OBJECTIVES: Corynebacterium striatum is an emerging multidrug-resistant (MDR) pathogen of immunocompromised and chronically ill patients. The objective of these studies was to provide a detailed genomic analysis of disease-causing C. striatum and determine the genomic drivers of resistance and resistance-gene transmission.
METHODS: A multi-institutional and prospective pathogen genomics programme flagged seven MDR C. striatum infections occurring close in time, and specifically in immunocompromised patients with underlying respiratory diseases. Whole genome sequencing was used to identify clo…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberous Sclerosis Complex (TSC) is a multisystem autosomal dominant condition caused by inactivating pathogenic variants in either the TSC1 or the TSC2 gene, leading to hyperactivation of the mTOR pathway. Here, we present an update on the genetic and genomic aspects of TSC, with a focus on clinical and laboratory practice. We briefly summarize the structure of TSC1 and TSC2 as well as their protein products, and discuss current diagnostic testing, addressing mosaicism. We consider genotype-phenotype correlations as an example of precision medicine, and discuss genetic counseling in TSC, with
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We characterized associations between central nervous system (CNS) adverse events and brain neurotransmitter transporter/receptor genomics among participants randomized to efavirenz-containing regimens in AIDS Clinical Trials Group studies in the USA.
PARTICIPANTS AND METHODS: Four clinical trials randomly assigned treatment-naive participants to efavirenz-containing regimens. Genome-wide genotype and PrediXcan were used to infer gene expression levels in tissues including 10 brain regions. Multivariable regression models stratified by race/ethnicity were adjusted for CYP2B6/CYP2A6…
СтатьяРандомизированное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infections with Neisseria gonorrhoeae, a sexually transmitted pathogen that causes urethritis, cervicitis, and more severe complications, are increasing. Gonorrhea is typically treated with antibiotics; however, N. gonorrhoeae has rapidly acquired resistance to many antibiotic classes, and lineages with reduced susceptibility to the currently recommended therapies are emerging worldwide. In this review, we discuss the contributions of whole genome sequencing (WGS) to our understanding of resistant N. gonorrhoeae. Genomics has illuminated the evolutionary origins and population structure of N. …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The inherited bone marrow failure syndromes (IBMFS) typically present with significant cytopenias in at least one haematopoietic cell lineage that may progress to pancytopenia, and are associated with increased risk of cancer. Although the clinical features of the IBMFS are often diagnostic, variable disease penetrance and expressivity may result in diagnostic dilemmas. The discovery of the genetic aetiology of the IBMFS has been greatly facilitated by next-generation sequencing methods. This has advanced understanding of the underlying biology of the IBMFS and been essential in improving clin
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The review summarizes the results of first genomic and transcriptomic investigations of the liver fluke Clonorchis sinensis (Opisthorchiidae, Trematoda). The studies mark the dawn of the genomic era for opisthorchiids, which cause severe hepatobiliary diseases in humans and animals. Their results aided in understanding the molecular mechanisms of adaptation to parasitism, parasite survival in mammalian biliary tracts, and genome dynamics in the individual development and the development of parasite-host relationships. Special attention is paid to the achievements in studying the codon usage bi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To gain insight into how mutant huntingtin (mHtt) CAG repeat length modifies Huntington's disease (HD) pathogenesis, we profiled mRNA in over 600 brain and peripheral tissue samples from HD knock-in mice with increasing CAG repeat lengths. We found repeat length-dependent transcriptional signatures to be prominent in the striatum, less so in cortex, and minimal in the liver. Coexpression network analyses revealed 13 striatal and 5 cortical modules that correlated highly with CAG length and age, and that were preserved in HD models and sometimes in patients. Top striatal modules implicated mHtt
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Visceral obesity and metabolic syndrome are commonly associated with non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD). The progression of steatosis to NASH depends on a number of metabolic and patient-related factors. The mechanisms of genetic predisposition towards the development of NASH and related fibrosis remain unclear. In this study, our aim was to utilize mitotyping and identify mitochondrial haplotypes that may be associated with NAFLD.
METHODS: We examined mitochondrial haplotypes along with patatin-like phospholipase domain containing 3 (PNPLA3) rs738409 genotype to determine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Understanding the pathogenesis of systemic sclerosis (SSc) is confounded by considerable disease heterogeneity. Animal models of SSc that recapitulate distinct subsets of disease at the molecular level have not been delineated. We applied interspecies comparative analysis of genomic data from multiple mouse models of SSc and patients with SSc to determine which animal models best reflect the SSc intrinsic molecular subsets.
METHODS: Gene expression measured in skin from mice with sclerodermatous graft-versus-host disease (GVHD), bleomycin-induced fibrosis, Tsk1/+ or Tsk2/+ mice was
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Body size is the most important economic trait for animal production and breeding. Several hundreds of loci have been reported to be associated with growth trait and body weight in chickens. The loci are mapped to large genomic regions due to the low density and limited number of genetic markers in previous studies. Herein, we employed comparative population genomics to identify genetic basis underlying the small body size of Yuanbao chicken (a famous ornamental chicken) based on 89 whole genomes. The most significant signal was mapped to the BMP10 gene, whose expression was upregulated in the…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid low-cost whole-genome sequencing (WGS) is revolutionizing microbiology; however, complementary advances in accessible, reproducible, and rapid analysis techniques are required to realize the potential of these data. Here, investigations of the genus Neisseria illustrated the gene-by-gene conceptual approach to the organization and analysis of WGS data. Using the gene and its link to phenotype as a starting point, the BIGSdb database, which powers the PubMLST databases, enables the assembly of large open-access collections of annotated genomes that provide insight into the evolution of th
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ticks are obligate hematophagous ectoparasites considered as vectors of animal diseases, having a huge economic impact in cattle industry. Babesia spp. are tick-borne pathogens that cause a disease called babesiosis in a wide range of animals and in humans. Control of tick infestations is mainly based on the use of acaricides, which have limited efficacy reducing tick infestations, mostly due to wrong usage, and is often accompanied by the selection of acaricide-resistant ticks, environmental contamination, and contamination of milk and meat products. Vaccines affecting both vector and pathoge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The budding yeast Saccharomyces cerevisiae represents a well-consolidated and widely used eukaryotic model, with a number of features that make it an ideal organism to carry out functional toxicological studies. Several advantages are permitted by the use of yeast cells, as the possibility to identify molecular biomarkers, unknown mechanisms of action and novel potential targets. Thanks to the evolutionary conservation, yeast can provide also useful clues allowing the prioritization of more complex analyses and toxicity predictions in higher eukaryotes. The last two decades were incredibly fru
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Head and neck cancer (HNC) broadly includes carcinomas arising from the mucosal epithelia of the head and neck region as well as various cell types of salivary glands and the thyroid. As reflected by the multiple sites and histologies of HNC, the molecular characteristics and clinical outcomes of this disease vary widely. In this Review, we focus on established and emerging biomarkers that are most relevant to nasopharyngeal carcinoma and head and neck squamous-cell carcinoma (HNSCC), which includes primary sites in the oral cavity, oropharynx, hypopharynx and larynx. Applications and limitati
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Assisted reproductive technologies have been used to achieve pregnancies since the first successful test tube baby was born in 1978. Inferti … enome instability, but the general mechanism is less clear. Application of the genome theory and 4D-Genomics recently led to the establishment of a new paradigm for sexual reproduction; sex primarily constrains genome integrity that defines the biological system rather than just providing genetic diversity at the gene level. We therefore propose that appli …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Olfaction is essential for the survival of animals. Diverse odor molecules in the environment are detected by the olfactory receptors (ORs) in the olfactory epithelium of the nasal cavity. There are ~400 and ~1,000 OR genes in the human and mouse genomes, respectively, forming the largest multigene family in mammals. The relationships between ORs and odorants are multiple-to-multiple, which allows for discriminating almost unlimited number of different odorants by a combination of ORs. However, the OR-ligand relationships are still largely unknown, and predicting the quality of odor from its m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lyme disease is the most common tick-borne human illness in North America. In order to understand the molecular pathogenesis, natural diversity, population structure and epizootic spread of the North American Lyme agent, Borrelia burgdorferi sensu stricto, a much better understanding of the natural diversity of its genome will be required. Towards this end we present a comparative analysis of the nucleotide sequences of the numerous plasmids of B. burgdorferi isolates B31, N40, JD1 and 297. These strains were chosen because they include the three most commonly studied laboratory strains, and b
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vector-borne diseases, including canine heartworm disease (CHWD), are of major socioeconomic and canine health importance worldwide. Although many studies have provided insights into CHWD, to date there has been limited study of fundamental molecular aspects of Dirofilaria immitis itself, its relationship with the canine host, its vectors, as well as the potential of drug resistance to emerge, using advanced -omic technologies. This article takes a prospective view of the benefits that advanced -omics technologies will have toward understanding D. immitis and CHWD. Tackling key biological ques
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We sought to review evidence linking nuclear factor-kappa B (NF-κB) to ovarian cancer and to identify genetic variants involved in NF-κB signaling.
METHODS: PubMed was reviewed to inform on ovarian cancer biology and NF-κB signaling and to identify key genes. Public linkage disequilibrium (LD) data were analyzed to identify informative inherited variants (tagSNPs) using ldSelect.
RESULTS: We identified 319 key NF-κB genes including five NF-κB subunits, 167 activating genes, and 55 inhibiting genes. We found that the 1000 Genomes Project was the most informative LD source for most
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) is an aggressive tumor with a poor prognosis. Currently, only sorafenib is approved by the FDA for advanced HCC treatment; therefore, there is an urgent need to discover candidate therapeutic drugs for HCC. We hypothesized that if a drug signature could reverse, at least in part, the gene expression signature of HCC, it might have the potential to inhibit HCC-related pathways and thereby treat HCC. To test this hypothesis, we first built an integrative platform, the "Encyclopedia of Hepatocellular Carcinoma genes Online 2", dubbed EHCO2, to systematically collect
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования