BACKGROUND: The emergence of acquired resistance to epidermal growth factor receptor (EGFR) tyrosine kinase inhibitors (TKIs) presents a sig … and transwell invasion assays. Mechanistic insights were gained through integrated RNA sequencing (RNA-seq), immunofluorescence, and lipid peroxidation assays using BODIPY 581/591 C11.
RESULTS: We identified the transcription factor TP63 as a master regulator of adaptive resistance, showing marked upregulation in resistant cells. Although TP63 depletion …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitogen-activated protein kinases (MAPKs) play pivotal roles in response to low-temperature stress, but their functional characterization un … s, whereas VaMAPK9-RNAi lines manifested inverse phenotypic and biochemical trends. RNA sequencing (RNA-seq) analysis revealed that VaMAPK9 could enhance cold tolerance through the regulation of metabolic pathways, flavonoid biosynthesis, and phytohormone signaling transduction networks. Additionally, yeast two-hybrid (Y2H) and luciferase complementation …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Esophageal adenocarcinoma (AC) incidence has increased markedly in the United States and other Western countries over recent decades. Gastro-esophageal reflux disease (GERD) can cause Barrett's esophagus, which is strongly associated with the development of AC. However, the mechanisms underlying the pathogenesis of AC remain poorly elucidated. In this exploratory pilot study, we performed transcriptomic profiling by RNA sequencing (RNA-seq) on six normal esophagus (WT), four Barrett's esophagus with low-grade dysplasia (BL), and six esophageal adenocarcinoma (AC) samples using RNA extracted vi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Persistent epithelial alterations such as delayed wound healing are a key feature of diabetic corneal disease. Previously, we reported that epigenetic changes in the diabetic cornea led to the suppression of Wnt-5a, and that addition of Wnt-5a accelerated wound healing. In this study, we set to determine which Wnt receptor(s) mediated Wnt-5a induced stimulation of diabetic corneal epithelial wound healing.
METHODS: Human limbal epithelial cells (LECs) were isolated from postmortem diabetic and non-diabetic donor eyes for single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and DNA methylation anal…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Cardiac shockwave therapy (SWT) improves left ventricular (LV) function in patients with ischaemic cardiomyopathy. Shockwave therapy a … nary occlusion. Furthermore, SWT reduced myocardial scar size and improved LV function. Single-cell RNA-seq and RNA trajectory analyses revealed that SWT induced an endothelial fibroblast cluster and mechanical stimulation induced significant changes in chromatin organization, with chromatin being more accessible after both treatments in 1705 genomic regi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To study the therapeutic effect of hemagglutinin-2 and fimbrial (HA2-FimA) vaccine on experimental periodontitis in rats.
MATERIALS AND METHODS: The first batch of rats was divided into two groups and immunised with pure water or pVAX1-HA2-FimA at the age of 6, 7, and 9 weeks. After sacrificing the animals, total RNA was extracted from the spleens for RNA high-throughput sequencing (RNA-Seq) analysis. The second batch of rats was divided into four groups (A, B, C, D), and an experimental periodontitis rat model was established by suturing silk thread around the maxillary second molar…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Astrocytes are in constant communication with neurons during the establishment and maturation of functional networks in the developing brain … c markers, displayed intracellular calcium transients and secreted ADEVs. miRNAs were identified by RNA-Seq on astrocytes and ADEVs and target gene pathway analysis detected brain and immune related terms. The miRNA profile was consistent with astrocyte identity, and included approximately 80 miRNAs found in astrocytes that were relatively depleted in ADE …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: We aimed to explore the relationship between the serum Soluble Scavenger with 5 Domains (SSC5D) levels and heart failure (HF). M … eted proteins profile, 1,755 secreted proteins were investigated using human dilated cardiomyopathy RNA-seq data, and the results indicated that SSC5D levels were significantly elevated in failing hearts compared to the non-failing. Using single-cell RNA sequencing data, we demonstrated that Ssc5d is predominantly expressed in cardiac fibroblasts. In a mu …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Group B Streptococcus (GBS; S. agalactiae) causes chorioamnionitis, neonatal sepsis, and can also cause disease in healthy or immunocompromi … h generation of several isogenic variants with specific functional defects. We compare whole-genome RNA-seq from Δcas9 GBS with a full-length Cas9 gene deletion; dcas9 defective in its ability to cleave DNA but still able to bind to frequently occurring protospacer adjacent motifs; and scas9 that retains its catalytic domains but is unable to bind protosp …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parvoviruses are single-stranded DNA viruses, infecting many animals from insects to humans. Human parvovirus B19 (B19V) causes erythema inf … endothelial cells. Viral messenger RNA transcription remained, however, undetected. RNA sequencing (RNA-seq) identified 272 differentially expressed cellular genes between B19V DNA-positive and -negative healthy ileum biopsy specimens. Pathway enrichment analysis revealed that B19V persistence activated the intestinal cell viability and inhibited apoptosi …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates resistance mechanisms in a paraquat (PQ)-resistant Eleusine indica population. The resistant population exhibited 27 … recovered in the resistant population, which also displayed higher glutathione peroxidase activity. RNA-seq analysis further revealed that two vacuolar transport-related genes, VPS26A and VPS32.2, were overexpressed in resistant plants regardless of PQ treatment. Importantly, transgenic rice seedlings overexpressing these genes exhibited resistance to the …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colon cancer progression is associated with transcriptional and signaling abnormalities. MZF1, linked to leukemogenesis, has an unclear role in colon cancer. This study examined its function in colon tumorigenesis and signaling-targeted therapies. Multi-omics (RNA-seq, CUT&Tag) identified MZF1 targets, validated in vitro/in vivo using xenografts and epithelial-specific MZF1 knockout mice. Virtual screening found MZF1 inhibitors. MZF1 activated SnoN transcription, suppressing TGF-β/SMAD signaling. Overexpression enhanced proliferation and colony formation; knockdown reversed these. In vivo, MZF…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanisms underlying renal cell carcinoma (RCC) progression remain incompletely understood. Here, we identify phytanoyl-CoA dioxygenase … 1, alters its association with ribosomes, and restrains protein translation. Ribosome profiling and RNA-seq identify ceramide transporter 1 (CERT1) as a key effector of the PHYHD1-eEF1A1 axis. PHYHD1 depletion enhances CERT1 translation, whereas targeting CERT1 impairs proliferation of PHYHD1-deficient cells. These findings define a PHYHD1-eEF1A1-CERT1 ax …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative splicing (AS) shapes tumor biology by generating mRNA isoforms that regulate oncogenic signaling, immune modulation, and therapeutic response. However, its immune-related role in breast cancer (BRCA) remains insufficiently defined. Using TCGA-BRCA RNA-seq and clinical data, we quantified percent-spliced-in values with SpliceSeq and identified 1,063 differentially expressed AS events across 861 genes. These genes were enriched in cancer- and immune-related pathways, including focal adhesion, VEGF signaling, and cytokine-receptor interactions. Prognostic analyses revealed immune-asso…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stachyose is a commonly utilized natural additive due to its profound metabolism-improving properties, but the molecular mechanisms underlying its metabolism-regulatory activities remain largely unknown. This study reveals that oral supplementation with stachyose reverses overnutrition-induced insulin resistance, hyperglycemia and dyslipidemia, which is accompanied by ameliorated adipose tissue remodeling and alleviated liver steatosis. RNA-seq and immunoblot analysis indicate that stachyose restores AKT phosphorylation in peripheral metabolic organs. The mechanistic study indicates that stach…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunoglobulin A (IgA) nephropathy (IgAN) is a major cause of end-stage renal disease with limited therapies. Altered lipid metabolism is implicated in chronic kidney disease, but its role in IgAN is unclear. Plasma oxylipin profiling and renal single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) revealed reduced epoxyeicosatrienoic acids (EETs) and increased soluble epoxide hydrolase (sEH) in IgAN. Two sEH inhibitors, t-AUCB and macamide, reduced proteinuria, improved renal function, attenuated IgA deposition, and restored EET levels. Mechanistically, sEH overexpression activated NF-κB (p65 phosphorylation…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Computational biology often turns biological measurements into fitted models, embeddings, or summaries and then compares them with a distanc … information geometry helps explain when common transformations, such as variance stabilization for RNA-seq, approximate a model-implied distance; when dependence or latent nuisance structure limits that approximation; and when misspecification makes empirical, nonparametric, or sensitivity-based comparisons more appropriate. The goal is a clearer, more e …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This multicenter, prospective, randomized controlled trial (NCT03285152) evaluates the primary endpoint of feasibility of a very-low carbohy … ow-density lipoprotein (LDL) rise 6 ± 2.7% and 17.8 ± 8.9%. In a pre-specified exploratory outcome, RNA-Seq shows enrichment of CD8 + T-cells (q < 0.034; NES > 1.75), confirmed by immunohistochemistry (IHC) showing CD8 + T-cells infiltration of the tumor margins (q = 0.034; NES = 1.75). We conclude that VLCD is feasible and well-tolerated.
СтатьяРандомизированное исследованиеМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: This review article summarizes progress made using transcriptomics, in particular RNA-seq studies such as bulk, single cell (sc) and spatial sequencing results, in the study of bone and cartilage in the context of osteoarthritis (OA) and osteoporosis (OP) over the past two years.
RECENT FINDINGS: Recent advances in OA and OP research using advanced transcriptomics technologies have been crucial in the identification of cellular and molecular patterns of disease, facilitating a deeper knowledge of disease endotypes, mechanisms, and putative therapeutic targets. Increased use…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vagus nerve is a central component of the parasympathetic nervous system, innervating multiple abdominal organs to monitor and regulate their function. Vagal sensory neuron cell bodies reside in the nodose ganglia, but their molecular diversity and spatial organization remain incompletely defined. Here, we generated and integrated single-nucleus RNA sequencing (snRNA-seq) data with multiple published datasets to construct a unified atlas of 106,436 cells and combined this with spatial transcriptomics to create a single-cell and spatial map of the mouse nodose ganglion (NodoMap). We identif…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования