Most characterized metazoan mitochondrial genomes are compact and encode a small set of proteins that are essential for oxidative phosphorylation, as well as rRNA and tRNA for their expression. However, in rare cases, invertebrate taxa have additional open reading frames (ORFs) in their mtDNA sequences. Here, we sequenced and analyzed the mitochondrial genome of a polychaete worm, Polydora cf. ciliata, part of whose life cycle takes place in low-oxygen conditions. In the mitogenome, we found three "ORFan" regions (544, 1,060, and 427 bp) that have no resemblance to any standard metazoan mtDNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The spondylo-meta-epiphyseal dysplasia (SMED) short limbs-hand type is a rare autosomal recessive disease, which is characterized by premature calcification leading to severe disproportionate short stature and various skeletal changes. Defective function of a conserved region encoding discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 (DDR2 protein) by the discoidin domain-containing receptor 2 (DDR2 gene) is cause of this disease. The purpose of present study was to investigate disease-causing mutations on DDR2 gene in an Iranian family with SMED, and predict the DDR2 protein molecular m
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myxovirus resistance 1 (Mx1) gene plays an important role in uterine receptivity and conceptus development by creating a strong defense mechanism in the uterine environment. However, the specific role of Mx1 gene is not yet documented in the goat. Therefore, in the present study, full-length coding sequence (CDS) of the Mx1 gene was amplified, sequenced and characterized through various Bioinformatic tools. Temporal expression profile of Mx1 mRNA and protein was also examined by quantitative real-time PCR (qPCR) and western blot, respectively, in the endometrium of cyclic stage (non-pregnant),
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Primary coenzyme Q10 deficiency refers to a group of diseases characterised by reduced levels of coenzyme Q10 in related tissues or cultured cells associated with the 9 genes involved in the biosynthesis of coenzyme Q10. A biallelic pathogenic variant of COQ8A gene causes the occurrence of the primary coenzyme Q10 deficiency type 4. The objective of this study was to investigate the genetic cause of muscle weakness in a proband who had a negative DMD gene test for Becker muscular dystrophy.
METHODS: The DNA of the proband was sequenced using whole exome sequencing. With the help o
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify the genetic causes of male infertility characterized by teratozoospermia.
DESIGN: Genetic studies.
SETTING: Medical university.
PATIENT(S): Two infertile brothers with teratozoospermia in a consanguineous Chinese family, another 124 sporadic infertile male patients presenting with teratozoospermia, and 200 male controls with normal fertility.
INVENTION(S): None.
MAIN OUTCOME MEASURE(S): Whole exome sequencing and genotype analysis to identify the potential pathogenic mutation, Sanger sequencing to validate the mutation in family members, in silico structural modelin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyneuropathy, organomegaly, endocrinopathy, M-protein, and skin changes (POEMS) syndrome is a rare plasma cell dyscrasia characterized by polyneuropathy, organomegaly, endocrinopathy, extravascular fluid overload, M protein, and a myriad of skin changes. The pathogenesis is poorly understood, but monoclonal plasma cells are λ-restricted and these immunoglobulin λ light chain variable (IGLV) region genes are derived from only two germlines, either IGLV1-44 or 1-40. Here we analyzed the clonal IGLV gene rearrangements of genomic DNA samples of bone marrow mononuclear cells using next-generatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mutations in various desmosomal proteins were shown to cause inherited forms of cardiomyopathy. Carvajal syndrome (Online Mendelian Inheritance in Man [OMIM] 605676) is characterized by the association of dilated cardiomyopathy, striate palmoplantar keratoderma, and woolly hair. It is caused by homozygous as well as heterozygous mutations in DSP, which encodes the desmosomal plaque protein desmoplakin. An overlapping cardiocutaneous phenotype was also described with homozygous mutations in genes encoding two other desmosomal proteins; plakoglobin (Naxos disease; OMIM 601214) and de
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three soybean [Glycine max (L) Merr.] small RNA libraries were generated and sequenced using the Illumina platform to examine the role of miRNAs during soybean nodulation. The small RNA libraries were derived from root hairs inoculated with Bradyrhizobium japonicum (In_RH) or mock-inoculated with water (Un_RH), as well as from the comparable inoculated stripped root samples (i.e. inoculated roots with the root hairs removed). Sequencing of these libraries identified a total of 114 miRNAs, including 22 novel miRNAs. A comparison of miRNA abundance among the 114 miRNAs identified 66 miRNAs that
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
External Ca2+ entry into myometrial smooth-muscle cells is important to uterine contraction and hence to labor progression and parturition. Proteins of the transient receptor potential (Trp) channel family are putative capacitative Ca2+ entry channels that respond to contractant-generated signals and intracellular Ca2+ store depletion. Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction was used to examine the relative expression of TrpC mRNAs in rat myometrium and determine their expression pattern during pregnancy and labor. rTrpC1, rTrpC2, rTrpC4, rTrpC5, rTrpC6, and rTrpC7 mRNAs,
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A highly conserved region in the PTH promoter was identified using the basic local alignment search tool (BLAST) 2 Sequences comparison. Strong specific complexes were observed with a DNA probe that contained much of the computer-derived conserved sequence in the EMSA using bovine parathyroid gland (bPTG) nuclear extracts. Ethylation interference footprinting indicated that the major complex made contacts to a sequence strikingly similar to an Sp1 binding site. Sp3 was evident in the major DNA-binding complexes, whereas the contribution by Sp1 was substantially weaker. Specific binding by addi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trypanosomatid infections are an important public health threat affecting many low-income countries across the tropics, particularly in the Americas. Trypanosomatids can infect many vertebrate, invertebrate, and plant species and play an important role as human pathogens. Among these clinically relevant pathogens are species from the genera Leishmania and Trypanosoma. Mixed trypanosomatid infections remain a largely unexplored phenomenon. Herein, we describe the application of an amplicon-based next-generation sequencing (NGS) assay to detect and identify trypanosomatid species in mammalian re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foot-and-mouth disease serotype O viruses (FMDV/O) are responsible for the most outbreaks in FMD endemic countries. O1/BFS is one of the recommended FMD/O vaccine strains by World Reference Laboratory for FMD. In the current study, FMDV/O1 BFS vaccine strain and serotype O field isolates (45) were analyzed phylogenetically and antigenically to gain more insight into the genetic and antigenic characteristics of the vaccine strain and field isolates. O1/BFS showed similarity with 89% of the field isolates using a virus neutralization test (VNT). The P1 region encoding the FMDV capsid was sequenc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The aim of this study was to investigate the blaNDM gene, pathogenic potential, and antimicrobial resistance of clinical isolates of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae isolated from patients admitted to the University Hospital of Londrina between January 2014 and March 2017.
METHODS: blaNDM-1 and virulence genes were investigated using conventional PCR methods Antimicrobial susceptibility testing was performed by disk diffusion method according to the Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines of 2017. Clonal relationships of the New Delhi metallo-β-lactamase (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We investigated the molecular etiology of a young male proband with confirmed immunodeficiency of unknown cause, presenting with recurrent bacterial and Varicella zoster viral infections in childhood and persistent lymphopenia into early adulthood.
AIM: To identify causative functional genetic variants related to an undiagnosed primary immunodeficiency.
METHOD: Whole genome microarray copy number variant (CNV) analysis was performed on the proband followed by whole exome sequencing (WES) and trio analysis of the proband and family members. A >4 kbp deletion identified by repeated
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wolbachia endobacteria are obligate intracellular bacteria with a highly reduced genome infecting many arthropod and filarial species, in which they manipulate arthropod reproduction to increase their transmission and are essential for nematode development and survival. The Wolbachia genome encodes all enzymes required for the synthesis of the cell wall building block lipid II, although a peptidoglycan-like structure has not been detected. Despite the ability to synthesize lipid II, Wolbachia from arthropods and nematodes have only a subset of genes encoding enzymes involved in the periplasmic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Canine parvovirus type 2c (CPV-2c) emerged in 2000 and is known for causing a more severe disease than other CPV-2 variants in puppies. In 2015, the emerging CPV-2c variant was isolated in Taiwan and it subsequently became the predominant variant. To trace the evolution of Taiwanese CPV-2c, we compared complete VP2 genes of CPV-2c from Taiwan and sequences obtained from GenBank. The evolutionary rate of CPV-2c was estimated to be 4.586 × 10-4 substitutions per site per year (95% highest posterior density (HPD) was 3.284-6.076 × 10-4). The time to the most recent common ancestor (TMRCA) dated t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid and accurate identification of an influenza outbreak is essential for patient care and treatment. We describe a next-generation sequencing (NGS)-based, unbiased deep sequencing method in clinical specimens to investigate an influenza outbreak. Nasopharyngeal swabs from patients were collected for molecular epidemiological analysis. Total RNA was sequenced by using the NGS technology as paired-end 250 bp reads. Total of 7 to 12 million reads were obtained. After mapping to the human reference genome, we analyzed the 3-4% of reads that originated from a non-human source. A BLAST search of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the WDR45 gene have been identified as causative for the only X-linked type of neurodegeneration with brain iron accumulation (NBIA), clinically characterized by global developmental delay in childhood, followed by a secondary neurological decline with parkinsonism and/or dementia in adolescence or early adulthood. Recent reports suggest that WDR45 mutations are associated with a broader phenotypic spectrum. We identified a novel splice site mutation (c.440-2 A > G) in a 5-year-old Argentinian patient with Rett-like syndrome, exhibiting developmental delay, microcephaly, seizures
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Closed breeding populations in the dog in conjunction with advances in gene mapping and sequencing techniques facilitate mapping of autosomal recessive diseases and identification of novel disease-causing variants, often using unorthodox experimental designs. In our investigation we demonstrate successful mapping of the locus for primary open angle glaucoma in the Petit Basset Griffon Vendéen dog breed with 12 cases and 12 controls, using a novel genotyping by exome sequencing approach. The resulting genome-wide association signal was followed up by genome sequencing of an individual case, lea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As one of the three macronutrients, potassium participates in many physiological processes in plant life cycle. Recently, potassium-dependent transcriptome analysis has been reported in Arabidopsis, rice and soybean. Alligator weed is well known, particularly for its strong ability to accumulate potassium. However, the molecular mechanism that underlies potassium starvation responses has not yet been described. In this study, we used Illumina (Solexa) sequencing technology to analyse the root transcriptome information of alligator weed under low potassium stress. Further analysis suggested tha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.