CONTEXT: Biomolecules serve as intrinsic repositories of information related to function, binding interactions, molecular motion, and structural conformations. With the rapid accumulation of structural data from fields such as structural biology and cheminformatics, the ability to visualize biomolecular architecture has become essential for researchers in biology, pharmacology, and related disciplines. Molecular visualization represents a foundational step in accessing and interpreting this data, enabling its application in diverse scientific and therapeutic contexts. Recent advancements in co
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have determined the 1.8 Å X-ray crystal structure of nonlipidated (i.e., N-terminally truncated) nontypeable Haemophilus influenzae (NTHi; H. influenzae) protein D. Protein D exists on outer membranes of H. influenzae strains and acts as a virulence factor that helps invade human cells. Protein D is a proven successful antigen in animal models to treat obstructive pulmonary disease (COPD) and otitis media (OM), and when conjugated to polysaccharides also has been used as a carrier molecule for human vaccines, for example in GlaxoSmithKline Synflorix™. NTHi protein D shares high sequence and
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work was aimed at probing the influence of solvent surface tension on protein ionization by electrospray. In particular, we were interested in testing the previously suggested hypothesis that the charge-state distributions (CSDs) of proteins in electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) are controlled by the surface tension of the least volatile solvent component. In the attempt to minimize uncontrolled conformational effects, we used acid-sensitive proteins (cytochrome c and myoglobin) at low pH or highly stable proteins (ubiquitin and lysozyme) in the presence of low concentrati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: STXBP1-related disorders (STXBP1-RD) are among the most common genetic neurodevelopmental disorders, marked by early onset epilepsy, global developmental delay, and motor impairments. Many missense variants remain uncharacterized, limiting accurate variant interpretation and hindering development of precision therapies. Current American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG)/Association for Molecular Pathology (AMP) variant curation frameworks provide limited discriminatory power for STXBP1 missense variants due to limited functional data and frequently incomplete parental
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inhibition of an imperative antioxidant enzyme with subsequent death is a victorious and widely accepted strategy to combat various infectious diseases. Among different antioxidant enzymes, thioredoxin reductase (TrxR) is an exclusive one. Studies have revealed that direct inhibition of TrxR by different classes of chemical moieties promptly results in the death of an organism. Especially the structural as well as biochemical modifications of the enzyme upon inhibition project serious threat towards the subject organism. Herein, an attempt was made to inhibit TrxR of filarial species by admini
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The coronavirus (CoV) disease 2019 (COVID-19) pandemic caused by severe acute respiratory syndrome CoV-2 (SARS-CoV-2) is a health threat worldwide. Viral main protease (Mpro, also called 3C-like protease [3CLpro]) is a therapeutic target for drug discovery. Herein, we report that GC376, a broad-spectrum inhibitor targeting Mpro in the picornavirus-like supercluster, is a potent inhibitor for the Mpro encoded by SARS-CoV-2, with a half-maximum inhibitory concentration (IC50) of 26.4 ± 1.1 nM. In this study, we also show that GC376 inhibits SARS-CoV-2 replication with a half-maximum effective co
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative bacterium responsible for a large number of nosocomial infections. The P. aeruginosa respiratory chain contains the ion-pumping NADH:ubiquinone oxidoreductase (NQR). This enzyme couples the transfer of electrons from NADH to ubiquinone to the pumping of sodium ions across the cell membrane, generating a gradient that drives essential cellular processes in many bacteria. In this study, we characterized P. aeruginosa NQR (Pa-NQR) to elucidate its physiologic function. Our analyses reveal that Pa-NQR, in contrast with NQR homologues from other bacterial s
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein kinases are ubiquitously expressed as Serine/Threonine kinases, and play a crucial role in cellular activities. Protein kinases have evolved through stringent regulation mechanisms. Protein kinases are also involved in tauopathy, thus are important targets for developing Anti-Alzheimer's disease compounds. Structures with an indole scaffold turned out to be potent new leads. With the aim of developing new inhibitors for human protein kinase C, here we report the generation of four point 3D geometric featured pharmacophore model. In order to identify novel and potent PKCθ inhibitors, th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cysteine biosynthesis takes place via a two-step pathway in bacteria, fungi, plants and protozoan parasites, but not in humans, and hence, the machinery of cysteine biosynthesis is an opportune target for therapeutics. The decameric cysteine synthase complex (CSC) is formed when the C-terminal tail of serine acetyltransferase (SAT) binds in the active site of O-acetylserine sulfydrylase (OASS), playing a role in the regulation of this pathway. Here, we show that OASS from Brucella abortus (BaOASS) does not interact with its cognate SAT C-terminal tail. Crystal structures of native BaOASS showe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Marburg virus (MARV) is a highly pathogenic filovirus that is classified in a genus distinct from that of Ebola virus (EBOV) (genera Marburgvirus and Ebolavirus, respectively). Both viruses produce a multifunctional protein termed VP35, which acts as a polymerase cofactor, a viral protein chaperone, and an antagonist of the innate immune response. VP35 contains a central oligomerization domain with a predicted coiled-coil motif. This domain has been shown to be essential for RNA polymerase function. Here we present crystal structures of the MARV VP35 oligomerization domain. These s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in type 3 repeats of cartilage oligomeric matrix protein (COMP) cause two skeletal dysplasias, pseudoachondroplasia (PSACH) and multiple epiphyseal dysplasia (MED). We expressed recombinant wild-type COMP that showed structural and functional properties identical to COMP isolated from cartilage. A fragment encompassing the eight type 3 repeats binds 14 calcium ions with moderate affinity and high cooperativity and presumably forms one large disulfide-bonded folding unit. A recombinant PSACH mutant COMP in which Asp-469 was deleted (D469 Delta) and a MED mutant COMP in which Asp-361 w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular polymeric substances (EPS) as the core sewage sludge components play important roles in floc stability and pollutant adsorption. However, the molecular mechanisms underlying EPS-virus interactions and their environmental implications remain unclear. This study employed three representative model EPS components, i.e., proteins, polysaccharides, and humic substances, and systematically investigated EPS-virus interaction mechanisms with T7 bacteriophage as a virus surrogate. By integrating surface plasmon resonance analysis, double-layer agar plaque assays and qPCR, we demonstrated
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In living cells, proteins involved in specialized biochemical functions are often spatially organized within biomolecular condensates. Increasing evidence suggests that some of these condensates, including DNA repair condensates, emerge through liquid-liquid phase separation (LLPS). In the nucleus, however, condensates form within a highly heterogeneous environment composed of chromatin fibers, RNA, and additional protein scaffolds such as PAR chains, all of which may interact with phase-separating proteins. Moreover, condensate formation is frequently associated with specific chromatin confor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The female reproductive tract (FRT) is composed of distinct sections which all take part in the sperm selection processes that occur after copulation. Among the different sections, the uterotubal junction (UTJ) presents a significant obstacle to sperm and is a major site of sperm selection. This selection is based not only on motility and morphology, but on the presence and conformation of specific sperm surface proteins. In the mouse model, a disintegrin and metallopeptidase domain 3 and other sperm surface proteins have been identified as being critical for passage through the UTJ, however,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
α-Synucleinopathies are devastating neurodegenerative diseases characterized by pathological accumulation of a neuronal protein, α-synuclein (αSyn). Lowering soluble αSyn levels is a promising therapeutic strategy to limit aggregation and neurotoxicity, but directly targeting this protein is hindered by its intrinsically disordered structure and other factors, such as its conformational heterogeneity and intracellular drug delivery barriers. Consequently, increasing attention has been directed toward targeting the SNCA transcript, which encodes αSyn. Here, we developed phosphorodiamidate morph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
4-HNE carbonylation and phosphorylation in the Zu5-ANK domain have been observed in human erythrocytes with sickle cell trait and G6PD deficiency. However, the atomic-level effects of phosphorylation and multiple carbonylations by 4-HNE on the Zu5-ANK domain are not yet fully understood. The present work provides further insight into understanding the changes caused by polymodifications in Zu5-ANK due to oxidative stress and phosphorylation. Here, we present a molecular dynamics simulation-based study of the polycarbonylated, phosphorylated, and phosphocarbonylated Zu5-ANK domain. Our results
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the pathogen responsible for the COVID-19 pandemic. The prominent characteristic of SARS-CoV-2 is the use of a trimeric spike (S) glycoprotein to invade the host cell; therefore, the S protein has become a major drug and vaccine target. Recently, a universal aptamer (MSA52) has been reported to bind to the S protein of seven former variants of concern (VOCs) in both glycan and nonglycan forms. However, no molecular details regarding these interactions are currently available. Thus, in this work, molecular dynamics (MD) simulations
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Charcot-Marie-Tooth disease (CMT) is a genetic peripheral neuropathy caused by mutations in many functionally diverse genes. The aminoacyl-tRNA synthetase (ARS) enzymes, which transfer amino acids to partner tRNAs for protein synthesis, represent the largest protein family genetically linked to CMT aetiology, suggesting pathomechanistic commonalities. Dominant intermediate CMT type C (DI-CMTC) is caused by YARS1 mutations driving a toxic gain-of-function in the encoded tyrosyl-tRNA synthetase (TyrRS), which is mediated by exposure of consensus neomorphic surfaces through conformational changes
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human immunodeficiency virus (HIV-1) matrix protein p17 (p17) is released from infected cells as a protein capable of deregulating the biological activity of different cells. P17 variants (vp17s), more frequently detected in the plasma of HIV-1+ patients with rather than without lymphoma and characterized by amino acids insertions in their C-terminal region, were found to trigger B cell growth and clonogenicity. Vp17s endowed with B-cell-growth-promoting activity are drastically destabilized, whereas, in a properly folded state, reference p17 (refp17) does not exert any biological activity
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein therapeutics, particularly antibodies, depend on maintaining their native structures for optimal function. Hydrophobic interfaces, such as the air-water interface, can trigger protein aggregation and denaturation. While completely avoiding such interfacial exposures during manufacturing and storage is impractical, minimizing them is crucial for enhancing protein drug stability and extending shelf life. In the biologics industry, surfactants like polysorbates are commonly used as additives (excipients) to mitigate these undesirable interfacial exposures. However, polysorbates, the most
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования