BACKGROUND: Abdominal aortic aneurysm (AAA), characterized by a continued expansion of the aorta, leads to rupture if not surgically repaired. Mice aid the study of disease progression and its underlying mechanisms since sequential studies of aneurysm development are not feasible in humans. The present study used unbiased proteomics and systems biology to understand the molecular relationship between the mouse models of AAA and the human disease.
METHODS AND RESULTS: Aortic tissues of developing and established aneurysms produced by either angiotensin II (AngII) infusion in Apoe -/- and Ldlr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Head and neck cancer (HNC) affects over 890,000 people annually worldwide and has a mortality rate of 50%. Aside from poor survival, HNC pain impairs eating, drinking, and talking in patients, severely reducing quality of life. Different pain phenotype in patients (allodynia, hyperalgesia, and spontaneous pain) results from a combination of anatomical, histopathological, and molecular differences between cancers. Poor pathologic features (e.g., perineural invasion, lymph node metastasis) are associated with increased pain. The use of syngeneic/immunocompetent animal models, as well as a new mo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrinsically disordered proteins (IDPs) have no fixed three-dimensional (3D) structures under physiological conditions, with the content being about 51% in human proteomics. IDPs are associated with many human diseases, such as cancer, diabetes, and neurodegenerative diseases. Because IDPs do not crystallize and have diverse conformers, traditional experimental methods such as crystallization and NMR can hardly capture their conformation ensemble and just provide average structural characters of IDPs. Therefore, molecular dynamics (MD) simulations become a valuable complement to the experimen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The macrophage-inducible C-type lectin (mincle) is part of the innate immune system and acts as a pattern recognition receptor for pathogen-associated molecular patterns (PAMPS) and damage-associated molecular patterns (DAMPs). Ligand binding induces mincle activation which consequently interacts with the signaling adapter Fc receptor, SYK, and NF-kappa-B. There is also evidence that mincle expressed on macrophages promotes intestinal barrier integrity. However, little is known about the role of mincle in hepatic fibrosis, especially in more advanced disease stages. Mincle expression was measu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer-associated muscle wasting (CAW), a symptom of cancer cachexia, is associated with approximately 20% of lung cancer deaths and remains poorly characterized on a mechanistic level. Current animal models for lung cancer-associated cachexia are limited in that they (1) primarily employ flank transplantation methods, (2) have short survival times not reflective of the patient condition, and (3) are typically performed in young mice not representative of mean patient age. This study investigates a new model for lung cancer-associated cachexia that can address these issues and also
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comparison of relative fixation rates of synonymous (silent) and nonsynonymous (amino acid-altering) mutations provides a means for understanding the mechanisms of molecular sequence evolution. The nonsynonymous/synonymous rate ratio (omega = d(N)d(S)) is an important indicator of selective pressure at the protein level, with omega = 1 meaning neutral mutations, omega < 1 purifying selection, and omega > 1 diversifying positive selection. Amino acid sites in a protein are expected to be under different selective pressures and have different underlying omega ratios. We develop models that accou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shakeel et al. reported the solubility of vanillin in ten environmentally friendly solvents in Food Chemistry [180 (2015) 244-248] and correlated the solubility data using the modified Apelblat model and the Van't Hoff model. While the experimental data are of significant value, we found that the Apelblat model parameters they reported exhibit systematic deviations, indicating incomplete fitting and resulting in poor agreement between the calculated values and experimental values in several solvent systems. In addition, there appear to be inconsistencies in the reported correlation coefficient
КомментарийПисьмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) studies were performed for a series of carbonic anhydrase inhibitors using comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) techniques. The large set of 37 different aromatic/heterocyclic sulfonamides carbonic anhydrase (CA, EC 4.2.1.1) inhibitors, such as CA II chosen for the present study. The conventional ligand-based 3D-QSAR studies were performed based on the low energy conformations employing database alignment rule. The ligand-based model gave q(2) values 0
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As precision medicine becomes an integral part of clinical practice, medical curricula would benefit from the inclusion of accessible training in bioinformatics and computational biology. This project provides a scalable, stepwise pedagogical framework for introducing medical students to the drug discovery pipeline using high-impact, small-scale computational projects. Each research project involves using online genomic databases to identify and characterize genes of importance to pathogenesis using Plasmodium falciparum as a model organism. The methodology changes from sequence to structure a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Heartland virus (HRTV) is a tick-borne human pathogenic phlebovirus that primarily causes leukopenia and thrombocytopenia. It is transmitted by Amblyomma americanum type of tick, that is, notable for their aggressive biting behavior, affinity for human hosts, and high prevalence. Developing vaccines or immunizations against HRTV is gaining importance as a public-health preventive strategy. The current study was planned to prioritize a multi-epitope stable mRNA vaccine model against HRTV from lead B-cell and T-cell epitopes (with IC50 < 100 nM) of HRTV proteome following advanced immunoinfo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The new coronavirus, SARS-CoV-2, caused the COVID-19 pandemic, characterized by its high rate of contamination, propagation capacity, and lethality rate. In this work, we approach the use of phthalocyanines as an inhibitor of SARS-CoV-2, as they present several interactive properties of the phthalocyanines (Pc) of Cobalt (CoPc), Copper (CuPc) and without a metal group (NoPc) can interact with SARS-CoV-2, showing potential be used as filtering by adsorption on paints on walls, masks, clothes, and air conditioning filters. Molecular modeling techniques through Molecular Docking and Molecular Dyn
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this study was to investigate the effect of molecular mobility of water adsorbed by disintegrants on the hydrolytic degradation of active pharmaceutical ingredients (APIs). Fourteen different disintegrants were tested. First, powdered disintegrants were stored at conditions of 40 °C/75% relative humidity ("humid conditions") and their T2 relaxation times were measured by time-domain nuclear magnetic resonance for examination of the molecular mobility of water adsorbed by the disintegrant. From the observed T2 values, the water molecular mobility was fully characterized. In parti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It has been shown recently, without an explanation of the possible molecular mechanisms involved, that 4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazinepropanesulphonic (EPPS) acid effectively protects from the neurotoxicity induced by oligomers and plaques formed by the protein amyloid-β protein. Here we report the same protective effect, obtained in vitro (HT22-diff cell line) and ex vivo (hippocampal slices) models, against amyloid neurotoxicity induced by oligomers of salmon Calcitonin (sCT), which has been shown to be a good model for the study of neurodegenerative diseases. Based on biophysical studies fo
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Krabbe disease is a rare neurodegenerative disease with an autosomal recessive character caused by a mutation in the GALC gene. The mutation leads to an accumulation of psychosine and a subsequent degeneration of oligodendrocytes and Schwann cells. Psychosine is the main biomarker of the disease. The Twitcher mouse is the most commonly used animal model to study Krabbe disease. Although there are many references to this model in the literature, the lipidomic study of nervous system tissues in the Twitcher model has received little attention. This study focuses on the comparison of the lipid pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral diseases are responsible for substantial morbidity and mortality and continue to be of great concern. To ensure better control of viral infections, I have been tackling the issue as a medical doctor, an academic researcher, and a public health officer. Especially, I have studied respiratory viruses, such as the influenza virus, from the perspectives of molecular virology, theoretical modeling, and field epidemiology. RNA biology and its involvement with viral life-cycle and pathogenicity are central topics of molecular study, while mathematical models of transmission dynamics and phyloge
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tyrosine hydroxylase (TH), the rate-limiting enzyme in dopamine (DA) synthesis, is conserved across most animal phyla. DA regulates motor activity, sensory processing motivation, neural homeostasis, and protection against oxidative stress. TH and DA have been described in vertebrates and in some invertebrates, including arthropods. This study investigated the anatomical location of TH and DA and characterized the biochemical and molecular structure of TH in the brain of the mangrove crab Ucides cordatus. This species is a useful environmental model for neurodegeneration studies, due to its occ
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-protein interactions (PPIs) and nanobody-antigen interactions (NAIs) play essential roles in cellular function, yet potential hotspot prediction remains challenging. We present Surf2Spot, a deep learning framework that integrates sequence embeddings, structural features, and protein surface properties to predicts surface regions with a high propensity to contain PPI hotspot residues. Unlike complex-prediction approaches that require predefined binding partners, Surf2Spot identifies interaction-prone regions directly from target sequences or predicted monomeric structures, enabling part
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-protein interactions (PPIs) are fundamental to nearly all cellular processes; however, elucidating the principles governing protein association into complexes remains a significant challenge. Previous studies have shown that protein-protein interfaces can be partitioned into distinct regions-core, rim, and support-that differ in hydration and residue composition. Here, we present a detailed analysis of interactions occurring within each of these interface regions. Extending beyond simple residue proximity or atomic contacts, our analysis, facilitated by our open-source software MICLOT,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uracil-DNA glycosylases (UDGs) are widely used to prevent carryover contamination in nucleic acid amplification-based diagnostics; however, existing thermolabile UDGs exhibit limited thermal inactivation windows for emerging applications. Here, we combine evolutionary mining, structural analysis, and structure-guided saturation mutagenesis to define non-catalytic determinants that tune UDG thermolability without compromising catalytic function. From 8482 bacterial UDG sequences, we assembled a 24-member diversity panel and identified UDG_7 as a naturally thermolabile scaffold coupling robust l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
When bacteria are treated with multiple antibiotics simultaneously, resistance is highly unlikely to evolve. In contrast, resistance against multiple phages frequently arises during therapy. Why does resistance against multi-phage cocktails evolve so easily? Using a mathematical model, we show how the bacterial evolutionary dynamics and phage replicative dynamics uniquely intertwine, facilitating the rapid evolution of multi-phage resistance. As different phages replicate and become inhibitory at varying time points, bacteria can sequentially acquire resistance rather than simultaneously-incre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования