A Multiplex PCR assay for the detection of Porphyromonas gingivalis and Streptococcus intermedius in chronic periodontitis is presented. A total of 180 samples from 65 adults with untreated periodontitis and 17 healthy volunteers were taken and processed in a simple boiling step. Cell lysates were used as DNA source for multiplex PCR assays. Primers were designed from 16S rRNA gene sequences from the GenBank-EMBL database showing specificity for target pathogens. This multiplex PCR system could detect 8.2 P gingivalis and S. intermedius cells. In untreated periodontitis patients, only 78.5% we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Taeniasis has been known as one of the prevalent parasitic infections in Korea. Until recently, Taenia saginata had long been considered a dominant, and widely distributed species but epidemiological profiles of human Taenia species in Korea still remain unclear. In order to better understand distribution patterns of human Taenia tapeworms in Korea, partial nucleotide sequences of mitochondrial cox1 and ITS2 (internal transcribed spacer 2) were determined, along with morphological examinations, on 68 Taenia specimens obtained from university museum collections deposited since 1935. Genomic DNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epidemiology and ecology of Lyme disease is very complex, and its reported geographical distribution is constantly increasing. Furthermore, the involvement of birds in long distance dispersal and their role as reservoir hosts is now well established. In this study, we have shown that sea birds in the Arctic region of Norway carry Ixodes uriae ticks infected with Lyme disease Borrelia garinii spirochetes. Interestingly, DNA sequencing showed that these isolates are closely related to B. garinii previously isolated from birds, as well as from clinical specimens in northern Europe.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gordonia species are emerging pathogens that are often misidentified as Rhodococcus or Nocardia species but are reliably distinguished by 16S ribosomal RNA gene sequencing. We present a case series of 6 episodes of catheter-associated infection caused by Gordonia species in 5 patients seen at a tertiary care pediatric hospital and describe the management and outcomes of this infection in adults and children.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Appropriate, rapid and reliable laboratory tests are essential for the diagnosis and optimal antibiotic therapy of acute bacterial meningitis. Broad-range bacterial PCR, combined with DNA sequencing, was compared with culture-based methods for examining cerebrospinal fluid (CSF) samples from patients with suspected meningitis. In total, 345 CSF specimens from 345 patients were analysed, with acute community-acquired bacterial meningitis being diagnosed in 74 patients. The CSF of 25 patients was positive by both PCR and culture; 26 patients had CSF specimens positive by PCR only, and 14 patient
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Babesia gibsoni was first recognized in India in 1910. Analysis of 18S rRNA has shown that there are at least three distinct isolates that are morphologically identical. Although organisms similar to B. gibsoni have been identified in peripheral blood smears from one dog in Brazil, this isolate has not been molecularly characterized. Accordingly, we obtained blood samples from 16 dogs with intraerythrocytic inclusion bodies. DNA was extracted and amplified with primers that detect a segment of the 18S rRNA gene of the Babesia genus. Amplicons of the expected size for B. gibsoni were observed i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated whether host-seeking nymphs and adults of the western blacklegged tick, Ixodes pacificus Cooley & Kohls, the primary vector of Lyme disease spirochetes in far-western North America, are infected naturally with relapsing-fever group spirochetes in Mendocino County, California. Relapsing-fever group borreliae were detected in four (1.7%) of 234 nymphal and two (0.7%) of 282 adult host-seeking I. pacificus ticks by polymerase chain reaction and sequence analysis of the 16S rRNA and flagellin genes, respectively, exhibiting 99 and 98.5% sequence homology to Borrelia miyamotoi Fukun
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The authors treated a patient for what appears to be the first reported occurrence of acute peritonitis and salpingitis associated with streptococcal toxic shock syndrome (STSS). This was caused by Lancefield group G alpha-haemolytic Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis TKCH2004-001. The isolate showed M protein type stc36 and carried the spegg gene. To the best of the authors' knowledge, the present report represents the first case of STSS complicating acute peritonitis and salpingitis caused by Lancefield group G alpha-haemolytic S. dysgalactiae subsp. equisimilis.
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We recently reported the occurrence of natural infection with H. pylori in a group of cynomolgus monkeys with chronic active gastritis and gastric erosions. The goal of the present study was to characterize and to compare strains isolated from animals originating from two different geographical areas. Gross and microscopic pathology determined at the time of necropsy was similar in all animals. H. pylori were isolated from specimens harvested in five monkeys (four from Vietnam and one from the Philippines) with gastritis. Isolates from monkeys bred in Vietnam had a similar DNA fingerprint patt
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Species status of the already described methylotrophic bacteria has been specified, and new isolates have been identified. The bacteria under study are classified as those from Methylobacterium genus on the basis of a set of diagnostic characteristics (they are capable to assimilate, besides methanol, other organic substances; to realize serine cycle of one-carbon compounds assimilation, to form rast-coloured colonies; they can form rosy-coloured colonies). As a result of the study of phenotypical characteristics in 14 strains of Methylobacterium and sequence-analysis of the gene 16S pRNA two
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An 8-week-old female Yorkshire terrier with a history of weakness, diarrhea and intestinal isosporiasis was euthanized and a post mortem examination performed. Histologically, there was severe gastrointestinal cryptosporidiosis, severe intestinal isosporiasis and thymic lymphoid depletion. PCR revealed visible bands for the actin and 18S rRNA genes but not for the acetyl CoA synthetase gene for Cryptosporidium spp. The PCR product for the actin gene was sequenced and found to have a 97.6-99.8% similarity to that of Cryptosporidium canis. To our knowledge, this is the first report of gastric cr
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report moderately severe cases of human ehrlichiosis and a lethal one caused by human granulocytic Ehrlichia, the HGE agent, closely related to Ehrlichia phagocytophila and Ehrlichia equi. Their vector is the Ixodes ricinus tick, which also transmits Borrelia burgorferi sensu lato in central, west and east regions of the Czech Republic. The diagnosis was established by PCR with sequence analysis of the genes encoding 16S rRNA of Ehrlichia and with reverse hybridization by using enzyme linked immunosorbent assay with different covalently coupled probes to the activated plate. Ten out of 47 p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A case of endocarditis caused by Tropheryma whippelii is reported. The 69-year-old patient was diagnosed as suffering from severe aortic regurgitation requiring aortic valve replacement, but showed no other symptoms of Whipple's disease. T. whippelii was detected in the explanted aortic valve by broad-range PCR amplification of the 16S rDNA and subsequent sequence analysis of the product. The etiologic agent was classified as a type 2A sequence variant based on the 16S-23S intergenic spacer and the 23S rDNA (domain III) sequences. The histological examination of the aortic valve was compatible
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTS: We attempted to evaluate the usefulness of in situ hybridization (ISH) in the specific diagnosis of Aspergillus pulmonary infection.
METHODS: We used an ISH technique using a multiple digoxigenin-incorporating probe, which was constructed by means of the polymerase chain reaction (PCR) from the 18S ribosomal RNA of Aspergillus fumigatus.
MATERIALS: We studied twelve formalin-fixed, paraffin-embedded lung tissue sections from autopsy-confirmed invasive pulmonary aspergillosis (IPA) (5 acute myelocytic leukemias, 2 acute lymphocytic leukemias, 2 chronic myelocytic leukemias, 1 adult T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have developed a sensitive assay for leptospira, using the polymerase chain reaction (PCR). On the basis of the published nucleotides sequence of 23S rRNA gene from Leptospira interrogans serovar canicola strain Moulton, primers were chosen to produce an amplified fragment of 123 bp. Primer A: 5'GAT CTA ATT CGC TGT AGC AGG3' and primer B: 5'ACT TTC ACC CTC TAT GGT CGG3' Eight different svs. of Leptospira interrogans could all be detected by PCR, but the DNAs from L. biflexa. Leptonema bacteria, virus and human could not produce the specific amplified fragment. The assay detected approximate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alterations in the gut microbiota have been implicated in autism spectrum disorder (ASD), but reported microbial profiles remain inconsistent, potentially because of heterogeneity in factors affecting gut microbial composition. Because Helicobacter pylori infection is associated with alterations in the gut microbiota, we investigated whether ASD was associated with gut microbial composition in a cohort of H. pylori-positive adolescents. This cross-sectional study included seven adolescents with ASD and 80 controls before H. pylori eradication therapy. Gut microbiota was analyzed using 16S rRNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The involvement of the intratumoral microbiome in gastric cancer (GC) pathogenesis remains insufficiently characterized, particularly in early gastric cancer (EGC). Here, we explored the relationship between the microbial community and EGC, with a specific focus on Helicobacter pylori (Hp)-negative microbiota. METHOD: Gastric mucosal microbiota from patients with EGC (n = 76) and healthy controls (HC, n = 39) were analyzed using 16 S rRNA V3-V4 amplicon sequencing. Linear discriminant analysis effect size (LEfSe) and random forest modeling were employed to identify microbial taxa t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Necrotizing soft-tissue infection (NSTI) is a rapidly progressing, life-threatening disease that is difficult to diagnose based on clinical findings alone. NSTI often does not present with pus at the infection site, so it may not be suspected during an autopsy. Consequently, bacterial cultures are not performed, which hinders identification of the causative organism. In this study, we attempted to amplify the 16S ribosomal RNA (16S rRNA) gene (also referred to as 16S rDNA) from blood samples collected during forensic autopsies in two cases where death was suspected to be due to NSTI, as determ
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study investigated variations in vaginal microbiota across female life stages and their correlation with quality of life. METHODS: This is a cross-sectional study based on the data and sample of 133 women from the outpatient department and health examination center of the hospital between January 2022 and July 2024. They were age-matched within a two-year range and classified into three groups: reproductive (n = 32), perimenopausal (n = 41), and postmenopausal (n = 60). Vaginal swabs were collected for 16 S rRNA gene sequencing on the Illumina platform to characterize microbia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid and sensitive determination of total bacterial count in water is essential for safeguarding water safety. In this work, an ultrasensitive electrochemical nucleic acid biosensor was developed for the detection of total bacteria in water. A conserved fragment of bacterial 16S rRNA gene (16S rDNA) was screened as the universal target, and the corresponding hairpin capture probe was designed and immobilized on magnetic particles for specific recognition and enrichment. By combining electrochemical detection with a triple signal amplification strategy-including hybridization chain reaction, G
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.