase repertoire, leading to the discovery of a novel alkaline serine lipase, PCLIP, subs
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanoplastics (NPs) are globally recognized as pervasive emerging contaminants with demonstrated toxicological risks, yet predicting their environmental behavior under realistic conditions remains a major scientific challenge. Addressing this gap, this study integrates controlled aggregation experiments with a hybrid machine-learning (ML) framework to enhance mechanistic and predictive understanding of NP fate across diverse aqueous matrices. Experimentally derived aggregation kinetics were used to train a stacked ML architecture, while Explainable AI (XAI) methods elucidated the underlying dri
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Targeted nanomedicines can improve drug solubility and stability, reshape pharmacokinetics, and enhance tolerability; however, precise delivery to the intended organ, recipient cell, and site of action remains difficult to achieve and verify. Following administration, dilution, component exchange, biomolecular corona formation, complement activation, blood-cell interactions, organ sequestration, intracellular trafficking, and degradation reshape formulation composition, biological interactions, and disposition. These processes transform the as-formulated synthetic identity into an acquired bio
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The catalytic properties of bimetallic nanoclusters are governed by a complex interplay between their size, composition, chemical ordering, and interaction with the support. Here, we perform a comprehensive data-driven computational study using the USPEX evolutionary algorithm for global structure prediction of Pt-Au nanoclusters (up to 24 atoms), followed by high-throughput screening for O and CO adsorption energy with MACE foundation model and simulations of chemical reactor. We combine about 12 000 density functional theory (DFT) calculations with a machine learning workflow that adds over
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review examines recent quantum chemical methodologies applied to investigating antibiotic structure and mechanisms of action. The discussion is organised into three sections: (1) enzymatic hydrolysis of the β-lactam ring, (2) interactions of antibiotics with ribosomal subunits and enzyme active sites, and (3) complex formation with metal ions. Each section evaluates how quantum chemical approaches, particularly density functional theory (DFT) and hybrid QM/MM techniques, model molecular processes relevant to antibiotic function, including transition states, electron density analyses, and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragment-based drug discovery (FBDD) has emerged as a transformative strategy in modern medicinal chemistry, offering a rational and efficient alternative to traditional highthroughput screening (HTS). By utilizing small, low-molecular-weight fragments with moderate binding affinity, FBDD enables systematic optimization into potent lead compounds with improved physicochemical properties. Its modular and ligand-centric nature has proven particularly advantageous in accelerating early-stage drug discovery. The COVID-19 pandemic highlighted the adaptability of FBDD, as fragment screening and comp
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vascular smooth muscle cell (VSMC) senescence is a major driver of age-related vascular remodeling and functional decline, and i … sms of lysosomal membrane repair were elucidated using electron microscopy, immunofluorescence, and computational chemistry.
RESULTS: GA-D was identified and verified to ameliorate vascular senescence and stiffness. GA-D enhanced endoplasmic reticulum (ER)-lysosome colocalization and restored lysosomal acidity in senescent VSMCs. Surface plasmon resonance analysis indic …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PROSPECT (PRimary screening Of Strains to Prioritize Expanded Chemistry and Targets) is an antimicrobial discovery platform based on chemical-genetic interaction profiling of compounds against a pool of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) hypomorphs, each depleted of an essential gene. We now report a novel N-oxolan-3-yl pyrazole carboxamide inhibitor, BRD1554, with selective activity against strains depleted of polyketide synthase 13 (Pks13), an essential polyketide synthase in mycolic acid synthesis, and Rv2581c, an uncharacterized protein similar to glyoxylase II enzymes. PCL analysis, our pre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasitic helminth infections impose major burdens on human and animal health, and increasing anthelmintic resistance reinforces the need for new drugs. Early-stage discovery remains constrained by the scarcity of novel, potent, selective and chemically tractable starting points, the limited predictive value of some experimental models, mechanistic uncertainty and insufficient capacity to sustain promising series through medicinal chemistry, safety and exposure studies. Discovery can begin through complementary routes, including target-agnostic whole-organism screening, screening of known-phar
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) represents a significant challenge in antimicrobial chemotherapy, with mortality rates reaching 50% in bloodstream infections. Building on prior disk diffusion evidence of K. pneumoniae inhibition by N-acetamide tetrazoloquinazoline compounds and a cross-series analysis of >60 published derivatives across seven structural subclasses, this study presents the first MIC-quantified antibacterial evaluation against a clinically isolated, multidrug-resistant K. pneumoniae strain. Twenty-one synthetic tetrazolo[1,5-c]quinazoline deriv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования