PURPOSE: Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is aggressive with a poor prognosis. The tumor microenvironment (TME) significantly affects tumor progression and therapy resistance. Previous work has shown that fibroblasts in metastatic lymph nodes can confer cisplatin resistance to ESCC cells via PI16 (peptidase inhibitor 16). This study investigates the role of fibroblast-derived PI16 in the ESCC TME.
METHODS: Public single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data for ESCC were analyzed. A cell co-culture assay was performed to evaluate regulatory T cells (Tregs) differentiation from naïve C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dynamics of colorectal epigenetics within the adenoma stages of oncogenesis remain undocumented. In this study, we investigated DNA methylation dynamics in colorectal cancer oncogenesis from non-tumor colon tissue to low-grade, high-grade adenoma and adenocarcinoma. The methylome of 12 low-grade and 19 high-grade colorectal adenomas was determined via the EPIC v1 Human Methylation BeadChip. These methylation profiles were complemented with the methylomes of 206 non-tumor colon and 22 colon adenocarcinoma samples from the GEO and TCGA databases. Differentially methylated CpGs were identifie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) ranks among the most common and deadly malignancies globally. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide (SNRPB), a core spliceosomal component, was recently identified as essential for GC cell survival, although its mechanisms remain unclear. This study investigated the functions of SNRPB in GC progression and explored its underlying molecular mechanisms. SNRPB expression in GC tissues and adjacent non-cancerous tissues from 48 patients was analyzed via immunohistochemistry. SNRPB was significantly overexpressed in GC tissues compared with its expression in adjacent norma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coagulation factor family genes play a pivotal role in tumor progression and immune modulation, but their relationship with tumor microenvironment and immunotherapy response in gastric cancer remains unclear. This study utilized single-cell and The Cancer Genome Atlas datasets to investigate the clinical and immune relevance of coagulation factor family genes in gastric cancer. Based on coagulation factor family genes, a risk score was constructed. The high-risk group was found to have a worse prognosis and exhibited an immunosuppressive state. Coagulation factor V (F5) emerged as a central ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is one of the most prevalently diagnosed malignancies. Frequent metastasis and recurrence render treatments ineffective. The accumulation of omics data has helped develop a comprehensive functional regulatory network underlying tumorigenesis, causing significant breakthroughs in cancer therapy.
METHODS: Systematic transcriptomic analysis of CRC tissues and matched normal samples identified miR-7974 as a novel miRNA with distinct expression pattern in CRC. Independent RT-qPCR assays further validated its tumor-biased expression. To investigate the role of mi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The plastic role of regulatory factor X1 (RFX1) in colon cancer progression and its impact on the tumor microenvironment remain poorly understood. The study aimed to clarify the molecular and clinical role of RFX1 in colon cancer.
METHODS: We classified colon cancers into subgroups with high and low RFX1 expression and characterized their immune profiles, mutational profiles, cancer immunotherapy and drug sensitivity. By combining RFX1 expression with persistent tumor mutational burden, we proposed a novel nomogram clinical prediction model and validated its predictive performance,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The accuracy and reliability of identified biomarkers in differentiating early non-small cell lung cancer (NSCLC) remain suboptimal, thereby impeding the timely detection of NSCLC.The objective of this research is to examine the expression level and diagnostic utility of miR-668-3p in individuals with NSCLC, along with its effectiveness and predictive capacity in the combined diagnosis of early-stage NSCLC using serum markers.
METHODS: The research included 117 NSCLC patients and 101 pulmonary nodule patients (controls). Quantitative PCR was employed to assess the expression level
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: TBXT, a member of the T-box transcription factor family, drives epithelial-to-mesenchymal transition in the metastasis of some cancers. However, the relationship between the epigenetic regulatory landscape and its expression in lung cancers remains elusive.
METHODS: Circularized chromosome capture combined with sequencing (4C-seq) was employed to analyze physical chromatin interactions at the TBXT loci in the lung cancer cell line H460, a high TBXT-expressing cell line, compared to H358 and A549, which do not express TBXT. To define the regulatory landscape, the targeted TBXT chro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer cells are highly plastic, favoring adaptation to changing conditions. Genes related to basic cellular processes evolved in ancient species, while more specialized genes appeared later with multicellularity (metazoan genes) or even after mammals evolved. Transcriptomic analyses have shown that ancient genes are up-regulated in cancer, while metazoan-origin genes are inactivated. Despite the importance of these observations, the underlying mechanisms remain unexplored. Here, we study local and global epigenomic mechanisms that may regulate genes from specific evolutionary periods. Using e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor metastasis is a major obstacle for the effective treatment of breast cancer. Some studies showed that exosomes could promote tumor distant metastasis by establishing pre-metastasis niches (PMN). MicroRNAs (miRNAs) in exosomes play a critical role in tumor development and invasion. We aimed to investigate the effects of exosomal miRNAs derived from breast cancer cells on metastasis. MiRNA sequencing and RT-PCR approach were used to screen potential exosomal miRNAs. We compared the levels of serum exosomal miRNAs from breast cancer patients and those from MCF10A/MCF7/MDA-MB-231 cells. We f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic cancer remains one of the most malignant tumors, characterized by limited treatment efficacy.
MAIN FINDINGS: microRNAs (miRNAs) play a crucial role in regulating the proliferation, invasion, migration, drug resistance, apoptosis, and cell cycle progression of pancreatic cancer cells by inhibiting tumor-associated proteins. Metscape analysis revealed that miRNA-targeted proteins associated with pancreatic cancer are enriched in processes such as cell proliferation, mitosis, and cell migration, and participate in multiple signaling pathways. These proteins primarily local
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying tumor-specific T cell clones that mediate immunotherapy responses remains challenging. Mutation-associated neoantigen (MANA) -specific CD8+ tumor-infiltrating lymphocytes (TIL) have been shown to express high levels of CXCL13 and CD39 (ENTPD1), and low IL-7 receptor (IL7R) levels in many cancer types, but their collective relevance to T cell functionality has not been established. Here we present an integrative tool to identify MANA-specific TIL using weighted expression levels of these three genes in lung cancer and melanoma single-cell RNAseq datasets. Our three-gene "MANAscore"
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Protein palmitoylation, catalyzed by the zDHHC family of palmitoyltransferases, has emerged as a critical post-translational modification implicated in tumor progression. However, the comprehensive role of zDHHCs-mediated palmitoylation in molecular subtyping, prognosis, and immune microenvironment modulation in pancreatic cancer (PC) remains unclear.
METHODS: We systematically integrated multi-cohort transcriptome, single-cell RNA-seq, and somatic mutation data for PC. Bioinformatic analyses included molecular subtyping based on zDHHCs expression, differential gene expression, fu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most common malignant tumors worldwide, with insensitive treatment and poor prognosis; in recent years, breakthroughs in IFN signaling pathway and PDL1/PD1 signaling pathway in HCC immunotherapy research.
OBJECTIVES: This study aimed to investigate the molecular mechanisms controlling the immune response and immune evasion.
METHODS: NRIR was identified as a differential gene affecting the IFN signaling pathway and PDL1/PD1 signaling pathway in HCC by bioinformatics, and the function of NRIR was investigated in the HCC cell model and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ABSTRACT: Cytokeratin 7 (CK7) is a marker of epithelial differentiation and is positive in >90% of breast carcinomas. In the right clinical setting, coexpression of CK7 and GATA3 is considered as strong evidence of breast origin, which can be further confirmed by positive expression of estrogen and progesterone receptors. Pathologists use CK7 in the breast to confirm epithelial differentiation and highlight foci of invasion, and outside the breast it is often used as a marker to support breast origin of metastatic tumors. Few studies have reported loss of CK7 in invasive breast carcinoma, howe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) remains a malignant and life-threatening tumor with an extremely poor prognosis, posing a significant global health challenge. Despite the continuous emergence of novel therapeutic agents, patients exhibit substantial heterogeneity in their responses to anti-tumor drugs and overall prognosis. The pentose phosphate pathway (PPP) is highly activated in various tumor cells and plays a pivotal role in tumor metabolic reprogramming. This study aimed to construct a model based on PPP-related Genes for risk assessment and prognosis prediction in HCC patients. We integra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervical cancer is the leading type of primary malignancy in the uterus, causing significant morbidity and mortality, particularly in developing countries. Traditional treatments often result in severe side effects and recurrence, highlighting the need for safer alternatives. This study investigates the anticancer potential of Tetraselmis suecica, a green microalga known for its bioactive compounds.
METHODS: HeLa cervical cancer cells and HUVEC were treated with varying concentrations of T. suecica (25, 50, 75, and 100 mg/ml) for 24 h. Cell viability was assessed using the MTT ass
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic reprogramming is recognized as a hallmark of cancer frequently associated with drug resistance in ovarian cancer. This is problematic as ovarian cancer is one of the deadliest gynecologic cancers with platinum resistance contributing to poor survival. However, the mechanism by which ovarian cancer cell metabolism contributes to platinum resistance is not well understood. Herein, metabolic signatures were determined in platinum-resistant ovarian cancer cell lines compared to the more platinum-sensitive parental lines. Chemoresistant ovarian cancer cells showed increased oxidative phos
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypoxia and activation of the pentose phosphate pathway (PPP), as well as overexpression of glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD), are hallmark features of glioblastomas (GBM), contributing significantly to tumor progression metabolic adaptation and drug resistance. This study aimed to evaluate the cytotoxic effects of nine synthetic compounds incorporating annulated benzimidazole and nitrothiazole scaffolds in two glioblastoma cell lines (A172 and U87-MG) under both normoxic and hypoxic conditions. Three compounds (BZM-7, BZM-9, and CNZ-3) demonstrated potent anticancer activity, with CNZ-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PARP inhibitors exploit synthetic lethality in BRCA1/2-mutated ovarian cancers but are limited by emerging therapeutic resistance. Therefore, novel biomarkers predicting PARP inhibitor response are urgently needed. In this study, we performed integrative analysis using drug sensitivity, patient survival, gene dependency, and expression data to identify biomarkers associated with PARP inhibitor response in ovarian cancer. Mutations in BRCA1, MLL2, NF1, and SMARCA4 were associated with increased sensitivity to PARP inhibitors, suggesting potential synthetic lethality with PARP1. In contrast, SMA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования