Although the multi-copy and specific element IS6110 provides a good target for the detection of Mycobacterium tuberculosis complex by PCR techniques, the emergence of IS6110-negative strains suggested that false negative may occur if IS6110 alone is used as the target for detection. In this report, a multiplex polymerase chain reaction (mPCR) system was developed using primers derived from the insertion sequence IS6110 and an IS-like elements designated as B9 (GenBank accession no. U78639.1) to overcome the problem of detecting negative or low copy IS6110 containing strains of M. tuberculosis.…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neonatal bacterial sepsis is a challenging disease that needs to be detected early. As it is a life-threatening condition, the use of an approach that could be more rapid than standard culture and identification techniques for detection of neonatal sepsis would be highly desirable.
OBJECTIVE: The aim of this work was to assess the effectiveness of the PCR technique compared with blood culture for the early detection of bacterial sepsis.
PARTICIPANTS AND METHODS: This study included 50 neonates with suspected sepsis. A blood sample was collected and divided into two parts: one par
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To determine the value of anterior chamber paracentesis with polymerase chain reaction (PCR) in patients with anterior uveitis.
DESIGN: Retrospective observational case series.
SETTING: Bascom Palmer Eye Institute.
PATIENT POPULATION: Fifty-three patients with a diagnosis of anterior uveitis who underwent anterior chamber paracentesis with PCR.
OBSERVATION PROCEDURES: Anterior chamber paracentesis with PCR of aqueous fluid.
MAIN OUTCOME MEASURE: Diagnostic utility and frequency of management change based on anterior chamber paracentesis and PCR.
RESULTS: There were 15 of 53 (28%…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Yellow fever is considered a re-emerging disease and is endemic in tropical regions of Africa and South America. At present, there are no standardized or commercialized kits available for yellow fever virus detection. Therefore, diagnosis must be made by time-consuming routine techniques, and sometimes, the virus or its proteins are not detected. Furthermore, co-circulation with other flaviviruses, including dengue virus, increases the difficulty of diagnosis.
OBJECTIVE: To develop a specific reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) and nested PCR-based assay to …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We introduced polymerase chain reaction (PCR) testing for Neisseria gonorrhoeae (NG) on the Cobas 4800 CT/NG assay for all samples received with a Chlamdyia trachomatis request in March 2012. From 1 March 2012 to 30 June 2012, all PCR-positive/culture-negative specimens had additional testing at another assay. A total of 40053 tests were performed. The estimated specificity and positive predictive value were 99.9% and 97.1%, respectively; thus routine additional testing is not required.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Onychomycosis is one of the most prevalent dermatophytic diseases. Mycological methods used in the conventional diagnosis may not be optimal. PCR was reported as a reliable alternative in the diagnosis of dermatophytosis.
MATERIALS AND METHODS: A PCR method based on the amplification of the chitin synthase 1 gene was developed. The study included 119 strains of dermatophytes and non dermatophytic fungi, eight dermatophytic reference strains and 201 nail specimens from patients with dermatophytic onyxis. DNA extraction was carried out by using the QIAamp DNA extraction kit (Quiagen
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Culture and quantitative polymerase chain reaction (qPCR) assays for the detection of Legionella were compared on samples from a residential area before and after two interventions. A total of 84 samples were collected from shower hoses and taps as first flush samples and at constant temperature. Samples were grouped according to the origin of the sample, a) circulation water b) water from empty apartments c) water from shower hoses. The aims were to investigate the usefulness of qPCR compared to culture for monitoring remedial actions for elimination of Legionella bacteria and as …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpes zoster ophthalmicus is uncommon in children, and diagnosis may be delayed until the typical skin lesions become apparent. Delay in appropriate treatment may result in sight-threatening complications. We report a case of an 18-month-old child in whom we promptly confirmed the clinical suspicion of herpes zoster ophthalmicus by the identification of viral DNA using polymerase chain reaction. This procedure enabled us to administer prompt antiviral treatment, preventing sight-threatening sequelae. We review the literature regarding the possible mechanism of herpes zoster ophthalmicus in im…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Few studies were conducted on the diagnosis and control of small ruminants' leptospirosis. Thirteen goat herds and seven sheep flocks located in the state of Rio de Janeiro, Brazil, were screened for leptospirosis. From the three herds and three flocks with greatest seroreactivity by MAT (Microscopic Agglutination Test), 19 and 40 seropositive goats and sheep, respectively, were selected, and urine samples were collected for bacteriology and PCR. For both species of animals, the most prevalent reactions were due to serogroups Sejroe and Shermani. Although leptospires were observed by darkfield
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid diagnosis of leptospirosis, through culture and/or serology, can be difficult without proper expertise and is often delayed because of the length of time required to obtain results. In this study, we developed a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay using a TaqMan probe targeting lipL32, which is present only in pathogenic Leptospira spp. Using Leptospira interrogans serovar Icterohaemorrhagiae DNA, the lower limit of detection was found to be 20 genomic equivalents/reaction with a 95% cutoff value. The assay detected pathogenic Leptospira strains, but not intermediately pathog…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To report a case of unilateral varicella zoster virus (VZV) retinal vasculitis aspect in an immunocompetent child without systemic infection. Clinically, no signs of retinal necrosis or frosted branch vasculitis were present. This is an observational case report. Quantitative PCR was performed on the aqueous humor (AH) using primers specific for herpes virus (cytomegalovirus, Epstein-Barr virus, herpes simplex virus 1-2, and VZV). The patient was treated with intravenous acyclovir, intravitreous ganciclovir, and oral valacyclovir. A positive quantitative PCR result was found for VZV DNA (1.72
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although some clues exist about the causative relationship of fungi and chronic rhinosinusitis, the relationship of nasal polyps … were compared with 18 cases of concha bullosa based on direct microscopy, fungal culture, serology, polymerase chain reaction (PCR), and sequencing.
RESULTS: Fungal colonization was detected in 15 (50.0%) of the cases with massive NP, but only in 2 (11.1%) of the cases with concha bullosa. A significant difference was found between the study and the control groups in term …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop quantitative PCR (qPCR) assays with allele-specific primers to provide a rapid and accurate diagnostic and screening test for the 3 mutations identified as causes of gangliosidoses in domestic cats.
SAMPLE POPULATION: DNA samples obtained from archived feline blood samples submitted for GM1 and GM2 testing.
PROCEDURES: A qPCR assay was developed for each mutation to monitor the efficiency of PCR amplification. Results were determined on the basis of the fluorescent intensity of DNA staining.
RESULTS: Samples from 60 cats were screened by use of the 3 qPCR assays. Of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Parvovirus B19 (B19V) DNA screening has been introduced to comply with European regulations for certain plasma pr … s were screened for B19V DNA loads exceeding 10(6) IU/ml using the Roche and the in-house real-time polymerase chain reaction assay.
RESULTS: A total of 232 plasma units were identified with B19V DNA loads above 10(6) IU/ml. Concordant results were observed for the majority of B19V positive samples; however, three of these showed discrepant results between the two assay s …
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The impact of sexually transmitted diseases (STDs) on the development of cervical intraepithelial neoplasia (CIN) has been increasingly recognized over the last 25 years. The role of bacterial vaginosis (BV) is the focus of several current investigations, not only in the genesis of CIN but also in the development of other gynecological and obstetric complications. Out of 150 women with vaginitis, 46 were diagnosed as T. vaginalis infection by different methods: wet mount, In-Pouch TV culture and PCR. Pap smear showed that 10 smears had atypical squamous cells of undetermined significance (ASCU
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We here report the case of a previously healthy 20-y-old male with disseminated meningococcal disease and purulent pericarditis. Polymerase chain reaction was used to identify Neisseria meningitidis serogroup C as the causative agent in the pericardial fluid.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A multiplex polymerase chain reaction (PCR) was developed for diagnosing leptospirosis and differentiating pathogenic and saprophytic leptospires. Specific primers were designed to amplify 23S rDNA from pathogenic Leptospira and saprophytic Leptospira spp. PCR products from 27 pathogenic and 5 (including 1 intermediate) saprophytic serovars were 615 and 316 base pairs (bp), respectively. After the restriction enzyme's digestion of PCR products, the fragments by SacI of pathogenic serovars and by PstI of saprophytic serovars were 339 and 276 bp and 202 and 114 bp, respectively. The PCR primers …
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования