To produce albinism in the marine medaka Oryzias melastigma, we disrupted the solute carrier family 45 (SLC45a2) gene by clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 with a single guide RNA (sgRNA). Selected sgRNAs were able to target a SLC45a2 gene as confirmed by genotyping and heteroduplex mobility assay (HMA). Of the survived embryos after injection, 54.2% and 60.0% embryos exhibited albinism phenotype by sgRNA1 and sgRNA2, respectively. Deep sequencing at the on-target sites showed different insertion and deletion (indel) mutation profiles near the DNA cleavage
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic sclerosis (SSc; scleroderma) is a multisystem fibrotic disease. The mammalian cleavage factor I 25-kD subunit (CFIm25; encoded by NUDT21) is a key regulator of alternative polyadenylation, and its depletion causes predominantly 3'UTR shortening through loss of stimulation of distal polyadenylation sites. A shortened 3'UTR will often lack microRNA target sites, resulting in increased mRNA translation due to evasion of microRNA-mediated repression. Herein, we report that CFlm25 is downregulated in SSc skin, primary dermal fibroblasts, and two murine models of dermal fibrosis. Knockdown
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alphaviruses such as Chikungunya and Ross River (RRV) viruses are associated with persistent arthritis and arthralgia in humans. Monocytes and macrophages are believed to play an important role in alphaviral arthritides. In this study, we evaluated RRV permissiveness of the human acute leukemia MM6 cell line. Viral growth analysis showed that RRV infection of MM6 cells resulted in a very low virus progeny production with daily output. Using recombinant RRV expressing the reporter gene Renilla luciferase, a weak viral replication level was detected in infected cells at the early stages of infec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular detection of transmission of rapidly mutating pathogens such as hepatitis C virus (HCV) is commonly achieved by assessing the genetic relatedness of strains among infected patients. We describe the development of a novel mass spectrometry (MS)-based approach to identify HCV transmission. MS was used to detect products of base-specific cleavage of RNA molecules obtained from HCV polymerase chain reaction fragments. The MS-peak profiles were found to reflect variation in the HCV genomic sequence and the intrahost composition of the HCV population. Serum specimens originating from 6
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative cleavage and polyadenylation (APA) generates diverse mRNA isoforms. We developed 3' region extraction and deep sequencing (3'READS) to address mispriming issues that commonly plague poly(A) site (pA) identification, and we used the method to comprehensively map pAs in the mouse genome. Thorough annotation of gene 3' ends revealed over 5,000 previously overlooked pAs (∼8% of total) flanked by A-rich sequences, underscoring the necessity of using an accurate tool for pA mapping. About 79% of mRNA genes and 66% of long noncoding RNA genes undergo APA, but these two gene types have dis
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MAPREC test (mutant analysis by polymerase chain reaction and restriction enzyme cleavage), evaluating the content of neurovirulent mutants with nucleotide substitution of U for C in position 472 in the 5'-nontranslated RNA region, in a virus population was used for a retrospective analysis of 3 specimens of inoculated viruses and 55 lots of type 3 oral poliovirus vaccine (OPV) prepared at M. P. Chumakov Institute of Poliomyelitis, Russian Academy of Medical Sciences, during recent 6 years. The mean content of neurovirulent mutants in inoculated viruses was 0.26 +/- 0.06%, in monovaccines 0.34
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA interference (RNAi) pathway regulates gene expression and viral defense and has been harnessed in therapeutic solutions to inhibit otherwise undruggable proteins by preventing translation. Dicer initiates RNAi by generating cleaved RNA products that bind to a target mRNA to promote gene silencing. Mutations to the Dicer catalytic domain cause DICER1 syndrome, which increases the risk of cancers, including early childhood variants. However, the catalytic mechanism remains poorly defined due to the lack of structural data for Dicer bound to a substrate (or substrate mimic) in the presenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is an aggressive malignancy with limited therapeutic options. Therefore, novel treatment strategies are urgently needed.
PURPOSE: This study aimed to evaluate the antitumor effects of Gaudichaudione H (GH), a natural caged xanthone isolated from Garcinia oligantha Merr., and to elucidate its underlying mechanisms with a focus on cell death regulation in ESCC.
METHODS: The antitumor activity of GH was evaluated in ESCC cell lines (KYSE150, KYSE450, Eca-109) and a xenograft mouse model. Cell viability, LDH release, morphological changes, an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate estrogen receptor gene 1 (ESR1) and estrogen-driven transcription in human endometrial stromal cells.
DESIGN: RNA sequencing (RNA-seq) and Cleavage Under Targets and Release Using Nuclease (Cut&Run) were performed on telomerase-immortalized human endometrial stromal cells with Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats-mediated ESR1 activation. Hi-C-based chromatin architecture analysis (H3K27ac HiChIP) was conducted in primary endometrial stromal cells.
SUBJECTS: Biopsies from two healthy, reproductive-aged volunteers with regular menstrual cycles an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bladder cancer (BLCA) is a common malignancy characterized by dysregulated transcription and a lack of effective therapeutic targets. In this study, we aimed to identify and evaluate novel targets with clinical potential essential for tumor growth in BLCA.
METHODS: CRISPR-Cas9 screening was used to identify transcription factors essential for bladder cancer cell viability. The biological functions of KLF16 in bladder cancer were investigated both in vitro and in vivo. The regulatory mechanism between KLF16 and MYC was elucidated through a series of analyses, including RNA sequenci
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Legionella pneumophila is an environmental bacterium that parasitizes protozoa, but it may also infect humans, thereby causing a severe pneumonia called Legionnaires' disease. To cycle between the environment and a eukaryotic host, L. pneumophila is regulating the expression of virulence factors in a life cycle-dependent manner: replicating bacteria do not express virulence factors, whereas transmissive bacteria are highly motile and infective. Here we show that Hfq is an important regulator in this network. Hfq is highly expressed in transmissive bacteria but is expressed at very
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Monosodium glutamate (MSG) is a food ingredient that is increasingly used commercially. MSG leads to oxidative stress, consequently suppressing steroid hormone production that causes defects in male reproductive system. This study aimed to evaluate the effect of L-carnitine as an antioxidant on testicular damage in MSG-induced male rats.
METHODS: Sixty adult male Spargue-Dawley rats were randomly divided into six groups of ten as follows: control (water), sham (normal saline), L-carnitine (200 mg/kg b.w), MSG (3 g/kg b.w), MSG + L-carnitine 100 (3 g/kg b.w of MSG and 100 mg/kg b.w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The CYP11A1 gene encodes the cytochrome P450 side-chain cleavage enzyme, which is essential for steroid formation. Recessive variants in this gene can lead to impairment of sexual differentiation caused by a complete or partial loss of steroid hormone production. The phenotypic spectrum in affected 46XY males may vary from surgically repairable defects including cryptorchidism and hypospadias to complete feminization of external gonads, accompanied by symptoms of adrenal dysfunction.
METHODS: Whole-exome sequencing (WES) of a 12-year-old male proband and his parents was performed
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of the present study was to examine the effects of progestins on progesterone synthesis and expression of the cytochrome P450 cholesterol side-chain cleavage gene (P450(scc)) in a stable porcine granulosa cell line, the JC-410. Cells were incubated for 48 h with the synthetic progestogen-levornorgestrel with or without RU486 (progesterone and glucocorticoid receptor antagonist) or RWJ26819 (progesterone agonist without affinity to glucocorticoid receptors). Both levonorgestrel and RU486 enhanced progesterone accumulation in a dose-dependent manner. RU486 did not antagonize the effe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Twenty-four-day old female rats were injected with 25 microg recombinant leptin twice daily for 24, 48, 72, or 93 h. Periovarian fat contained significantly greater amounts of aromatase mRNA at 72 and 93 h and estradiol at 72 h after leptin treatment as compared to the ovary. On the other hand, there was an increase in testosterone at 72 h and progesterone at 72 and 93 h after leptin in the ovary as compared to periovarian fat. Cholesterol side chain cleavage and 17alpha-hydroxylase mRNA were found only in the ovary and not periovarian fat. Thus, periovarian fat has a greater capacity to synth
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phages have evolved various anti-CRISPR (Acr) proteins or RNA-based anti-CRISPR (Racr) to evade host CRISPR immunity by direct interference. However, whether other counter-CRISPR mechanisms exist remains unexplored. Here, we report a phage-encoded two-protein system, termed Healer, which neutralizes CRISPR immunity via a post-cleavage DNA repair mechanism. This phage replication-associated system comprises two proteins: Gp63 (a DUF669 domain-containing protein), and Gp64 (an AAA domain-containing protein). Mechanistic investigations elucidate that Gp63 acts as a rapid-response effector of CRIS
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Constructing target-gene mutants with a common genetic background is crucial for elucidating gene function in antimicrobial resistance (AMR) research. Taking advantage of the single-guide RNA (sgRNA) and protospacer adjacent motif (PAM) sequence (3'-NGG) specificity of the Cas9 protein in the CRISPR/Cas9 (Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9) system and codon degeneracy, the authors design a repair template that incorporates the desired point mutation while excluding the PAM sequence disrupted by a synonymous substitution, thereby preventing re-
СтатьяVideo-Audio MediaПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Storing magnetic resonance imaging (MRI) and positron emission tomography (PET) imaging data in DNA offers a promising solution for the long-term archival management of rapidly expanding biomedical image volumes. However, querying these data typically requires polymerase chain reaction and sequencing, which increases readout complexity and retrieval latency. Here, we propose a CRISPR-Cas12a-based querying strategy that leverages the programmability of CRISPR RNA (crRNA) for precise matching with identifier (ID) sequences. In this approach, crRNA functions as a query tool that identifies matchi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-associated transposons (CASTs) are Tn7-like elements that have co-opted RNA-guided CRISPR effectors for targeted DNA insertion. CASTs have been adapted as genome editing tools for programmable, site-specific integration. Among them, the type I-F system from Pseudoalteromonas (PseCAST) shows exceptionally robust activity in human cells, yet its mechanistic basis remains poorly understood. Here, we present structural and biochemical analysis of the PseCAST transposase TnsAB. Biochemical reconstitution of transposon DNA excision defines key characteristics of the transposition mechanism. C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Processivity is essential for gene expression: Escherichia coli RNA polymerase (RNAP) must transcribe 10+ kbp operons without failure, yet backtrack-induced long-lived pauses threaten premature termination. Gre factors stimulate transcript cleavage to rescue backtracked RNAP, whereas NusA and NusG, which bridge the expressome, respectively stimulate and suppress pausing. How they cooperate to secure full-length transcription is unclear. Using high-throughput magnetic tweezers, we reconstitute ops-induced pausing, showing that sequence context sets pause occupancy. RfaH, a NusG paralog recruite
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования