Klebsiella pneumoniae resides in the gastrointestinal (GI) microbiota of humans and animals. To characterize the population dynamics of GI-colonizing K. pneumoniae, we examined the clonality of K. pneumoniae isolates, which were longitudinally collected from the fecal samplings of a healthy married couple and their pet animals during Sep. 2015 to Oct. 2016. As revealed by XbaI-PFGE analysis, the K. pneumoniae populations detected in the male owner and in one of the dogs, consisted of clonally diverse K. pneumoniae isolates; whereas, a dominant clone persisted in the GI tract of the female owne
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Clinical mass spectrometry requires a simple step process for sample preparation. This study aims to optimize the method for isolating periplasmic protein from Gram-negative bacteria and apply to clinical mass spectrometry.
EXPERIMENTAL DESIGN: The Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing E. coli standard cells were used for optimizing the osmotic shock (OS) lysis method. The supernatant from OS lysis was analysed by LC-MS/MS and MALDI-TOF MS. The effectiveness of the OS lysis method for KPC-2-producing Enterobacteriaceae clinical isolates were then confirmed by MALDI-TOF
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To characterize the antibiotic resistance and virulence in a carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP). Methods: A CRKP (designated K. pneumoniae C35) was isolated from a stool sample. The minimal inhibitory concentrations of antimicrobial agents were determined using the broth microdilution method. Whole-genome sequencing and genome analysis were performed to identify the antibiotic resistance and virulence genes. The genetic relationship among K. pneumoniae C35 and other CRKP isolates from our hospital was analyzed by single nucleotide polymorphism (SNP) typing of core gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The aim of this study was to monitor the development of drug-resistant bacteria isolated from acute uncomplicated cystitis (AUC) and to evaluate methodology of the survey conducted by collecting only clinical data.
METHODS: We enrolled female patients at least 16 years of age diagnosed with AUC in 2018. Patient information including age, menopausal status, and results of bacteriological examination were collected and analyzed regardless of bacterial identification, antimicrobial susceptibility testing or extended-spectrum β-lactamase (ESBL) detection method.
RESULTS: A total of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TEM-1 β-lactamase degrades β-lactam antibiotics with a strong preference for penicillins. Sequence reconstruction studies indicate that it evolved from ancestral enzymes that degraded a variety of β-lactam antibiotics with moderate efficiency. This generalist to specialist conversion involved more than 100 mutational changes, but conserved fold and catalytic residues, suggesting a role for dynamics in enzyme evolution. Here, we develop a conformational dynamics computational approach to rationally mold a protein flexibility profile on the basis of a hinge-shift mechanism. By deliberately weigh
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence and spread of carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) are perceived as a serious public-health threat world-wide. Despite sporadic reports, no systemic study has been carried out on CRE in companion animals in Indian subcontinent. In total, 237 canine specimens collected from five veterinary polyclinics in and around Kolkata were analyzed for isolation, antimicrobial resistance profiling and molecular characterization of carbapenem-resistant (CR) E. coli. Of the 29 CR isolates, 19 were identified as metallo-β-lactamase producers (MP-CRE) and 10 as metallo-β-lactamase non-pr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria that cause life-threatening illnesses in humans are also capable of contaminating hospital surfaces, thus pose as a potential source of infection. This study aimed to investigate the prevalence, genetic diversity, virulence, and antibiotic resistance profile of Klebsiella pneumoniae in South Africa. In a nonoutbreak setting involving four public hospitals, 777 samples were collected in three different wards from 11 different sites. Phenotypic and genotypic methods were used for isolation and identification. The Kirby-Bauer disk-diffusion method was used to examine antibiotic resistanc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-resistant organisms (CRO) are a major global public health threat. Enterobacterales hydrolyze almost all β-lactams through carbapenemase production. Infections caused by CRO are challenging to treat due to the limited number of antimicrobial options. This leads to significant morbidity and mortality. Over the last few years, several new antibiotics effective against CRO have been approved. Some of them (e.g., plazomicin or imipenem-cilastatin-relebactam) are currently approved for use only by adults; others (e.g., ceftazidime-avibactam) have recently been approved for use by childre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli sequence type (ST) 131 is considered a high-risk pandemic clone and frequently extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing clone that is strongly associated with the global dissemination of CTX-M-15 type. The emergence of ST131 has become a public health threat because this clonal group typically exhibits multiple virulence factors and antimicrobial resistance. Therefore, this study aimed to analyze the literature published on the estimation of the prevalence of clone ST131 among E. coli strains isolated from patients with urinary tract infections in western Asia. A systema
СтатьяМетаанализСистематический обзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the growing threat of antimicrobial resistance worldwide, uncovering the molecular epidemiology is critical for understanding what is driving this crisis. We aimed to evaluate the prevalence of plasmid-mediated-quinolone-resistance (PMQR) and extended-spectrum beta-lactamase- (ESBL) producing gram-negative organisms among primigravid women with bacteriuria. We collected urine specimens from primigravid women attending their first antenatal visit at Gandhi Hospital during October 1, 2015 to September 30, 2016. We determined antimicrobial susceptibility and ESBL and quinolone resistance usi
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Typically, raw meat can be contaminated with antibiotic resistant pathogens at unhygienic slaughter and sale points. Consumption of meat contaminated with antibiotic resistant E. coli is associated with grave health care consequences. The aim of this study was to determine the microbial quality of raw meat, the antimicrobial susceptibility and Extended Spectrum Beta Lactamase (ESBL) production in E. coli isolates from raw meat.
RESULTS: Total Plate Counts exceeded the acceptable limit of 5.0 log CFU/ cm2 in 60.5% (124/205) of raw meat samples. Total Coliform Counts in 70.7% (145/2
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate antimicrobial resistance (AMR) characteristics of Escherichia coli isolates from pig origin (including pigs, pig carcass, and pork) and humans in Thailand and Lao People's Democratic Republic (PDR) border provinces. The majority of the E. coli isolates from Thailand (69.7%) and Lao PDR (63.3%) exhibited multidrug resistance. Class 1 integrons with resistance gene cassettes were common (n = 43), of which the most predominant resistance gene cassette was aadA1. The percentage of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producers was 3.4 in Thailand and 3.2 in Lao P
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serratia fonticola is a human pathogen widely found in the environment, with birds being reported as possible natural hosts. During an epidemiological and genomic surveillance study conducted to monitor the occurrence of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacterales in South American wild birds, we identified an ESBL-positive S. fonticola in a fecal sample collected from a Hudsonian Whimbrel, during its non-breeding range on the Pacific Coast of Chile. Whole genome sequencing analysis and "in silico" modeling revealed a novel variant of the class A ESBLs FONA family, designat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Urinary tract infections (UTIs) are commonly encountered. They are more commonly caused by Enterobacteriaceae, while antimicrobial resistance is an emerging problem in their management, with extended-spectrum-β-lactamase (ESBL) producing Gram-negative bacteria and multidrug-resistant (MDR) Pseudomonas aeruginosa being increasingly common. The purpose of this study was to investigate the epidemiology and outcomes of UTIs in patients admitted in a tertiary hospital, which mostly admits geriatric patients, and compare the effects of antimicrobial resistance on patient outcomes.
METHODS: A
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive infections caused by carbapenemase-producing bacteria are associated with excess mortality. We applied a rapid diagnostic test (RDT) on clinical samples with an elevated likelihood of carbapenemase-producing bacteria and documented its impact on antibiotic treatment decisions. Among 38 patients, twelve tested positive for infections caused by carbapenemase-producing bacteria (31.6%), mainly in blood cultures. KPC (n = 10) was more frequent than OXA-48 (n = 2). RDT-based carbapenemase detection led to a treatment modification to ceftazidime/avibactam-containing regimens in all patients
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The resistance to all aminoglycosides (AGs) conferred by 16S rRNA methyltransferase enzymes (16S-RMTases) is a major public health concern.
OBJECTIVES: To characterize the resistance genotype, its genetic environment and plasmid support, and the phylogenetic relatedness of 16S-RMTase-producing Escherichia coli from France.
METHODS: We screened 137 E. coli isolates resistant to all clinically relevant AGs from nine Parisian hospitals for 16S-RMTases. WGS was performed on clinical isolates with high-level AG resistance (MIC ≥256 mg/L) and their transformants.
RESULTS: Thirty of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the dissemination and characteristics of blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like , blaIMP, and blaVIM among the carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) strains isolated from adult and children patients. A total of 935 non-duplicate CRE strains were collected from 36 hospitals in 24 provinces or cities across China from 2016 to 2018. Antimicrobial susceptibility testing was performed by broth microdilution method and carbapenemase genes blaKPC, blaNDM, blaOXA-48-like , blaIMP, and blaVIM were screened by PCR and confirmed by DNA sequencing. Overall, carbapenemases w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duck/fish polyculture farming is a typical farming model in the Pearl River delta in southern China. We examined soil, water, and sediment samples from three duck-fish farms in Guangdong Province in September and December 2014. We determined the abundance of three metal resistance genes, 16S rDNA, and 23 antibiotic resistance genes encoding resistance to tetracycline, sulfonamides, quinolones, chloramphenicol, and β-lactamases. Microbial community structure was quantified by Illumina high-throughput sequencing of 16S rDNA genes. We found a prevalence of antibiotic resistance genes and the sul1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Extended-spectrum β-lactamase/AmpC β-lactamase-producing Escherichia coli (ESBL/AmpC-E. coli) are common in developing countries and travellers represent potential reservoirs for their dissemination. The aim of this study was to quantify cefotaxime (CTX)-resistant E. coli harboured by travellers to Vietnam and to conduct a follow-up study.
METHODS: In total, 19 travellers and 34 travel events were investigated. After confirming that travellers were not colonised with CTX-resistant E. coli before travel, 15 travellers and 20 travel events were studied to quantify travellers harbour
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The spread and outbreak of Enterobacteriaceae producing OXA-48-like carbapenemases have become more and more prevalent in China.
RESULTS: A total of 62 non-duplicated OXA-232-producing K. pneumoniae (OXA232Kp) were isolated between 2015 and 2017. An outbreak of OXA232Kp was observed in burn ICU. The 62 OXA232Kp isolates were all belongs to ST15 and categorized into two PFGE types (A and B). Type A was dominated of the isolates, which contained 61 clinical isolates and divided into 10 subtypes (A1-A10). In addition, most of OXA232Kp strains exhibited low-level carbapenems resistanc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования