BACKGROUND: Krüppel-like factor 5 (KLF5) is involved in various aspects of tumor development, metastasis, and drug resistance through their regulation of transcription and translation, yet its functions in a comprehensive cancer framework are still unclear.
METHODS: Our research involved a detailed pan-cancer analysis using multi-omics data sourced from various public databases. We investigated the clinical characteristics, prognostic significance, mutations, and methylation patterns of KLF5 across various cancer types.
RESULTS: We discovered that KLF5 is implicated in tumor progression and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA foundation models trained on large-scale genomic and epigenetic datasets have shown promise for regulatory variant interpretation, yet their application to tissue-specific contexts remain limited. Here, we present a transfer learning (TL) framework to adapt Enformer, a deep neural network trained on 5,313 multi-omics tracks, to breast and prostate cancer using 275 and 357 tissue-specific transcription factor (TF) ChIP-seq tracks, respectively. We computed tissue-specific cis-regulatory activity (tCRA) scores for millions of single-nucleotide variants (SNVs) in genome-wide association study
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study is to identify and validate ketogenesis-immune cross-talk genes with prognostic significance in LUAD patients. Bulk RNA-seq data of LUAD were obtained from TCGA and GEO databases to analyze differentially expressed genes (DEGs), which were intersected with ketogenesis-related gene sets from MSigDB. DEGs associated with anti-PD-1 therapy sensitivity were further identified. Univariate and multivariate Cox regression analyses were performed to determine independent prognostic genes. Molecular subtypes and an 8-gene ketogenesis-immune prognostic signature were constructed an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: The prognostic relevance of erythropoietin receptor (EPOR) expression in clear cell renal cell carcinoma (ccRCC) remains incompletely defined. We evaluated whether EPOR expression is associated with overall survival in The Cancer Genome Atlas Kidney Renal Clear Cell Carcinoma cohort (TCGA-KIRC) and whether this association persists after joint adjustment for erythropoietin (EPO) expression.
PATIENTS AND METHODS: Transcriptomic and clinical data from TCGA-KIRC were analyzed. EPOR expression was modeled as a z-scored continuous variable. Cox proportional hazards models estimated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in TP53 occur in approximately half of all common cancer types and play a critical role in tumor progression and metastasis. However, because mutant TP53 can induce both loss- and gain-of-function effects, the development of drugs that directly target TP53 remains challenging. To identify downstream effectors of specific TP53 mutations, we compared gene expression profiles of colorectal (CRC), lung (LC), and stomach cancers (STC) carrying wild-type or mutant TP53. TP53 mutations were frequent (CRC 70.9%, LC 50.1%, STC 45.7%), with TP53-R273H being the most common. Comprehensive analy
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Abiraterone resistance represents a major clinical challenge in the management of castration-resistant prostate cancer (CRPC), yet the epigenetic mechanisms that sustain this resistance remain poorly understood. In particular, how super enhancers (SEs) reprogram transcriptional networks to promote this therapy resistance has not been fully elucidated. Here, by integrating chromatin immunoprecipitation sequencing and transcriptome profiling, we identified aberrantly activated oncogenic SEs that drive the transcriptional upregulation of the transcription factors ELF3 and JUNB in abiraterone-resi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteosarcoma is a primary malignant bone tumor most common in children and also occurs in older adults. Although it has several histopathological subtypes, it is generally aggressive and tends to metastasize. Vitamin D, through its active form 1,25(OH)2D3, binds to the vitamin D receptor (VDR) and influences pathways that inhibit tumor growth and metastasis. High VDR expression has been linked to better outcomes in various cancers, but its specific role in osteosarcoma is still unclear. VDR expression was evaluated immunohistochemically in paraffin-embedded osteosarcoma tissues from patients d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the advances in molecular classification of bladder cancer subtypes, pre-clinical rodent models used to study urothelial tumorigenesis must be profiled to reflect clinical relevance and optimize translational research strategies. Murine models of bladder cancer such as the autochthonous N-butyl-N-(4-hydroxybutyl) nitrosamine (BBN) model and genetically-engineered Upk3a-CreERT2; Trp53L/L; PtenL/L; Rosa26LSL-Luc (UPPL) model are muscle invasive models which have been found to correlate with basal and luminal subtypes, respectively. The rat MNU model has been used to represent non-muscle inv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Adenosine-to-Inosine (A-to-I) modification is one of the most common transfer RNA (tRNA) modifications in humans. However, the role of A-to-I tRNA modification in colorectal cancer (CRC) remains poorly understood. METHODS: tRNA modification was profiled by LC-MS in paired CRC and adjacent normal tissues (N = 70). The clinical significance of adenosine deaminase tRNA specific 2 (ADAT2) was evaluated using in-house (N = 157) and TCGA cohorts (N = 283). The function of ADAT2 in CRC was determined in intestine-specific ADAT2 knockout mice. Mechanism of ADAT2 was assessed by integrated
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammary tumors are the most common cancer in female dogs. Many dogs develop synchronous tumors, i.e. tumors occurring simultaneously or within a short time period in the same or different mammary gland. Whether synchronous canine mammary tumors are more biologically similar than random tumors due to shared genetic and environmental factors remains uncertain. Estrogen receptor alpha (ER) and Ki-67 are important biomarkers in human breast cancer but less studied in canine mammary tumors (CMTs). To assess tumor similarity and intratumoral heterogeneity, this study examined ER and Ki-67 expression
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
THSD7B (thrombospondin type-1 domain-containing 7B) has been implicated in several malignancies; however, its role in gastric adenocarcinoma remains unclear. This study aimed to investigate the expression pattern, clinical significance, and biological function of THSD7B in gastric adenocarcinoma. Public datasets from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO) were analyzed to evaluate THSD7B expression and its association with clinical outcomes. Functional enrichment analysis was performed to explore potential biological processes. In vitro assays, including cell prolifer
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastasis in gastric cancer requires metabolic reprogramming, but its key drivers remain unclear. Using a CRISPR-Cas9 metabolic knockout screen integrated with patient transcriptomes, we identified the mitochondrial enzyme ALDH6A1 as an anti-invasive factor. ALDH6A1 down-regulation blocked the terminal step of valine catabolism and caused intracellular accumulation of methylmalonic acid (MMA). MMA competitively occupied the α-ketoglutarate (α-KG) cofactor pocket of the histone demethylase KDM5C, suppressing its activity and increasing H3K4 dimethylation (H3K4me2) at promoters of invasion-rela
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circular RNAs (circRNAs) are a subclass of non-coding RNAs, playing an important regulatory role in tumor progression. Accumulating evidence has revealed that circRNAs can be regulated by m6A machinery, influencing their expression and biological functions. However, the functions and mechanisms of m6A-mediated circRNAs in nasopharyngeal carcinoma (NPC) remain to be elucidated. In this study, the sequence of hsa_circ_0005882 (circ_0005882) was determined by Sanger sequencing, and its localization in both the cytoplasm and nucleus was confirmed by fluorescence in situ hybridization. Furthermore,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study assessed the expression of different isoforms of PPAR, an important regulator of cell metabolism and proliferation, in meningiomas and correlated it with different clinicopathological variables and clinical outcomes. A total of 238 meningiomas were studied, including grade 1 (n=133), grade 2 (n=66), grade 3 (n=2), and brain-invasive otherwise benign meningiomas (BIOB) (n=37). The expression of PPAR-γ, phosphorylated PPAR-γ, and PPAR-β was assessed by immunohistochemistry. A semiquantitative grading was used to classify the cases into high and low expression. High nuclear and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to identify neutrophil extracellular trap-related genes (NET-RGs), explore their prognostic significance, and predict drug interactions in peripheral T-cell lymphoma (PTCL).
METHODS: Differentially expressed NET-RGs (DE-NRGs) between PTCL and normal tissues were screened. Functional enrichment analysis was conducted. Bioinformatics and machine learning were used to identify hub genes and assess their diagnostic value. Univariate and multivariate analyses were used to evaluate prognostic roles. Correlation and immune infiltration analyses were performed to explore r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNA (lncRNA) insulin-like growth factor 1 receptor antisense imprinted non-protein coding RNA (IRAIN) and lysine-specific demethylase 1 (LSD1) are aberrantly expressed in various malignancies. However, their roles in the progression of mantle cell lymphoma (MCL) remain unclear. This study aimed to investigate the expression pattern and biological role of IRAIN in MCL progression and to further explore the relationship between IRAIN and LSD1. In this study, the expression levels of IRAIN and LSD1 in MCL cells were detected by RT-qPCR. An IRAIN-overexpressing lentiviral vector (L
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral squamous cell carcinoma (OSCC) accounts for most head-and-neck cancers, and effective biological adjuvants remain limited. Gingival mesenchymal stem cells (GMSCs) exhibit anti-tumour paracrine activity, but the underlying molecular mechanisms and their relevance in patient cohorts remain incompletely understood. Consensus apoptosis-reactive oxygen species (ROS) effectors were identified through integrated transcriptomic analyses of TCGA-HNSC and three GEO cohorts. Candidate genes were evaluated in primary OSCC cells exposed to GMSC-conditioned medium or indirect Transwell co-culture. Find
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Papillary thyroid carcinoma (PTC) typically exhibits a favorable prognosis; however, lymph node and distant metastases continue to present significant clinical challenges. Plectin isoform 1d (PLEC 1d) contributes to myofiber integrity and is implicated in cytoskeletal organization and cancer cell motility, but its role in PTC progression is largely unknown. In this study, PLEC 1d expression was examined by RT-PCR in three PTC cell lines (MDA-T32, MDA-T41, MDA-T120) and normal thyroid cells (Nthy-ori-3-1). CRISPR-Cas9-mediated knockdown (KD) of PLEC 1d was performed in MDA-T41 cells, with KD ef
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Adrenocortical carcinoma (ACC) is a rare adrenal cortex cancer (0.7-2.0 cases per million) with high malignancy and poor prognosis (5-year survival <40%). Early detection is difficult due to adrenal location, and effective treatments are lacking, highlighting the need for prognostic biomarkers and therapeutic targets. Anillin actin-binding protein (ANLN), a key regulator of cytokinesis, is overexpressed in many cancers compared with normal tissues and is associated with poor prognosis and advanced stage. However, the clinicopathological significance of ANLN in ACC remains uncle
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 64-year-old man with metachronous metastatic urothelial carcinoma originating from the right renal pelvis underwent nectin-4-targeted [ 68 Ga]Ga-NECT-224 PET/CT prior to initiation of nectin-4-targeted antibody-drug conjugate (ADC) therapy with enfortumab-vedotin (PADCEV), in combination with pembrolizumab. A CT follow-up after 3 months of ADC therapy showed a progressive adrenal metastasis. Subsequent [ 68 Ga]Ga-NECT-224 PET/CT restaging revealed multiple new lesions with intense nectin-4 expression. This case illustrates the potential of [ 68 Ga]Ga-NECT-224 PET/CT to visualize heterogeneou
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования